植物基因組DNA的RFLP多態性分析
一、原理DNA多態性是指DNA堿基順序的差異性。這種差異性不僅存在于不同的植物之間,也存在于同一種植物的不同個體之間。RFLP多態性是指DNA限制性內切酶酶切片段長度的多態性(restniction fragment length olymophorphism)。由于堿基順序的差異,在不同的種或同一個種的不同個體之間,它們的基因組DNA限制性內切酶位點的種類和數目不同,經特定的限制性內切酶切割后,所產生的限制性酶切片段在大小(長度)和數目方面自然也存在著差異。通過瓊脂糖凝膠電泳分離和溴化乙錠染色,在紫外檢測儀下觀察,即可直接看到這種差異。電泳分離后,通過Southern雜交也可顯示出已知DNA片段的差異。二、目的通過本實驗了解不同植物或同一植物不同個體之間基因組DNA順序的差異性,掌握DNA限制性酶切片段長度多態性研究的基本方法。三、材料和試劑1、從不同植物或同一植物不同個體分離出的基因組DNA。2、限制性內切酶。3、1......閱讀全文
植物基因組DNA的RFLP
實驗概要本實驗介紹了植物基因組DNA的RFLP多態性分析的原理及操作步驟。通過本實驗可了解不同植物或同一植物不同個體之間基因組DNA順序的差異性,掌握DNA限制性酶切片段長度多態性研究的基本方法。實驗原理DNA多態性是指DNA堿基順序的差異性。這種差異性不僅存在于不同的植物之間,也存在于同一種植物的
植物基因組提取(CATB法)
一、實驗目的?掌握植物總DNA的抽提方法和基本原理。學習根據不同的植物和實驗要求設計和改良植物總DNA抽提方法。?二、實驗原理?通常采用機械研磨的方法破碎植物的組織和細胞,由于植物細胞勻漿含有多種酶類(尤其是氧化酶類)對DNA的抽提產生不利的影響,在抽提緩沖液中需加入抗氧化劑或強還原劑(如巰基乙醇)
開花植物“統治”植物界或因基因組瘦身
據英國廣播公司(BBC)1月14日報道,開花植物為什么會后來居上超越蕨類植物等,傳遍世界各地并成為最主要的陸生植物?這一問題曾讓達爾文困惑不已。現在,美國微生物學家表示,“基因組瘦身”或是開花植物遍布地球的“秘密武器”。 1898年,達爾文在《物種起源》一書中提出一個令他頗為不解的問題。他說,
昆明植物所在植物基因組印跡研究中取得進展
蓖麻基因組印跡以及其甲基化分析 基因組印記 (genetic imprinting)是一種非常重要的表觀遺傳學現象之一。在配子或合子發育過程中,來自親本的等位基因或染色體發生了差異的表觀修飾,導致了親本等位基因的差異表達(即印跡基因)。在植物中基因組印跡主要發生在被子植物的三倍體胚乳組織
植物組織制備基因組DNA實驗
氯化銫法 CTAB法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分子DNA則
植物組織制備基因組DNA實驗
實驗方法原理?加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部, 從而達到提取的目的。實驗材料?植物組織試劑、試劑盒?抽提緩沖液十二烷基肌氨酸鈉TE異丙醇溴化乙錠氯化銫儀器、耗材?離心機實驗步驟 ? 收取1
SDS法提取植物基因組DNA
本方法由Dellaporta,Wood和Hicks(1983)的方法修改而成。其基本原理是研磨的組織細胞用熱的SDS裂解后,加入高濃度的KAc,0℃放置以除去蛋白和多糖類雜質,最后用乙醇或異丙醇沉淀。一 材料、試劑和儀器1 材料 新鮮的組織材料或-80℃凍存的材料2 試劑(1)提取緩沖液Tris-H
迄今最古老植物基因組破譯
一個國際科研團隊對在利比亞撒哈拉沙漠考古遺址收集的新石器時代的西瓜種子進行測序,破譯了迄今最古老的植物基因組。對6000年前的西瓜種子進行測序,為西瓜的馴化提供了新線索,有助研究如何增強西瓜的抗旱、抗病蟲害能力。相關論文發表于最近的《分子生物學與進化》雜志。 科學家們普遍認為西瓜來自非洲,但究
