華大基因推出桌面化測序儀
日前，華大基因推出一款桌面化的測序儀系統bgiseq-500，這是繼前不久推出完全集成式的“超級測序儀”revolocitytm之后，華大基因第二款基于completegenomics技術的測序系統。與前者的大容量不同，bgiseq-500是一套小巧的集成桌面測序解決方案，可自動進行樣本制備、測序和數據分析，多種檢測應用可以一鍵式操作。 據了解，該儀器單次可進行16-192個樣本檢測，同時內置自動化分析軟件，從dna樣本建庫到數據分析，全過程最快可24小時內完成。據悉，bgiseq-500的技術信息將于今年10月在深圳舉行的第十屆國際基因組學大會上正式發布。 同時，華大基因還推出自主研發的產前基因檢測新產品smarttesttm。在其原有產品基礎上，提速了檢測周期，增加了檢測內容，可組合產前檢測項目，只需用5ml的孕婦靜脈血，就可同時完成胎兒染色體異常檢測、遺傳性耳聾基因檢測、地中海貧血基因檢測以及12種常見遺傳病基因檢......閱讀全文
基因測序腫瘤檢測
臨床醫生在腫瘤治療中發現，人體腫瘤千差萬別，即使是同一個部位的腫瘤，治療效果和方法也應因人而異，這種因人、因病而采取的不同疾病治療方法稱為“個體化治療”。因此在癌癥治療過程中，只有同病異治，因人而異，實施個體化治療，才能針對不同類型的病人選擇合適他們的藥物。下圖中給出的是在乳腺癌中HER2基因的表達
用循環測序法檢測突變實驗
實驗材料血液或者其他來自待測個體的 DNA 材料試劑、試劑盒乙酸鈉異丙醇TE 緩沖液分子質量標記物寡聚核苷酸測序引物多聚核苷酸激酶反應緩沖液多聚核苷酸激酶雙脫氧核苷酸Taq DNA 聚合酶10 X 循環測序反應緩沖液礦物油終止液儀器、耗材熱循環儀和管子實驗步驟展開
基因測序與基因檢測的區別
基因測序是測出DNA上的堿基是A,C,G,T中的哪一個；而基因檢測是通過雜交或測序等方法來確定DNA序列中是否含有特定的一段序列，來明確相關的基因某些功能。基因測序只是測定DNA的序列，和站在機器前拍一張X光片是一樣的。基因測序的結果拿到一個由A、G、C、T組成的文件。沒有對測序結果進行分析和判斷，
NGS測序技術的不同檢測方案
測序技術是單基因遺傳病診斷應用的主要技術，針對檢測基因的范圍可大體分為單基因檢測技術和多基因檢測技術。單基因檢測是指針對某一特定基因進行測序的技術，適用于具有特異疾病表型的疾病。單基因檢測技術中應用最廣泛的是Sanger測序，也稱一代測序。Sanger測序因僅能檢測一個或少數幾個基因，因此適用于明確
檢測癌癥相關DNA修飾新測序方法
牛津Ludwig癌癥研究所助理成員Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler領導的這項研究表明，他們開發的新方法，TET輔助吡啶硼烷測序（TET-assisted pyridine borane sequencing，TAPS）是一種比亞硫酸氫鹽測序（bis
單基因檢測和二代測序
在肺癌患者中，有一批攜帶驅動基因突變的患者，在治療上可以針對突變的基因采用靶向治療。在預后上，這部分患者也往往具有較長的生存期。目前，指南推薦了9個靶向治療的相關基因，他們分別是：EGFR、ALK、ROS1、Her2、KRAS、MET、RET、BRAF和最近一年剛進入指南的NTRK基因。為了識別這一
基因測序技術升級檢測CRISPR脫靶效應
政府主導致效率低 2014年末，習近平總書記前往鎮江視察時發表過如下言論：“一些大醫院始終處于‘戰時狀態’的狀況需要改觀。”新醫改啟動至今已是第七年，但因患者在大醫院高度擁堵造成的看病難、看病貴卻絲毫不見緩解，反而有所加劇，習總書記所指出的，正是這一輪醫療衛生體制改革最亟需解決的問題。 相關
武漢大學研發納米孔靶向測序檢測方法
記者從武漢大學獲悉：該校組建的聯合團隊創新性開發的納米孔靶向測序檢測方法，能夠大幅提升病毒陽性檢出率，并能實現當天同時檢測新冠病毒和其他10類40種常見呼吸道病毒并監測病毒突變，有助于破解臨床疑似病例難以確診的問題。 據介紹，既往新冠病毒診斷依賴于qPCR核酸檢測，但是該方法顯示出較高的假陰性
Nat－Commun：手機檢測致癌突變，測序它也行！
1月16日，研究人員在《 Nature Communications》上表示，他們開發出了一種移動顯微鏡，利用手機相機來檢測細胞和組織中DNA測序反應生成的熒光產物。這種移動顯微鏡可以檢測到KRAS基因的突變位點，而該突發被發現于超過30%的結直腸癌患者體內。 本文共同作者，瑞典斯德哥爾摩大學
基因檢測，一臺測序儀并不夠
如今，基因組測序的新聞已變得司空見慣，不像幾年前，基因組草圖甚至能登上雜志的封面。隨著測序儀的價格不斷下探，你也考慮購入一臺。挑來選去，不知哪一臺更好。在這一期的《BioTechniques》上，Jeffrey Perkel告訴你，一臺也許并不夠。 新一代測序儀在上市之初，價格高昂，僅限“土豪
