我國完成世界首個番茄超泛基因組構建
4月6日,由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭,聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位,在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。這是新疆農科院首次以第一單位在《自然·遺傳》發表論文。 新疆農科院余慶輝研究員為論文第一通訊作者,李寧副研究員為論文第一作者,中國農業科學院作物科學所博士后賀強為論文的共同第一作者,中國農業科學院深圳農業基因組研究所李宏博博士和中國農業科學院生物技術所王歡研究員為共同通訊作者。 番茄(Solanum lycopersicum?L.)作為果實遺傳、發育和生理研究的經典模型系統,也是全球生產中最重要的蔬菜作物。由于人們為追求更大的果實和更高的產量,對栽培番茄進行密集人工選擇,致使目前番茄遺傳多樣性大幅喪失,改良過程存在嚴重瓶頸。相比之下,野生番茄在各生態環境下表現出廣泛的遺傳和表型多樣性,其豐富的等位基因變......閱讀全文
我國完成世界首個番茄超泛基因組構建
4月6日,由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭,聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位,在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。這是新疆農科院首次以第一單位在《自然·遺傳》發表論文。 新疆農科院余慶輝
我國構建世界首個番茄超泛基因組,或大幅提升番茄產量
近日,由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭,聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位,成功構建了國際首個番茄超泛基因組。相關科研成果已于4月6日以《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》為題在線發表于國際學術期刊《自然·遺傳》。超泛基因組是指在一個基因組序列內涵
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
泛基因組:賦能未來作物育種的基石
?繪圖:黃怡可 泛基因組(Pan-genome)是一個物種內所有基因組信息的總和,它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來,科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
泛基因組:賦能未來作物育種的基石
?繪圖:黃怡可 泛基因組(Pan-genome)是一個物種內所有基因組信息的總和,它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來,科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
番茄基因組作圖與分子育種
摘要:? ?? ? The cultivated tomato, Lycopersicon esculentum, is the second most consumed vegetable worldwide and a well-studied crop speciesin terms of g
人類泛基因組首個草圖發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500424.shtm5月10日,《自然》發表了人類泛基因組參考的初稿,這一集合旨在最終代表整個人類物種中盡可能多的DNA序列。該項研究組合的人群遺傳物質來自47個遺傳多樣化個體,為人類基因組提供了更完整的
人類泛基因組首張草圖發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515798.shtm (圖片來源:Gideon MendelCorbis via Getty)5月10日,《自然》雜志發表了人類泛基因組參考的“初稿”,在3篇論文的合集中,人類泛基因組參考聯盟(H
基因組學出手-尋找番茄舊時味
近日,《科學》雜志以封面報道形式介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果,同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時,《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 小小番茄之所以獲得如此高的關注度,源于這種果實既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜,又是植物生物學家的最愛之一,堪稱植物遺
基因組學出手助番茄復“味”
以《更好吃的番茄》為題,1月27日的《科學》雜志用封面報道介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果,同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時,《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 《科學》和《自然》雜志如此重視這小小番茄的原因在于,番茄既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜,根
中國農科院破譯芝麻基因組
記者日前從中國農科院油料所獲悉,由該所牽頭與深圳華大基因聯合開展的芝麻基因組破譯工作順利完成。相關結果在線發表于《基因組生物學》雜志。 據項目主持人、油料所研究員張秀榮介紹,在主要油料作物的種子中,芝麻的含油量平均較高,一般約為種子干重的50%~60%,最高可達65%,但其油脂合成基因相對
全球首個牧草圖形泛基因組發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495404.shtm?3月3日,四川農業大學(以下簡稱四川農大)草業科技學院教授黃琳凱團隊在國際權威學術期刊《自然—遺傳學》(Nature Genetics)在線發表了題為《美洲狼尾草泛基因組構建、結構變
圖形泛基因組為蘋果精準育種“加碼”
人生嘗到的第一口水果很可能就是蘋果。它不僅口感大眾化,而且營養頗為豐富,是全世界最受歡迎的水果之一。 中國工程院院士、中國農業科學院作科所研究員劉旭指出,當前我國蘋果種業面臨優異種質資源匱乏、核心性狀改良周期長、現代分子技術應用不足等“瓶頸”問題,嚴重制約了蘋果新品種的選育及產業的持續提質增效
《自然》發表首個人類泛基因組草圖
當地時間5月10日,人類泛基因組參考聯盟(Human Pangenome Reference Consortium)發表了首個人類泛基因組草圖。相關的四篇論文均已發布,其中三篇發布在《自然》(Nature)雜志,一篇發布在《自然-生物技術》(Nature Biotechnology)雜志。
