實驗室分析技術基于HPLCMS／MS的蛋白質組學技術
基于高效液相色譜串聯質譜（HPLC-MS/MS）的蛋白質組學技術的發展主要取決于液相色譜-質譜聯用分析設備、樣品分離和制備技術、鑒定以及生物信息學。目前，shotgun鳥槍法是最常用的大規模蛋白質鑒定策略。如下圖所示，在自下而上分析策略中，蛋白質通過蛋白水解酶水解成肽的混合物，然后通過色譜法或親和分離技術進行分離，最后通過質譜檢測碎裂離子。通過數據庫搜庫將質譜與數據庫中蛋白質理論消化產生的譜進行匹配，并根據一系列指標進行評分，實現肽譜匹配（PSM），并最終完成蛋白質組鑒定。而在基于自上向下的蛋白質組學分析策略中，可以直接從樣品中分離和檢測完整的蛋白。與自下而上的方法相比，自上向下分析策略能提供更多保存蛋白物種的信息。這兩種分析策略促進了疾病和癌癥的蛋白質組學研究。自下而上（a）和自上而下（b）基于質譜法的蛋白質組學工作流程（Jeong K等，2020）......閱讀全文
實驗室分析技術基于HPLCMS/MS的蛋白質組學技術
基于高效液相色譜串聯質譜（HPLC-MS/MS）的蛋白質組學技術的發展主要取決于液相色譜-質譜聯用分析設備、樣品分離和制備技術、鑒定以及生物信息學。目前，shotgun鳥槍法是最常用的大規模蛋白質鑒定策略。如下圖所示，在自下而上分析策略中，蛋白質通過蛋白水解酶水解成肽的混合物，然后通過色譜法或親和分
綜述：基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展
糖是組成生命體的四大類重要分子之一，糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內，在很多生命過程中起著重要作用，如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時，糖基化修飾在疾病中，特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用，許多疾
蛋白質組學研究技術
可以說，蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否，很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基（20/ 4）， 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾，如磷酸化和糖基化等，給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外，
蛋白質組學+AI技術
人們在吞咽的時候，頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動，它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目，就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小，但它影響到五臟六腑。數據顯示，每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中，約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的，
蛋白質組學鑒定技術流程
蛋白質組（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亞Macquarie大學的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一個基因組（Genome），或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。蛋白質組學（Proteomics）以細胞、組織或生物體全體蛋白質為研究對象，通過高通量的色譜質譜聯用技術
蛋白質組學實驗技術大全
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新，蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多，但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前，先看看這篇技術簡介吧。一?蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中，例如DNA復制、mRNA轉錄與
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。 自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大
蛋白質組學技術的功能介紹
“讀”，在字典里的意思是識取、讀取，放在蛋白研究中可以理解為對生物樣本中未知單一蛋白或復雜蛋白的篩選、鑒定或者定量檢測。自2003年4月14日人類基因組計劃（HGP）宣告完成以來，基因組研究取得了舉世矚目的成就。基因組學雖然在基因活性和疾病的相關性方面為人類提供了有力證據，但實際上絕大多數疾病并不是
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組，蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然，不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質，一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
陳穎：基于分子生物學和蛋白質組學的食品真偽鑒別技術
2014年7月31日，第二屆國際檢驗檢測技術與裝備博覽會在北京國家會議中心隆重召開（以下簡稱檢博會）。本屆博覽會以“高端技術，服務民生”為主題，以“質檢、科技、國際”為特色，秉著“搭建國際平臺，服務檢測市場”的宗旨，為科技服務水平提升、檢驗檢測行業和諧發展、科技成果交流與合作、檢驗檢測儀器拓展
Nature年度技術：定向蛋白質組學
時近歲末，各大雜志接連進行了年終盤點，此前出版的《Nature》雜志也對2012年進行了回顧，評點了2012年的科技進展，科技政策以及重要人物，中國科學家王俊入選了人物篇。同時《Nature Methods》也盤點了今年與明年的技術熱點，選出了2012年度技術成果：定向蛋白質組學(targe
定量蛋白質組學的技術發展
