《科學》:科學家完成牛基因組測序
有助于優質肉、奶生產 一個國際科學家團隊4月23日說,他們已完成了牛的基因組測序工作,這一成果將有助于生產質量更好的牛肉和牛奶。 在美國農業研究局和貝勒醫學院的領導下,來自25個國家的300多位科學家以海福特牛為樣品牛,歷經6年完成了基因組測序工作。24日出版的新一期美國《科學》雜志刊登相關論文介紹這項成果。研究人員發現,牛至少有2.2萬個基因,其中80%與人類共享。牛在遺傳上與人類的相似性遠遠超過老鼠。這也意味著,牛可以替代實驗鼠作為研究人類疾病的動物模型。研究人員還認為,通過將人類基因組與牛等動物的基因組進行比較,可以更好地理解人類疾病的基因基礎。 同一期《科學》雜志還刊登了另一個研究小組的研究論文,這篇論文比較了海福特牛與6種其它牛的DNA差別,并對19種地理及生物學上完全不同的497頭牛進行了研究。他們希望牛基因組測序工作的完成能夠有助于培育出肉質更好或產奶量更多的新品種牛。 美國農業部長湯姆......閱讀全文
《科學》:科學家完成牛基因組測序
有助于優質肉、奶生產 一個國際科學家團隊4月23日說,他們已完成了牛的基因組測序工作,這一成果將有助于生產質量更好的牛肉和牛奶。 在美國農業研究局和貝勒醫學院的領導下,來自25個國家的300多位科學家以海福特牛為樣品牛,歷經6年完成了基因組測序工作。24日出版的新一期美國《科學》雜志
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
澳科學用基因組測序技術研究提升牛類健康新方法
“高大上”的基因測序技術,在實際生產生活中其實也可用于畜牧業——譬如說用來增加牛類的產肉和產奶效率。14日,英國《自然-遺傳學》雜志在線發表的一篇論文中,澳大利亞遺傳學家們匯報了234頭牛的完整DNA序列。這些“調查對象”所具有的品種內部遺傳多樣性,可以幫助畜牧業更好、更直接地選擇健康的牛。
澳科學用基因組測序技術研究提升牛類健康新方法
“高大上”的基因測序技術,在實際生產生活中其實也可用于畜牧業——譬如說用來增加牛類的產肉和產奶效率。14日,英國《自然-遺傳學》雜志在線發表的一篇論文中,澳大利亞遺傳學家們匯報了234頭牛的完整DNA序列。這些“調查對象”所具有的品種內部遺傳多樣性,可以幫助畜牧業更好、更直接地選擇健康的牛。
解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
PNAS:甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度(Sequencing depth)是指測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系,測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體,如果采用的是雙末端或Ma
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代,其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1,科學家通過454全基因組測序,掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因,包括抗病能力、牛奶產量,這些性狀已通過北美的當
牛基因組中忽視基因被發現
近日,瑞士蘇黎世聯邦理工學院的科學家將幾種家養牛及密切相關的野生牛的基因組整合到一個全基因組中,發現超過7000萬個堿基未包含在目前的家畜普通牛的參考基因組中。相關成果發表在近日的美國《國家科學院院刊》上。 在遺傳研究中分析基因變異往往依賴于參考基因組。作為物種遺傳構成的典型示例,參考基因組一
基因組測序拯救鸮鸚鵡
為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo,幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序,這為其保護管理提供了重要信息。 新西蘭鸮鸚鵡kakapo(Strigops habroptila)有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡,有的雄性甚至超過3公斤,被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡,通過
我國完成小麥A基因組測序
本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日,中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉,這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3:基因,基因組,遺傳學》(G3-Genes Genomes Genet
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入和
454用于西紅柿基因組測序
最近,西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜,以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜,并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較,尋找與水果有些特性相關的基因,相關文獻在Nature雜志作為封面文章發
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者: 種屬:非洲腔棘魚(Latimeria chalumnae) 基因組:~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕,直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后,近日,中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作,順利完成中國蓮的基因組測序,構建了首張中國蓮全基因組圖譜,相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎,也標志著我國相關研究將對生物進
Nature突破:香蕉基因組測序
由法國的研究人員領導的一個國際小組近日完成了對香蕉品種小果野蕉(Musa acuminata)的基因組測序,并開始分析這一基因組草圖。相關研究成果發布在了7月11日的《自然》(Nature)雜志上。 研究人員采用Roche 454、Sanger和Illumina的測序方法繪制出了雙單倍
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布,巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成,巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快,可以用作燃料和木材,是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來,人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開,分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中,他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法",人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法",其實是一種
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中,PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而,PCR也帶來一些問題,包括不均勻擴增,導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序(NGS)平臺而言,測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
基因組測序的具體過程
講起來很復雜哈,簡單來說,就是邊合成邊測序,把所要測序的序列通過各種手段來建庫,然后加上5‘和3’都加上接頭,放在一個小玻璃片一樣的芯片上,上面一般是8個lane,把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合(之前的建庫時加的接頭與之反向互補),然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇,然
測序基因組勘探食品污染
上周,兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠(Blue Bell Creameries)已確認有少量食品原料已感染李斯特菌,目
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。這些技
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部(DOE)與美國國家衛生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基
測序解讀基因組,真的好嗎?
測序解讀基因組,真的好嗎? “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire,在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說,“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年,但
牛基因組內首次發現個體差異區域
來自美國貝勒醫學院、康奈爾大學和美國農業部的科學家發現,與人類相似,牛的基因組也攜帶CoRSIV(系統性個體間差異相關區域)。CoRSIV是基因組中攜帶DNA化學標記的區域,這些標記提供的信息對于農民預測并選擇具有理想特征的奶牛至關重要,如更高的產奶量、生育能力和抗病能力等。這一研究為提升養牛產業甚
牛基因組內首次發現個體差異區域
科技日報訊?(記者劉霞)來自美國貝勒醫學院、康奈爾大學和美國農業部的科學家發現,與人類相似,牛的基因組也攜帶CoRSIV(系統性個體間差異相關區域)。CoRSIV是基因組中攜帶DNA化學標記的區域,這些標記提供的信息對于農民預測并選擇具有理想特征的奶牛至關重要,如更高的產奶量、生育能力和抗病能力等。
Nature發布基因組測序重要發現
由科隆大學Roman Thomas領導的一個國際研究小組,對110個小細胞肺癌(SCLC)樣本進行了測序,發現除了兩個樣本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通過調查這一疾病的基因組景觀,他們還發現有不少的腫瘤具有與TP73基因相關的基因組重排或突變,以及激酶基因突變和Notch家族基因