SNP位點的選擇原則
1,如果是檢測基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查詢到這些SNP位點,SNP位點可以通過查詢dbSNP數據庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)數據庫(http://snp.cshl.org/),可以獲知基因及上下游鄰近序列的SNP位點。2,至于挑選的原則,可以介紹一下Hap Map的正規化標準:SNP Selection CriteriaCategory 1 "verified"This contains all SNPs for which we have allele frequency or genotyping data. This includes SNPs from the TSC allele frequency project, as well as SNPs characterized by J......閱讀全文
SNP位點的選擇原則
1,如果是檢測基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查詢到這些SNP位點,SNP位點可以通過查詢dbSNP數據庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)數據庫(http://snp.cshl.org/),可以獲知基因及上
亞甲基四氫葉酸還原酶相關SNP位點
(1)MTHFR C677T rs1801133; (2)MTHFR A1298C rs1801131; (3)MTRR A66G rs1801394; 研究認為,以上位點多態性與多種疾病相關: (1)婦幼保健類:神經管缺陷、先天性心臟病、唇腭裂、妊娠期高血壓疾病,自發性流產; (2)
識別位點
中文名稱識別位點英文名稱recognition site定 義限制性內切酶特異結合的核苷酸序列。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
剪接位點
中文名稱剪接位點英文名稱splicing site;splice site定 義剪接體可識別的RNA前體中內含子和外顯子連接邊界的序列和接頭位點。根據位置不同可以分為供體和接納體剪接位點。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)
進入位點
中文名稱進入位點英文名稱entry site定 義特指氨酰tRNA進入核糖體的部位。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)?
加帽位點
中文名稱加帽位點英文名稱cap site定 義mRNA中加帽結構的部位,該位點在前體mRNA的5'端。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
nut-位點的定義
中文名稱nut 位點英文名稱nut site定 義噬菌體基因組中抗終止因子N蛋白的識別位點。N蛋白對nut位點的識別和隨之發生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略終止信號而持續通過終止子。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
什么是活性位點
者一般用在大分子化學中,活性位點指的是可以發生化學反應的集團。活性位點少,發生有效碰撞的機率就少,也就是說反應比較單一,容易被控制
磷酸化位點分析實驗磷酸化位點的確定
實驗方法原理 磷酸化位點的確定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白質被純化,如果可能蛋白質要均一;磷蛋白被特異性的化學或酶反應切斷、產生肽混合物,其中含有一到兩個磷酸肽不同之處在干其分離磷酸肽的策略是為了確定氨基酸序列,定位肽段內磷酸化的殘基。上面所述的分離方法, 2D-PP 作圖、 HPLC 或 l
磷酸化位點分析實驗磷酸化位點的確定
磷酸肽的化學測序 磷酸肽的質譜分析 源后衰變 用酶和化學方法去磷酸化 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 磷酸化位點的確定也使用一
加帽位點的概念
中文名稱加帽位點英文名稱cap site定 義mRNA中加帽結構的部位,該位點在前體mRNA的5'端。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
無嘌呤位點的定義
中文名稱無嘌呤位點英文名稱apurinic site定 義核酸中脫去嘌呤堿的部位。產生的醛基,易發生β消除反應而使核酸鏈在該處斷裂。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
陰離子位點顯示實驗
實驗方法原理 實驗材料 組織樣品試劑、試劑盒 磷酸緩沖液陽離子化鐵蛋白液體戊二醛鋨酸實驗步驟 1. 0.1 mol/L磷酸緩沖液配制陽離子化鐵蛋白,濃度為0.2~0.5 mg/ml。2. 組織樣品懸浮于陽離子化鐵蛋白液體中,室溫下反應30 min。3. 0.1 mol/L磷酸緩沖液充分漂洗。4. 3
無嘧啶位點的概念
中文名稱無嘧啶位點英文名稱apyrimidinic site定 義核酸中脫去嘧啶堿的部位。產生的醛基,易發生β消除反應而使核酸鏈在該處斷裂。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
無堿基位點的定義
中文名稱無堿基位點英文名稱abasic site定 義核酸中失去堿基的部位。該部位堿基失去后,產生一個醛基,易發生β消除反應而使核酸鏈在該處斷裂。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
細胞化學詞匯nut-位點
中文名稱:nut 位點英文名稱:nut site定 義:噬菌體基因組中抗終止因子N蛋白的識別位點。N蛋白對nut位點的識別和隨之發生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略終止信號而持續通過終止子。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
什么是序列標簽位點?
