長鏈非編碼RNA:從科研到臨床(一)
概述長鏈非編碼RNA (LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結構,或在細胞質中調控翻譯、促進或抑制mRNA降解、吸附miRNA等。LncRNA具有譜系特異性,參與調控基因組印記、干細胞多潛能分化、胚胎發育[1]、心臟發育[2]、造血與免疫系統[3]以及內分泌系統[4]等多種生物生理學過程。在一系列疾病,比如神經退行性疾病、心血管疾病[5]、腎臟疾病、糖尿病和腫瘤[6]中,都發現了lncRNA的表達紊亂。檢測不同細胞或疾病狀態下的lncRNA表達量有助于理解其功能、揭示其作用機理、或鑒定有效的分子標志物。LncRNA分類雖然關于lncRNA已有很多研究,然而目前只有少量lncRNA的功能......閱讀全文
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(一)
概述長鏈非編碼RNA?(LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床
長鏈非編碼RNA (LncRNA)是一類真核生物中長度大于200 nt的非編碼RNA分子;根據其與鄰近基因的位置可以分為反義lncRNA、增強子lncRNA、基因間lncRNA、雙向lncRNA、和內含子lncRNA;它具有多種作用機制,比如在細胞核中作為分子支架、協助可變剪接、調節染色體結構
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(三)
腎臟疾病與糖尿病?糖尿病經常伴隨著腎病的發生[5].?比如基因間lncRNA PVT1與二類疾病都緊密關聯。研究人員在II型糖尿病人的晚期腎病進程中發現了PVT1的基因變異。高糖處理可以誘導人的腎間質細胞中PVT1和纖連蛋白1、IV型膠原蛋白、TGFβ1、PAI1等因子的高表達。相反,敲除P
長鏈非編碼RNA:-從科研到臨床(二)
脂類代謝和脂肪生成最新的研究表明,lncRNA控制肝臟中的脂類代謝,調控脂肪生成,從而維持機體的脂質穩態[9]。APOA1編碼蛋白是高密度脂蛋白的重要組分。其反義轉錄本APOA1-AS可以在體內和體外抑制APOA1的表達。LncRNA NEAT1在脂肪生成過程中調節PPARγ2的可變剪接,它還介
長鏈非編碼RNA調控腫瘤生長
人類基因組能夠產生10000多種長鏈非編碼RNA(lncRNA),但是至今為止,人們只知道幾十種lncRNA分子的功能。 加州大學圣地亞哥分校的Liuqing Yang等人發表在Nature上的一項研究成果表明,兩種lncRNAs可以與雄激素受體結合并控制其功能。雄激素受體是一種轉錄因
長鏈非編碼-RNA(lncRNA)研究策略
長鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子,它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構。研究顯示,lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能,它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作
長鏈非編碼-RNA-測序案例分析
背景:人類壽命的延長伴隨著神經退行性疾病的發病幾率的增加,因而價格不貴的血液診斷的發展迫在眉睫。通過 RNA-seq 分析血液細胞的轉錄本是發現新的生物標志物的非常高效的途徑。 目的:利用 Illumina 測序平臺對帕金森病人白血球中 lncRNAs 進行分析,探討其對 mRNA 選擇性剪接的
帶你走進神秘的長鏈非編碼RNA
長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究
長鏈非編碼RNA與淋巴瘤
類基因組中僅有1.5%~2.0%編碼蛋白的基因得以穩定轉錄,而剩余的絕大多數RNA無編碼蛋白的功能。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類異質性的非編碼RNA,根據lncRNA的功能,可將其分為信號分子、誘餌分子、引導分子和骨架分子4類。人們以往僅將這些不具編碼功能的RNA視為進化過程中產生的廢
