最新測序技術能用單個細胞分析基因組
美國物理學家組織網9月18日報道，最近，來自美國加利福尼亞大學圣地亞哥分校、克雷格·文特爾研究院和Illumina公司的科學家對現代基因測序算法進行了改良，只需從一個細菌細胞中提取的DNA（脫氧核糖核酸）就可組裝成接近完整的基因組，準確率達到90%，而傳統的測序方法至少需要10億個相同的細胞才能完成。這一突破為那些無法培養的細菌提供了測序方法。研究發表在9月18日的《自然·生物技術》網絡版上。 實驗室無法培養的細菌范圍極廣，約占99.9%，從產生抗體和生物燃料的微生物，到人體內的寄生菌。它們的生存條件特殊，比如必須和其他菌種共生，或只能生存在動物皮膚上，因此很難進行人工培養。 論文合著者、文特爾研究院的羅杰·拉斯肯教授10年前曾開發出一種多重置換擴增（MDA）技術，可對實驗室無法培養的細菌測序，能恢復70%的基因。其工作原理是對一個細胞的基因片斷多次復制，直到其數量相當于10億個細胞那么多。不過，這......閱讀全文
什么是基因組測序技術
自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來，人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開，分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中，他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法"，人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法"，其實是一種
澳科學用基因組測序技術研究提升牛類健康新方法
“高大上”的基因測序技術，在實際生產生活中其實也可用于畜牧業——譬如說用來增加牛類的產肉和產奶效率。14日，英國《自然-遺傳學》雜志在線發表的一篇論文中，澳大利亞遺傳學家們匯報了234頭牛的完整DNA序列。這些“調查對象”所具有的品種內部遺傳多樣性，可以幫助畜牧業更好、更直接地選擇健康的牛。
澳科學用基因組測序技術研究提升牛類健康新方法
“高大上”的基因測序技術，在實際生產生活中其實也可用于畜牧業——譬如說用來增加牛類的產肉和產奶效率。14日，英國《自然-遺傳學》雜志在線發表的一篇論文中，澳大利亞遺傳學家們匯報了234頭牛的完整DNA序列。這些“調查對象”所具有的品種內部遺傳多樣性，可以幫助畜牧業更好、更直接地選擇健康的牛。
英開發出簡化的基因組測序新方法
據物理學家組織網12月12日(北京時間)報道，英國研究人員簡化了基因組測序的標準流程，首次無需進行文庫制備便完成了DNA(脫氧核糖核酸)單分子測序，而且新方法只要很少量的DNA就能獲得序列數據，用量可低至不到1納克(10億分之一克)，僅為常規測序方法的500分之一到600分之一。 文庫制備
簡述單分子測序技術—第三代測序技術的基因組測序應用
由于具有讀長長的特點，SMRT測序平臺在基因組測序中能降低測序后的Contig數量，明顯減少后續的基因組拼接和注釋的工作量，節省大量的時間[25]。Christophern等[26]僅僅用0.5*的Pacbio RS系統長度的數據與38*的二代測序(NGS)的測序數據，對馬達加斯加的一種指猴基因
簡述全基因組測序的技術路線
全基因組測序的技術路線：提取基因組DNA，然后隨機打斷，電泳回收所需長度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接頭, 進行DNA簇（Cluster）制備，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法對插入片段進行測序。然后對測得的序列組裝成Contig，通
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
最新測序技術能用單個細胞分析基因組
美國物理學家組織網9月18日報道，最近，來自美國加利福尼亞大學圣地亞哥分校、克雷格·文特爾研究院和Illumina公司的科學家對現代基因測序算法進行了改良，只需從一個細菌細胞中提取的DNA（脫氧核糖核酸）就可組裝成接近完整的基因組，準確率達到90%，而傳統的測序方法至少需要10億個
美用新技術完成炭疽基因組測序
美國喬治亞理工學院科學家使用一種稱為RNA測序的新技術，描繪出了炭疽芽孢桿菌的基因表達。公布在最新一期《細菌學》雜志網絡版上的此項研究成果，標志著任何細菌轉錄(細菌表達不同基因時產生的完整信使RNA集合)自此可被全面定義，并為研究細菌如何調控基因表達提供了更多細節。 喬治亞理工學院光電系統
單細胞全基因組擴增技術大比武
2013年，權威技術期刊《Nature Methods》將年度技術授予了單細胞測序。正如社論中所說，每個細胞都是獨一無二的--它占據了獨特的空間位置，它的復制基因組中攜帶了獨特的錯誤。然而，過去以細胞群體為對象的研究只獲得了平均值，而忽略了異質性。目前多種新型分析技術，如NGS，都是為細胞群
