中國科學家發現肝癌細胞演化和遷移新路徑
記者今天從中科院北京基因組研究所獲悉，新近出版的《美國科學院院刊》上刊登了中國科學家在肝癌癌癥基因組研究方面的最新進展：利用嶄新的腫瘤演化分析理念，可以鑒定出腫瘤發生發展過程中突變產生的時間順序，以及導致腫瘤細胞增殖和腫瘤轉移的關鍵基因。這將為發展控制腫瘤生長的新技術、尋找適當的藥物靶點以用于腫瘤的個體化醫療奠定基礎。 這項研究是由中科院北京基因組研究所所長吳仲義及其團隊與國立臺灣大學醫學院教授陳定信、陳培哲等共同開展。此次發表的學術論文報告了該項研究的第一例肝癌全基因組最新研究成果。 目前，癌癥是人類死亡的第二大主因。肝癌、肺癌、食管癌和胃癌的5年生存率均不超過30%，其中肝癌僅為5%―6%。肝癌是全球第三位癌癥殺手，在我國則居第二位，肝癌的治療以手術治療為主，但即使早期切除，5年內仍有半數患者轉移復發。腫瘤發生是一個動態過程，是基因突變不斷累積的結果，并具有高度個體特異性。癌癥發生和......閱讀全文
“863”腫瘤全基因組研究獲進展
7月14日，“十一五”國家“863”重大專項“食管癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”和“肺癌全基因組關聯分析和藥物基因組學研究”成果匯報會在京召開。 日前，遺傳學權威期刊《自然—遺傳學》刊登了我國科學家食道癌和肺癌研究的重要進展。由中國醫學科學院腫瘤研究所分子腫瘤學國家重點實驗室教授林東昕
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
全基因組測序揭示肝癌相關基因突變
由亞洲癌癥研究組織(ACRG)、深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細胞癌相關的基因突變研究成果于2013年6月20日在《基因組研究》(Genome Research)雜志上發表。這是繼2012年3月份在《自然-遺傳學》上發表的乙肝病毒整合機制研究之后，該研究團隊在肝癌研究中所取得的又
日研究人員成功消滅腫瘤干細胞
新華社東京3月19日電：日本一個研究小組發現，對腫瘤干細胞進行基因操作可以使化療藥物更易發揮作用，殺死癌細胞。這一發現或促進開發出根治癌癥的治療方法。 腫瘤干細胞被認為在體內處于幾乎不增殖的“休眠狀態”。化療藥物雖能遏制腫瘤細胞增殖，但對干細胞卻難以發揮作用。即使化療后腫瘤看起來
日本研究人員成功消滅腫瘤干細胞
日本一個研究小組發現，對腫瘤干細胞進行基因操作可以使化療藥物更易發揮作用，殺死癌細胞。這一發現或促進開發出根治癌癥的治療方法。 腫瘤干細胞被認為在體內處于幾乎不增殖的“休眠狀態”。化療藥物雖能遏制腫瘤細胞增殖，但對干細胞卻難以發揮作用。即使化療后腫瘤看起來已經消失，但只要殘留少量
EBioMedicine：全基因組測序高效識別癌癥相關基因突變
UT西南醫學中心癌癥研究人員已經證明，全基因組測序可用于識別癌癥的遺傳性風險，其可以潛在地改善癌癥的預防，診斷和治療。 這是首次研究使用了全基因組測序以評估一系列258癌癥患者的基因組，診斷其癌癥傾向性突變情況。這項研究發表在雜志EBioMedicine上。全基因組測序是新的基因工具，能夠確定
單細胞的可靠全基因組擴增
目前多種新型分析技術，如新一代測序和芯片，都是為細胞群體而設計的，需要一定的樣本量。對于一些臨床或法醫樣本，如腫瘤細胞或循環胎兒細胞等，它們的細胞數量有限，直接限制了其下游應用。例如，在分析腫瘤細胞中的體細胞DNA突變或單個細菌基因組時，單細胞中的DNA無法滿足測序的mg級樣品量需求。為了從少量樣品
中國科學家發現肝癌細胞演化和遷移新路徑
記者今天從中科院北京基因組研究所獲悉，新近出版的《美國科學院院刊》上刊登了中國科學家在肝癌癌癥基因組研究方面的最新進展：利用嶄新的腫瘤演化分析理念，可以鑒定出腫瘤發生發展過程中突變產生的時間順序，以及導致腫瘤細胞增殖和腫瘤轉移的關鍵基因。這將為發展控制腫瘤生長的新技術、
基因組所肝癌全基因組合作研究取得新進展