【盤點】長鏈非編碼RNA的研究進展
非編碼RNA在生命調控過程中扮演著重要角色,近年來的研究成果常入選CNS年度十大科學突破。人類基因組轉錄區高達76%,但轉錄產物中只有不到2%是編碼蛋白質的mRNA,其他均為非編碼RNA,其中microRNA (miRNA)、長鏈非編碼RNA(lncRNA)、環狀RNA(circRNA)等調控
調節免疫應答的新途徑——長鏈非編碼RNA
“我們需要知道細菌感染引發的炎癥反應是由什么來調節該過程的。”該研究的領導者,UTA大學化學副教授Subhrangsu Mandal說。 “如果我們能做到這一點,我們就可以控制中樞神經系統炎癥性疾病,迄今為止這些疾病一直難以治療,如敗血癥和腦膜炎,以及癌癥和肌肉營養不良,它們也可以看作一種炎癥
長鏈非編碼RNA測序服務助力揭開lncRNA神秘面紗
2012年12月18日,華大基因科技服務有限公司(簡稱“華大科技”)在國內推出長鏈非編碼RNA測序(lncRNA-Seq)服務。該技術突破了常規研究方法效率低、研究范圍受限的瓶頸,可一次性獲得樣本中幾乎全部的lncRNA序列,不僅可以對已知lncRNA進行定量分析,還可對 novel lnc
科學家發現長鏈非編碼RNA作用新模式
中國工程院院士、中國醫學科學院院長曹雪濤帶領課題組發現,長鏈非編碼RNA(lncRNA)可通過直接結合細胞漿中的信號轉導蛋白分子并影響其磷酸化的新方式而調控免疫細胞的分化發育與功能。該成果為研究lncRNA發揮生物學效應的作用機制提出了新觀點,并為免疫細胞分化發育與功能調控研究提出了新方向。相關
長鏈非編碼RNA對腦生長起重要作用
“長非編碼RNA通常被描述為‘基因組的暗物質’。在這里,我們系統地研究了它們對大腦發育、長期記憶儲存、衰老和癡呆導致的記憶力下降的分子機制,”Puthanveettil說。 RNA是細胞的主要調節因子,是讀取、轉錄和調節DNA表達以及構建蛋白質的小型核苷酸鏈,雖然科學家們已經掌握了腦細胞之間如
中國科大在動物長鏈非編碼RNA研究中取得進展
中國科學技術大學生命科學學院非編碼RNA功能及功能機理研究團隊近日在國際期刊《基因組生物學》(Genome Biology)發表了題為Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,報道了
研究發現空氣污染誘發肺癌關鍵長鏈非編碼RNA
中科院動物所周光飚研究組通過深入研究,發現了空氣污染誘發肺癌的關鍵長鏈非編碼RNA。相關成果日前發表于腫瘤學雜志Oncotarge。 據了解,肺癌已成為全球發病率最高、致死人數最多的癌癥,其中90%的肺癌由吸煙、空氣污染等環境因素引起。然而,空氣污染誘發肺癌的分子機制目前尚不清楚。 此前研究
長非編碼RNA與肺癌轉移
我們體內的大多數DNA(約80%)并沒有編碼蛋白,不過它們會轉錄為RNA。這些非編碼的RNA分子負責在細胞中實現多種功能。microRNA等小RNA已經被研究得很多了,近年來人們又發現了一類長非編碼RNA,這些RNA擁有兩百個以上的核苷酸。 長非編碼RNA對細胞周期、細胞生長和細胞死亡等細
長鏈非編碼RNA編碼多肽的系統挖掘和鑒定研究新進展
6月13日,Molecular & Cellular Proteomics在線發表了中國科學院生物物理研究所研究員楊福全團隊和中科院院士陳潤生團隊,關于長鏈非編碼RNA(lncRNA)編碼多肽的系統挖掘和鑒定的研究論文Deeply Mining a Universe of Peptides En
科學家通過多種方法探究長鏈非編碼RNA
直到今天,針對lncRNA的簡潔且合理的分類系統仍遙不可及。長鏈非編碼RNA的概念模型 2013年,一群研究人員決定更加深入地挖掘一種名為H1的人類胚胎干細胞系,并且獲得了一些驚喜。H1是最著名的干細胞系之一,但該團隊還是成功發現了2000多個此前未被闡明的RNA片段。更重要的是,其中有1
從心臟病到癌癥——長非編碼RNA到底發揮了什么作用?
