家犬基因組學研究獲新進展
科學界對于家犬的起源和馴化一直爭議不斷。近日，中科院院士張亞平帶領團隊發現，家犬中亞起源的假說與基于全基因組重測序數據分析的家犬東亞南部起源模式相沖突。相關成果日前在線發表于美國《國家科學院院刊》。 2015年，美國學者Shannon等人通過分析大量的家犬群體全基因組DNA芯片數據，提出了家犬中亞起源假說。然而，張亞平團隊通過重新梳理Shannon等人的工作，發現他們把尼泊爾和蒙古都劃歸到中亞，而這與傳統的地理劃分相悖。其次，該工作并未包含中國南方這一家犬可能的起源地。通過整合已發表的中國南方家犬群體數據，張亞平團隊發現，中國南方的家犬群體擁有最小的連鎖不平衡距離。這支持了中國南方而非尼泊爾和蒙古是家犬起源地的結論。 同時，家犬的線粒體DNA（mtDNA）在分子法醫學研究中也日益受到重視。2015年，3個研究組分別基于線粒體DNA基因組序列，構建了家犬mtDNA的單倍型類群樹。由于采用了不同的參考序列和數據集，3棵單倍型......閱讀全文
家犬基因組學研究獲新進展
科學界對于家犬的起源和馴化一直爭議不斷。近日，中科院院士張亞平帶領團隊發現，家犬中亞起源的假說與基于全基因組重測序數據分析的家犬東亞南部起源模式相沖突。相關成果日前在線發表于美國《國家科學院院刊》。 2015年，美國學者Shannon等人通過分析大量的家犬群體全基因組DNA芯片數據，提出了家犬
野獅可感染家犬病毒
犬瘟熱是一種致命病毒性疾病，主要存在于犬類中，但也會感染其他哺乳動物。該病毒曾在上世紀90年代中期因為首次從家犬轉移到坦桑尼亞塞倫蓋蒂野生獅子身上而成為新聞，此次事件曾導致該類貓科動物新宿主死亡率達到30%。 為了保護獅子，科學家啟動了一項為犬類注射疫苗抵抗該病毒的運動，科技博客網The Ve
基因平衡選擇影響家犬毛色
近日從中科院昆明動物研究所獲悉，中科院院士張亞平課題組的王國棟博士和公安部昆明警犬基地程魯光合作，對昆明犬毛色人工選擇開展研究，揭示了平衡選擇是品種化過程中的一種重要驅動力，為家犬人工選擇提供了新的思路和線索。該研究日前在線發表于國際刊物《公共科學圖書館·綜合》(PLOS ONE)。
昆明動物所揭示非洲家犬復雜的源流歷史
近日，《遺傳學和基因組學雜志》（Journal of Genetics and Genomics）發表了中國科學院昆明動物研究所張亞平課題組題為A Cryptic Mitochondrial DNA Link between North European and West African Dog
研究揭示從郊狼到北美土著家犬的古老漸滲
犬類生殖器傳染性腫瘤（CTVT）是一種可以在犬科動物中傳染生存的腫瘤，作為最初患瘤個體（CTVTfounder）的活化石，其基因組記錄了一只古代犬科動物的遺傳信息。近10年來，科學家們反復討論了CTVT的起源和腫瘤進化過程。目前，通過對全球范圍的現代家犬和部分古代家犬化石的全基因組測序，CTVT
“大灰狼”如何變家犬？“狗狗祖先”DNA來揭秘
作為家犬的唯一野生祖先，灰狼的相關研究對理解家犬起源具有重要的作用。為探究東亞灰狼遺傳演化歷史及其與家犬的聯系，中國科學院古脊椎動物與古人類研究所聯合西北大學等單位開展了中國古代灰狼群體母系遺傳研究。5月29日，相關研究成果發表于《整合動物學》。 在這項研究中，研究人員成功獲取了來自中國北方的
張亞平等揭示青藏高原家犬低氧適應機制
記者8月27日從中科院昆明動物所獲悉，該所張亞平課題組與云南大學、中科院北京基因組所、青海大學等合作發現，藏犬群體表現出與藏族人群非常相似的高原適應性模式。相關成果發表于《基因組生物學與進化》雜志。 據了解，家犬自古以來跟隨人類活動遷徙和擴散，即使在海拔超過3500米的青藏高原上，依然表現出與
昆明動物所在家犬行為相關基因研究中取得進展
馬里努阿犬是一種高興奮型工作犬，在局促環境中常表現出轉圈行為。其中表現一定轉圈行為的個體較無轉圈行為個體具有更高的興奮性和工作欲望，較極度轉圈個體具有更好的行為控制力。值得注意的極度轉圈行為已經被定義為強迫癥，且之前的研究已經發現了一些與之相關的一些基因，神經鈣粘蛋白基因（Cadherin 2：
昆明動物所家犬嗅覺受體基因研究取得新進展
家犬作為人類最親密的朋友，在人類歷史上一直扮演者重要的作用。更重要的是，家犬是人類最早馴化的家養動物，由于其經過了馴化和品種培育兩個重要的群體歷史階段，并且在家養哺乳動物中形成了最具多樣性的品種，因此家犬一直是研究人工選擇和自然選擇的重要模式生物。中國最為家犬的馴化地，不僅遺傳多樣
張亞平團隊揭示非洲家犬抵御瘧原蟲侵害遺傳機制
中國科學院昆明動物所張亞平院士團隊首次揭示家犬在伴隨人類的過程中適應非洲炎熱自然環境的遺傳機制，為今后非洲人群瘧疾研究工作提供重要靶點和參考，這是該研究團隊在推動萬犬基因組計劃發展中取得的又一新成果。相關研究結果近日發表在《分子生物學與進化》上。 家犬約在3萬多年前從東亞的灰狼馴化而來，并于
昆明動物所等揭示家犬適應歐洲牛奶飲食的遺傳機制