近日，由中國科學院北京基因組研究所所長吳仲義及其科學團隊與國立臺灣大學醫學院陳定信院士、陳培哲院士共同合作開展的“肝癌癌癥基因組合作研究”計劃獲最新進展，相關學術論文在在最新出版的PNAS雜志上發表。 “肝癌癌癥基因組合作研究”計劃于2009啟動，作為基因組所一項長期的癌癥基因
復雜腫瘤全基因組異常的檢測難題得以解決
中國科學技術大學信息科學與技術學院副教授李驁研究組以原創性論文（Original paper）的形式，在Bioinformatics上在線發表了最新研究成果。論文的第一作者是博士生余振華。 基因組異常是多種惡性腫瘤的標志性特征，在腫瘤發病機理、臨床診斷和治療等研究中具有極為重要的作用。傳統的腫
多種測序技術或將深入推動癌癥領域研究
本文中小編整理了多篇文章，來解讀測序技術在闡明癌癥發生機制、癌癥診斷及療法開發等方面的巨大潛力，與各位一起學習！ 【1】JAMIA：新工具深入挖掘外顯子測序結果 幫助找到最佳癌癥治療藥物 doi：10.1093/jamia/ocw022 科羅拉多大學的研究人員最近在國際學術期刊JAMIA上
中國科大攻克復雜腫瘤全基因組異常的檢測難題
中國科學技術大學信息科學與技術學院副教授李驁研究組以原創性論文（Original paper）的形式，在Bioinformatics上在線發表了最新研究成果。論文的第一作者是博士生余振華。 基因組異常是多種惡性腫瘤的標志性特征，在腫瘤發病機理、臨床診斷和治療等研究中具有極為重要的作用。傳統的
全基因組測序助推常規巴氏檢測法敏銳診斷腫瘤
來自約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心的科學家們開發了一種測試方法，利用常規巴氏檢測（Pap test）獲得的宮頸分泌物來檢測卵巢癌及子宮內膜癌。在一項初步研究中，研究人員采用這種命名為“PapGene”的測試方法，依靠全基因組測序癌癥特異性突變，檢測出了全部24個子宮內膜癌，以及22個卵巢癌其中
研究人員發布全基因組單核苷酸變異數據庫
10月22日，國際學術期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
震驚！全基因組測序還能這樣用在癌癥治療上？
近年來，隨著全基因組測序所需時間和成本的降低，個體化治療將造福更多的癌癥患者。近日發表于《Nature Medicine》的一項研究表明，開發新的機器學習算法對腫瘤全基因組序列信息進行分析，有助于預測患者的預后，幫助患者選擇最佳的治療方案。 全基因組測序（Whole-genome seque
－利用腫瘤細胞的基因突變制備癌癥疫苗
個性化疫苗為治療多對基因突變引發的癌癥提供新的選擇。 在一個小型臨床試驗中，利用在腫瘤細胞中的突變蛋白所制備的疫苗成功地引發了機體對癌細胞的免疫應答反應。 該結果是目前致力于研發個性化癌癥治療所得出的最新成果，并公布于4月2日的科學（Science）雜志中。在此次試驗中，三位惡性黑色素瘤患者
單細胞全基因組擴增技術大比武
2013年，權威技術期刊《Nature Methods》將年度技術授予了單細胞測序。正如社論中所說，每個細胞都是獨一無二的--它占據了獨特的空間位置，它的復制基因組中攜帶了獨特的錯誤。然而，過去以細胞群體為對象的研究只獲得了平均值，而忽略了異質性。目前多種新型分析技術，如NGS，都是為細胞群
科研人員創建新型全腫瘤細胞疫苗平臺
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505835.shtm全腫瘤細胞疫苗（TCV）是經典的個體化腫瘤免疫療法，由于其免疫原性弱且引起的免疫反應個體差異大，亟需通過學科交叉發展新理念和新技術，實現按需免疫增效。近日，中國科學院過程工程所（以下簡
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲，地理分布廣，感染率高，寄生于人體盲腸，導致人體慢性感染，對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
研究人員開發羥基酪醇高效全細胞催化劑
