高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。相關研究成果以長文的形式在線發表在《自然遺傳學》（Nature Genetics）雜志上。 豌豆是糧菜飼綠肥兼用的北方一年生和南方越年生冷季食用豆類作物，具有豐富的營養價值和顯著的生態優勢，在世界范圍內廣泛種植。自孟德爾發現遺傳定律以來，豌豆作為遺傳研究的模式植物，受到了學界和公眾的廣泛關注。然而，豌豆基因組非常大，組裝起來相當復雜，豌豆高質量基因組精細物理圖譜一直未能完成，嚴重阻礙了豌豆的理論和應用研究。 該研究團隊利用中國豌豆主栽品種“中豌6號”，基于多種先進測序技術，整合優化多種組裝策略，提供了顯著改進的豌豆高質量精細物......閱讀全文
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
我國牽頭完成高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支
首個野生大豆高質量參考基因組被解析
近日，香港中文大學林漢明教授團隊及華大基因等多家國內外機構合作完成了全球首個野生大豆高質量參考基因組解析，該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優化栽培大豆品種提供了重要工具。相關研究成果近日在線發表于《自然-通訊》。圖片來源于網絡 基因組信息是當前作物改良計劃的重要基礎。過往大豆基因組研究主要
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
高質量沙漠蝗蟲基因組測序完成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481733.shtm 近日，美國農業部農業研究院（ARS）的一項研究公布了第一個高質量沙漠蝗蟲基因組。這項研究是ARS的Ag100Pest計劃的一部分。該計劃旨在破譯對農業和環境產生影響的100種害蟲
抗根腫病蕪菁高質量參考基因組發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/478019.shtm 蕓苔屬植株在長期對抗根腫病菌的過程中CR基因的進化模型?? 課題組供圖 近日，華中農業大學教授張椿雨、教授楊慶勇團隊與沈陽農業大學教授樸鐘云團隊合作，發布了抗根腫病的歐
中國樹鼩全基因組解析完成
中科院昆明動物研究所張云研究員課題組與深圳華大基因研究院合作，解析了新型實驗動物中國樹鼩的全基因組，系統評估了樹鼩作為藥物研發實驗動物的特征和優勢。研究近日發表于《公共科學圖書館·綜合》。 研究不僅為中國樹鼩用于新藥研發的藥效學、藥理學和毒理學評價提供了系統的基礎信息數據和科學依據，而且揭示了
破譯對蝦基因組－獲國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜
由中國科學院海洋研究所相建海和李富花研究組主導的研究團隊，與國內外多家單位共同合作，歷時十年成功破譯凡納濱對蝦基因組，獲得國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜，研究成果于1月21日在《自然-通訊》（Nature communications）在線發表，為甲殼動物研究及對蝦基因組育種和分子改良提供了重
我國完成世界首個番茄超泛基因組構建
4月6日，由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭，聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位，在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。這是新疆農科院首次以第一單位在《自然·遺傳》發表論文。 新疆農科院余慶輝
香港中文大學等解析全球首個野生大豆高質量參考基因組
香港中文大學林漢明團隊和華大基因等多家機構合作，完成全球首個野生大豆高質量參考基因組解析。該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優化栽培大豆品種提供了重要依據。相關成果近日在線發表于《自然—通訊》。 “大豆的基因組含有大量重復區，組裝時困難重重。我們整合了幾種最新測序方法產生大量數據，才最終把問
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
首個石榴端粒到端粒參考基因組圖完成
近日，中國農業科學院鄭州果樹研究所（以下簡稱鄭果所）特色漿果與干果種質改良課題組在國際期刊《植物生物技術雜志》（Plant Biotechnology Journal）上發表研究論文，該研究組裝了首個石榴端粒到端粒（T2T）參考基因組圖，揭示了控制石榴果皮顏色和籽粒硬度等重要經濟性狀形成的遺傳機
我國學者攻破高質量角苔參考基因組
苔蘚類包括苔、蘚和角苔三大分支，是現存最早的陸生植物，代表了植物演化過程中從水生到陸生的過渡類群。長久以來關于早期陸地植物的起源與植物登陸一直存在諸多爭論和未解之謎。近年來，人們利用組學數據將早期陸地植物的系統位置爭論聚焦到了角苔類上。角苔類以其難解的系統位置、衍生與原始兼具的形態特征、與細菌和
PacBio構建目前最高質量的植物基因組參考序列
來自中科院遺傳與發育生物學研究所，四川農業大學的研究人員發表了題為“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，對一個秈稻基因組蜀恢498（R498）進行PacBio單分子測序，結合遺傳圖譜和
水生所發布高質量AB品系斑馬魚參考基因組
斑馬魚是生命科學、健康科學和環境科學等研究領域的重要模式生物之一。常見的兩種實驗室斑馬魚品系分別是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑馬魚被國內外很多實驗室作為研究對象。然而，卻缺乏一個高質量的AB品系斑馬魚參考基因組。 由于不同品系斑馬魚來源不同，各品系之間存在著大量基因序列上的