首個蕨類植物基因組測序完成
蕨類植物是地球上最多樣化的植物種群之一,也是僅有的沒有完成基因組測序的主要植物種群。2018年7月18日,美國康奈爾大學研究人員在《自然-植物》期刊上發表了其完成蕨類植物基因組測序的結果。 蕨類植物的基因組較大,可以擁有多達720對染色體,包含多達1480億個堿基對的DNA序列(Gb)。相比之
利用CTAB法提取植物基因組DNA
一、實驗原理 CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)是一種去污劑,可溶解細胞膜并能與核酸形成復合物,該復合物在高離子強度(0.7mol/L)的溶液里是可溶的,通過離心可將復合物同蛋白質、多糖類物質分開。在酚仿變性的條件下,去除殘留的CTAB和蛋白質等雜質,然后利用異戊醇或無水乙醇將DNA分
所有開花植物同類的基因組秘密
一個無油樟花。 據科學家們報告,代表最古老開花植物世系——一種有著乳白色花的小灌木——的單一物種的基因組序列終于被找到了,這讓人們對開花植物是如何演化的提供了關鍵性的見解。研究當今地球上植物多樣化的進化生物學家對無油樟(Amborella trichopoda)——該植物代表了被子植物
植物所等破譯構樹基因組
構樹(Broussonetia papyrifera)又稱紙皮樹、肥豬樹,為桑科構屬多年生闊葉喬木,自然分布于我國大部分地區和東南亞,是一種典型的鄉土樹種和先鋒植物。構樹雌雄異株,種子數量多,易繁殖,生長快,表型性狀和遺傳多樣性豐富,基因組緊湊,可作木本植物研究的模式材料。同時,構樹有著悠久的開
上海植物逆境中心建立植物基因組精確定點修飾技術
中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組近日通過模仿和改造微生物中的一種抵御外源侵染的防護機制,成功開發出一種能對植物基因組進行精確定點修飾的技術,從而使高效植物分子改良性狀成為可能。這一適用于植物的CRISPR/Cas技術就像一把剪刀可以對基因組任意感興趣的位置進行編輯,它的成功開發將革命
昆明植物所破譯稻屬植物5個物種全基因組
亞洲栽培稻(一般稱為水稻)是世界上最重要的糧食作物之一,是中國第一大糧食作物,養活了80%以上的中國人口。在水稻與其它約23個物種共同組成的稻屬植物中,它和7個稻種(普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻、長雄蕊野生稻和南方野生稻)都是AA基因組類型,這些水稻近緣物種間斷分
植物所發現植物細胞器基因組新的演化模式
質體和線粒體是內共生起源的細胞器,在高等植物中有不同的遺傳特征,相較于動態復雜的線粒體基因組,質體基因組的結構和序列更保守。在基部維管植物石松類卷柏科植物中,這兩種細胞器基因組表現出相似的特征,但是造成二者趨同演化的機制尚不清楚。? 中國科學院植物研究所研究員張憲春研究組從事石松類和蕨類植物的
植物基因組“剪刀”-被成功打造-可編輯基因組任意位置
中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組通過模仿和改造微生物中的一種抵御外源侵染的防護機制,成功開發出能對植物基因組進行精確定點修飾的技術,從而使高效植物分子改良性狀成為可能。這一適用于植物的CRISPR-Cas技術就像一把剪刀,可以對基因組中任意感興趣的位置進行編輯,它的成功開發將革命性地改變
版納植物園揭示殼斗科植物的基因組大小進化
物種的基因組大小是物種形成和多樣化中最近處的性狀。通過測定物種的基因組大小,有助于了解物種的染色體倍性和基因組進化,為全基因組測序提供基礎數據,提高基因組多樣性的生物信息學研究的效率。前人對植物基因組大小進化的研究多集中于溫帶草本類群,并且未與系統發育和地理分布相關聯,對熱帶木本植物的基因組大小
