改善RNA提取的4點建議
在分離RNA時,良好的實驗室技術很關鍵。與DNA相比,RNA更加嬌貴,也更不穩定。RNA含有高反應性的羥基(C-OH)基團,確保鏈不斷合成、分解和再次利用。分離出的RNA迅速降解,并很容易受到核糖核酸酶(RNase)的污染。RNase似乎隨處可見。 加利福尼亞州科學院(California Academy of Sciences)的Jack Dumbacher博士目前正開展轉錄組和小RNA的分離,以便鑒定宏基因組病毒序列。他的研究目標是了解病毒與宿主的共生關系。Dumbacher博士為改善RNA提取提出了幾點建議。 優化RNA的保存 研究小組常常從偏遠地區采集樣本,如熱帶雨林或珊瑚礁。他們的最大挑戰在于無法用液氮迅速冷凍樣本,而RNA在乙醇中逐步降解。于是,他們用拭子蘸取鳥的泄殖腔,并放在RNA穩定劑或其他包含4M 硫氰酸胍(GITC)的溶液中。由于鹽的濃度,一些RNA穩定劑可能會給RNA......閱讀全文
基因組構的定義
中文名稱基因組構英文名稱gene organization定 義(1)單個基因的組成結構。一般包含啟動子、增強子、非翻譯序列、編碼序列等。真核生物和原核生物的一個顯著區別是前者具有內含子。(2)廣義指一個完整的生物個體內基因的組織排列方式。原核和真核生物的一個顯著區別是原核生物的結構基因成串分布,
基因組構的定義
中文名稱基因組構英文名稱gene organization定 ?義(1)單個基因的組成結構。一般包含啟動子、增強子、非翻譯序列、編碼序列等。真核生物和原核生物的一個顯著區別是前者具有內含子。(2)廣義指一個完整的生物個體內基因的組織排列方式。原核和真核生物的一個顯著區別是原核生物的結構基因成串分布,
基因組的定義
在分子生物學和遺傳學領域,基因組是指生物體所有遺傳物質的總和。這些遺傳物質包括DNA或RNA(病毒RNA)。基因組包括編碼DNA和非編碼DNA、線粒體DNA和葉綠體DNA。研究基因組的科學稱為基因組學。
基因組的分類
病毒基因組病毒基因組可以由RNA或DNA組成。 RNA病毒的基因組包含單鏈或雙鏈RNA,也包含一種或多種單獨的RNA分子。 DNA病毒基因組可以是單鏈或雙鏈DNA。大多數DNA病毒基因組由單個線性DNA分子組成,但有些由DNA病毒基因組由環狀DNA分子組成? 。原核基因組原核生物和真核生物基因組由D
江蘇省人類功能基因組學重點實驗室破譯焦慮癥“密碼”
近日,江蘇省人類功能基因組學重點實驗室朱東亞教授研究團隊發現腦內神經元型一氧化氮合酶(nNOS)與其PDZ結構域的羧基末端配體蛋白(CAPON)的結合可直接導致焦慮癥,從生物學上破解了焦慮癥的“密碼”,該研究發表在8月17日的國際權威期刊Nature Medicine(IF:28.054)雜志
實驗室:多層次基因組分析揭示參與人類記憶的遺傳基因
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? 記憶是人類重要的認知功能。外界信息由感知系統進入大腦,經由記憶系統編碼、處理以及存儲從而成為個體的知識經驗。因此,從很大程度上,記憶定義了個體。以往研究通過雙胞胎和家系分析對記憶的遺傳基礎進行了探索,一般認為
基因組所人類基因組突變研究獲進展
序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變 基因突變會導致人類疾病的產生,因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。 近日,中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊,在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展
移動基因組增加弧菌基因組可塑性的機制
移動基因組增加微生物物種多樣性的示意圖。研究團隊 供圖 6月27日,中國科學院南海海洋研究所熱帶海洋生物資源與生態重點實驗室研究員王曉雪團隊通過研究珊瑚體內具有生態競爭的假交替單胞菌和弧菌之間的互作,揭示了一種移動基因組增加弧菌基因組可塑性,驅動弧菌遺傳和表型多樣化的機制。相關研究在線發表
將基因組存進銀行-迎接真正的基因組時代
你知道在你身上什么東西比錢更有價值,并且還是唯一的嗎?答案是:你的基因組。就像你的錢一樣,你的基因組也應該被盡可能安全的存儲起來。而那些負責存儲你基因組的機構應該對如何存儲、使用以及分享它進行監管。 隨著醫學科學的進步,人們能夠控制和管理他們的個人基因組將變得越來越重要。為
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前,由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
植物基因組學國家重點實驗室2014夏季青年學術論壇召開
中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物基因組學國家重點實驗室2014年度夏季青年學術論壇于7月24日至25日成功召開。實驗室的職工、博士后、研究生以及客座人員等共350余人參加了此次論壇。實驗室副主任儲成才研究員致開幕詞,指出實驗室青年學術論壇進一步推動了實驗室的內部交流,希望青年人員以此為平臺,
聚焦基因組組裝-至今最大組裝競賽尋找最優基因組指標
2013年7月23日,由華大基因和BioMed Cental聯合創辦的開放式期刊《GigaScience》發表了當前最大、最系統的基因組組裝過程及評價結果。在第二屆Assemblathon競賽中,共有21個團隊基于由三種不同的測序技術所得的鳥、魚和蛇的未組裝基因組數據,提交了43個組裝結果,
基因組所肝癌全基因組合作研究取得新進展
近日,由中國科學院北京基因組研究所所長吳仲義及其科學團隊與國立臺灣大學醫學院陳定信院士、陳培哲院士共同合作開展的“肝癌癌癥基因組合作研究”計劃獲最新進展,相關學術論文在在最新出版的PNAS雜志上發表。 “肝癌癌癥基因組合作研究”計劃于2009啟動,作為基因組所一項長期的癌癥基因
植物基因組“剪刀”-被成功打造-可編輯基因組任意位置
中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組通過模仿和改造微生物中的一種抵御外源侵染的防護機制,成功開發出能對植物基因組進行精確定點修飾的技術,從而使高效植物分子改良性狀成為可能。這一適用于植物的CRISPR-Cas技術就像一把剪刀,可以對基因組中任意感興趣的位置進行編輯,它的成功開發將革命性地改變
美國百萬基因組PK英國十萬基因組-只為助力“精準醫療”?
