中科院動物所攜手華大等機構構建全球首份多器官衰老時空圖譜
11月5日凌晨，中國科學院動物研究所攜手華大生命科學研究院、北京基因組研究所（國家生物信息中心），在全球頂尖學術期刊 《細胞》（Cell）上發表了最新研究成果，利用華大自主研發的“超廣角百億像素生命照相機”——時空組學技術，構建了全球首份多器官衰老時空圖譜，增強了對衰老生物學機制的理解，找到了可用于衰老預警和評估的新型生物學標志物，并為進一步探索衰老的干預策略奠定了理論基礎。 研究中，研究團隊利用時空組學技術Stereo-seq對不同年齡小鼠的心臟、肝臟、脾臟、肺、小腸等9個器官進行了分析，最終形成了一張包含72個細胞類型的多器官衰老時空圖譜。這些圖譜不僅能“看到”不同細胞內基因的表達情況，還能精確定位每個細胞的位置，如同一部生命衰老的紀錄片，展現了不同器官在不同年齡段的“模樣”。 研究團隊表示，通過多器官衰老時空圖譜，研究人員可以如同“拍電影”般，清晰地記錄下身體各個器官衰老的微觀過程。 通過深入研究，研究團隊提出了......閱讀全文
小鼠肺發育時空分子圖譜繪制成功
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員彭廣敦團隊同合作者運用高通量空間轉錄組技術，繪制出小鼠胚胎期主要階段到出生后P0天的時空分子圖譜，從而揭示了肺發育過程中的復雜調控機制。相關成果發表于《科學通報》（Science Bulletin）。哺乳動物肺的功能發育是一個復雜的過程，它依賴于多種細胞
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前，由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
人腦多區域時空發育轉錄組圖譜獲解析
科學家通過單細胞和時空轉錄組研究，首次解析迄今為止跨時間點最廣（GW6-GW23）、面積最大（最大4cm x 3cm）的人腦多區域時空發育轉錄組圖譜，為解碼人腦發育及區域特化研究提供了新見解。日前，相關研究成果發表在《細胞》上。 腦是人類最復雜和神秘的器官。解剖學上，腦可以被劃分為不同的區域，
科學家解析人腦發育時空圖譜及規律
作為人類最復雜的器官，腦在解剖學上被劃分為不同的區域，包括端腦【主要由新皮層（Cor）構成】、間腦（Dien）、中腦（Mid）和小腦（Cere）等。這些不同腦區具有特殊的輸入輸出連接，發揮不同的功能。在人腦發育過程中，通過內在基因程序產生了復雜的細胞類型。在這些細胞類型中，有些已有明確的特征，但
Nature公布大麥基因組圖譜
大麥是世界上最重要的糧食作物之一，17日Nature公布了目前為止最完善的大麥基因組測序圖譜。這項由美國農業部主導的大工程，在德國、日本、芬蘭、澳大利亞、英國、美國和中國科學家們的共同努力下，歷經六年終于取得了重大進展。大麥基因組圖譜將成為人們提高大麥產量、增強大麥抗蟲抗病能力、增加大麥營養價值
我國科學家繪制出脊髓損傷時空動態圖譜
7月18日，《發育細胞》（Developmental Cell）在線發表了中國科學院上海有機化學研究所研究員方燕姍團隊、中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員彭廣敦團隊和暨南大學副研究員李昂團隊合作最新成果。他們成功繪制出脊髓損傷后原位基因表達和細胞互作的時空動態圖譜，為脊髓損傷的治療提供了新視角
科學家成功繪制鼠腦出血后時空分子圖譜
腦出血，指非外傷引起的大腦血管破裂造成血液流出，是病死率最高的腦血管疾病，大多數患者無法完全恢復功能獨立。由于腦出血的病理機制復雜且缺乏精準干預靶點，至今尚無特異性治療手段。記者從華大生命科學研究院了解到，近日，該院聯合鄭州大學、瑞典卡羅林斯卡學院及哥德堡大學，利用時空組學技術Stereo-seq，
高清肝臟時空圖譜出爐！揭示肝再生機制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521203.shtm在過度熬夜、吸煙喝酒、高糖高鹽飲食等不良習慣日漸常態化的現代生活中，肝臟疾病也呈現出日益嚴峻的態勢。作為人體的“化工廠”，肝臟除了解毒功能外，還具備代謝、合成、消化、免疫等多種功能。肝
