單抗藥物的分子質量、氨基酸序列以及糖基化位點鑒定三
經過 Protein Deconvolution 2.0 軟件去卷積處理之后的單抗分子質量分布圖（圖 3），根據單抗的氨基酸序列理論分子質量進行計算，將觀察到的質譜峰進行歸屬，可以初步推斷該單抗藥物存在多種形式的糖鏈結構，主要包括 G0、G0F、G1F 和 G2F，該結論與常見的單抗組成基本一致，同時根據質譜峰的峰強度信息，我們還可以計算得到不同糖型單抗的相對定量信息，如圖 3 中藍色數字所示。 圖 3. LTQ-Orbitrap Elite 質譜采集的單抗原始質譜圖經過 Protein Deconvolution 2.0 軟件去卷積處理之后的單抗分子質量分布圖（G0、G0F、G1F 和 G2F 表示不同類型的糖型，藍色數字表示質譜峰所對應的峰強度和相對定量信息。） 3.2 氨基酸序列測定經過 LTQ-Orbitrap Elite 質譜數據采集和 Proteome Discoverer 1......閱讀全文
植物蛋白質組學和糖基化實驗（四）
3.3 我的糖基化蛋白在哪實驗人員可通過這個方法獲得關于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的結構信息。這類實驗可在純化的糖蛋白或者從 1D 或 2D 電泳膠上分離出來的蛋白上進行，首先，用蛋白內切酶消化蛋白質，通過高效液相色譜（HPLC) 分離消化后的肽和糖肽混合物。對含有糖苷的收集組分進行糖
直播預告丨多肽藥物第五期多肽藥物的結構表征與分析
多肽類藥物由多種氨基酸組成，通常分子量較大，紫外光譜、紅外光譜、核磁共振波譜等常用的小分子化學藥物確證方法不能滿足全方面結構解析的要求。指導原則提出“多肽原料藥一級結構應明確氨基酸連接順序，對于具有氨基酸側鏈修飾的多肽和存在兩個以上分子內環（如二硫鍵、酰胺鍵等）的環肽，應明確具體修飾位點、修飾物結構
新技術可高效誘導單克隆抗體
抗體藥物作為生物技術產業的關鍵驅動力，能安全有效地對癌癥、自身免疫病和感染性疾病等進行靶向治療，該藥物在2012年創下全球645.7億美元的銷售額，占生物制藥51.8%的份額。目前抗體藥物的市場需求量仍在攀升，預計到2015年，抗體藥物銷售額有望達980億美元左右。業內人士認為，隨著疾病譜變化，
20點直播｜三位專家講述分子生物學
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/520924.shtm直播時間：2024年4月16日（周二）20:00-22:00直播平臺： 科學網APP （科學網微博直播間鏈接） 科學網微博 科學網視頻號 北京時間4月16日晚八點，
分子細胞中心等研發出系統性鑒定siRNA脫靶位點新方法
12月4日，Molecular Therapy–Nucleic Acids在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心（生物化學與細胞生物學研究所）吳立剛研究組，上海市計劃生育科學研究所李衛華研究組與揚州大學趙雅研究組合作的研究成果Identifying Cleaved and Noncleav
糖基轉移酶的小分子抑制劑編輯氮連接連接糖基化位點
蛋白質的N連接的糖基化是一種重要的蛋白翻譯后修飾，對蛋白質的折疊、穩定性和生理功能均起著重要的作用。N連接糖基化修飾主要是通過糖基轉移酶（OST）將寡糖逐漸轉移到蛋白質中的NXT/S (X≠P) 序列上的天冬酰胺上。OST含有兩個獨立編碼的催化亞基，分別為SST3A和STT3B。SST3A負責大
簡述血凝素的生物組成
病毒基因組片段4編碼流感病毒的主要膜蛋白血凝素(HA),各型及亞型病毒的HA基因長度略有不同,從1742～1778核苷酸不等。HA蛋白的命名來源于病毒顆粒通過HA蛋白與特異性含唾液酸的受體結合,凝集血紅細胞。其合成是首先在細胞內質網合成分子量為 76 kD、含有 562～566個氨基酸的 HA蛋
血凝素的生物組成
病毒基因組片段4編碼流感病毒的主要膜蛋白血凝素(HA)，各型及亞型病毒的HA基因長度略有不同，從1742～1778核苷酸不等。HA蛋白的命名來源于病毒顆粒通過HA蛋白與特異性含唾液酸的受體結合，凝集血紅細胞。其合成是首先在細胞內質網合成分子量為 76 kD、含有 562～566個氨基酸的 HA蛋白前