1月下旬,美國總統奧巴馬在2015年國情咨文演講中深情地說道,美國已經消滅了小兒麻痹癥、繪制出人類基因組等舉措,這意味著美國已經 使人類醫學邁入一個新的時代……接下來,我們致力于治愈癌癥和糖尿病等疾病,讓所有人獲得需要保障自己和家人健康的個性化的信息,并宣布了新的項目——精 準醫療計劃(Pr
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank-3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0,并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題,在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所揭示線粒體基因組氧化損傷修復分子機制
線粒體是真核生物細胞主要的能量代謝場所,其中呼吸鏈氧化磷酸化過程伴隨有高水平的氧自由基(ROS)的產生。線粒體基因組缺乏組蛋白結合保護,所以容易受到ROS攻擊而發生損傷,其突變的累積已證實與多種人類疾病(如神經退行性病變、糖尿病、心血管疾病和癌癥等)的發生密切相關。有關核基因組DNA損傷修復分子
北京基因組研究所Plant-cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組,通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank-3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0,并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題,在線發表在Nucleic Acids Rese
科學家進行基因組測序-成功破譯金雕基因組
?? 作為一種知名度極高的猛禽,金雕經常以威猛霸氣的形象出現在影視作品和小說中。現在,英國研究人員完成了對金雕的基因組測序工作,希望從基因層面深入了解這一物種,以便更好地保護它們。 金雕以巨大的體型和敏捷有力的飛行等特征而著名,其成鳥的翼展平均超過2米,體長可達1米。金雕一般生活于多山或丘陵地區
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術,并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位,成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜,構建了栽培和野生豌豆泛基因組,解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構,為揭示豌豆起源馴化,以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
線粒體基因組的簡介
線粒體是真核細胞的一種細胞器,有它自己的基因組,編碼細胞器的一些蛋白質。除了少數低等真核生物的線粒體基因組是線狀DNA分子外(如纖毛原生動物Tetrahymena pyniform和Paramecium aurelia以及綠藻Clam ydoomonas rein—hardtia 等),一般都是一個
線粒體基因組的概念
線粒體是真核細胞的一種細胞器,有它自己的基因組,這些基因組統稱為線粒體基因組。線粒體內的DNA,可參與蛋白質的合成,轉錄,與復制,具有較高的研究價值。
雙義基因組定義
中文名稱雙義基因組英文名稱ambisense genome定 ?義雙鏈DNA病毒中正義鏈和反義鏈同時含有可讀框,其間被A-U富集區所分隔的一種基因組結構。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
體內基因組編輯介紹
這應該是最受期待的基因治療方法,即使用基因編輯技術直接修改體內突變的靶DNA,消除致病基因,恢復身體功能。這種方法的優點是可以治愈這種疾病。例如,在亨特綜合征或血友病A患者中,尿酸-2-硫酸酯酶(IDS)或凝血因子-8在體內沒有正常表達。如果將IDS或八因子基因插入基因組,它可以終身正常表達;缺點是
揭秘基因組“暗物質”
記國家自然科學基金重大研究計劃“基因信息傳遞過程中非編碼RNA的調控作用機制” 在人類遺傳信息傳遞過程中,非編碼RNA不參與編碼蛋白質,占全部RNA的98%,如同宇宙中神秘的“暗物質”,是生命活動調控的“幕后推手”。 2014年起,中國科學家發起重大研究計劃,并于2023年底完成結束評估。 在
Nature:水母基因組之謎
太平洋側腕水母的基因組中缺少很多常見基因。 櫛水母基因序列草圖的發表揭示了一種與眾不同的神經系統。 櫛水母(comb jelly)——或櫛水母門動物(ctenophore)——看起來就像微小的迪斯科球,它們利用特殊的纖毛推動自己在海洋中游動,并且用粘性觸手來捕獲更微小的獵物。圣奧古斯丁佛羅里達大
線粒體基因組的原理
線粒體基因組能夠單獨進行復制、轉錄及合成蛋白質,但這并不意味著線粒體基因組的遺傳完全不受核基因的控制。線粒體自身結構和生命活動都需要核基因的參與并受其控制,說明真核細胞內盡管存在兩個遺傳系統,一個在細胞核內,一個在細胞質內,各自合成一些蛋白質和基因產物,造成了細胞核和細胞質對遺傳的相互作用;但是