我研究團隊主導構建小鼠肝臟高精度時空圖譜
4月16日，深圳華大生命科學研究院研究團隊利用自研時空組學技術和單細胞轉錄組測序技術，構建出小鼠肝臟高精度時空圖譜。這一圖譜，分別揭示小鼠肝臟穩態的空間分子特征，以及肝部分切除、膽汁淤積損傷與修復過程中的復雜分子機制。兩項研究以不同角度解析了肝臟損傷與再生復雜機制，有望為肝臟疾病治療、肝臟再生與移植
我國科學家繪制出脊髓損傷時空動態圖譜
7月18日，《發育細胞》（Developmental Cell）在線發表了中國科學院上海有機化學研究所研究員方燕姍團隊、中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員彭廣敦團隊和暨南大學副研究員李昂團隊合作最新成果。他們成功繪制出脊髓損傷后原位基因表達和細胞互作的時空動態圖譜，為脊髓損傷的治療提供了新
基因組圖譜的方法和意義
中文名稱基因組圖譜英文名稱genomic map定 義展示一種生物全基因組結構的圖譜。按建立圖譜的研究目的方法和精細程度，可以有不同的形式，包括以遺傳學方法建立的遺傳連鎖圖譜，按距離繪出基因位置分布的物理圖譜，經測定核酸序列建立的核苷酸序列圖譜，以及標記出可表達序列的轉錄圖譜等。應用學科生物化學與
首個家雞基因組圖譜繪制完成
西南大學教授徐洛浩課題組以中國特有家雞品系胡須雞為材料，在國際上率先繪制出首個家雞全基因組圖譜。2月13日，相關研究成果以《家雞基因組完成圖的演化分析》為題，發表在美國《國家科學院院刊》上。這是繼去年人類基因組完成圖公布以來，首個發表的脊椎動物基因組完成圖，也是基因組完成圖譜繪制技術首次在經濟動物中
揭秘：帝王蟹的基因組圖譜
科學家成功獲得高質量帝王蟹基因組圖譜 帝王蟹 唐伯平供圖 帝王蟹基因組染色體圖譜 唐伯平供圖 帝王蟹和其他泛甲殼動物的系統演化關系 唐伯平供圖 近日，《分子生態資源》發表了首個歪尾類螃蟹的高質量基因組圖譜，即一種重要經濟蟹類藍帝王蟹（Paralithodes platypus）的基因組
首次繪制小麥表觀基因組圖譜
最近，英國利物浦大學的科學家們，對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化，進行了首次全基因組范圍的調查，這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀：權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽，將自己附著在DNA上
腦也能再生？《科學》封面現首個腦再生時空圖譜
2022年9月2日，華大生命科學研究院主導完成的首個蠑螈腦再生時空圖譜以背靠背封面文章的形式發表于國際頂級學術期刊《科學》，這也是全球首個腦再生時空圖譜。 研究團隊基于華大時空組學Stereo-seq技術，系統解析并比較了蠑螈腦發育和再生過程，找到了蠑螈腦再生過程中的關鍵神經干細胞亞群，描繪了此
首個棉花纖維起始發育單細胞時空組學圖譜發布
近日，中國農業科學院棉花研究所鄉村振興科技創新團隊牽頭構建了首個結合單細胞轉錄組、空間轉錄組及空間代謝組的棉花纖維起始發育圖譜。利用該圖譜可以識別關鍵基因的表達模式及其與代謝途徑的關系，深入剖析纖維發育過程中的核心調控機制。相關研究成果發表在《自然通訊（Nature Communications）》
“透視”肝臟：中國科學家構建小鼠肝臟高精度時空圖譜
·首次成功構建了小鼠肝臟的高精度時空圖譜，探索了肝臟的空間分子特征與損傷修復中的分子機制，為未來肝臟疾病的治療提供了新思路。在所有的器官中，肝臟可能是最“神秘”的一個。它不僅是最大的實體器官，包含最多的血液，具備器官中最強的再生能力，還擔負著代謝、合成、消化、免疫等多種功能。古代人曾認為肝代表著欲望
Nature：中科院團隊合作獲得小鼠胚胎早期時空轉錄圖譜
在小鼠胚胎的植入后發育期間，早期外胚層中的內細胞團的后代從幼稚狀態轉變為多能狀態。同時，形成胚層并指定細胞譜系，從而建立胚胎發生的藍圖。命運映射和譜系分析研究表明，胚胎層不同區域的細胞在原腸胚形成期間獲得位置特異性細胞命運。在基本身體計劃形成之前，細胞命運的區域化-其機制有助于理解胚胎編程和基于
玉米基因組更詳細圖譜出爐