Nature子刊發布重磅測序技術：基因組和轉錄組平行測序
四月二十七日的Nature Methods雜志上發布了一項引人注目的測序技術，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。該技術能夠實現大規模的DNA和RNA平行測序，同時展現單個細胞的基因組序列和基因活性。 研究人員用G&T-seq對220個小鼠
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
長讀長測序技術：拯救基因組組裝項目
隨著高精度長讀長測序技術的出現，基因組難以組裝的狀態正在改變。《Nature Methods》雜志上近日發表了一篇文章，介紹了基因組組裝項目如何受益于這種技術。 自測序技術問世以來，利用DNA序列的片段來組裝人類、動植物或微生物的基因組就一直是難題。許多參考基因組都存在缺陷，如組裝錯誤或存在缺
謝曉亮團隊利用遺傳診斷新技術提高試管嬰兒成功率
今年2月底在美國佛羅里達召開的生物技術領域最有影響力的“全球基因組生物學與技術進展”(AGBT)大會上，美國科學院院士、北京大學長江講座及千人計劃教授、北京大學生物動態光學成像中心(BIOPIC)主任謝曉亮代表北大BIOPIC-北醫三院生殖醫學研究團隊報告了一項最新的單細胞基因組擴增技術成果，首
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
！單細胞測序的”CPU－2.0”時代
對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面，在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值；另一方面，對于非常珍貴的細胞樣品
宏基因組下一代測序技術問世
據12日發表于《自然·醫學》雜志的論文，美國加州大學舊金山分校科研團隊成功研發了一種宏基因組下一代測序（mNGS）技術，該技術能夠在短時間內檢測出包括病毒、細菌、真菌及寄生蟲在內的多種病原體。這項歷時10年的研究成果，預示著其在診斷由腦膜炎和腦炎等疾病引起的神經系統感染方面有著巨大潛力，并有望加
JAMA：全基因組測序用于臨床仍存在技術挑
據3月12日發表在《美國醫學會雜志》上的一則研究報告披露，在一項有12名成年人參與的探索性研究中，應用全基因組測序(WGS)與不完整的遺傳性疾病基因的覆蓋、檢測具有最高潛在臨床影響的基因變異的低復驗性，以及臨床報告發現的不確定性有關，盡管在某些案例中，WGS會發現基因變異株從而引入早期的醫療干預
羅氏宣布推出目標基因組測序的新技術
羅氏應用科學部（Roche Applied Science）旗下的Roche NimbleGen公司的宣布推出商業化的NimbleGen序列捕獲技術（NimbleGen Sequence Capture technology），以幫助那些希望對基因組選定目標區域進行高通量測序的科學家們。這項新技術使
多種測序技術成就高質量的蚊子基因組
提起蚊子，相信大家沒有愛只有恨吧。這種惱人的生物不僅會吵得你睡不好覺，還會傳播多種疾病。每年全球大約有4億人感染由埃及伊蚊（Aedes aegypti）傳播的病毒，包括登革熱、黃熱病、寨卡和基孔肯雅病毒。 為了更好地了解蚊子背后的生物學，并開發消滅蚊子的工具，由洛克菲勒大學領導的國際研究團隊本
關于基因組高通量測序的技術發展介紹
高通量測序平臺(high-throughput_genome_sequence_database) 自從2005年454 Life Sciences公司（2007年該公司被Roche正式收購）推出了454 FLX焦磷酸測序平臺（454 FLX pyrosequencing platform）以
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
單細胞的可靠全基因組擴增
目前多種新型分析技術，如新一代測序和芯片，都是為細胞群體而設計的，需要一定的樣本量。對于一些臨床或法醫樣本，如腫瘤細胞或循環胎兒細胞等，它們的細胞數量有限，直接限制了其下游應用。例如，在分析腫瘤細胞中的體細胞DNA突變或單個細菌基因組時，單細胞中的DNA無法滿足測序的mg級樣品量需求。為了從少量樣品
警惕皮肌炎mda5！
MDA5皮肌炎是最重要、最致命的肺間質疾病，發展迅速。起初，運動后出現干咳和氣短。隨著肺部疾病的發展，屏氣的表現越來越明顯和加重，稍有活動就會出現屏氣。在疾病的后期，窒息也發生在靜止狀態，需要持續吸氧。最后，氧氣吸入無法維持，需要氣管插管。死亡率相對較高，疾病往往進展迅速。呼吸衰竭發生在最短的一
Nature－Methods新方法能矯正RNAseq測序的技術偏差
基因表達分析正越來越多地用于癌癥的診斷和檢測，是生物學研究的主要工具，一種新型的計算方法可以提高基因表達分析的準確性。 來自卡耐基梅隆大學和紐約州立大學石溪分校的研究人員稱，他們的方法（被稱作Salmon）能夠矯正轉錄組測序技術（RNA-seq）中的技術偏差。而且這種技術預估基因表達水平的速度