直到近幾年才發現人類基因的70%是非編碼RNA,非編碼RNA不能翻譯為蛋白質,但仍在人體中發揮重要作用。Stefanie Dimmeler是首批發現一個microRNA亞群在血管再生中發揮重要作用的研究人員之一,她最近獲得了歐洲研究委員會(ERC)的ERC高級研究員資助,這使她能夠對另一群非編碼
中國科大在長鏈非編碼RNA調控腫瘤形成研究中取得進展
7月1日,中國科學技術大學生命科學學院教授梅一德研究組在《美國國家科學院院刊》(PNAS)上在線發表題為Long noncoding RNA EMS connects c-Myc to cell cycle control and tumorigenesis的研究論文。 c-Myc作為促癌蛋白
同濟大學教授最新文章:癌癥與長鏈非編碼RNA
同濟大學生命科學與技術學院的研究人員發表了題為“HULC cooperates with MALAT1 to aggravate liver cancer stem cells growth through telomere repeat-binding factor 2”的文章,長鏈非編碼RNA-
CRISPR新成果:-針對長鏈非編碼RNA的完全敲除高通量篩選
之前的方法在效率、質量(假陽性、假陰性)上各有欠缺:比如CRISPRi的方法只能實現基因表達抑制而不是完全敲除,CRISPRa的方法只能上調基因表達,無法對基因不可或缺的作用實施篩選評估。大片段刪除的策略由于步驟的繁瑣,也限制了其在更大規模上得到應用。 作為強大的基因編輯工具,CRISPR/C
如何揭開長非編碼RNA的神秘面紗
長非編碼RNA(lncRNA)長達兩百個核苷酸以上的轉錄本,但并不編碼任何蛋白質。盡管如此,長非編碼RNA在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,說明lncRNA的調控具有重要的生物學意義。細胞中絕大多數lncRNA(也稱lincRNA)位于細胞核,它們對應的DNA區域有的與蛋白編碼基因重疊,
我國學者揭示長鏈非編碼RNA順式調控基因表達的新模式
國際學術期刊Cell Stem Cell(《細胞·干細胞》)于近日在線發表了清華大學醫學院沈曉驊研究組的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cel
上海巴斯德所等揭示長鏈非編碼RNA調控HIV復制新機制
2月21日,國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表了中國科學院上海巴斯德研究所王建華課題組的研究論文“Long noncoding RNA MALAT1 releases epigenetic silencing of HIV-1 replication
陳潤生院士、趙春華教授Cell子刊解析長鏈非編碼RNA
來自中科院生物物理研究所、中國醫學科學院的研究人員證實,長鏈非編碼RNA ADINR通過在轉錄水平上激活C/EBPα調控了脂肪生成。這項研究發布在10月15日的《Stem Cell Reports》雜志上。 中科院生物物理研究所的陳潤生(Runsheng Chen)院士和中國醫學科學院的趙春華
我科學家發現一類新型長非編碼RNA
國際著名學術期刊《分子細胞》近日以封面故事發表了中科院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組的最新研究論文,揭示了一類全新內含子來源的長非編碼RNA的產生機制,及其參與剪接調控的重要功能。這將為進一步了解PWS綜合征的病理機制提供新的研究思路。 幾乎所有哺乳動物細胞的基因
長鏈非編碼RNA在沙棘果實花青素合成中的調控作用研究
沙棘(拉丁學名:Hippophae rhamnoides Linn.)是一種落葉性灌木,其特性是耐旱、抗風沙,可以在鹽堿化土地上生存,因此被廣泛用于水土保持。中國西北部大量種植沙棘,用于沙漠綠化。沙棘果實中維生素C含量高,素有維生素C之王的美稱。沙棘是植物和其果實的統稱。植物沙棘為胡頹子科沙棘屬
Cell-Death-and-Disease-長鏈非編碼RNAMEG3抑制肝癌發生新機制
母源性印記基因MEG3是一種長鏈非編碼RNA,在大多數腫瘤中呈低表達,且有抑制腫瘤生長的功能,但其作用的分子機制不詳。 最近同濟大學生命科學技術學院的陸東東教授課題組和東方醫院肝病科合作研究發現,MEG3在人類肝癌組織中表達極低, 且能抑制肝癌細胞的體內外生長。 研究結果顯示,MEG3促進