家犬大約在1萬五千年前到4萬年前從歐亞大陸的灰狼馴化而來，現已遍布世界大部分有人類居住的地方。家犬與人類生活在相同的環境中，在很多方面存在趨同進化，家犬對環境的適應性進化遺傳機制一直是進化生物學家的研究熱點。經歷長時間的人工選擇和自然選擇，歐亞大陸家犬分成歐洲家犬和東南亞兩個群體，其背后的遺傳機
昆明動物所等家養動物線粒體DNA基因組學研究取得進展
近年來，家養動物線粒體DNA（mtDNA）基因組學得到了迅速發展，積累了大量的mtDNA序列數據。與此同時，一些問題隨之浮現出來。除了數據質量存在缺陷（Shi, et al. 2014. Mol Ecol）之外，mtDNA世系劃分標準不一，世系命名混亂的問題也已開始干擾家養動物mtDNA的研究工
家犬搖尾有何運動特征？研究稱對人越熟悉越偏右
中新網北京7月23日電 (記者 孫自法)狗搖尾巴有何運動特征？偏左還是偏右？中國科學院(中科院)合作團隊最新完成的一項研究發現，與每個人都有獨特的步態相類似，人類最忠實的朋友——家犬也有著獨特而穩定的搖尾特征：它們尾巴搖擺的左右偏側化與其與人的熟悉程度有關，對人越熟悉越偏右。這項研究由中科院遺傳與發
中國科學家通過基因編輯技術建立孤獨癥家犬模型
作為兒童和青少年常見的一種精神疾病，孤獨癥(又稱自閉癥)致病機理及醫療研究長期以來備受學界和社會廣泛關注。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所(遺傳發育所)10月27日在北京舉行腦疾病家犬模型成果研討會宣布，該所張永清團隊聯合中外多家科研機構長期協力攻關，在國際上首創孤獨癥家犬模型，基因編輯突變犬
家犬基因組聯盟發表dog10K計劃白皮書
2016年，來自世界各地的20多位科學家成立家犬基因組聯盟，全面深度探討家犬起源與馴化、人工選擇、疾病機制、醫學模型等重大科學問題。自成立后，科研工作積極有序進行，近期研究聯盟在國際刊物National Science Review上發表dog10K計劃白皮書。 研究聯盟指出，家犬是行為和表型
研究揭示結構變異和新基因在家犬馴化中的作用
近日，中國科學院昆明動物研究所遺傳資源與進化國家重點實驗室、動物進化與遺傳前沿交叉卓越創新中心張亞平團隊與中國農業科學院農業基因組研究所開展合作，第一次系統地構建了家犬在馴化中的結構變異（Structural Variations）圖譜、探討了新基因在馴化中的作用、并指出了大尺度基因組變異在馴化
中國古代家犬線粒體全基因組揭示其種群擴散
1月8日，中科院生物一區雜志《分子生物學與進化》（Molecular Biology and Evolution）在線發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所古DNA實驗室付巧妹研究員團隊與中國科學院昆明動物研究所、陜西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、蘭州大學和四川大學等合作完成的關于中國古
基因組學分析揭示
英國《自然》雜志18日在線公開的一篇基因組學論文顯示，來自西伯利亞阿爾泰山脈東部尼安德特人的祖先，和現代人祖先的相遇與交融繁殖可能比原先認為的更早。已有證據顯示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向現代人貢獻了遺傳物質。這項新研究還顯示，大約在10萬年前，現代人和尼安德特人之間
研究揭示家犬同人類近萬年來的共遷移歷史
家犬是人類第一個馴化的動物，考古證據表明至少一萬年前歐亞大陸多處均出現了犬的身影，其起源、擴散以及與人類遷徙的互動關系等科學問題對于理解動物馴化和人類文明傳播都至關重要，因此長期受到學界的關注。早期基因組研究表明，家犬早在兩萬年前就已出現了血統分化并于歐亞大陸廣泛擴散，但這些擴散是否與特定人類文化群
我國科學家破解中國古代家犬線粒體全基因組
2020年1月8日，《分子生物學與進化》（Molecular Biology and Evolution）在線發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所古DNA實驗室研究員付巧妹團隊與中國科學院昆明動物研究所、陜西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、蘭州大學和四川大學等合作完成的關于中國古代家犬線
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
基因組所與昆明動物所在家犬起源進化研究中取得新進展
5月14日，中科院北京基因組研究所與中科院昆明動物研究所在家犬起源進化合作研究中取得重要進展，相關論文在最新一期《自然·通訊》在線發表。該研究成果從全基因組層面上闡述了狗的起源進化，并首次將其進化歷史和人類的近期演化聯系了起來。 在昆明動物所張亞平教授和基因組所吳仲義教授的帶領下，昆明動物
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組