海南大學團隊定義植物基因組學“終極參考圖譜”
近日，記者從海南大學獲悉，該校三亞南繁研究院陳飛教授團隊首次構建了“分型端粒到端粒超級泛基因組”理論體系，實現了植物基因組從個體單倍型完整到群體遺傳多樣性全覆蓋的技術跨越。相關成果發表在國際期刊《植物科學趨勢》。植物基因組研究長期受制于參考基因組的局限——傳統組裝難以解析著絲粒、端粒等復雜區域，且無法反映物種全面的遺傳變異，從而限制了基因挖掘和育種的范圍。針對這一難題，研究團隊創新提出“分型端粒到端粒+超級泛基因組”雙維度框架，在理論上統一了個體層面的“端粒到端粒”完整性與群體層面的遺傳多樣性，突破了單一參考基因組無法兼顧完整性與代表性的瓶頸。研究團隊在多種植物中驗證了該體系的有效性：“端粒到端粒”組裝首次實現無間隙染色體級拼接，高重復序列區域得到完整解析；超級泛基因組顯著提升了結構變異捕獲率與基因多樣性表達能力，并證明可在超大基因組物種中實現低成本高精度組裝。陳飛表示，該框架已經在多個重要作物的遺傳育種研究開展應用，揭示關鍵功......閱讀全文
昆明植物所山茶屬代表植物比較葉綠體基因組學研究獲進展
山茶屬是山茶科中包含許多舉世聞名經濟植物的一個重要類群，包括為人類提供天然保健飲料的茶（Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis），健康型高級食用植物油的油茶（C. oleifera）以及觀賞花卉云南山茶（C. reti
武漢植物園在裸子植物葉綠體基因組學研究方面獲進展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我國特有珍稀瀕危植物，屬裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉屬(Cephalotaxus)。它在三尖杉屬中的地位特殊，形態、解剖、胚胎發育、孢粉、核型及分子系統學的研究均支持將其獨立成篦子三尖杉組。 松杉類植物
海南大學團隊定義植物基因組學“終極參考圖譜”
近日，記者從海南大學獲悉，該校三亞南繁研究院陳飛教授團隊首次構建了“分型端粒到端粒超級泛基因組”理論體系，實現了植物基因組從個體單倍型完整到群體遺傳多樣性全覆蓋的技術跨越。相關成果發表在國際期刊《植物科學趨勢》。植物基因組研究長期受制于參考基因組的局限——傳統組裝難以解析著絲粒、端粒等復雜區域，且無
首個植物功能基因組學智能問答系統PlantGPT問世
近日，中國科學院院士、華南農業大學教授劉耀光和研究員祝欽瀧團隊聯合清華大學，開發了一個以擬南芥為基礎的植物功能基因組學專家問答系統PlantGPT，通過融合檢索增強生成技術和大語言模型微調方法，實現了對植物功能基因組學專業問題的精準回答與分析。相關成果在線發表于《先進科學》（Advanced S
利用植物表型組學挖掘基因組學的成果
到2050年，全球人口將達到97億，預計作物產量翻一番才能滿足全球人口的糧食需求。為了達到這一目標，作物產量需每年增長2.4%，但目前作物產量平均增長率僅為1.3%。作物生產性能的遺傳改良仍然是提高作物生產力的關鍵因素，但當前的改善速度無法滿足可持續性和糧食安全的需要。為了確保糧食安全、生態系統的可
基因組學研究重建苔類植物演化歷程獲突破
深圳市仙湖植物園研究團隊與合作者使用轉錄組數據，首次對苔類目級系統框架進行了重建，得到了高支持的系統發育樹。相關研究9月8日在線發表于Annals of Botany。該論文第一作者為深圳市仙湖植物園董珊珊副研究員，通訊作者為劉陽研究員。深圳市仙湖植物園張力研究員，深圳華大生命科學研究院聯合培養研究
版納植物園葉綠體比較基因組學研究取得進展
樟科油丹屬樹種木材質優，國際市場上的商品名為“medang”，和楠木樹種的親緣關系較近。以往的分子系統學研究表明油丹屬為復系類群，但與潤楠屬、鱷梨屬和楠屬等的系統關系尚不明晰。 近日，中國科學院西雙版納熱帶植物園生物多樣性研究組以分布于印度南部的油丹模式種Alseodaphne semecar
昆明植物所在南方菟絲子基因組學研究中取得進展
自然界絕大部分植物都通過葉片的光合作用和根部的水分和營養吸收維持自養生存，而寄生植物則是一類通過寄生在自養植物上獲取能量和營養的植物。寄生植物獨特的起源、演化和特殊生理生態長期以來吸引著研究者的目光。旋花科莖寄生植物菟絲子寄生行為在實驗室中方便控制和觀察，近年來已成為許多探索寄生植物生理生態和進
武漢植物園葡萄基因組學研究取得新進展
葡萄是世界上第二大果樹作物，鮮果及用其加工品葡萄酒一直廣受消費者喜愛。隨著社會對葡萄需求量進一步增加，如何高效快速地培育優良葡萄品種是目前葡萄產業發展的瓶頸。近年來，通過新一代測序技術和生物信息學手段相結合，對植物基因組結構和特點深入解析，將獲得的信息應用于分子輔助或基因工程育種
上海市資源植物功能基因組學重點實驗室通過驗收
2016年12月13日，上海市資源植物功能基因組學重點實驗室驗收會于上海辰山植物園（中國科學院上海辰山植物科學研究中心）舉行。會議由上海市科委基地處周婧主持，上海市科委基地處處長過浩敏處長、7名驗收評審專家及重點實驗室相關領導和人員出席了本次驗收會。 會上，辰山科研中心副主任馬金雙研究員對科委
