解析小麥多倍化的表觀遺傳調控分子機制
近日，南京農業大學農學院教授宋慶鑫課題組在《基因組生物學》（Genome Biology）上發表了研究論文。該研究利用OCEAN-C技術繪制了不同倍性小麥的開放染色質互作圖譜，并整合了染色質可及性、組蛋白修飾和轉錄組，深入解析了六倍體小麥多倍化過程中開放元件遠距離互作調控基因表達的分子機制。 基因組多倍化可以幫助物種具備更廣泛的環境適應能力，是物種形成和進化的重要驅動力，在自然界中廣泛存在。普通小麥（AABBDD）由二倍體祖先種經歷兩輪的雜交和基因組加倍形成的異源六倍體作物。在小麥發育和環境應答過程中，功能元件和基因之間的廣泛互作對于基因表達具有重要的調控作用。小麥龐大（16 Gb）而復雜（三個亞基因組，85%以上為轉座元件）的基因組導致其精確的染色質互作圖譜難以繪制，嚴重制約了小麥三維基因組的研究。 該研究通過不依賴抗體和低成本的OCEAN-C技術高分辨率地繪制了二倍體、四倍體和六倍體小麥全基因組開放染色質互作圖譜。與......閱讀全文
解析小麥多倍化的表觀遺傳調控分子機制
近日，南京農業大學農學院教授宋慶鑫課題組在《基因組生物學》（Genome Biology）上發表了研究論文。該研究利用OCEAN-C技術繪制了不同倍性小麥的開放染色質互作圖譜，并整合了染色質可及性、組蛋白修飾和轉錄組，深入解析了六倍體小麥多倍化過程中開放元件遠距離互作調控基因表達的分子機制。
著名華裔學者Cancer－Cell解析癌癥表觀遺傳調控的特殊機制
來自美國斯坦福大學，中國科學技術大學等處的研究人員發表了題為“Chromatin accessibility landscape of cutaneous T cell lymphoma and dynamic response to HDAC inhibitors”的文章，利用ATAC-seq
科學家解析sirtuin長壽蛋白家族調控衰老的表觀遺傳機制
Sirtuin蛋白是一類從古細菌到人類高度保守的去乙酰化酶。Sirtuin蛋白的酶活依賴輔酶因子β-煙酰胺腺嘌呤二核苷酸NAD+，是通過熱量限制延緩衰老策略的重要靶點，在多個物種中發揮著壽命調控的相關功能，被稱為“長壽蛋白家族”。人類sirtuin家族的7個成員（SIRT1-7）均具有NAD+結合和
遺傳發育所解析生長素調控葉片展開的分子機制
葉片是植物進行光合作用的主要器官。為最大限度提高光合能力，高等植物的葉片進化出了具有極性（即不對稱性）的扁平形狀。雖然葉片的展開對于高效光合至關重要，人們尚不了解葉片原基如何在發育過程中展開以形成扁平結構。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所焦雨鈴研究組的最新研究發現，植物激素生長素對于葉片原基
動物所等揭示成年神經干細胞的表觀遺傳分子調控機制
4月9日，中國科學院動物研究所焦建偉研究組在國際神經領域雜志Journal of neuroscience (《神經科學雜志》)在線發表了題為《Ezh2調控神經干細胞及神經元產生和學習記憶》的研究論文(Ezh2 Regulates Adult Hippocampal Neurogenes
六倍體小麥調控組和亞基因組的分化調控研究
普通小麥(Triticum aestivum L.）是經兩次遠緣雜交而形成的一種異源六倍體作物，含有A、B和D三個亞基因組。亞基因組分化對多倍體小麥基因組可塑性具有重要貢獻，且成為其成功馴化的關鍵因素之一。然而，決定小麥亞基因組分化的時空特異性調控機制尚不清楚。中國科學院遺傳與發育生物學研究所研
遺傳發育所在小麥胚發育的表觀組調控方面取得進展
胚胎發育是生物生命周期中至關重要的環節之一，在動植物中存在廣泛的保守性和特異性。動物胚胎發育過程中存在基因組范圍內表觀遺傳修飾的重編程事件，并影響了胚胎發育的進程。胚胎發育過程也適用于探究表觀修飾及轉錄調控對細胞命運決定的貢獻。然而，人們對于植物胚發育過程中轉錄及表觀修飾層面變化的了解要滯后于動
遺傳發育所在小麥胚發育的表觀組調控方面取得進展
胚胎發育是生物生命周期中至關重要的環節之一，在動植物中存在廣泛的保守性和特異性。動物胚胎發育過程中存在基因組范圍內表觀遺傳修飾的重編程事件，并影響了胚胎發育的進程。胚胎發育過程也適用于探究表觀修飾及轉錄調控對細胞命運決定的貢獻。然而，人們對于植物胚發育過程中轉錄及表觀修飾層面變化的了解要滯后于動
遺傳發育所在小麥胚發育的表觀組調控方面取得進展
