中國科學院動物所團隊綜述環形RNA藥物設計
環形 RNA（circular RNA,circRNA）是一類廣泛存在于真核細胞中的內源性非編碼 RNA 分子，在生物體發育過程中發揮著重要作用。其獨特的環狀結構使其免受外切酶降解，因此比線性 RNA 更加穩定。自 2010 年代初以來，circRNA 在 RNA 適配體、 guide RNA 等領域的應用受到了廣泛關注，近年來甚至被用于 SARS-CoV-2 疫苗的研發。隨著 circRNA 設計及體外和體內合成技術的不斷進步，其在大規模工程化生產中的潛力日益顯現，有望成為一種穩定且低免疫原性的 RNA 治療手段。2024 年 11 月 21 日，中國科學院動物研究所趙方慶團隊在 Nature Reviews Bioengineering 發表了題為 “Engineering circular RNA medicines” 的綜述文章。該綜述詳細總結了 circRNA 藥物的設計與開發，......閱讀全文
中國科學院動物所團隊綜述環形RNA藥物設計
環形 RNA（circular RNA,circRNA）是一類廣泛存在于真核細胞中的內源性非編碼 RNA 分子，在生物體發育過程中發揮著重要作用。其獨特的環狀結構使其免受外切酶降解，因此比線性 RNA 更加穩定。自 2010 年代初以來，circRNA 在 RNA 適配體、 guide RNA 等領
環形RNA獲新研究進展
9月18日，國際著名學術期刊《細胞》在線發表了中科院上海生命科學研究院計算生物學伙伴研究所楊力課題組和生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲課題組關于環形RNA研究的最新進展。該研究成果首次闡明了互補序列對外顯子來源環形RNA產生的調節機制，并進一步揭示了互補序列競爭性配對介導的可變環化調控，以全新的
RNA引物設計怎么設計
一般就是設計引物能夠跨越至少一個exon-exon junction的，就是引物在兩個exon的交界處，這樣pcr的時候就不會有DNA污染現在NCBI可以直接有引物設計，還可以選擇上述的設計方式或者可以通過找到cDNA序列然后自己在primer3上設計也可以
環形RNA與線性RNA定量比較分析新系統CLEAR發布
1月15日，國際學術期刊Genomics,Proteomics & Bioinformatics在線發表了中國科學院－德國馬普計算生物學伙伴研究所楊力研究組關于環形RNA研究的最新進展“CIRCexplorer3: A CLEAR Pipeline for Direct Comparison o
環形變壓器的設計計算
通過設計一臺50Hz石英燈用的電源變壓器， 其初級電壓U1=220V，次級電壓U2=11.8V，次級電流I2=16.7A，電壓調整率ΔU≤7%，來說明計算的方法和步驟。 1)計算變壓器次級功率P2 P2=I2U2=16.7×11.8=197VA(5) 2)計算變壓器輸入功率P1(設變壓器效
我國科學家發現環形RNA新功能
基因“暗物質”間接參與免疫調節 人類基因“暗物質”環形RNA (核糖核酸)又被“發掘”一項新功能。中科院生物化學與細胞生物學研究所與中科院—馬普計算生物學研究所科研人員，合作研究發現了環形RNA及其生成調控過程參與抗病毒免疫反應，為環形RNA的功能和抗病毒免疫相關研究提供了新視角。日前，相關成
藥物設計，設計什么？
上周《Nat. Rev. Drug Discov.》一篇分析顯示設計符合類藥性（drug-like）規則的候選藥物并不能真正增加這些藥物在開發路程上的成功率。那么現在藥物需要如何設計才能保證一定的成功率呢？ 首先藥物設計不是大學教科書里講的活性分子設計，設計活性化合物要容易無數倍。新藥在今天的
北京生科院發表環形非編碼RNA識別新技術
2月28日，國際學術期刊Briefings in Bioinformatics 發表了中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊題為Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因為目前在環形RNA識別方面存
科研家提出環形RNA全長轉錄本解析技術
近日，中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊在《自然-實驗手冊》（Nature Protocols）上，發表了題為Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究論文，建立了環形RNA全長轉錄本解析
北京生科院提出環形RNA全長轉錄本解析技術
4月12日，中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊在《自然-實驗手冊》（Nature Protocols）上，發表了題為Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究論文，建立了環形RNA全長