“特色植物功能基因組學研究與應用”項目總結交流會召開
近日，“十二五”國家863計劃現代農業技術領域“特色植物功能基因組學研究與應用”項目總結交流會在中國農業科學院棉花研究所海南繁育基地召開。科技部農村科技司郭志偉副司長出席會議并講話，農村科技司農業科技處和農村中心有關同志，項目首席專家、中國工程院院士喻樹迅研究員，項目牽頭單位中國農業科學院棉花研
水生植物澤瀉科系統發育基因組學研究獲新進展
澤瀉科（Alismataceae）為古老的單子葉水生植物類群，包含17個屬約100個物種。該科植物在世界廣泛分布，因其復雜的進化歷史、較高的觀賞價值和生態價值等，長期以來一直受到植物進化生物學家及生態學家的關注。然而，由于該科植物形態復雜多變以及先前研究所采用的分子標記和樣本采集的局限性，該科屬間及
澳大利亞CSIRO機構與中科院將在植物基因組學進行合作
據GenomeWeb記者報道，2011年3月10日—澳大利亞聯邦科學與工業研究組織（CSIRO）今天宣布，將在下周與中科院共同探索在植物基因組研究上的合作計劃。 這項研究合作，將重點放在水稻和小麥農作物上。水稻和小麥將同玉米一并成為在世界上種植最廣泛的三大農作物；來自兩個研
昆明植物所等在薔薇類系統發育基因組學研究中取得進展
薔薇類（rosids）和菊類（asterids）是真雙子葉植物的兩個主干分支，其中薔薇類包括17個目，140個科，約70,000個物種，呈現了豐富的形態多樣性，并具有重要的經濟價值。近十幾年以來，對葉綠體基因序列的分析支持薔薇類分為豆類分支和錦葵類分支。其中，豆類分支包括固氮支系（由葫蘆目Cuc
植物基因組學國家重點實驗室2014夏季青年學術論壇召開
中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物基因組學國家重點實驗室2014年度夏季青年學術論壇于7月24日至25日成功召開。實驗室的職工、博士后、研究生以及客座人員等共350余人參加了此次論壇。實驗室副主任儲成才研究員致開幕詞，指出實驗室青年學術論壇進一步推動了實驗室的內部交流，希望青年人員以此為平臺，
基因組學分析揭示
英國《自然》雜志18日在線公開的一篇基因組學論文顯示，來自西伯利亞阿爾泰山脈東部尼安德特人的祖先，和現代人祖先的相遇與交融繁殖可能比原先認為的更早。已有證據顯示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向現代人貢獻了遺傳物質。這項新研究還顯示，大約在10萬年前，現代人和尼安德特人之間
植物基因組學國家重點實驗室2012年度青年學術論壇
植物基因組學國家重點實驗室2012年度青年學術論壇于2013年1月10日至11日召開。實驗室課題組長、工作人員和研究生共計450余人出席了此次論壇。實驗室主任左建儒研究員代表實驗室學術委員會主任方榮祥院士致開幕詞。左建儒研究員引用“他山之石，可以攻玉”、“三人行，必有吾師”，充分肯定了
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
國際基因組學大會在長春落幕
10月24日，2011國際基因組學大會在長春落幕。中科院院士賀林、美國國立衛生研究院癌癥研究所資深研究員Charles Vinson等國內外知名專家學者，圍繞“基因組學時代的機遇與挑戰”主題，從基因組科學、基因組技術、基因組信息學與計算生物學、基因組轉化與應用等方面進行了交流，并就全球基因
基因組學出手－尋找番茄舊時味
近日，《科學》雜志以封面報道形式介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果，同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時，《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 小小番茄之所以獲得如此高的關注度，源于這種果實既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜，又是植物生物學家的最愛之一，堪稱植物遺
基因組學推進腫瘤研究未來發展
——訪億明達腫瘤業務營銷副總裁約翰·萊特 基因組學正在改變腫瘤研究，其最終目標是推進癌癥的診斷、治療、監控及最終的篩查方式。 癌癥通常按照形態進行分類，這指的是病理學家在顯微鏡下看到的內容。“如今，癌癥分類依據已經開始從形態特征轉變為更有效的治療方式，其中的主要轉變在很大程度上歸功于基因組研
藥物基因組學發展和應用【一】
影響患者對藥物反應的因素有很多，包括患者本身的內在因素如年齡、性別、種族/民族、遺傳、疾病狀態和器官功能，還有其它生理變化，包括懷孕、哺乳以及外源性因素如吸煙和飲食。基因變異可導致疾病表現和藥物反應的多樣性這一觀念目前已得到廣泛認可，并經許多的研究證實。對于一些遺傳因素影響研究比較明確的藥物，在治療