胚胎發育是生物生命周期中至關重要的環節之一，在動植物中存在廣泛的保守性和特異性。動物胚胎發育過程中存在基因組范圍內表觀遺傳修飾的重編程事件，并影響了胚胎發育的進程。胚胎發育過程也適用于探究表觀修飾及轉錄調控對細胞命運決定的貢獻。然而，人們對于植物胚發育過程中轉錄及表觀修飾層面變化的了解要滯后于動
研究發現植物光形態建成的表觀遺傳調控機制
光是植物光合作用的能量來源。作為重要的環境信號，光廣泛參與調控植物生長發育的各個階段。當植物幼苗出土見光后，光信號迅速激活光形態建成，表現為下胚軸生長抑制、子葉張開變綠以啟動光合作用。這是植物早期生長的關鍵性階段之一。植物在進化過程中形成復雜而精密的光信號轉導系統，通過精細調控光形態建成，實現對
科學家解析野生近緣種滲入在小麥遺傳背景下的表達調控機制
野生近緣種對于農作物遺傳改良有重要作用。野生近緣種提升小麥農藝性狀的遺傳與分子機制是研究熱點。中國科學院遺傳與發育生物學研究所等提出了定量滲入片段表達豐度的新策略——利用公共泛基因組資源構建囊括麥族近緣種基因序列信息的基因參考集合，從而最大限度地定量外源片段的轉錄本。團隊使用小麥種質群體的苗期轉錄組
科學家解析野生近緣種滲入在小麥遺傳背景下的表達調控機制
野生近緣種對于農作物遺傳改良有重要作用。野生近緣種提升小麥農藝性狀的遺傳與分子機制是研究熱點。中國科學院遺傳與發育生物學研究所等提出了定量滲入片段表達豐度的新策略——利用公共泛基因組資源構建囊括麥族近緣種基因序列信息的基因參考集合，從而最大限度地定量外源片段的轉錄本。團隊使用小麥種質群體的苗期轉錄組
Genome－Biology：普通小麥精細表觀組圖譜繪制成功
7月15日，Genome Biology期刊在線發表中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所張一婧研究組與南京農業大學張文利研究組等合作完成的研究論文。該工作生成并繪制普通小麥精細的表觀組圖譜，以此為基礎針對性開發整合計算流程對全基因組順式調控元件進行了系統的挖掘與鑒定，并初步探索
研究揭示春化作用促進開花的表觀遺傳調控機制
春化作用是植物必須經歷一段時間的持續低溫才能由營養生長階段轉入生殖生長階段的一種表觀遺傳現象，是植物適應溫度的季節性波動進化出來的一種機制，以確保在適當的時期開花。春化作用是影響植物物候期和地理分布的重要因素，對于牧草及作物生產具有非常重要的作用。DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，參與植物
解析了康復者免疫記憶形成的表觀遺傳機制
2021年6月9日，Nature Cell Biology在線發表了題為Single-cell epigenomic landscape of peripheral immune cells reveals establishment of trained immunity in individ
香山科學會議探討多倍體作物研究
“在連恐龍都滅絕的白堊紀末，多倍體植物仍‘頑強’地存活并大量繁殖。”近日，以“多倍體作物基因組解析與品種改良”為主題的第637次香山科學會議在北京召開。會上，一位專家生動地描述了多倍體作物超強的抗逆與適應性。 據報道，高等植物中約70％是多倍體，包括小麥、棉花、油菜等重要的糧、棉、油作物。因
《Cell》文章：特殊的表觀遺傳調控
來自中科院生物物理所，美國哥倫比亞大學的研究人員發表了題為“Multisite Substrate Recognition in Asf1-Dependent Acetylation of Histone H3 K56 by Rtt109”的文章，報道了Rtt109-Asf1-H3-H4復合物的
遺傳發育所等在小麥穗型調控分子模塊解析中獲新進展
小麥是世界上最重要的糧食作物之一，在我國糧食安全中發揮著重要作用。如何提高小麥產量是小麥研究與育種中長期以來的熱點與難點問題。小麥穗分枝等穗型性狀是單株產量的重要決定因素，也是小麥選育的關鍵農藝性狀之一。然而，小麥是異源六倍體，基因組龐大復雜，約是水稻的34倍、大豆的16倍、玉米的7倍、大麥的3
我國揭示OGlcNAc糖基化介導表觀遺傳修飾調控發育新機制
細胞內蛋白質翻譯后O-連N-乙酰氨基葡萄糖（O-GlcNAc）修飾，由O-GlcNAC糖基轉移酶催化完成，這種糖基化修飾參與調控細胞內多種重要的生物學過程，并在人類疾病與治療中得到應用。在植物中，這種動態的蛋白糖基化與磷酸化修飾調節植物春化作用介導的開花過程，而O-GlcNAc信號與組蛋白表觀遺
