Science：CRISPR／Cas9大革命
DNA編輯技術CRISPR近年來風生水起，已經開始取代了其它基因組編輯工具，如鋅指核酸酶和 TALENs等。不過目前科學家們對于這一技術中的RNA引導核酸內切酶：Cas9了解的還不夠多，如果能更精確的掌握這種酶在CRISPR系統中如何發揮作用的，將能提高這一技術的使用效率和特異性。 5月16日Science雜志發表了題為“Cas9 Targeting and the CRISPR Revolution”的綜述性文章，指出近期的一些生化試驗和結構研究有助于解析Cas9這種關鍵酶，這些研究成果為未來合成生物學，轉化醫學研究，以及新一代基因組工程中的新應用奠定了基礎。 CRISPR本身是一種防御系統，用以保護細菌和古細菌細胞不受病毒的侵害。在這些生物基因組中的CRISPR位點能表達與入侵病毒基因組序列相匹配的小分子RNA 。當微生物感染......閱讀全文
SARS病毒基因組復制機制研究獲突破
近日，武漢大學生命科學學院教授郭德銀領導的研究組以選擇冠狀病毒特有的多個RNA加工酶作為主要研究目標，通過酵母菌系統的功能篩選和體外生物化學分析，發現SARS病毒基因組1b區編碼的一種非結構蛋白nsp14同時具有兩種RNA加工酶活性，一是參與RNA 5’-端加帽的N7-甲基轉移酶，二是進行RNA
研究人員首次破譯艾滋病病毒完整基因組
新華網華盛頓8月6日電 美國北卡羅來納大學6日報告說，該校的一個科研小組成功破譯了艾滋病病毒的完整基因組。這對于人類理解艾滋病病毒感染人體的機制，尋找抗“艾”新療法提供了有力幫助。 相關論文發表在6日出版的英國《自然》雜志上。研究小組負責人凱文·威克斯介紹說，艾滋病病毒的遺傳信息由單鏈核糖
新冠病毒全基因組大小和序列的研究進展
2月3日，《自然》在線發表論文介紹了上海公共衛生臨床中心和復旦大學公共衛生學院教授張永振等人對2019-nCov的基因組序列的分析。該病毒基因組從就職于出現首批患者的海鮮市場的一名病人身上獲得。基因組分析顯示，該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。 通過對從患者收集的
人類腸道宏基因組的古菌病毒研究新進展
2022年12月30日，中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所馬迎飛團隊在《自然-通訊》（Nature Communications）上，發表了題為Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in
PNAS：讓病毒“吐出”基因組
病毒感染導致的手足口病，會使兒童出現可能致命的腦腫脹和麻痹，現在科學家們找到了治療這種疾病的潛在途徑，這一發現也為對抗其他相關病毒提供了寶貴線索。 在中國和東南亞國家，每年都會出現手足口病的爆發，這種疾病是由腸道病毒71型(EV71)引起的。在一些受到感染的兒童中，病毒會引發腦炎造成永久性
Science：人巨細胞病毒病毒基因組測序
人巨細胞病毒是一種很常見的皰疹病毒，感染約50-100%的成人，但通常沒有不良影響，并且它可以保持潛伏多年。人巨細胞病毒感染是比較常見的，發展中國家感染人數比發達國家人數多。 該病毒可導致出新生兒生缺陷和免疫系統受損，可能會導致致命疾病。該病毒也與癌癥發展有關聯。這項新的研究分析了病毒的蛋
樹懶基因組中發現“化石”病毒
????? 二趾樹懶(Choloepus hoffmanni，如上圖)的基因組中隱藏著一個“化石”病毒。 據美國《科學》雜志在線新聞報道，就像恐龍在焦油中留下的腳印一樣，逆轉錄酶病毒會將其DNA中的一些片段插入到一種動物的基因組中。研究人員在樹懶的基因組中發現了泡沫病毒的古老片段。研究人
新研究揭示乙肝病毒DNA與人基因組互作景觀圖
乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）感染是全球性重大公共衛生健康問題之一，目前，全球乙肝病毒慢性感染者人數較多。HBV屬嗜肝DNA病毒科，在人體肝臟細胞核內可形成cccDNA、整合入人體基因組等病毒DNA形式穩定存在，這是HBV維持長期慢性感染的關鍵。因此，研究乙肝病毒與宿
科學研究！新冠病毒RNA是否能夠整合進宿主基因組？
新型冠狀病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球范圍肆虐的病因。該病毒為一種單股正鏈RNA病毒，具有高傳染性特性，能夠感染人體各代謝系統的多種組織器官，并引發嚴重的臨床癥狀，深入研究新冠病毒基因組RNA的特性十分必要。 2021年8月2日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中