血凝素的生物組成
病毒基因組片段4編碼流感病毒的主要膜蛋白血凝素(HA)，各型及亞型病毒的HA基因長度略有不同，從1742～1778核苷酸不等。HA蛋白的命名來源于病毒顆粒通過HA蛋白與特異性含唾液酸的受體結合，凝集血紅細胞。其合成是首先在細胞內質網合成分子量為 76 kD、含有 562～566個氨基酸的 HA蛋白前
治療性抗體藥物的思考
前段時間，有小伙伴在公眾號留言說能不能寫點生物藥的文章，不要老是小分子藥嘛。難道你們團隊里只有化學，沒有生物？我們團隊的生物大咖劉博坐不住了，閃開，我來做個分享，絕對干貨！后面還要加鹵蛋！（不對，是彩蛋！） 話不多說，直接開始： 1897年Paul Ehrlich 提出的“魔術子彈”( ma
為何要關注抗體藥物的糖基化修飾？
在眾多的蛋白質翻譯后修飾中，糖基化修飾是最重要和最復雜的修飾之一，也是評價抗體的關鍵質量屬性之一。單抗藥物功能的實現與其糖基化修飾密切相關，糖基化修飾會影響蛋白的性能，如構象、穩定性、溶解度、藥物代謝動力學、活性及免疫原性。本文中，筆者就糖基化及其對抗體藥物的穩定性/半衰期、安全性及生物活性進
研究抗體藥物的糖基化修飾為何重要？
在眾多的蛋白質翻譯后修飾中，糖基化修飾是最重要和最復雜的修飾之一，也是評價抗體的關鍵質量屬性之一。單抗藥物功能的實現與其糖基化修飾密切相關，糖基化修飾會影響蛋白的性能，如構象、穩定性、溶解度、藥物代謝動力學、活性及免疫原性。本文中，筆者就糖基化及其對抗體藥物的穩定性/半衰期、安全性及生物活性進行
分子層面鑒定遺傳－兒童癌癥基因組找到可用藥物靶點
英國《自然》雜志1日在線發表的兩篇文章，美國和歐洲科學家在基因組和分子層面上詳細表征了上千例兒童癌癥，這是在兒童中進行的首次泛癌癥基因組分析。其結果有利于人們理解兒童癌癥的起因，并有助于研發新的治療方案。圖片來源于網絡 德國NCT海德堡霍普兒童癌癥中心（KiTZ）的科學家團隊，此次選取914名
糖基化位點檢測
經常聽到糖基化修飾，今天帶大家一探究竟。什么是糖基化修飾呢？糖基化是在糖基轉移酶的控制下，蛋白質或脂質附加上糖類的過程，發生于內質網和高爾基體。糖基化修飾是一類非常重要的翻譯后修飾，大部分膜蛋白和分泌蛋白均為糖蛋白，糖基化修飾不僅影響蛋白質的空間構象、活性、運輸和定位，同時在信號轉導、分子識別，
蓖麻毒蛋白的物化性質
生化組成蓖麻毒蛋白是糖蛋白異二聚體，是由全毒素、毒類素、凝集素三種物質組成的蛋白質，并由數種不同類型的高分子蛋白質組成，其分子式為：-[C8H8N2O2]n-，分子量64000左右，也有報道為36000～85000。已發現的結晶型有已發現的類型有：結晶型（2種）、B1型、T3型、G型、D型，中國和日
IgA1異常糖基化在IgA腎病的致病機制
IgA腎病發病機制中，IgA1異常糖基化致病機制是一個研究的熱點。 雖然其學術地位重要，但是近年來出現了質疑之聲。 本次學習筆記的要點就在于此。 IgA1分子的異常糖基化是導致 IgA 腎病發病的關鍵因素。 IgA1 異常糖基化主要是 指GalNAc末端無 Gal相連接, 表現為 O連接
揭示新的藥物靶點：KRAS蛋白的構象控制位點
控制KRAS：揭示關鍵癌癥蛋白的變構位點研究人員在基因組調控中心和威康薩克研究所利用深度突變掃描技術全面識別了蛋白質KRAS中的變構控制位點，該蛋白質是許多類型的癌癥中最常見的突變基因之一。科學家們使用深度突變掃描技術來量化超過26,000個突變對KRAS的折疊和其與六個相互作用伙伴結合的影響。KR
控制融合蛋白生產中的糖基化生成有潛力的biobetter
制藥公司的管線充滿了生物藥物。許多是創新的治療蛋白質，但越來越多的代表生物仿制藥和biobetters（圖1）（1）。biobetters通常被定義為“基于創新生物制品，但具有改進的性質”（2）。 他們的發展受益于已知的治療方法和作用機制，從而導致低風險，快速通向臨床，從而降低成本。優勢是通過延
txyz.ai初探EAD奧義:－AI釋讀7600系統新進應用
SCIEX高分辨質譜 ZenoTOF??7600 系統自2021年發布以來，各種學科的科學家利用其新型的電子活化解離(Electron Activated Dissociation, EAD)技術結合Molecule Profiler和Biologics Explorer等數據處理軟件，在生物藥、脂