PNAS發文：多倍體農作物為何具有廣泛適應能力
近日，南京農業大學在PNAS上發表了最新研究文章，從DNA甲基化和轉錄水平揭示了基因組多倍化如何增強水稻在鹽脅迫環境中的適應能力。 基因組多倍化（全基因組加倍）在植物的進化過程中普遍發生。許多植物包括重要農作物都是多倍體，如六倍體小麥、四倍體棉花和馬鈴薯等。雖然水稻、大豆和玉米等作物是二倍體
植物所揭示水稻籽粒大小表觀遺傳調控新機制
水稻籽粒大小決定稻米的產量和外觀品質，并受多個數量性狀位點（QTLs）的控制；其中，編碼組蛋白乙酰化酶的GRAIN WEIGHT 6a（GW6a）是水稻籽粒大小和產量的正向調節因子。目前對于GW6a依賴的基因調控網絡尚不清楚。在擬南芥中，泛素受體DA1通過調控細胞增殖期來控制種子和器官的大小，然
Nature子刊揭示干細胞表觀遺傳調控新機制
對基因組序列略加修飾在多能干細胞轉化為各種分化細胞類型中起至關重要的作用。來自德國慕尼黑大學(LMU)的一個研究小組現在鑒別出了負責一種修飾的因子。 每個細胞中都包含有存儲遺傳信息，這些信息編碼在構成DNA的堿基序列中。然而，在特定的細胞類型中實際上只有部分的信息得到利用。堿基序列為蛋白質合成
研究首次揭示T細胞淋巴瘤的表觀遺傳調控機制
近日，中國科學技術大學生命科學學院醫學中心及中科院天然免疫和慢性疾病重點實驗室瞿昆教授課題組聯合美國斯坦福大學Howard Chang實驗室，首次揭示了T細胞淋巴瘤（CTCL）的表觀遺傳調控機制。該研究成果以“Chromatin accessibility landscape of cutane
植物所揭示種子休眠與萌發的表觀遺傳調控機制
種子休眠與萌發是植物由生殖生長過渡到營養生長的重要發育轉變進程，涉及大量基因的激活或者沉默。組蛋白修飾介導的表觀遺傳基因轉錄調控可能在其中發揮關鍵作用，但其分子機制尚不完全清楚。 中國科學院植物研究所劉永秀研究組利用遺傳和生理生化等手段，揭示了擬南芥SNL1和SNL2調控種子休眠和萌發的分子機
AKG調控肝臟糖代謝的表觀遺傳學機制獲揭示
近日，華南農業大學動物科學學院江青艷/束剛教授團隊初步揭示了α-酮戊二酸調控動物肝臟糖代謝的分子機制。相關研究在線發表于《科學進展》（Science Advances）。 據悉，束剛教授和江青艷教授為該論文通訊作者，華南農業大學博士后袁業現、朱燦俊副教授和西北農林科技大學王永亮副教授為第一作者
研究揭示啟動胚胎干細胞分化的表觀遺傳調控機制
cJUN啟動胚胎干細胞分化的表觀遺傳調控機制示意圖。課題組 供圖 中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院（以下簡稱廣州健康院）研究員劉晶課題組與西湖大學研究員裴端卿課題組合作揭示了染色質重塑復合物BAF和組蛋白修飾H3K27ac通過調控染色質可及性變化啟動胚胎干細胞分化的分子機制。相關研究6月16日在
上海生科院發現調控植物開花的表觀遺傳新機制
11月8日，《自然-遺傳學》（Nature Genetics）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心何躍輝研究組與杜嘉木研究組合作完成的題為A cis cold memory element and a trans epigenome reader mediate Po
研究人員揭示決定種子活力的表觀遺傳調控機制
種子的出現使高等植物能夠在多樣的自然環境中得以廣泛生存和分布。產生高活力的種子從而在環境條件合適時迅速萌發并發育產生健壯的幼苗是高等植物繁衍的關鍵，也是農業生產中種子品質的重要指標。然而，目前尚不清楚在種子形成時，其萌發和胚后發育的能力是如何產生的。 2022年12月，中國科學院遺傳與發育生物學
我國科研團隊解析調控番茄形態的分子機制
14日，記者從華中農業大學獲悉，該校園藝林學學院、果蔬園藝作物種質創新與利用全國重點實驗室、湖北洪山實驗室王鵬蔚團隊，研究發現SlMAP70-SlIQD21a/SUN10模塊協同作用通過影響微管骨架動力學功能調控番茄果實形態建成，為未來通過基因工程手段定向改良番茄果實外觀品質提供了重要理論基礎。
我國科研團隊解析調控番茄形態的分子機制
14日，記者從華中農業大學獲悉，該校園藝林學學院、果蔬園藝作物種質創新與利用全國重點實驗室、湖北洪山實驗室王鵬蔚團隊，研究發現SlMAP70-SlIQD21a/SUN10模塊協同作用通過影響微管骨架動力學功能調控番茄果實形態建成，為未來通過基因工程手段定向改良番茄果實外觀品質提供了重要理論基礎。