研究開發出高效環形RNA檢測與定量工具
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）高遠團隊與動物研究所趙方慶團隊，開發出面向TB級轉錄組數據的高效環形RNA檢測與定量工具CIRI3，通過反向剪接序列比對與跨樣本整合算法設計，實現了TB級數據的超高速處理，并可高靈敏識別低豐度及非傳統剪接信號的新型環形RNA，突破了環形RNA大規模
環形RNA：從“無名之輩”到“明日之星”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516892.shtm動植物體內存在種類繁多的環形核糖核酸（circular RNA），其中以反向剪接產生的環形RNA含量最為豐富，因其具有獨特的閉環結構，近期引發全世界科學家的關注。在國家自然科學基金重大
北京生科院提出環形RNA識別的新方法
環形RNA是一類新報道的結構特殊的非編碼RNA。近兩年的研究發現，環形RNA在動物細胞內廣泛存在，且大多位于基因的外顯子區域。另有研究表明，少數環形RNA分子可以充當microRNA“海綿”，在轉錄后水平對基因表達進行調控。然而，目前絕大多數的環形RNA功能仍不明確，科學家們推測其可能與蛋白質及
環形初粘力測試儀的設計原理
初粘力測試儀是膠黏劑制品瞬間與物體粘合力的檢測儀器。環形初粘力測試儀是將環形試樣與標準浮法玻璃試驗板，以一定恒速完全接觸之后，儀器自動地再反向將環形試樣和試驗板以一定速度完全分離，所產生的較大力，這個較大力職即為所測試試樣的環形初粘力。LT-1000環形初粘力測試儀結構小巧緊湊，可以讓使用者快速
環形初粘力測試儀的設計原理
初粘力測試儀是膠黏劑制品瞬間與物體粘合力的檢測儀器。環形初粘力測試儀是將環形試樣與標準浮法玻璃試驗板，以一定恒速完全接觸之后，儀器自動地再反向將環形試樣和試驗板以一定速度完全分離，所產生的較大力，這個較大力職即為所測試試樣的環形初粘力。LT-1000環形初粘力測試儀結構小巧緊湊，可以讓使用者快速
北京生科院在環形RNA研究領域取得新進展
6月28日，國際學術期刊Nature Communications 在線發表了中國科學院北京生命科學研究院計算基因組實驗室趙方慶團隊題為Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even
分子細胞卓越中心發表關于環形RNA的綜述文章
5月17日，中國科學院分子細胞科學卓越創新中心陳玲玲團隊在Cell上，在線發表了題為Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications的綜述論文。該論文系統梳理了針對環形RNA研究的生物學技術手段，總結了其以非編碼RN
北京生科院建立單細胞環形RNA分析技術及表達圖譜
環形RNA是一類在真核細胞中廣泛存在的內源性非編碼RNA分子，在生物體發育過程中發揮重要作用。之前研究已在不同物種中鑒定出數百萬個環形RNA分子，并產生了大量用于揭示生物體組織表達模式的環形RNA數據資源。然而，由于大多數環形RNA表達量較低，傳統的轉錄組測序方法無法表征單個細胞環形RNA表達譜
研究揭示環形RNA促進相分離調控腫瘤發展分子機制
環形RNA是由pre-mRNA通過反向剪接形成的閉合環狀RNA分子，在生物體內可發揮miRNA海綿、結合蛋白以及翻譯成短肽等分子功能來調控各種生理和病理過程。與線性mRNA相比，環形RNA獨特的環狀結構使其具有更高的穩定性，在細胞內可更穩定地存在。因此，環形RNA更適合作為腫瘤的分子標志物及治療
PNAS：游戲玩家教你設計RNA
??????? 研究人員發現，與計算機相比，網絡游戲玩家可以更好的預測和設計RNA折疊。這一發現能為新興的分子工程領域帶來什么樣的啟示呢？ RNA可以被彎曲、成環和扭轉形成多種不同的結構，這種自我裝配的分子在生物學和生物工程領域具有關鍵性的作用，其應用前景非常廣闊。許多研究者們都在設計能夠折疊
我國學者成功挖掘和識別哺乳動物環形RNA功能
2019年3月19日，國際學術期刊Cell Reports 在線發表了中國科學院北京生命科學研究院計算基因組學實驗室趙方慶團隊題為“Expanded expression landscape and prioritization of circular RNAs in mammals”的最新研究
生科院提出環形RNA內部序列結構可視化新方法
1月18日，中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊于Bioinformatics 雜志上在線刊發了題為Visualization of circular RNAs and their internal splicing events from transcriptomic data 的研究。該研
深度解析|脂質納米粒(LNP)遞送RNA藥物全過程+如何設計LNP!