病毒基因組的結構特點介紹
1.病毒基因組大小相差較大,與細菌或真核細胞相比，病毒的基因組很小，但是不同的病毒之間其基因組相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小，所含信息量也較小，只能編碼4種蛋白質，而痘病毒的基因組有300kb之大，可以編碼幾百種蛋白質，不但為病毒復制所涉及的酶類編碼，甚至為核苷酸代謝的酶類編碼，因此
關于病毒基因組的基本介紹
病毒是最簡單的生物，完整的病毒顆粒包括外殼蛋白和內部的基因組DNA或RNA（有些病毒的外殼蛋白外面有一層由宿主細胞構成的被膜（envelope），被膜內含有病毒基因編碼的糖蛋白。病毒不能獨立地復制，必需進入宿主細胞中借助細胞內的一些酶類和細胞器才能使病毒得以復制。外殼蛋白（或被膜）的功能是識別和
北京基因組研究所Plant－cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組，通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
武漢病毒所在蝙蝠飛行和免疫適應進化基因組學研究獲進展
近期，由5個國家9個實驗室組成的聯合研究團隊解析了2種蝙蝠的全基因組序列。這2種蝙蝠分別來自澳大利亞的大蝙蝠狐蝠(Pteropus.alecto)和中國的小蝙蝠大衛鼠耳蝠(Myotis.davidii)。分析結果提供了蝙蝠飛行、免疫系統及其它獨特生物學特性的適應性進化的生物信息學證據。相關成果發
武漢病毒所蝙蝠飛行和免疫適應進化基因組學研究獲進展
近期，由5個國家9個實驗室組成的聯合研究團隊解析了2種蝙蝠的全基因組序列。這2種蝙蝠分別來自澳大利亞的大蝙蝠狐蝠（Pteropus.alecto）和中國的小蝙蝠大衛鼠耳蝠（Myotis.davidii）。分析結果提供了蝙蝠飛行、免疫系統及其它獨特生物學特性的適應性進化的生物信息學
新冠病毒可“植入”人體基因組？PNAS最新學術研究引爭議
在COVID-19大流行的最初幾個月，分析測試結果的醫護人員發現：已經從COVID-19中康復的病人有時會在幾周甚至幾個月后的PCR測試中莫名其妙地出現陽性。 這些人并未二次感染COVID-19，從他們的樣本中也沒有分離出活的病毒。而且，RNA的壽命通常很短，所以陽性測試不太可能是殘留RNA的
未知基因組的神秘“巨型病毒”揭示病毒世界變異性
據國外媒體報道，目前，科學家最新發現一種具有未知基因組的神秘巨型病毒。 該病毒被稱為“Yaravirus”，是在巴西貝洛哈里桑塔城帕普哈人工湖中發現的，它是以巴西神話傳說中“水仙（Yara）”的名字命名的。盡管該病毒可能不是什么超自然警報，但它可能像神話中的“水仙（Yara）”一樣神秘。 因
Nature－Biotechnology定義病毒基因組標準：何謂高質量基因組
據說，地球上的微生物總量超過了銀河系中的恒星數量，而且病毒總量也要比之前預計的多得多。 在最新的Nature Biotechnology雜志上，美國能源部（DOE）聯合基因組研究所（JGI）構建了重要的病毒序列數據庫，同時提出了病毒基因組標準，指出了三類基因組質量的分級。 目前雖然許多病毒未
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現，作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白（C2H2-ZF）實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究，有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員，是規模最大的一種人類蛋白。然而，人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
華大在新冠病毒基因組變異監測及研究方法上取得突破
隨著新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）肆虐全球，世界衛生組織（WHO）已經正式宣布其為全球流行病（Pandemic）。WHO最新新冠疫情狀態報告顯示，截至北京時間2020年3月26日10點，新冠肺炎疫情已蔓延至全球198個國家和地區，確診患者超過46萬例，且仍呈現迅速增長態勢。 病毒在傳播過
武漢病毒所基因組內16S－rRNA基因差異性研究獲進展