以質譜為基礎的定向蛋白質組學研究領域的發展歷程并不短，早在上個世紀70年，三重四極桿質譜儀就已經出現，并在80年代首次在發表的文章中，證明可以被用來檢測肽段。 過去幾年間，更廣泛的范圍內定向質譜技術的應用迅速攀升，而且新方法，新工具，新資源和新一代方法，也令更多研究領域的科學家們能利用到這項技
基于質譜分析技術的蛋白質組學檢測法能更有效識別肝癌
隨著丙型肝炎病毒感染的不斷發生，肝癌病例不斷增加，這就急需一種針對肝癌的早期診斷方法。 一項發表在1月15日《臨床癌癥研究》(Clinical Cancer Research)雜志上的研究性文章稱，一種基于質譜分析技術的蛋白質組檢測比傳統的生物標志物檢測更為準確，可以更好地區分肝癌患者和丙型肝炎肝硬
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代謝組學（一）
Stefan Weidt,2 Bogusia Pesko,2 Cristian Cojocariu,1 Paul Silcock,1 Richard J. Burchmore,2 and Karl Burgess21Thermo Fisher Scienti_c, Runcorn, UK2Glasg
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代謝組學（三）
使用 SIMCA 軟件進行多變量統計分析。5將結論數據轉化為更為直觀的對數值，將 Y 類別設為各時間點，生成數據的偏最小二乘判別分析（PLS-DA）模型。該軟件生成分數圖和載荷圖，以顯示沿著主成分每個時間點的聚類和分離（圖 6）情況。從本次分析可知，死亡后立即取樣的樣品（RAT_T0）聚集在
基于－Orbitrap－GCMS－的非靶向代謝組學（二）
???圖 2. 大鼠肌肉組織樣品代謝 0–3 天后的 GC-MS 色譜圖（自上而下天數增加），X 軸為保留時間，Y 軸為強度（固定為1E9 計數）。例如，記下高亮區域中峰強度隨時間的變化。?化合物發現階段Q Exactive GC 系統獲取了每個樣品的全掃描色譜圖（圖 2）。該系統在較寬的動態范
董孟秋·科學：蛋白質組學新技術
來自美國斯克利普斯研究所（Scripps Research Institute）Salk生物研究院，加州大學圣地亞哥分校的研究人員利用一種蛋白定量分析新方法對長壽命線蟲進行了研究，發現了能延長和縮短壽命的蛋白。這對于進一步豐富蛋白定量研究方面來說意義重大。這一研究成果公布在《Science》雜志上。
蛋白質組學技術分析方法及概括
1 蛋白質組學概述“蛋白質組”一詞的英文是Proteome，它是proteins 和genome 兩個詞的組合，意思是proteins expressed by a genome，即為基因組表達的蛋白質[1]。蛋白質組的概念是1994 年由Wilkins首先提出，并在1995 年7月的“Electr
蛋白質組學技術分析方法及概括
1 蛋白質組學概述“蛋白質組”一詞的英文是Proteome，它是proteins 和genome 兩個詞的組合，意思是proteins expressed by a genome，即為基因組表達的蛋白質[1]。蛋白質組的概念是1994 年由Wilkins首先提出，并首次在1995 年7月的“Elec
復旦大學發表蛋白質組學新技術
復旦大學現代色譜分離分析實驗室的研究人員設計出一種基于芯片的二維液相色譜系統，可在質譜分析之前去除血漿樣品中的高豐度蛋白。這項成果于近日發表在《Analytical Chemistry》上。 對于血漿樣品的質譜分析，一個重大挑戰是高豐度蛋白往往占據了主要信號，而掩蓋了人們感興趣的低豐度蛋白的信
華盈視角：蛋白質組學——質譜技術
蛋白質作為功能的直接執行者，在生物醫學領域中有著重要意義，檢測蛋白質表達、修飾、互作等有助于我們理解生命機體的各類機制和活動規律，為疾病的治療、診斷，藥物的開發、優化等提供有力的支持。質譜技術作為檢測蛋白質組學的主流技術，有必要了解其核心原理，才能更好的服務于科學問題的解決。1.質譜的原理： 質譜是
蛋白質組學哪些技術需要進行重復實驗？
Label free需要進行三次重復，而iTRAQ、TMT一般建議客戶做3次實驗重復，如果實驗方案后期設計了大量的驗證實驗如WB或ELISA等，最好做也能做兩次重復；如果不進行重復實驗后期的驗證實驗也少，在后期發表文章的時候結果可能會受到一些審稿人的質疑，從而影響文章的發表，特別是一些高分雜志較
“鳥槍法(shotgun)”定量蛋白質組學技術
1999年，Yates研究組提出“鳥槍法”(shotgun)，其基本技術路線是針對液體或SDS-PAGE條帶的復雜混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后對肽混合物進行多維毛細管液相色譜分離和串聯質譜分析以及數據庫檢索，從而確定蛋白質的種類，可同時鑒定成百上千種蛋白質。他們把這種思路稱
蛋白質組學實用分析技術一覽
分析其實也屬于技術的一部分，且在蛋白質組學研究中顯得尤為重要，因為蛋白質組學研究提供的數據是生物學上最龐大的，而且蛋白質組比基因組具有更大的復雜性，因此蛋白質組信息學更有挑戰性。今天小編先拋磚引玉地介紹幾個常用的分析方法和軟件。蛋白質定性分析蛋白質定性分析通常是指利用質譜法進行蛋白質鑒定和序列分析。
蛋白質組學牛人利用新技術分析蛋白質圖譜
蛋白質組(proteomics)分析是針對不同條件下細胞中蛋白的功能和特性進行研究的統稱，這一領域的研究一直以來都落后于基因組研究，后者在技術創新方面取得了不少成果，一些令人眼花繚亂的快速基因組圖譜繪制技術，還有無需借助核心實驗室設備就能完成實驗的技術，都令我們印象深刻。 但是與基因組研究
基于賽默飛－Orbitrap－GCMS的非靶向代謝組學
引言：代謝組學旨在表征和定量生物系統中的完整小分子代謝通路或 代謝物組。代謝物組包含小分子多元混合物（包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂質）。非靶向代謝組學挑戰性，因 為其要求定性和定量上百個不同種類化合物，而有關這些代謝 物的經驗知識有限。因此，有必要使用一個既可以以非靶向的 方式靈敏檢測特
基于賽默飛－Orbitrap－GCMS的非靶向代謝組學
引言：代謝組學旨在表征和定量生物系統中的完整小分子代謝通路或 代謝物組。代謝物組包含小分子多元混合物（包括氨基酸、糖 和磷酸糖、生物胺和脂質）。非靶向代謝組學挑戰性，因 為其要求定性和定量上百個不同種類化合物，而有關這些代謝 物的經驗知識有限。因此，有必要使用一個既可以以非靶向的 方式靈敏檢
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