揭秘早期哺乳動物的發育過程
由于小鼠的易實驗性和強遺傳性，其一直是生物醫學研究中使用廣泛的動物模型。但是，胚胎學研究發現，小鼠早期發育的許多方面與其他哺乳動物不同，從而使有關人類發育的推論復雜化。英國劍橋大學等研究團隊合作構建了兔發育的形態學和分子圖譜。該研究成果于近日發表在《Nature Cell Biology》，題為：An atlas of rabbit development as a model for single-cell comparative genomics。 研究人員對來自胚胎的超過18萬個單細胞的轉錄和染色質可及性特征，以及高分辨率組織學切片進行分析，這些胚胎跨越了原腸胚形成、著床、羊膜發育和早期器官發育。他們描述了滋養細胞分化的基因調控程序，并確定了造血過程中涉及卵黃囊間皮的信號交互作用。研究人員展示了如何組合兔和小鼠圖譜，從獼猴和人類數據中提煉新的生物學見解。 該研究報告的數據集及研究方法為破譯早期哺乳動物的發育過程，進......閱讀全文
單細胞染色質圖譜|揭示轉錄因子網絡和細胞譜系關系
2019年10月8日，美國圣地亞哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl團隊在Cell Reports雜志上發表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日，四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉，我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文，以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
單細胞染色質開放性圖譜在器官發生的分子調控機制的...
單細胞染色質開放性圖譜在器官發生的分子調控機制的運用在哺乳動物胚胎發育的過程中，多能細胞迅速分裂分化，但是每個器官細胞譜系的調控程序仍不清楚。近日，中科院動物研究所劉峰課題組與劍橋大學、加州大學圣地亞哥分校的研究人員在《Nature Cell Biology》雜志上合作發表了題為“Single-
Cell：繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達；也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達，還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目：表征人類基因組，選擇的模式生物的D
揭秘早期哺乳動物的發育過程
由于小鼠的易實驗性和強遺傳性，其一直是生物醫學研究中使用廣泛的動物模型。但是，胚胎學研究發現，小鼠早期發育的許多方面與其他哺乳動物不同，從而使有關人類發育的推論復雜化。英國劍橋大學等研究團隊合作構建了兔發育的形態學和分子圖譜。該研究成果于近日發表在《Nature Cell Biology》，題為
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
單細胞水平揭示造血干細胞擴增的動態圖譜
造血干細胞具有自我更新和分化的生物學特征，既可以維持其自身在造血組織中的恒定數量，又能向紅系、粒系、巨核系和淋巴系等多種血細胞分化。造血干細胞移植廣泛應用于白血病、再生障礙性貧血、骨髓增生異常綜合征等臨床血液系統惡性腫瘤的治療，然而，造血干細胞來源不足，限制其廣泛應用。因此，如何模擬體內造血干細
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源：錢文峰等 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。相關結果近日發表于《遺傳學和基因組學期刊》。水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組
研究人員繪制七鰓鰻單細胞轉錄組圖譜
雷氏七鰓鰻作為現存的無頜脊椎動物代表，是一種由無脊椎動物向脊椎動物進化的過渡類型，被視為研究脊椎動物演化的重要模式生物。近日，華大生命科學研究院聯合遼寧師范大學七鰓鰻研究中心等單位在《自然—通訊》發表最新研究成果，團隊基于華大自主研發的DNBelab C4和 DNBSEQ測序平臺，采用單細胞RNA測
科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
科學家繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
研究成果：靈長類海馬衰老的單細胞轉錄組圖譜繪制
海馬體作為腦的重要組成部分，在學習和記憶中發揮重要作用。隨著年齡增長，海馬功能逐漸退化，導致認知功能的減退以及多種人類神經退行性疾病發生。由于海馬結構復雜，細胞組成具有高度異質性，傳統研究技術難以精確揭示海馬衰老過程中不同細胞類型的衰老規律及分子調控網絡。此外，由于倫理及樣本來源的限制，不同年齡