近期，中科院武漢病毒研究所周寧一研究員課題組在基因組內16S rRNA基因的差異性而導致的原核生物多樣性高估研究方面取得重要進展。相關結果發表在10月的微生物學刊物Applied and Environmental Microbiology上，并被本期雜志選為亮點文章(Spotlight
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列（論文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示，該病毒與此前在
The－Scientist：最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI，現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙，后又轉變為一本每月出版的雜志，同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息，并幫助科學家分析研究的，以協助決策影響他們的
進擊的古基因組研究
? 今年5月，《科學》在線發表了一項中國科學院古脊椎動物與古人類研究所（以下簡稱古脊椎所）領銜的關于華夏族群探源的突破性研究成果，它揭開了有關中國南北方史前人群格局及遷移與混合這一重大學術問題上的若干謎團；兩個月后，該團隊又發布最新發現：通過古基因組研究最新發現距今約1.1萬年的中國南方未知現代人群
Nature發布基因組研究指南
測序人類全基因組比以往任何時候變得更快速、更便宜，使得比較患者與無特定疾病人群基因組一類的研究激增。臨床醫生和從事某種疾病遺傳貢獻研究的研究人員往往會遇到一些似乎與疾病相關的變異，但卻發現另外一些攜帶相同突變的人群并不罹患這種疾病或影響程度較輕。 醫生要怎樣找到真正引起疾病的遺傳變化?發表
The－Scientist：最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI，現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙，后又轉變為一本每月出版的雜志，同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息，并幫助科學家分析研究的，以協助決策影響他們的工作生活。
CRISPR大規模基因組研究
來自杜克大學的研究人員設計出了一種能快速，方便有效靶向人類基因組任何基因的新方法，這種新工具建立在一種來自細菌的RNA引導酶的基礎上，即CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶(RNA-guided nucleases，RGNs)。 這一研究成果公布在7月25日Nature Met
The－Scientist：最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI，現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙，后又轉變為一本每月出版的雜志，同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息，并幫助科學家分析研究的，以協助決策影響他們的工作生活。
《基因組研究》：首張貓基因組草圖繪就
貓是研究人類失明和艾滋病模型之一，因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”（Cinnamon）的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》（Genome Research）雜
美國一項新研究在人類基因組中再次“擒獲”病毒DNA
美國一項新的研究在人類基因組中發現了19個特殊DNA片段——它們來自古老的病毒，這些病毒在成千上萬年前感染了我們的祖先，并從此“潛伏”在人類的DNA中。 研究人員發表在《美國國家科學院院刊》上的報告稱，新發現的DNA片段中有一個甚至包含了一種病毒的完整基因信息。這個完整的病毒基因組出現在X染色
研究揭示乙肝病毒相關性肝癌的多維蛋白基因組學特征
肝細胞癌（Hepatocellular Carcinoma，HCC）是全球第四大癌癥死亡原因，占所有原發性肝臟惡性腫瘤的85%-90%。HCC誘發的主要原因包括乙型肝炎病毒（Hepatitis B Virus，HBV）和丙型肝炎病毒（Hepatitis C Virus，HCV）慢性感染、酗酒以及