美國研究人員12日在《自然》雜志網絡版上發表論文稱，他們利用新一代測序技術對玉米自交系B73進行測序，得到了新的、更詳細的基因組圖譜。研究顯示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因組差異明顯。這意味著在全球氣候環境變化不斷加劇的情況下，玉米仍有巨大的發展空間。 玉米是生物學研究中的重要
玉米基因組更詳細圖譜出爐
美國研究人員12日在《自然》雜志網絡版上發表論文稱，他們利用新一代測序技術對玉米自交系B73進行測序，得到了新的、更詳細的基因組圖譜。研究顯示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因組差異明顯。這意味著在全球氣候環境變化不斷加劇的情況下，玉米仍有巨大的發展空間。 玉米是生物學研究中的重要
基因組物理圖譜的主要構架途徑
基因組物理圖譜的構建不需要經過減數分裂的世代群體，可直接利用DNA分子分析，主要有以下三種構建途徑：限制性酶圖譜。利用限制性內切酶構建圖譜，對于DNA分子長度在50kb以下的片段，一般沒有什么困難。而對于大于50kb的DNA分子，可選用稀有切點的內切酶酶切DNA。（1）用識別較多核苷酸的內切酶，如N
鐵樹“開花”：蘇鐵喜獲完整基因組圖譜
蘇鐵基因組圖譜研究由來自22個科研機構的65位科學家聯合完成。??蘇鐵目系統發育樹支持現存蘇鐵是在經歷大量滅絕以后，幾次輻射演化的后代。如今蘇鐵有2科10屬。（劉陽供圖）??也許你不熟悉蘇鐵類植物，但你一定聽說過“鐵樹開花”這個成語，比喻事情很難實現。相傳因受蘇東坡青睞，鐵樹得名“蘇鐵”。作為現存最
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日，韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜，并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之，由陸生向水生演化，和陸生偶蹄動物如牛、豬等
老鼠基因組單體型圖譜出爐
美國的研究人員希望通過對15只常用于生物醫藥研究的小鼠的DNA進行研究來幫助科研人員確定出與環境疾病敏感性相關的基因。目前這些數據被存放在了基因變異數據目錄之下，即小鼠基因組單體型圖譜（將染色體分隔成許多小的片段），從而幫助研究人員找出小鼠中影響健康和疾病的基因和遺傳變異。這個單體型圖譜公布在7月2
Scientific－Reports：創建首個全面基因組圖譜
近日，澳大利亞加文醫學研究所的研究人揭示身體不同部位脂肪積聚所造成的傷害的驅動因素。他們的一項新研究比較了皮膚下的脂肪細胞和腹部內的有害脂肪，創建了第一個全面的基因組圖譜。該圖譜揭示了在細胞發育早期獨特的特征，不同類型的脂肪似乎“硬捆綁”（hard-wire）在一起。該研究發表于Scientif
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
全球首份！中科院攜手華大構建多器官衰老時空圖譜
中國科學院動物研究所攜手華大生命科學研究院、北京基因組研究所(國家生物信息中心)，于11月5日在全球頂尖學術期刊《細胞》(Cell)上發表了最新研究成果，該研究利用華大自主研發的“超廣角百億像素生命照相機”——時空組學技術，構建了全球首份多器官衰老時空圖譜。 研究中，研究團隊利用時空組學技術S
科學家建立首個人類肢體發育的單細胞時空圖譜
中山大學中山醫學院教授張宏波團隊與英國Sanger 研究所教授Sarah Teichmann團隊合作，研究建立了首個人類肢體發育的單細胞時空圖譜并解析關鍵調控機制。12月6日，相關成果在線發表于Nature。 “我們基于單細胞轉錄組學和空間轉錄組學技術建立的首個人類肢體發育單細胞圖譜，解析了從
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日，華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文，公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章