蛋白質組學實用分析技術一覽
分析其實也屬于技術的一部分，且在蛋白質組學研究中顯得尤為重要，因為蛋白質組學研究提供的數據是生物學上最龐大的，而且蛋白質組比基因組具有更大的復雜性，因此蛋白質組信息學更有挑戰性。今天小編先拋磚引玉地介紹幾個常用的分析方法和軟件。蛋白質定性分析蛋白質定性分析通常是指利用質譜法進行蛋白質鑒定和序列分析。
楊福全、付巖團隊在人血清N鏈接糖基化蛋白質組學獲進展
2月29日，國際蛋白質組學期刊Molecular & Cellular Proteomics 在線發表了由中國科學院生物物理研究所研究員楊福全團隊和中國科學院數學與系統科學研究院副研究員付巖團隊在人血清N-鏈接糖基化蛋白質組學研究中所取得的進展“Large-scale Identificatio
怎么確定小分子與蛋白的活性位點
1 A:對接的時候，小分子與蛋白的活性位點是怎么選呢?參照文獻么?選擇的時候，活性位點有很多，是選擇什么樣的位點對接呢? B:先分析你的化合物和已知底物的相似性關系，再選擇合適位點。 A:我剛剛開始接觸這些，不太懂，相似性關系是分析哪方面呢? B:拓撲結構相似性，電荷分
怎么確定小分子與蛋白的活性位點？
1A:對接的時候，小分子與蛋白的活性位點是怎么選呢?參照文獻么?選擇的時候，活性位點有很多，是選擇什么樣的位點對接呢?B:先分析你的化合物和已知底物的相似性關系，再選擇合適位點。A:我剛剛開始接觸這些，不太懂，相似性關系是分析哪方面呢?B:拓撲結構相似性，電荷分部的相似性。一類化合物能結合多個口袋的
單抗糖基化調控之控制參數篇
關鍵質量參數是單抗仿制藥研發的標桿，包括糖基化修飾、聚體、電荷異質性等，其中如糖基化修飾對單抗的生物活性、免疫原性、藥物代謝動力學、構象、穩定性及溶解度具有重要的影響。細胞培養過程中細胞所處環境，如pH、溫度、滲透壓、溶氧等參數會影響到單抗糖基化表現，本文就文獻中對滲透壓、培養時間和溶氧等培養控
單抗糖基化調控之參數篇（二）
關鍵質量參數是單抗仿制藥研發的標桿，包括糖基化修飾、聚體、電荷異質性等，其中如糖基化修飾對單抗的生物活性、免疫原性、藥物代謝動力學、構象、穩定性及溶解度具有重要的影響。細胞培養過程中細胞所處環境，如pH、溫度、滲透壓、溶氧等參數會影響到單抗糖基化表現，本文從pH著手就文獻中不同pH設置及調節pH
單抗糖基化調控之參數篇(下)
關鍵質量參數是單抗仿制藥研發的標桿，包括糖基化修飾、聚體、電荷異質性等，其中如糖基化修飾對單抗的生物活性、免疫原性、藥物代謝動力學、構象、穩定性及溶解度具有重要的影響。細胞培養過程中細胞所處環境，如pH、溫度、滲透壓、溶氧等參數會影響到單抗糖基化表現，本文從pH著手就文獻中不同pH設置及調節p
氨基酸序列的測定方法
有兩種方法，一是直接測序列法，常用Edman降解法，在弱堿性條件下多肽連N端氨基酸（阿爾發）與PITC反應，標記為苯氨基硫代甲酰蛋白質。肽鏈中的第一個肽鍵變弱，在無水酸的存在下發發生降解，第一個氨基酸（AA1）經過分子重排成為PTH-AA1結合層析技術即可確定氨基酸的性質。C端氨基酸殘基分析，可用；
氨基酸序列的測定方法
有兩種方法，一是直接測序列法，常用Edman降解法，在弱堿性條件下多肽連N端氨基酸（阿爾發）與PITC反應，標記為苯氨基硫代甲酰蛋白質。肽鏈中的第一個肽鍵變弱，在無水酸的存在下發發生降解，第一個氨基酸（AA1）經過分子重排成為PTH-AA1結合層析技術即可確定氨基酸的性質。C端氨基酸殘基分析，可用；
抗體偶聯藥物（ADC）生產用原材料的質量控制
抗體偶聯藥物（Antibody-Drug Conjugate，ADC）是通過連接子（linker）將具有生物活性的小分子藥物偶聯至單克隆抗體（單抗）上而產生的。 生產用原材料的控制 單抗：ADC 的單抗生產及控制應依據“人用重組單克隆抗體制品總論”及“人用單克隆抗體質量控制技術指導原則”，采
天津工生所等提高大腸桿菌植酸酶活性研究取得進展
植酸酶是重要的飼料添加劑，來自大腸桿菌的植酸酶(EcAppA)為目前所知活性最高的植酸酶之一，具有重要的商業應用價值，但是EcAppA的耐熱性較差，需要進一步增強以避免在飼料制程中經高溫處理而失去酶活。 中國科學院天津工業生物技術研究所的郭瑞庭研究員帶領的研究組和東莞泛亞太生技公司及臺灣基酵