北京基因組所揭示共轉錄m6A修飾建立機制及功能
4月2日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）任捷團隊和楊運桂團隊，在《分子細胞》（Molecular Cell）上在線發表了題為DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability的研究論文。該研究揭示了三鏈核酸結構R-loop、解旋酶DDX21與m6A甲基轉移酶METTL3之間的協同機制，以及促進轉錄終止、維持基因組穩定性的功能。在基因轉錄過程中，新生成的RNA可以和模板DNA互補，在染色質上形成由DNA:RNA雜合鏈和單鏈DNA組成的三鏈結構。這種核酸結構被稱為R-loop。它的穩態失衡是多種疾病的病理基礎。而N6-甲基腺嘌呤（m6A）是對mRNA生命周期進行調控的重要修飾，參與細胞分化與個體發育、應對環境壓力、免疫系統功能、腫瘤發生......閱讀全文
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據
文章導讀2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。m6A甲基化與mRNA關聯分析案例一：非洲爪蟾睪丸組織中m6A甲基化圖譜發表
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺，也是客戶發表文章最多的RNA甲基化測
Nature－Genetics－|－何川團隊繪制淋巴母細胞樣細胞系QTL圖譜
N6-甲基腺苷（m6A）在調節信使RNA加工中起重要作用。盡管在該領域取得了快速進展，但對m6A修飾的遺傳決定因素及其在常見疾病中的作用了解甚少。 2020年6月29日，芝加哥大學何川等團隊在Nature Genetics 在線發表題為“Genetic analyses support the
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
文章導讀 2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺，也是客戶發表
CHAPIR通過m6A甲基化調控心臟肥大的分子機制
慢性心肌肥大及其相關的心肌重塑是發展心臟功能障礙的主要因素，從而導致嚴重的心力衰竭和死亡。RNA m6A甲基化/去甲基化機制與心臟的生理和病理過程密切相關，然而m6A修飾參與心臟肥大的分子機制尚不清楚。非編碼RNA（ncRNA），尤其是ncRNA的心臟特異性表達，在生理和病理性心臟肥大中均具
我國學者發現m6A修飾小腦發育中的新功能
N6-甲基腺嘌呤（m6A）修飾是RNA上分布最廣泛的一種化學修飾，參與調控RNA的翻譯、降解以及可變剪接等多個過程，在胚胎干細胞干性維持、胚胎發育、配子發生等生命活動中均發揮重要作用。m6A修飾是由METTL3、METTL14以及WTAP等構成的m6A甲基轉移酶復合物催化形成的，其中METTL3
研究揭示m6A修飾調控天然免疫識別新機制
6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine，m6A）是mRNA中含量最豐富的甲基化修飾形式之一，由甲基轉移酶復合物METTL3/METTL14/WTAP等催化形成。病毒RNA中m6A修飾是否影響宿主對病毒的天然免疫識別及分子機制有待進一步研究。 3月11日，中國科學院生物物理所研究員
m6A修飾新功能——調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院北京基因組研究所韓大力和同濟
新型全轉錄組單堿基分辨率N6甲基腺苷（m6A）檢測方法
在已知的100多種RNA化學修飾中，N6-甲基腺苷（m6A）是真核細胞mRNA中最豐富的形式之一，占所有腺苷的0.1%~0.4%。m6A修飾可影響mRNA代謝的不同階段以及長非編碼RNA和microRNA產生，是RNA和表觀修飾領域的重要研究方向。已有研究表明，m6A能夠影響多種生物學過程，包括
RNA甲基化促進草莓成熟
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分，對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成，受到精確調控。解析果實成熟調控機制，將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。根據成熟機制的不同，果實可分為兩種類型：呼吸躍變型（如番茄、蘋果、香蕉）和非呼吸躍變型（如草莓、葡萄、柑橘）。植物激素
中山大學楊建華團隊發1篇Nature，揭示m6A詳細調控機制
2019年3月13日，美國希望之城貝克曼研究所陳建軍，芝加哥大學何川，中山大學楊建華及辛辛那提兒童醫院黃剛共同通訊在Nature在線發表題為“Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcr
草莓通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟
近日，中國科學院植物研究所研究員秦國政團隊發現，RNA甲基化（m6A）修飾在不同類型果實的成熟調控中均發揮重要作用，但是作用機制有所不同。在番茄果實中，m6A修飾主要通過反饋調控DNA甲基化來發揮作用，而在草莓果實中，m6A修飾則通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟，這為闡明果實成熟調控網絡提供
揭秘m6A修飾新功能－－－－調控染色質狀態和轉錄活性
文章導讀 m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院
云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用1
