中國科學家首次發現線蟲基因組存在DNA甲基化現象
中國科學家最新研究成果首次證實在旋毛蟲基因組中發現了甲基轉移酶并證實了DNA甲基化的存在,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該種表觀遺傳修飾的歷史。同時也使以DNA甲基化序列做靶標進行抗寄生蟲藥物研發成為可能,為抗旋毛形線蟲病的藥物開發提供了全新思路。 吉林大學人獸共患病研究所和華大基因研究院合作完成的旋毛蟲不同發育時期蟲體DNA甲基化差異分析的相關成果,作為主題新聞以“改寫DNA(羥基)甲基化經典”為題目在BioMed Central集團(擁有各領域SCI期刊243種)網站上發布,同時全文在其旗下著名期刊《基因組生物學》上發表。 該項目主要完成人高飛博士表示:“這是首次也是唯一一次在線蟲中發現DNA甲基化這種表觀遺傳修飾。不僅檢測到了旋毛蟲不同發育階段蟲體的DNA甲基化變化,同時也觀察到了重點對寄生相關基因的甲基化。該研究為以DNA甲基化為靶標的抗旋毛蟲及類似病原藥物與預防制劑開發提供了新的研究途徑。” 據介紹,DNA甲基化作......閱讀全文
吉林大學成立五個國別研究所
日前,吉林大學成立了5個國別研究所,包括日本研究所、朝鮮研究所、韓國研究所、俄羅斯研究所和蒙古研究所,以期通過追蹤各國形勢發展動態,深入研究東北亞地區的重大理論問題和現實問題。
我科學家改寫DNA甲基化經典
近日,吉林大學人獸共患病研究所和華大基因研究院通過合作,首次在旋毛蟲基因組中發現了甲基轉移酶,并證實了DNA甲基化的存在,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該種表觀遺傳修飾的歷史。相關成果發表于《基因組生物學》。業內專家認為,該研究為以DNA甲基化為靶標的抗旋毛蟲及類似病原藥物與預防制劑
中國科學家首次發現線蟲基因組存在DNA甲基化現象
中國科學家最新研究成果首次證實在旋毛蟲基因組中發現了甲基轉移酶并證實了DNA甲基化的存在,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該種表觀遺傳修飾的歷史。同時也使以DNA甲基化序列做靶標進行抗寄生蟲藥物研發成為可能,為抗旋毛形線蟲病的藥物開發提供了全新思路。 吉林大學人獸共患病研究所和華大基因研究院合作完成的
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
北京基因組研究所Plant-cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組,通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
TheScientist熱議:出人意料的甲基化
DNA甲基化是基因組中重要的表觀遺傳學標志,在大多數生物的生命周期中基因組的甲基化模式都相對穩定。然而近期發表在Genome Biology雜志上的兩篇文章顯示,有的生物在一生中不斷累積著甲基化,有的生物則可能通過甲基化去除大量DNA。 吉林大學劉明遠教授所領導的研究團隊首次在線蟲中發
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DN
全基因組甲基化定量檢測技術LUMA
LUMA介紹 基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件,有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此,我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化,稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methyl
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》(Nature Biotechnology)上發表,這是中國科學家
全基因組測序解讀重要甲基化機制
DNA看起來只是AGTC四種堿基的簡單排列,可一旦它與組蛋白包裝形成染色質,情況就復雜得多了。組蛋白主要有四種,分別是H2A、H2B、H3和H4。這些組蛋白要么令DNA盤繞起來保持沉默,要么將DNA解開允許基因表達。組蛋白上的化學修飾(如甲基化),能夠影響它對基因的控制。 H3K4me3是
全基因組甲基化定量檢測技術LUMA
LUMA介紹基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件,有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此,我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化,稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methylat
基因組直接測序法檢測甲基化的介紹
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
基因組直接測序法檢測DNA的甲基化
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應
揭示全基因組DNA甲基化、半甲基化與遺傳突變的新方法
5月31日,中國科學院北京生命科學研究院研究員孫中生團隊與北京大學腫瘤醫院合作,在Briefings in Bioinformatics上,發表了題為A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl
人類基因組DNA甲基化數據分析
近期來自電子科技大學,清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發,闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法,并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法,以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。 DNA甲基化是表觀
進行全基因組甲基化檢測需要多少錢
建庫是5000塊錢一個庫,測序就是1500每G,看您要測多少G的數據量,信息分析大概要5000塊錢左右吧。。。
北京基因組所發表RNA甲基化新發現
在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從DNA、RNA最后流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾,這些修飾可以在不改變DNA序列的基礎上調控基因的表達,并由此決定細胞的分化和發育情況。實際上,mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine(m
吉林大學Cell子刊發表表觀遺傳學研究成果
高等生物的基因組DNA圍繞著由四種組蛋白組成的八聚體,形成碟狀的核小體結構。基因組DNA以這樣的形式包裝成為染色質,使DNA受到良好的保護。染色質的結構和動態受到組蛋白表觀遺傳學修飾的調控,比如最近發現的組蛋白賴氨酸巴豆酰化。這種組蛋白修飾在基因表達、DNA損傷應答等重要的細胞過程中起到了關鍵性
吉大和華大基因聯合發現線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DNA甲基化
北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中,發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合,促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016
北京基因組研究所Cell子刊發表干細胞新成果
來自中科院北京基因研究所、邁阿密大學Miller醫學院的研究人員證實,喪失Asxl1會改變骨髓基質干細胞的自我更新和命運,在小鼠中導致Bohring-Opitz樣綜合征。這一研究發現發布在Stem Cell Reports雜志上。 中國科學院北京基因組研究所的王前飛(Qian-fei Wang
Nature-Genetics:單細胞全基因組DNA甲基化組新發現
北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心,北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法,首次在單細胞分辨
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月,中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組,與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究,發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
英基因組學研究所否認欺凌和性別歧視指控
在一名獨立律師進行調查之后,全球最大的基因組學研究中心之一否認了有關其負責人欺侮、歧視員工和濫用資金的指控。 這些指控涉及英國辛克斯頓惠康桑格研究所的管理層。該研究所在10月30日發表的一份聲明中說,調查澄清了該研究所所長、遺傳學家Mike Stratton關于欺凌和性別歧視的說法。“調查已經
北京基因組研究所最新文章比較高通量篩選方法
P2X7受體是嘌呤-配體門控離子通道受體家族 P2X的一員,是神經退行性疾病、類風濕關節炎、神經性疼痛藥物篩選的重要靶標, 已成為大型制藥公司新的研究熱點。近期中國科學院北京基因組研究所的研究人員針對3 種用于檢測 P2X7受體高表達細胞系藥理學特征的高通量熒光檢測方法,進行了比對,指出
中科院任命吳仲義為北京基因組研究所所長
2008年6月20日,中國科學院北京基因組研究所所長聘任、任命儀式在基因組所2樓報告廳舉行。會議由中科院北京分院黨組副書記劉松林主持,中科院副秘書長何巖,人事教育局局長李和風,基因組所黨委書記楊衛平,副所長于軍,所長助理胡松年研究員、王彩平研究員以及所黨委、紀委委員,中層管理干部,副研以上科研人員等
北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫
DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記,在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用,不同物種所采用的機制亦各不相同。因而,整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析,可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異,并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。
Cell:染色體水平油松基因組組裝和甲基化研究取得進展
近期,北京林業大學生物科學與技術學院聯合安諾優達在國際知名期刊Cell(IF:41.582)在線發表了題為“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者對油松進行了