研究提出空間細胞類型組分解析新算法
中國科學院動物研究所翟巍巍/馬亮團隊在《自然-通訊》(Nature Communications)上,發表了題為SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatial transcriptomics的研究論文,提出了新穎的基于空間轉錄組數據解析空間細胞類型組分的算法模型,并命名為SONAR。 生物體由各種類型的細胞組成。生物系統的結構功能和動態變化很大程度取決于細胞的空間分布,揭示和利用其規律對探索生命現象和探究疾病進化機制具有重要意義。當前,空間轉錄組測序(spatial transcriptomics)提供了強有力的手段,可在保留空間信息的同時測量組織中的基因表達,從而為解析細胞的空間分布和功能提供了可能。由于受到空間分辨率的限制,此類技術的每個空間位點(spot)上的基因表達通常來自于多......閱讀全文
新算法提升基因融合檢測效率
近日,華大基因公開一種基因融合檢測算法SOAPfuse。模擬數據和真實驗證數據的綜合測評表明,該算法具有準確率高、敏感性強、精度高、資源消耗少等優點。該算法主要采用局部窮舉算法和一系列精細的過濾策略,從而對基因融合進行快速、精確的檢測。相關研究成果在《基因組生物學》(Genome
擁有-“嗅覺”-的新神經算法芯片介紹
前言: 人類除視覺、聽覺之外,在嗅覺研究上有新突破,帶來新想象空間和應用空間,人類對大腦的認知以及類腦芯片、AI芯片又跨上新臺階,未來的芯片發展之路又有可能另辟蹊徑。類似人類大腦的神經擬態芯片神經擬態計算一直被寄予厚望。就算摩爾定律終結,它仍能繼續帶領信息時代向前。神經擬態計算可以大幅度提升
新算法讓監控復雜系統變簡單
在一個復雜系統中,如包含了2萬個互相聯系的基因的人類基因組,要想一次監控整個系統幾乎是不可能的。據物理學家組織網近日報道,來自美國東北大學、麻省理工大學等單位的研究人員開發出一種新算法,能識別出復雜系統的子單位或必要結點,使監控大型復雜系統成為可能。相關論文發表在最近出版
新算法TarCA用于揭示早期細胞命運決定
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518091.shtm近日,中山大學生命科學學院教授賀雄雷團隊基于細胞譜系追蹤技術構建的發育細胞譜系樹,結合群體遺傳學的經典溯祖理論思想,建立了一種估計祖先細胞群體大小的統計方法TarCA,以此來研究胚胎發
新算法可模擬人腦整體神經電路
下一代超級計算機利用新算法,可模擬人腦整體神經電路。圖片來自網絡 科技日報東京3月28日電 (記者陳超)日本理化學研究所日前宣布,他們的一個國際聯合研究小組成功開發出模擬人腦整體神經電路的算法,可在下一代超級計算機上應用。新算法不僅節省內存,也能大幅提高現有超級計算機上的腦模擬速度。 神經
新算法將物理問題轉化為量子語言
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515050.shtm科技日報訊?(記者劉霞)谷歌公司科學家設計出一種算法,可將復雜的物理問題轉化為量子物理學的語言,這可能使量子計算機變得更有用。相關論文發表于最近的《物理評論X》雜志。 新成果
國際團隊提出一種新量子算法
一個國際研究小組近日在美國《科學進展》雜志上介紹,他們設計了一種新型量子算法,有望推動量子計算在物理、化學等多個領域的應用。 據介紹,在復雜量子系統中存在能量較小的基態,還有能量較高的激發態。過去的量子算法只能對基態問題進行有效且精確求解。針對這個問題,英國布里斯托爾大學、美國微軟公司、中國中
預測小分子抗癌活性有了新算法
記者從中科院昆明動物研究所獲悉,該所李功華博士在研究員黃京飛的指導下,開發了一個新的基于分子藥效團的小分子比對算法,并成功應用于預測小分子的抗癌活性。近日,該研究發表在頂級計算生物學雜志《生物信息學》上。 據李功華介紹,開發新的抗癌藥物是科學界和醫學界的熱點和難點。直接采用實驗的方法篩選抗
新算法可大幅提高圖像邊界識別效率