花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜構建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518535.shtm近日，廣東省農業科學院作物研究所花生研究團隊與合作者，在花生光暗形態轉變的單細胞基因表達譜研究方面取得進展，成功構建的花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜。相關成果發表于《植物生物技術雜志》
單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜
2019年10月10日，來自英國Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等機構的科學家在Nature上以長文形式發表了題為“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次報道了由胎肝驅動的人胚胎
單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜
2019年10月10日，來自英國Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等機構的科學家在Nature上以長文形式發表了題為“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次報道了由胎肝驅動的人胚胎
科學家發表跨物種小腦皮層單細胞空間轉錄組圖譜
9月27日，《科學》（Science）在線發表了題為Cross-species single-cell spatial transcriptomic atlases of the cerebellar cortex的研究論文。該成果由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心聯合杭州華大生命科學研究院、
轉錄圖譜的定義
轉錄圖譜是在識別基因組所包含的蛋白質編碼序列的基礎上繪制的結合有關基因序列、位置及表達模式等信息的圖譜。在人類基因組中鑒別出占具2%~5%長度的全部基因的位置、結構與功能，最主要的方法是通過基因的表達產物mRNA反追到染色體的位置。
轉錄圖譜的原理
所有生物性狀和疾病都是由結構或功能蛋白質決定的，而已知的所有蛋白質都是由mRNA編碼的，這樣可以把mRNA通過反轉錄酶合成cDNA或稱作EST的部分的cDNA片段，也可根據mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段，然后，再用這種穩定的cDNA或EST作為“探針”進行分子雜交，鑒別出與轉錄有關的基
Cell：首次構建出哺乳動物單細胞染色質可接近性圖譜
科學家們對DNA纏繞和包裝到所謂的染色質中的方式感興趣，這是因為這會影響每個細胞中可用到的遺傳信息。DNA就像串在一根繩子上的念珠。在這些分子“念珠”移動的地方會有空間形成，這樣蛋白就能夠訪問和“讀取”遺傳信息。這種狀態或者說這種基因組特征就是染色質可接近性（chromatin accessib
Nature單細胞測序繪制首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜
哺乳動物的造血與免疫系統發育是在胚胎發育過程中由多個組織以復雜的協同作用所驅動的【1】。盡管研究界對于人體中這一過程所涉及的功能主體和時間序列都有了較為準確的認識，例如造血干細胞是先從受孕后2至3周的胚胎外卵黃囊（yolk sac）中，以及從3至4周的胚胎主動脈-性腺-中腎區域（aorta-go
暨南大學報道－造血干細胞發育單細胞lncRNA動態表達圖譜
來自暨南大學基礎醫學院蘭雨課題組、中國醫學科學院基礎醫學研究所余佳課題組、軍事醫學科學院附屬醫院（現為解放軍總醫院第五醫學中心）劉兵課題組合作發表研究論文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
胎肝造血干細胞擴增功能單元“HSC－PLUS”
血液作為生命的河流，源源不斷地為機體提供營養物質和免疫保護。作為血液源頭的造血干細胞，具有自我更新和多向分化的能力，不僅能夠維持機體的終身造血，也是惡性血液疾病移植治療的重要細胞來源【1,2】。但是，造血干細胞來源不足卻是限制其推廣的瓶頸。如何擴增足夠數量的功能性造血干細胞，一直是基礎科學研究的
3D轉錄組圖譜闡釋造血干細胞和微環境細胞間的調控網絡
血液系統中貯藏著一種具有自我更新、分化成各種血細胞潛能的成體干細胞，稱為造血干細胞，它能夠維持機體長久造血和組織穩態1。造血干細胞移植是惡性血癌的有效治療手段，但干細胞來源不足成為限制該治療廣泛應用的瓶頸。因此，造血干細胞的發育，尤其是造血干細胞擴增的研究備受關注。然而，現在的研究主要集中在特定
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目（項目編號：31722027）等資助下，浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板測序
我國科學家成功獲得長春花葉片單細胞轉錄組圖譜
長春花為夾竹桃科長春花屬植物，在中草藥用途上，全草入藥有止痛、消炎等功效。單萜類吲哚生物堿（MIAs）是植物中最多樣的特殊代謝產物，具有重要的藥用價值。長春花能夠合成130多種MIAs，是研究單萜吲哚生物堿合成的模式藥用植物，其所含生物堿，如長春花堿、長春新堿等被用來臨床治療白血病、霍奇金淋巴瘤