前言 脂質納米粒(LNP)是一種具有均勻脂質核心的脂質囊泡，廣泛用于小分子和核酸藥物的遞送，最近因其作為COVID-19mRNA疫苗遞送平臺的巨大成功而備受關注。由mRNA誘導的瞬時蛋白表達的應用遠不止傳染病疫苗，在癌癥疫苗、蛋白質替代療法和罕見遺傳病的基因編輯組件等也具有巨大的潛在應用價值。然而
一例藥物性角膜環形浸潤病例分析
患者，女，42歲，因右眼角膜炎3個月反復加重就診。患者有虹膜炎病史半年余，曾間斷球后注射地塞米松10余針，結膜下注射自體血6次，并加用醋酸潑尼松龍、妥布霉素、鹽酸托吡卡胺、玻璃酸鈉滴眼液點右眼，均每日3～4次，3個月后因眼澀于當地醫院就診，診斷為“病毒性角膜炎”，加用更昔洛韋眼用凝膠、小牛血去蛋白生
環形RNA可變反向剪接和可變剪接表達圖譜被系統繪制
6月30日，國際學術期刊Genome Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組和生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于環形RNA研究的最新進展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
北京生科院提出環形RNA全長轉錄本重建和定量新方法
國際學術期刊Genome Medicine 在線發表了中國科學院北京生命科學研究院計算基因組學實驗室趙方慶團隊題為Reconstruction of full-length circular RNAs enables isoform-level quantification 的最新研究成果。該研
中科院學者發現：環形RNA在天然免疫中的功能
近年來，隨著科學技術的發展，隱身于細胞中數以萬計的環形RNA逐漸浮出水面。但與已經被科學家反復深度剖析論證與人類生命活動密切相關的線形RNA相比，RNA分子家族的“新人”——環形RNA身上至今仍有許多未解之謎。當長鏈的核糖核酸（RNA）“變身”成環形RNA后，這些“重塑外形”的RNA是否連“內
體內表達shRNA（短發夾RNA）的設計
1.克隆到shRNA表達載體中的shRNA包括兩個短反向重復序列，中間由一莖環（loop）序列分隔的，組成發夾結構，由polⅢ啟動子控制。隨后在連上5-6個T作為RNA聚合酶Ⅲ的轉錄終止子。?2.兩個互補的寡核苷酸兩端須帶有限制性酶切位點。?3.Stratagene發現29個寡核苷酸較之原先推薦的2
關于小干擾RNA的siRNA設計介紹
最初，siRNA序列的選擇是基于實驗經驗而獲得的（Elbashir et al. 2001，2002）。最近，生物信息學工具被用來設計siRNA（表18-1），目前多個數據庫收錄了經過實驗確證的siRNA和shRNA。值得推薦的是，在設計新的siRNA之前可以通過搜索已有的siRNA數據庫和科研
RNA藥物迎來春天？強生聯手Isis重金開發自身免疫疾病RNA藥物
2015年伊始，位于加州卡爾斯巴德市的生物技術公司Isis醫藥公司再迎來一個開門紅。Isis生物技術公司與強生公司簽訂了一項價值高達8億3千5百萬美元的合作協議，共同開發用于治療腸道自身免疫疾病的RNA藥物。 這份協議中包括了3500萬美元的預付款和高達8億美元的里程碑獎金，同時Isis公司還