序列標簽位點(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因組中任何單拷貝的短DNA序列,長度在100~500bp之間。
核糖體結合位點
核糖體結合位點(ribosomebinding site,簡稱RBS),是指mRNA的起始AUG上游約8~13核苷酸處,存在一段由4~9個核苷酸組成的共有序列-AGGAGG-,可被16SrRNA通過堿基互補精確識別的序列。
序列標簽位點的簡介
任何DNA序列,只要知道它在基因組中的位置,都能被用作STS標簽。作為基因組中的單拷貝序列,是新一代的遺傳標記系統,其數目多,覆蓋密度較大,達到平均每1kb一個STS或更密集。這種序列在染色體上只出現一次,其位置和堿基順序都是已知的。在PCR反應中可以檢測出STS來,STS適宜于作為人類基因組的一種
序列標簽位點的定義
序列標簽位點(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因組中任何單拷貝的短DNA序列,長度在100~500bp之間。
降水監測降水采樣點監測點位環境要求
①采樣點應位于開闊、平坦的地區,測點周圍的下墊面無裸露上壤,以免風沙揚塵的影響。②采樣點應避開局地污染排放源,包括排放酸堿物質的煙塵、粉塵和生活排放源、廢物堆積場、停車場以及交通T線等。③采樣點周應無遮擋雨、雪的障礙物,其中包括房屋、橋梁、高大樹木等。障礙物與采樣器之間的水平距離不得小于該障礙物高度
SNP檢測技術(測序、taqman探針和snp芯片)
snp現有檢測技術有主要的3大類別1、測序 主要發現新的snp位點和比較集中的snp位點,如hla區域,但成本較高,工作量大,不適合大樣本做疾病關聯分析。 2、taqman探針 結果比較可靠,國外文章也大量應用,不過對于國內成本偏高,同類還有snpshot技術,abi和貝克曼
SNP命名規則
一般寫法是這樣: dbSNP后面跟featureID. featureID一般是rs/ss后跟7-8位數字, 比如:rs12345678或者dbSNP|rs12345678以下是老鼠(Mus muculas)的1號染色體上SNP列表格式(部分):---------------------------
酶的活性位點的作用
酶的活性位點通常是蛋白質表面一個能夠讓底物結合和嵌入的凹陷或裂隙,底物通常通過不同的相互反應結合位點上與現存的氨基酸結合,如:氫鍵、離子鍵、范德華力相互作用或偶極-偶極相互作用。例如,底物可能通過氫鍵結合在絲氨酸殘基上,也可通過離子鍵結合在天冬氨酸殘基上,或通過范德華力結合在苯丙氨酸殘基上。這些結合
細胞化學詞匯無嘧啶位點
中文名稱:無嘧啶位點英文名稱:apyrimidinic site定 義:核酸中脫去嘧啶堿的部位。產生的醛基,易發生β消除反應而使核酸鏈在該處斷裂。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
基因插入位點和模式實驗
實驗材料dCTP試劑、試劑盒乙醇次氯酸鈉β-葡萄糖醛酸酶基因活性測定液溴化乙錠儀器、耗材培養室MS 培養基實驗步驟一、轉基因插入位點的數目第一代( T0)轉基因植株外源基因的插入位點數目,一般都是通過遺傳方法進行鑒定。雖然遺傳分析可以在任何世代進行,但是一般選擇轉基因植株自交,或與野生型測交后得到的
細胞化學詞匯加帽位點
中文名稱:加帽位點英文名稱:cap site定 義:mRNA中加帽結構的部位,該位點在前體mRNA的5'端。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
細胞化學詞匯進入位點
中文名稱:進入位點英文名稱:entry site定 義:特指氨酰tRNA進入核糖體的部位。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
土壤現狀監測點位如何選擇
根據土壤導則要求污染影響型建設項目,二級要求監測柱狀樣和表層樣,三級要求監測表層樣。如果建設項目場地已經硬底化,該如何如何選取監測點?是需要把已經硬底化的場地破壞還是另外選取監測點? 根據建設項目實際情況,如果項目場地已經做了防腐防滲(包括硬化)處理無法取樣,可不取樣監測,但需要詳細說明
位點專一誘變的概念
中文名稱位點專一誘變英文名稱site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 義使DNA分子中某一特定的核苷酸序列發生改變。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)