美國麻省理工學院的研究人員日前稱,他們開發出了一種新的圖像分割算法,可將傳統分割算法的效率提高上萬倍。該研究將有助于改善醫療成像系統的識別精度并實現對特定3D物體的連續跟蹤識別。 當我們推開窗戶向外張望時,馬上就能看到汽車、人行道、行人或者遠處高大的建筑。這在計算機領域中被稱為視覺識別,對人類
新計算機算法可辨別聲音環境方向
假如把你蒙住眼睛放在一個陌生房間里,你打個響指聽聽動靜,能否聽出房間是什么形狀格局?蝙蝠和海豚能用這種回聲定位法在環境中辨別方向,有些盲人也能做到這一點。而據物理學家組織網6月18日報道,瑞士聯邦理工學院視聽通訊實驗室(LCAV)科學家設計出一種計算機算法,通過分析來自4個麥克的聲音,同樣能完成
AI新算法測壽命-或能助人類更長壽
據英國每日郵報報道,一項新的研究表明,利用AI技術可以檢測人的細胞年齡,并依此制定出個性化醫療方案,從而幫助人們實現長壽的愿望。 據悉,科學家開發的這種AI算法被稱為“Aging.AI”,根據人們的血液樣本可以計算出生理年齡,并驗證某些生活方式的改變和藥物是否能提高人們長壽和健康的幾率。目
新算法比較分析可搜索癌癥基因突變
桑福德伯翰醫學研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承擔了前所未有的對一個新興算法類別的比較分析,該算法通過聚焦內部基因結構,在癌癥數據庫中挖掘遺傳信息(即亞基因像素算法),這與專注于基因視其為單個單元的經典方法形成
機器學習算法助力新模型實現羊肉精準溯源
近日,中國農業科學院農產品加工研究所肉品科學與營養工程創新團隊將非靶向代謝組學與機器學習方法相結合,成功構建了羊肉產地精準判別模型,為羊肉產地精準溯源提供了新方法。相關研究成果發表于《食品化學X》(Food Chemistry: X)。受肉羊品種和飼養環境影響,羊肉品質具有鮮明的地域特征,因此地理標
機器學習新算法加速藥物研發進程
據物理學家組織網2月6日報道,加拿大多倫多大學的科研人員最新研制出了一套新的機器學習算法,能生成微小蛋白質分子的3D結構。研究人員指出,新算法有望徹底變革藥物的研發進程以及我們對生命的理解。 研發人員之一、多倫多大學的博士生阿里·普勒賈尼解釋稱,確定蛋白質分子的3D原子結構對于理解它們的工作原
研究提出空間細胞類型組分解析新算法
中國科學院動物研究所翟巍巍/馬亮團隊在《自然-通訊》(Nature Communications)上,發表了題為SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatia
空間細胞類型組分解析新算法被提出!
8月7日,中國科學院動物研究所翟巍巍/馬亮團隊在《自然-通訊》(Nature Communications)上,發表了題為SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for s
AI新算法測壽命-或能助人類更長壽
據英國每日郵報報道,一項新的研究表明,利用AI技術可以檢測人的細胞年齡,并依此制定出個性化醫療方案,從而幫助人們實現長壽的愿望。 據悉,科學家開發的這種AI算法被稱為“Aging.AI”,根據人們的血液樣本可以計算出生理年齡,并驗證某些生活方式的改變和藥物是否能提高人們長壽和健康的幾率。目
藥物動力學模擬新算法,將減少新冠藥物開發時間
英國《自然》雜志近日在線發表一篇重磅研究。在美國華盛頓大學蛋白質設計研究所所長、2021年生命科學突破獎獲得者戴維·貝克的帶領下,研究人員創造了一種生產蛋白質藥物的強大新方法。利用計算機,他們設計了可以針對體內重要蛋白質(如胰島素受體,以及病毒的表面蛋白)的小分子結合蛋白。這一進展或有助于開發應對諸
新算法為組織發育和疾病研究提供重要支撐
近日,西南華大生命科學研究院科研團隊成功開發了推斷細胞時空分化軌跡的新算法SpaTrack,該算法可充分整合細胞的轉錄組和空間信息,構建細胞分化的動態軌跡,為揭示組織發育、器官再生和疾病進展的動態研究提供了有效的方法支持與重要見解。相關成果在線發表于Cell旗下子刊《細胞系統》。空間坐標和取樣時間可
我國科學家提出DNA數字存儲糾錯新算法