m6A甲基化是近年來一大熱門研究方向，種種研究表明m6A修飾在各種真核生物、各類組織細胞中普遍存在，并對多種生物學功能、疾病腫瘤的發生發展具有極大影響。m6A甲基化位點的檢測依賴于MeRIP-seq，其中的抗體免疫共沉淀（IP）環節要求樣品RNA起始量相較普通轉錄組測序要高，曾經令許多難以大量獲取的
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用（三）
總結本文作者通過RNA-seq,?m6A-seq,?MeRIP-qPCR,?ChIP,?CoIP,雙熒光素酶實驗等方法，研究發現去甲基化酶ALKBH5缺失會加重胰腺ai的發生和不良臨床病理表現特征。ALKBH5的過度表達可降低了體外腫 瘤的增殖、遷移和侵襲活性，改善了體內腫 瘤生長，而ALK
揭秘m6A修飾新功能－－－－調控染色質狀態和轉錄活性
m6A是真核生物中最常見的一類化學修飾，能夠在多種生物過程中發揮重要作用，包括癌癥發生發展、細胞分化、壓力應答、免疫反應以及神經發育等方面。目前大部分研究主要探究m6A對蛋白編碼基因的調控——即影響mRNA穩定性或翻譯效率。 2020年1月17日，美國芝加哥大學何川，中科院北京基因組研究所
植物所解析RNA甲基化調控果實成熟的作用機制
DNA甲基化（5mC）和RNA甲基化（m6A）是兩種重要的核酸修飾，在基因表達調控中發揮重要作用并參與諸多生物學過程。然而，這兩種核酸修飾之間是否存在內在關聯性卻不清楚。近日，中國科學院植物研究所秦國政研究組和田世平研究組合作，揭示了DNA甲基化可通過調節m6A去甲基化酶基因表達的方式影響番茄果
何川、賈桂芳Nature子刊發布表觀遺傳學新成果
來自芝加哥大學、北京大學的研究人員在新研究中，揭示出了擬南芥m6A甲基化組（methylome）的獨特特征。他們的研究結果發表在11月28日的《自然通訊》（Nature Communications）雜志上。 芝加哥大學的何川（Chuan He）教授、Joy Bergelson教授以及北京大學
帶你解析腫瘤預后模型研究套路
研究背景 頭頸部鱗狀細胞癌（HNSCC）是全球人類第六大最常見的惡性腫瘤，超過50％的HNSCC確診患者處于晚期。免疫系統的失衡在以免疫抑制性疾病為特征的HNSCC的發展中起著至關重要的作用。因此，應進一步探索腫瘤免疫微環境（TIME）的調節機制，以確定可精確預測預后及優化免疫療法的有效生
上海生科院發現RNA－m6A修飾和果蠅性別決定新因子
3月19日，中國科學院上海生命科學研究院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所嚴冬研究組，與美國哈佛大學Norbert Perrimon研究組合作，以Xio is a component of the Drosophila sex determination pathway and RNA
中科院、復旦Nature子刊解析RNA甲基化
在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，并由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用2
3) m6A修飾與基因表達聯合分析通過m6A-MeRIP-seq和RNA-seq聯合分析，文章展示了m6A修飾水平與基因表達水平間的關系，統計發現表達高的基因分組中，受m6A修飾的基因比例也更高。4）甲基化相關酶的表達通過qPCR檢測了兩組樣品中6個甲基化相關酶的表達，發現在高度近視白內障患者中甲基
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化（RNA methylation）是一類表觀遺傳修飾，在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenos
RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化（RNA methylation）是一類表觀遺傳修飾，在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methylad
m6A－RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用（一）
導讀最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況，發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇，已經追平2019年整年度發表篇數，可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。?圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況（ data from PubMed）那么您
2019年云序RNA甲基化修飾領域文章匯總
感恩有你，一路同行！2019年末，云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候！光陰如梭，一年轉瞬又將成為歷史，新的一年意味著新的起點、新的機遇、新的挑戰，決心再接再厲，更上一層樓。回首即將過去的2019，云序生物不斷創新，碩果累累；展望2020，任重道遠卻信心倍
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
Nature揭示RNA修飾在大腦功能和性別決定中的重要作用
RNA在生物學系統中有著舉足輕重的作用，兼具信息分子和調控分子雙重功能。據估計RNA上有一百多種化學修飾，但絕大多數修飾的功能還鮮為人知。本期Nature發表的一項研究指出，RNA修飾對果蠅神經系統的功能至關重要，也在性別決定起到了重要作用。 N6-methyladenosine（m6A）是真