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物組織制備基因組DNA實驗——CTAB法
實驗方法原理加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團飄浮其中, 可用玻棒將其取出,而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部, 從而達到提取的目的。實驗材料植物組織試劑、試劑盒CTAB液2-疏基乙醇TE高鹽TE氯仿異戊醇儀器、耗材研缽離心機培養箱實驗步驟1. ?在所需量
現存最原始種子植物蘇鐵基因組發布
近日,科學家完成蘇鐵基因組解析工作,發布蘇鐵完整基因組圖譜,這意味著種子植物基因組演化研究中的最后一塊拼圖已順利完成。4月18日,《自然-植物》(Nature Plants)以封面文章發表該研究成果。據悉,該研究成果數據公開共享,全球科學家可免費下載使用。蘇鐵是地球上現存最古老的種子植物,是著名的“
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
使用離心機提取植物基因組DNA
植物基因組DNA提取使用什么樣的離心機做?具體步驟怎么樣?植物組織提取基因組DNA 一、材料 幼嫩葉子。 二、設備 移液器,冷凍高速離心機,臺式高速離心機,水浴鍋,陶瓷研缽,50ml離心管(有蓋)及5ml和1.5ml離心管,彎成鉤狀的小玻棒。(這時選擇設備的時候注意選擇那種通用性強的,可以一機配多種
多個秋海棠屬植物基因組被破譯
秋海棠屬植物葉型與葉斑的多樣性 ? ?仙湖植物園供圖近日,由深圳市仙湖植物園與深圳華大生命科學研究院牽頭完成的秋海棠屬植物基因組研究成果在植物學領域國際權威刊物《新植物學家》(New Phytologist)正式發表。最新發布的研究成果中,研究團隊完成了桑寄生狀秋海棠、鐵十字秋海棠、黑武士秋海棠、和
植物基因組總DNA的分離———SDS法
實驗方法原理SDS(十二烷基磺酸鈉)是一種強去污劑,可使細胞膜及核膜破裂,因此被用來分離DNA。該分離過程的第一步是用熱的去污劑(SDS)進行抽提,然后將抽提物置于0℃并加入高摩爾濃度的乙酸鉀,離心去除不溶物,以去除蛋白和多糖類雜質。實驗材料植物新鮮葉片試劑、試劑盒液氮提取緩沖液(用前加入)20%S
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
中國植物葉綠體基因組研究顛覆學界認知
中國科學家一項歷時五年的研究成果顛覆了學界對植物葉綠體基因組的認知——科學家發現整個葉綠體基因組都是可以轉錄的。該研究成果已于近日發表在了《自然》出版集團的《科學報告》上。 《科學報告》的審稿專家一致認為,“這一成果首次發現了我們從來沒有想象過的現象,顛覆了傳統遺傳學上認為的只有葉綠體編碼基因
植物基因組總DNA的分離———SDS法
實驗方法原理 SDS(十二烷基磺酸鈉)是一種強去污劑,可使細胞膜及核膜破裂,因此被用來分離DNA。該分離過程的第一步是用熱的去污劑(SDS)進行抽提,然后將抽提物置于0℃并加入高摩爾濃度的乙酸鉀,離心去除不溶物,以去除蛋白和多糖類雜質。實驗材料 植物新鮮葉片試劑、試劑盒 液氮提取緩沖液(用前加入)2
買麻藤類植物全基因組破譯
近日,由深圳市中國科學院仙湖植物園,中科院中-非聯合研究中心、武漢植物園、植物研究所,英國皇家植物園邱園等10余家國內外知名院所聯合開展的“裸子植物——買麻藤全基因組計劃”取得重要進展。 裸子植物和被子植物的起源、分歧及演化,是現代植物學科的基礎熱點領域。現存35萬余種種子植物被分成蘇鐵類、松