近日,中國農業科學院深圳農業基因組研究所農業基因組學技術研發與應用創新團隊提出DNA數字存儲糾錯新算法,成功突破了冗余對糾錯能力的限制,將大幅提升DNA存儲糾錯能力。相關研究成果發表在《國家科學評論》(National Science Review)上。 DNA數字存儲以其存儲密度高、存儲壽命
中科院聲學所發現新的頻率追蹤算法
近期,中國科學院聲學研究所噪聲與振動重點實驗室研究員楊軍、孫紅靈領導的有源降噪團隊提出一種新的基于并型陷波器的多頻估計算法,該算法復雜度低、估計結果準確,可以有效地追蹤多個變化的噪聲頻率。相關研究成果已在線發表于國際學術期刊《信號處理》。 噪聲通常指不需要的聲音,它對人類身心均會構成損害。常規
異交植物基因高效定位新算法工具開發成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519329.shtm近日,中國農業科學院蔬菜花卉研究所蔬菜分子設計育種創新團隊聯合馬鈴薯遺傳育種與栽培創新團隊,通過解析異交(異花授粉)植物雜交1代分離群體的遺傳特點,開發了一套新算法工具OcBSA,該工
新算法突破實現藥物靶標親合力快速精準預測
海南大學藥學院教授羅海彬團隊聯合中山大學藥學院副教授李哲團隊提出了一種基于組合結構的相對結合自由能?(CS-FEP) 的藥物設計新方法,實現小分子藥物與生物大分子靶標間的結合自由能(以下簡稱藥物-靶標親合力)的快速精準預測,取得藥物設計關鍵技術的突破,實現自由能微擾(FEP)在藥物設計新方法領域的國
新AI算法“望舌診病”成功率達98%
科技日報北京8月15日電?(記者劉霞)“望舌診病”是最具中醫特色的診斷方法之一,已有2000多年歷史。在一項最新研究中,該方法獲得了人工智能(AI)技術的加持。土耳其和澳大利亞研究人員成功開發出一種新型成像系統,其算法可通過分析患者舌頭的顏色,預測他們所患疾病,成功率高達98%。相關論文發表于新一期
劉小樂教授:CRISPR高通量篩選的新算法
高通量的CRISPR篩選,已在功能基因組學研究中顯示出巨大的潛力。12月16日,華人女學者、哈佛大學公共衛生學院Dana-Farber癌癥研究所的劉小樂教授,在國際著名學術期刊《Genome Biology》發表題為“Quality control, modeling, and visualiz
新AI算法“望舌診病”成功率達98%
“望舌診病”是最具中醫特色的診斷方法之一,已有2000多年歷史。在一項最新研究中,該方法獲得了人工智能(AI)技術的加持。土耳其和澳大利亞研究人員成功開發出一種新型成像系統,其算法可通過分析患者舌頭的顏色,預測他們所患疾病,成功率高達98%。相關論文發表于新一期《技術》雜志。研究人員使用5260張圖
抑制瞬時射頻干擾新算法助力脈沖星觀測
脈沖星是一種周期性發射微弱脈沖信號的中子星,長期以來都是天文和物理的前沿研究領域,涉及引力波探測、精確驗證廣義相對論、限制極端物理條件下的物態方程、高精度時空基準建立等重要問題。但隨著近及時年來通訊及數字技術快速發展,人為的射頻信號對來自遙遠深空的天文信號造成嚴重干擾,導致射電天文“干凈”的觀測
Science:新算法有望加快艾滋病疫苗研發
美國研究人員9日在學術期刊《科學》上報告說,他們開發出一種新計算方法,可以更快地發現抵御艾滋病病毒的強力抗體,這一成果有望加快艾滋病疫苗研發。 開發艾滋病疫苗是全球面臨的重要任務和挑戰。盡管艾滋病病毒已發現30多年,但由于其多變和多樣性,迄今還沒有一種針對該病的疫苗能離開實驗室并大量應用。
新算法突破實現藥物靶標親合力快速精準預測
海南大學藥學院教授羅海彬團隊聯合中山大學藥學院副教授李哲團隊提出了一種基于組合結構的相對結合自由能 (CS-FEP) 的藥物設計新方法,實現小分子藥物與生物大分子靶標間的結合自由能(以下簡稱藥物-靶標親合力)的快速精準預測,取得藥物設計關鍵技術的突破,實現自由能微擾(FEP)在藥物設計新方法領域
新算法將更好組裝DNA序列-檢測特殊遺傳突變
刊登在國際雜志Bioinformatics上的一項研究論文中,來自楊百翰大學(Brigham Young University)的研究人員開發了一種新方法來進行人類基因組的裝配,而且這或許可以幫助鑒別引發常見遺傳障礙的新型突變。 這種新方法依賴于一種新算法,其可以非常敏感地檢測DNA序列的特異