揭示基因“無用”序列穩定染色質三維結構及細胞穩態機制
人類基因組中的非編碼序列在多種生物學過程中發揮著至關重要的作用，如非編碼RNA、啟動子、增強子和轉座子等。作為在基因組中占比約98%的非編碼區域，仍有大量是功能未知的，這些曾被認為是基因組中“垃圾”的區域，已被逐漸證實存在重要功能。基因組的三維結構會影響基因的轉錄調控或其他細胞生命活動，然而，除了研究較多的增強子-啟動子成環所形成的三維結構在調控基因表達上的作用外，其他大量非編碼序列在形成和維持正確三維染色質結構上是否具有潛在功能，在目前的研究中是被忽視的一個方向。之前有研究表明，改變非編碼序列能夠改變染色質結構，如切除一些拓撲結構相關結構域（TAD）的邊界序列能夠導致異常的基因表達，誘發疾病產生。除了TAD邊界序列這一特殊類型，非編碼序列在結構上的重要性目前還沒有系統性的研究，尤其是一些與TAD無關、無任何表觀遺傳信號或功能元件注釋的區域。 加州大學圣地亞哥分校（UCSD）王巍課題組與北京大學魏文勝教授課題組在Scien......閱讀全文
染色體水平冬瓜參考基因組發布
近日，廣東省農業科學院蔬菜研究所發布了染色體水平冬瓜參考基因組。相關研究發表于Scientific Data，廣東省農業科學院蔬菜研究所副研究員羅文龍和副研究員閆晉強為該論文共同第一作者，廣東省農業科學院蔬菜研究所研究員江彪為通訊作者。廣東省農業科學院蔬菜研究所于2019年對黑皮大冬瓜B227進行基
“蠶姑娘”性染色體基因組密碼破解
7月8日，西南大學教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列，并揭示了鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化新機制。相關研究成果近日發表于期刊《科學進展》。 家蠶性別的決定機制一直受到科學界關注。以家蠶為代表的鱗翅目昆蟲性染色體在昆蟲界獨樹一幟。不同于大多數昆蟲性染色體組為XX/XY系統，其性染
“蠶姑娘”性染色體基因組密碼破解
7月8日，記者從西南大學獲悉，該校教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列，并揭示了鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化新機制。相關研究成果近日發表于期刊《科學進展》。家蠶性別的決定機制一直受到科學界關注。以家蠶為代表的鱗翅目昆蟲性染色體在昆蟲界獨樹一幟。不同于大多數昆蟲性染色體組為XX/XY系統
染色體級別的銀杏參考基因組公開
銀杏果實 曹福亮供圖 作為裸子植物銀杏綱唯一的孑遺物種，銀杏不僅具有特殊的科學研究價值，而且具有重要的應用價值。 近日，南京林業大學聯合中國農業科學院農業基因組研究所在《自然—植物》在線發表了染色體級別的銀杏參考基因組，是目前已發表的組裝質量最高的裸子植物參考基因組。 論文共同通訊作者、中國工
研究發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
Science：宏基因組研究挑戰DNA編碼規則
人們一直認為DNA編碼的指令是所有生命通用的，例外情況極少。但本期Science雜志上的一項新研究顯示，自然界中的生物又一次打破了既定的規則。 美國能源部聯合基因組研究所的Edward Rubin領導研究團隊，獲得來自1776種環境（包括17個人體區域）的微生物宏基因組數據，以便在其中尋找重編
基因組重編碼生物體“赭石”誕生
美國耶魯大學合成生物學家創建了一種新型基因組重新編碼生物體（GRO），并命名為“赭石”（Ochre），實現了對生物體遺傳密碼的重寫。這一成果發表在最新一期《自然》雜志上，不僅促進了人類對遺傳密碼可塑性的理解，也為未來合成生物學的應用提供了更多可能。在這項研究中，科學家成功將DNA或RNA中的冗余密碼
迄今最全面的非編碼基因組圖譜問世
生命科學 非編碼 DNA 延伸段在發育和基因調控中發揮著關鍵作用。2 月 3 日發表在《自然》（Nature）上的一項新研究稱，來自美國麻省理工學院（MIT）的研究團隊發表了迄今為止最全面的非編碼基因組圖譜，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
微陣列—比較基因組雜交技術檢測染色體異常
【摘要】近年微陣列一比較基因組雜交(microarraycomparativegenomichybirdization，microarray．CGH)技術被應用到臨床細胞遺傳學領域。該技術是選擇DNA特殊片段作為靶，固化在載體上，形成密集、有序的分子微陣列。然后，從測試標本中提取DNA，將測試DNA
上海師大團隊破解染色體級別基因組密碼
中新網上海12月16日電 (記者 許婧)上海師范大學16日發布消息稱，該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗
實驗方法原理比較基因組雜交（CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序，描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染（wcp)的常規熒光原位雜交（FISH)和多色FISH之處，是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源，而且還可將該片段定位于特定的染色體區帶
龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功
? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日，《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所（以下簡稱茶葉所）和中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）主導并攜手中國科學院昆明動物研究所（以下簡稱昆
染色體級別的鐵線蕨基因組首次繪制