我科學家完成棘球絳蟲基因組解析
包蟲病威脅著我國約5000萬人口，其元兇――細粒棘球絳蟲的遺傳密碼最近被科學家“破譯”。昨天，記者從國家人類基因組南方研究中心獲悉，經過中外科學家長達三年的協同努力，解析出了細粒棘球絳蟲的基因組合轉錄組，英國《自然?遺傳學》雜志前天在線發布了這一成果。 由棘球絳蟲所引起的包蟲病是人和家畜
《自然》發表中國人泛基因組參考圖譜，26家單位聯合研究
近日，復旦大學、西安交大、中國醫學科學院等26家單位聯合發布了中國人群泛基因組聯盟（CPC）一期研究進展。6月14日，相關成果以《基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜》為題發表于《自然》（Nature）主刊。這是我國學者領導的人群基因組研究首次發表在《自然》主刊。這項研究初步構建了我國人群的泛基因
人類泛基因組首個草圖發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500424.shtm5月10日，《自然》發表了人類泛基因組參考的初稿，這一集合旨在最終代表整個人類物種中盡可能多的DNA序列。該項研究組合的人群遺傳物質來自47個遺傳多樣化個體，為人類基因組提供了更完整的
Frontiers－in－Genetics首個非性逆轉黃鱔高質量基因組參考圖譜
中國水產科學研究院長江水產研究所水產養殖與遺傳育種研究室科研人員在國際期刊《遺傳學前沿》（Frontiers in Genetics）發表題為《Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Non-Sex-Reversal Fem
中科院等完成橡膠草基因組序列解析
中國科學院遺傳與發育生物學研究所李家洋研究組與中國農業科學院、中國熱帶農業科學院等合作，在橡膠草基因組序列解析方面取得重要進展，標志著以橡膠草作為模式植物進行天然橡膠合成研究進入后基因組時代。研究成果近日在線發表在權威學術期刊《國家科學評論》（National Science Review）雜
具有獨特濃郁風味的中國水蜜桃高質量參考基因組發布
近日，北京市農林科學院在《自然·通訊》上發表了研究論文，公布了具有獨特濃郁風味的中國水蜜桃高質量參考基因組，闡釋了以水蜜桃為代表的優質資源對于全球桃現代育成品種遺傳貢獻；揭示了桃風味改良過程中，東、西方對甜度趨同選擇和酸度分化選擇的模式，解析了重要基因在果實有機酸和可溶性糖積累中的功能。該研究提
人類泛基因組首張草圖發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515798.shtm （圖片來源：Gideon MendelCorbis via Getty）5月10日，《自然》雜志發表了人類泛基因組參考的“初稿”，在3篇論文的合集中，人類泛基因組參考聯盟（H
我科學家主導完成全球首個梨基因組解析
由南京農業大學梨工程技術研究中心、深圳華大基因研究院、浙江省農業科學院等多家科研院所合作完成的碭山酥梨基因組研究成果于 11月 13日在《基因組研究》(Genome Research)上發表。全球首個梨基因組的成功解析及其基因組層面的功能研究將為培育高產、優質和抗病的新品種梨奠定堅實的遺
補全中國人“拼圖”－《自然》發表中國人群泛基因組參考圖譜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502872.shtm6月14日，《自然》期刊在線發表了西安交通大學、復旦大學、中國醫學科學院等26家單位聯合發布的中國人泛基因組聯盟（CPC）一期研究進展——《基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜》。人
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因組圖譜繪就
亞洲栽培稻馴化歷史可追溯至一萬年前的普通野生稻。 面對全球人口增長和氣候變化加劇的雙重壓力，如何將野生稻歷經萬年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”已成為重要研究課題。然而，傳統依賴單一參考基因組的研究模式譬如以管窺天，僅能捕捉水稻遺傳多樣性的冰山一角。
小小角苔－會“借”基因——首個高質量角苔參考基因組發布
中國科學院植物研究所研究員陳之端團隊通過一系列精細設計的去污染流程，得到了119 Mb的芽胞角苔基因組組裝結果，獲得了第一個高質量的角苔參考基因組，填補了苔蘚類植物相關研究的空白。相關成果2月10日作為封面文章在線發表于國際學術期刊《自然—植物》（Nature Plants）上。圖片來源于網絡
科學家首次發布銀鯧高質量染色體水平參考基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日，中國科學院海洋研究所在銀鯧基因組學研究方面取得新進展，首次發布了我國重要名貴經濟魚類——銀鯧的高質量染色體水平參考基因組，相關研究成果在《自然》子刊《科學數據》在線發表。銀鯧隸屬
科學家構建出目前最高質量的植物基因組參考序列
隨著PacBio單分子實時（SMRT）測序技術的發展，利用它已能夠獨立完成高質量基因組草圖的組裝。然而，這些草圖序列中仍然存在多種錯誤，比如序列中會包含有很多嵌合體（即不同位置的序列連接到了一起）或是組裝質量比較差的區域等，特別是重復序列區域有的沒有組裝出來，有的組裝出來多個序列，而且這些錯誤通
我國科學家發布海帶高質量染色體水平參考基因組
近日，中國科學院海洋研究所海藻種質庫團隊在大型海藻基因組學研究方面取得重要突破，成功構建了海帶的高質量染色體水平參考基因組。該成果發表在國際期刊《科學數據》。這是該團隊在海洋經濟藻類基因組研究領域取得的又一重要成果，為海帶的遺傳改良和基因組學研究提供了關鍵資源。海帶孤雌生殖孢子體基因組組裝 海洋
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東