我國率先構建野生大豆泛基因組
中國農業科學院作物科學研究所與諾禾致源等合作,在國際上率先構建和分析了一年生野生大豆的泛基因組,為作物種質資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日在線發表于國際著名學術期刊《自然—生物技術》。 項目牽頭人、中國農科院作科所研究員邱麗娟介紹,大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日,華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文,公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章
新研究在番茄基因組庫中添加近5000個基因
現在,來自農業研究局(ARS)和Boyce Thompson研究所(BTI)的科學家們在剛剛發表的《Nature Genetics》一文中,重點討論了這個問題。 位于紐約伊薩卡的ARS植物、土壤和營養研究實驗室的分子生物學家James Giovannoni和BTI生物信息學科學家Zhangju
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位,成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜,構建了栽培和野生豌豆泛基因組,解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構,為揭示豌豆起源馴化,以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
新疆農科院首次發現兩種耐高輻射菌
來自我國新疆的科學家在世界上首次發現并分離出一種耐高輻射的真菌和一種放線菌,地球微生物家族中又多了兩種耐高輻射的成員。 “在一般的情況下,人在5戈瑞(輻射強度的計量單位)的輻射下只能存活1小時(廣島和長崎原子彈爆炸的輻射劑量即相當于10戈瑞);普通細菌在2000—5000戈瑞的輻射下也會全
科學家構建鷹嘴豆屬超級泛基因組
鷹嘴豆是世界第三大豆類作物,具有重要的經濟價值和營養價值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有獨特的生態價值。但鷹嘴豆的遺傳背景相對狹窄、抵抗生物或非生物脅迫的能力不足,限制了它的育種改良。 5月29日,華大生命科學研究院聯合國際半干旱熱帶作物研究中心、西澳大學、莫道克大學等單位的研究成果發表于《自
我國科學家首提“人類泛基因組”
人類基因組存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因 經過不懈研究和攻關,我國科研人員在人類基因組研究中獲得新的重大進展――發現人類基因組中存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因。科研人員還首次提出了“人類泛基因組”的概念。 由深圳華大基因研究院領銜,華南理工大學參與的研
科學家構建鷹嘴豆屬超級泛基因組
鷹嘴豆是世界第三大豆類作物,具有重要的經濟價值和營養價值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有獨特的生態價值。但鷹嘴豆的遺傳背景相對狹窄、抵抗生物或非生物脅迫的能力不足,限制了它的育種改良。5月29日,華大生命科學研究院聯合國際半干旱熱帶作物研究中心、西澳大學、莫道克大學等單位的研究成果發表于《自然—遺傳
我國牽頭完成高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析
9月22日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位,成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜,構建了栽培和野生豌豆泛基因組,解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構,為揭示豌豆起源馴化,以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支
水稻泛基因組研究方面取得突破性進展
近日,廣東省農業科學院水稻研究所分子育種團隊在水稻泛基因組研究方面取得突破性進展。相關研究發表于基因組學研究知名雜志Genome Biology。該論文第一單位為廣東省農業科學院水稻研究所,王健博士為第一作者,楊武副研究員為共同第一作者,胡海飛博士和趙均良副研究員為通訊作者,澳大利亞莫道克大學教
小麥泛基因組研究揭示我國重大品種演替規律
中國農業科學院作物科學研究所小麥基因挖掘與利用創新團隊聯合國內外科研院校,在基因組水平全面展示了20世紀50年代以來中國小麥育種歷史,揭示了不同層次的結構變異對小麥適應性和育種的影響,為全球種質資源的整合和利用,未來小麥智能設計育種提供了重要基因組支撐以及新的視角和策略。相關研究成果以研究長文的形式
研究指出基因組學引領生物育種變革
記者從近日舉行的第五屆國際農業基因組會議暨深圳國際食品谷研討會上獲悉,現代農業研究已邁入生物組學大數據時代,特別是基因組學及其衍生技術在生物育種中發揮著重要的引領作用。 基因組學是對生物體所有基因進行集體表征、定量研究及不同基因組比較研究的一門交叉生物學學科。基因組學主要研究基因組的結構、功能
我科學家揭示番茄進化線路-為培育美味番茄提供新工具
近日,中國農科院蔬菜花卉所研究員、深圳農業基因組所副所長黃三文領導的研究團隊,通過對世界各地的360份番茄種質進行重測序分析,構建了完整的番茄遺傳變異組圖譜,為培育更加美味的番茄提供了新的工具。其最新研究成果于北京時間10月14日凌晨以長篇論文在線發表于《自然·遺傳學》(Nature Genet
農科院團隊揭示小麥重大品種基因組演變規律
近日,中國農業科學院作物科學研究所(以下簡稱作物所)小麥基因資源發掘與利用創新團隊揭示了過去70年我國小麥育成品種基因組重塑和優化的過程,發現小麥3個亞基因組間存在顯著的育種選擇非對稱性,提出基于跨著絲粒區形成的大的單倍型區段優劣評估品種(品系)育種價值的策略。相關研究成果在線發表在《分子植物
我國科學家參與番茄全基因組研究獲重大進展
由來自中國、美國、荷蘭、以色列等14個國家的300多位科學家組成的“番茄基因組研究國際協作組”,歷時8年多的艱苦努力,于近日完成了對栽培番茄全基因組的精細序列分析。今天,國際權威學術期刊《自然》以封面文章發表了這項重大科學成果。 番茄是研究果實發育的經典模式植物,我國科學家在這項國際番茄基
科技驅動蔬菜品種換代升級
? 李君明和專家們在黃瓜大棚 ? 辣椒新品種 ? 番茄新品種■本報記者 胡璇子 “秧子吊得這么整齊!”“管理得真好!”“通常來說,已經到易發生病害的時間了,但是現在一點看不到……” 5月初,山東省壽光市趙旺鋪村番茄種植戶張天祥家的大棚中,一串串番茄圓潤飽