日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內外8家科研院所首次繪制了染色體級別的鐵線蕨基因組，揭示了蕨類植物孢子發育、真葉植物起源和種子演化、茉莉素信號通路進化等分子機制。相關研究成果發表在《自然—植物（Nature Plants）》。 真蕨植物以孢子體和配子體均具有光合自養能力為主要特
染色體級別橡膠基因組研究揭秘乳膠生物合成
橡膠樹是大戟科植物。在植物界大約2500種產膠植物中，橡膠樹產生的以聚異戊二烯為主要功能成分的天然膠乳約占全球天然橡膠的98% 以上。圖片來源于網絡 比起可能造成巨大環境污染的人工合成橡膠產業，天然橡膠因其良好的彈性、伸展性、耐老化等綜合理化性能而具有不可替代性，是任何國家必須具備的重要戰略
昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
鴨嘴獸基因組圖譜揭秘獨特的性染色體
鴨嘴獸可能是世界上長得最奇怪的動物。據說，當歐洲學者第一次見到這種鴨子嘴、海貍尾、水獺足的動物時，他們認為這是一場精心設計的騙局。它看上去既像爬行動物又像哺乳動物，還像鳥類。實際上，它屬于稀有的單孔類動物。 鴨嘴獸不僅有一些奇特的身體特征，其新的基因組版本也強調了它一些不尋常的遺傳特性。在上周
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（二）
二、正常男性中期染色體標本的制備1.準備一個封閉環境，其相對濕度約55%(可在50%?60%變化），溫度24?26.5℃。2.將巴斯德吸管置于玻璃載片上方2?4in處，讓一滴細胞懸液滴在玻片的左側。然后迅速將第二滴細胞懸液滴在玻片右側（見注釋7)3.在固定液全部蒸發前，將玻片浸入盛有新鮮固定液的染色
研究從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華
“六谷”豐登？——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（三）
六、中期染色體標本的變性1.在染色缸中加入大約50mL變性液，將染色缸放于75?76℃水浴中。預熱變性液使其溫度達到（73±2)℃。2.從-20℃冰箱中取出實驗所需的標本，室溫下系列乙醇脫水，各2min。3.室溫干燥片子（5min)，或在實驗室抽風櫥中微風吹過標本使標本干燥。4.在37?40℃電熱板
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉類植物，原產于中國云南和東南亞地區，具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊，采用單分子納米孔、Illumina測序策略，結合染色體構像捕獲技術，發表了首個象腿蕉染
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（一）
實驗方法原理 比較基因組雜交（CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序，描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染（wcp)的常規熒光原位雜交（FISH)和多色FISH之處，是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源，而且還可將該片段定位于特定的染色體區
NAR：人類基因組中或含有超過20％的非編碼基因
近日，一項刊登在國際雜志Nucleic Acids Research上的研究報告中，來自美國國家癌癥研究中心的科學家們通過研究發現，高達20%的編碼基因可能根本就無法進行編碼，因為這些基因具有非編碼或偽基因（即過時的編碼基因）的特征，由此導致的人類基因組的縮小或許會對生物醫學領域產生重要的影響，
基因組所發表長非編碼RNA分類問題綜述文章
近日，中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室的“百人計劃”研究員章張及其團隊，與沙特阿卜杜拉國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology)開展科研合作，對長非編碼RNA的分類問題進行了系統綜述，相關論文在RN
北京基因組所等揭示Y染色體表觀信息遺傳機制
表觀遺傳學是與傳統遺傳學相對應的概念。遺傳學以基于DNA序列的中心法則來傳遞遺傳信息，在人群中，遺傳信息在世代之間穩定遺傳，那么表觀遺傳信息是否像遺傳信息一樣可被子代繼承，尚缺少相關有力證據。DNA甲基化是非常重要的表觀遺傳信息，是表觀遺傳學研究的重要內容。目前，鮮少有DNA甲基化在人群中的繼承
破解染色體級別基因組密碼解析栽培菠菜的“前世今生”
上海師范大學16日發布消息稱，該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化歷史的解析。 該研究成果以“基因組解析
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日，中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝，并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白，為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
人類種了6000年的作物有了染色體級別基因組
大麻又名火麻、漢麻、線麻等，籽用大麻在食品、醫藥、紡織、造紙等多個領域被廣泛使用，是一種重要的工業原料。 9月15日，福建農林大學麻類研究室聯合該校基因組與生物技術中心在《植物通訊》（Plant Communications）上發表了首個染色體級別的籽用大麻參考基因組圖譜。他們在此基礎上解析了
人血細胞中的所有蛋白編碼基因進行全基因組轉錄組分析
在臨床和研究環境中，血液都是對人類進行分子分析的主要來源，并且是許多治療策略的目標，這突顯了需要對構成人類血液的細胞進行全面的分子圖譜構建。人類蛋白質圖譜計劃（www.proteinatlas.org）是一個開放式數據庫，旨在通過整合各種組學技術（包括基于抗體的成像）來繪制所有人類蛋白的圖譜。在