中國熱科院首次公布椰子全基因組測序
記者2日從中國熱帶農業科學院獲悉，該院椰子研究所近日首次公開在《大數據科學》（《GigaScience》）雜志上發表了海南高種椰子的全基因組測序。 據了解，此前，對椰子的全基因組測序研究在行業內是一片空白。從2013年開始，中國熱科院椰子研究所聯合熱帶生物技術研究所、華大基因和法國農業國際合作研究中心（CIRAD）自籌經費展開研究，于2015年首次完成椰子的基因組序列拼接，成功發現椰子擁有282個特有基因家族，這些信息為椰子功能基因組的研究奠定了良好基礎。 科學家根據全基因組測序研究，便可從基礎原理解釋：椰子為什么生長在海邊？為什么椰子的油含量很高，并且富含水分？為什么有的椰子3年開花，有的8年開花？ 該研究團隊專家介紹，海南高種椰子基因組能為椰子以及棕櫚科作物耐鹽、抗旱、抗寒、高油等功能基因的挖掘提供參考，也可以解釋椰子高油、耐鹽、抗風等原理，對椰子重要農藝性狀的解析及全基因組關聯分析提供參考體系。“全基因組測序工......閱讀全文
中國熱科院首次公布椰子全基因組測序
記者2日從中國熱帶農業科學院獲悉，該院椰子研究所近日首次公開在《大數據科學》（《GigaScience》）雜志上發表了海南高種椰子的全基因組測序。 據了解，此前，對椰子的全基因組測序研究在行業內是一片空白。從2013年開始，中國熱科院椰子研究所聯合熱帶生物技術研究所、華大基因和法國農業國際合
椰子高質量基因組揭示椰子高矮之謎
近日，中國熱帶農業科學院椰子研究所作為第一完成單位，聯合海南大學、廣西大學、華北理工大學科研團隊，在國際學術期刊《基因組生物學》上發表最新研究論文。 該研究繪制了兩個參考級別椰子基因組，結合變異組學、轉錄組學、代謝組學以及細胞學等，揭示了單子葉植物染色體的進化過程和椰子染色的形成歷程；分析了高矮
Science：華大參與三種鱷魚基因組測序
最近，德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組，測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出，通過測定這些基因組序列，科學家們可以更好地了解鳥類的進化，它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組，可以說真正
Science：華大參與三種鱷魚基因組測序
最近，德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組，測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出，通過測定這些基因組序列，科學家們可以更好地了解鳥類的進化，它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組，可以說真正
華大基因測序近700種植物的基因組
近日，華大基因的研究人員對云南瑞麗植物園內部及周邊近700種植物的基因組進行了測序和分析。這項工作有助于推動地球生物基因組計劃（EBP）以及萬種植物基因組計劃（10KP）。 在華大基因研究院副院長劉心的領導下，研究團隊收集了761個植物樣本，并產生了54 Tb的測序數據，每個物種的平均測序深
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成
最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
研究表明椰子樹的個頭400萬年前就決定了
椰子是一種重要的熱帶油料和水果作物，有著豐富的性狀表現，比如植株有高有矮、椰肉有多有少、椰殼有大有小……是什么導致這些差異？椰子身上有太多的謎團待解。 近日，發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上的一篇論文中，科研團隊繪制了高、矮種椰子高質量參考基因組，揭示了單子葉植物染色體
椰子樹的個頭，400萬年前就決定了
椰子是一種重要的熱帶油料和水果作物，有著豐富的性狀表現，比如植株有高有矮、椰肉有多有少、椰殼有大有小……是什么導致這些差異？椰子身上有太多的謎團待解。近日，發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上的一篇論文中，科研團隊繪制了高、矮種椰子高質量參考基因組，揭示了單子葉植物染色體的進化過
中國熱科院牽頭發布椰子高質量基因組
近日，中國熱科院椰子研究所作為第一完成單位，聯合海南大學、廣西大學、華北理工大學科研團隊，在國際學術期刊 Genome Biology（影響因子：13.58；中科院一區）上發表題為“High-quality reference genome sequences of two coconut cu
花生基因組宣稱花生二倍體野生種全基因組測序完成
國際花生基因組計劃4月2日在美國弗吉尼亞州亞歷山大市宣布，包括中方合作單位在內的多國科研人員已經成功完成花生基因組測序，將為選育更高產、適應性更廣的花生品種提供幫助。 國際花生基因組計劃宣稱，花生全基因組測序取得的重大進展，分別代表花生屬A基因組和B基因組的兩個二倍體野生種的全基因組測序已
中國完成海帶等7種海洋生物全基因組測序
中國科學家10月30日在青島首次披露了海帶、櫛孔扇貝和南美白對蝦全基因組測序的部分成果，至此中國已完成7種大型海洋生物的全基因組測序，為改良這些海洋生物品質、提高產量奠定了科學基礎。 中國的海洋生物基因組學研究雖然起步較晚，但現在一些研究成果已達到國際前沿水準。目前，人類完成全基因組測序的
花生二倍體野生種全基因組測序完成
國際花生基因組計劃(International Peanut Genome Initiative, IPGI)——由多國作物遺傳學家參與的國際團隊，于2014年4月2日宣布，歷經數年努力后成功完成了世界上首個花生全基因組測序。新測定的花生基因組序列將為世界各地的研究人員和植物育種者使用，來促
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
“千種動植物基因組計劃”一期啟動100多種測序
由深圳華大基因研究院發起的“千種動植物基因組計劃”，一期已啟動100多種動植物基因組測序分析項目，其中近一半的項目已經完成或接近尾聲。 華大基因5月13日召開發布會稱，該“千種計劃”在重要物種基因組學研究領域和巨型基因組數據庫構建上取得階段性進展，該計劃將加速全球基因組學研
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
454用于西紅柿基因組測序
最近，西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜，以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜，并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較，尋找與水果有些特性相關的基因，相關文獻在Nature雜志作為封面文章發
測序基因組勘探食品污染
上周，兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠（Blue Bell Creameries）已確認有少量食品原料已感染李斯特菌，目
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
Nature突破：香蕉基因組測序
由法國的研究人員領導的一個國際小組近日完成了對香蕉品種小果野蕉(Musa acuminata)的基因組測序，并開始分析這一基因組草圖。相關研究成果發布在了7月11日的《自然》(Nature)雜志上。 研究人員采用Roche 454、Sanger和Illumina的測序方法繪制出了雙單倍
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
基因組測序拯救鸮鸚鵡
為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo，幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序，這為其保護管理提供了重要信息。 新西蘭鸮鸚鵡kakapo（Strigops habroptila）有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡，有的雄性甚至超過3公斤，被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡，通過