羥基酪醇（Hydroxytyrosol）是一種天然的抗氧化劑，具有很強的清除自由基能力。已報道的以酪氨酸為底物生成羥基酪醇的生物合成途徑由于使用了鼠源酪氨酸羥化酶，嚴重地限制了羥基酪醇的有效生成。中國科學院微生物研究所唐雙焱課題組在文獻調研及前期工作的基礎上，通過有序消除兩個限速酶步驟的瓶頸制約
新算法比較分析可搜索癌癥基因突變
桑福德伯翰醫學研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承擔了前所未有的對一個新興算法類別的比較分析，該算法通過聚焦內部基因結構，在癌癥數據庫中挖掘遺傳信息（即亞基因像素算法），這與專注于基因視其為單個單元的經典方法形成
全基因組測序是癌癥診斷的強有力工具
? 一位沒有明顯癌癥家族史的婦女卻罹患了早發性乳腺癌和卵巢癌，以及與治療有關的急性髓細胞樣白血病。研究人員對這名婦女進行了全基因組測序，所用的是從該患者的皮膚和骨髓中獲取的DNA。在許多被懷疑患癌癥可能性增加了的病人中，常規性的候選基因測試（如BRCA1??和??BRCA2突變檢測）無法顯示出有用的
謝曉亮：單細胞全基因組測序曙光初現
?謝曉亮 12月21日出版的美國《科學》雜志發表了題為《單細胞全基因組測序探索精子重組規律和遺傳缺陷》的論文。同時，該期《科學》雜志也將單細胞全基因測序列為2013年六大值得關注的科學領域之一。 該論文由美國科學院院士、哈佛大學教授謝曉亮課題組與北京大學生物動態光學成像中心（
腦癌細胞系全基因組測序首次完成
其所揭示的新分子靶標將有助于開發出更具效力和更少毒性的藥物 美國加州大學洛杉磯分校瓊森綜合癌癥研究中心的科學家在1月29日的《公共科學圖書館·遺傳學》(PLoS Genetics)專刊上發表論文指出，他們首次完成了腦癌細胞系全基因組測序，這也是截至目前對單個癌癥細胞系所做的最為徹底的測序分析。
泛癌研究成果－基于WGS－22種轉移性實體瘤的全基因組特征
癌細胞轉移是癌癥相關死亡的主要原因之一，并與不良的治療效果有關。癌細胞轉移通常會導致癌細胞和腫瘤微環境發生急劇變化，并對當前的治療方法產生抗性。因此，更好地了解轉移性腫瘤的特征有助于找到合適的個性化治療方法，減少過度治療并改善預后。 近日，來自新西蘭的一個研究團隊在國際頂級學術期刊《自然》發表
Science：梳理患兒腫瘤細胞的基因組尋求答案
組蛋白翻譯后修飾方式出現異常，以及組蛋白修飾位置出現異常都會導致腫瘤發生。 高通量DNA測序技術的快速擴張讓我們能夠以前所未有的速度和精細度對人體疾病展開遺傳學分析，尤其是對罕見的小兒疾病進行全基因組測序(whole-genome sequencing)更是有助于我們對兒童發育，以及多
研究人員對肝硬化單細胞病理學進行全解析
2019年10月10日，英國女王醫學研究所N. C.Henderson和P. Ramachandran研究組在Nature上發表了題為“Resolving the fibrotic niche of human livercirrhosis at single-cell level”長文，對超過
光控增效型全腫瘤細胞疫苗研究獲進展
全腫瘤細胞疫苗（whole tumor cell vaccine，TCV）是經典的個體化腫瘤免疫療法，但TCV免疫原性弱且引起的免疫反應個體差異大，亟需通過學科交叉發展新理念和新技術，實現TCV的按需免疫增效。近日，中國科學院過程工程研究所生化工程國家重點實驗室與中國科學院大學化學科學學院合作，
光控增效型全腫瘤細胞疫苗研究獲進展
全腫瘤細胞疫苗（whole tumor cell vaccine，TCV）是經典的個體化腫瘤免疫療法，但TCV免疫原性弱且引起的免疫反應個體差異大，亟需通過學科交叉發展新理念和新技術，實現TCV的按需免疫增效。近日，中國科學院過程工程研究所生化工程國家重點實驗室與中國科學院大學化學科學學院合作，
香港中大破解鼻咽癌全基因組圖譜
香港中文大學7日宣布，該校醫學院研究人員成功破解鼻咽癌的全基因組圖譜，這一突破性發現有助評估鼻咽癌病人的預后情況，并向鼻咽癌的個人化治療邁出一大步。 鼻咽癌是華南地區常見的癌癥，也是一種極具侵略性的頭頸癌。據介紹，鼻咽癌大多與感染EB病毒相關。由于缺乏早期病征，60%至70%患者于確診時已屆晚