Illumina牽頭制定DNA測序腫瘤臨床檢測規范
Illumina聯合娜法伯癌癥中心、弗雷德哈欽森癌癥研究中心、MD安德森癌癥中心、紀念斯隆凱特林癌癥中心，宣布成立AGC（規范基因組聯盟）聯合機構，指導下一代測序技術在腫瘤臨床診斷中的應用。 他們的目標是定義什么是“癌癥專屬基因組”，即到底那些變異是癌癥真正特有的，由此腫瘤學家和病理學家可以確
SNP檢測技術（測序、taqman探針和snp芯片）
snp現有檢測技術有主要的3大類別1、測序 主要發現新的snp位點和比較集中的snp位點，如hla區域，但成本較高，工作量大，不適合大樣本做疾病關聯分析。 2、taqman探針 結果比較可靠，國外文章也大量應用，不過對于國內成本偏高，同類還有snpshot技術，abi和貝克曼
DNA測序PCR測序反應
1. 取0.2 ml的PCR管，用記號筆編號，將管插在顆粒冰中，按下表加試劑： 所加試劑 測定模板管 標準對照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待測的質粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 雙鏈DNA － 1 μl 待測DNA的正向引物 1 μl － M13(
DNA測序的測序原理
DNA測序的測序原理是：利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成，每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團，使延長的寡聚核苷酸
DNA測序的測序技術
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（Next-generation sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要有以
基因測序已能夠檢測150多種疾病的風險
6月30日，第四屆精準醫療與基因測序大會在京拉開帷幕。中國工程院院士程京在會上表示，現階段，基因測序能夠檢測出一個人罹患13類150多種疾病的風險，未來還會更多，基因檢測不僅能夠輔助臨床治療，也可以應用在預防醫學。 2009年，國家衛計委正式形文，鼓勵工業界第三方以獨立醫學檢驗的方式進入檢驗，
DNA測序技術檢測肝癌－靈敏度高達95％
近日，由Exact Sciences和梅奧診所（Mayo Clinic）開發的基于血液的DNA測序panel在一項2期臨床驗證性研究中表現優異，能準確地檢測各個階段的肝癌，且檢測特異性超過常用的血清測試。這項新發明有望幫助肝癌患者盡早診斷并采取治療。 肝細胞癌（HCC）是最常見的一種原發性肝癌
－PNAS：半導體測序助力胎兒遺傳病檢測
日前，來自中國廣州醫科大學等機構的科研人員報告了一種基于半導體的DNA測序平臺可能有助于增加胎兒遺傳病檢測的速度并減少成本，研究報告被發表在5月5日的PNAS網絡先行版上。 什么是基于半導體的DNA測序? 半導體DNA測序平臺是使用半導體生物傳感器芯片，對DNA復制期間產生的氫離子進
全基因組測序助力食源性疾病檢測
CDC研究人員檢查用于全基因組測序的電腦芯片。 李斯特菌暴發致3人死亡并且迫使美國得克薩斯州藍鈴冰淇淋公司在上個月底召回其全部產品，這是遺傳流行病學如何正在改變食源性疾病檢測的最新例子。兩年前，位于亞特蘭大的美國疾病控制和預防中心（CDC）啟動一項試點計劃，測序與某種疾病相關聯的每個李斯特菌樣品的
DNA測序技術的測序規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組寡核苷酸都有固定的起點，但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等，因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物，這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。在可以區分長度僅差一個核苷酸
簡述DNA測序的測序規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組寡核苷酸都有固定的起點，但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。 由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等，因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物，這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。 在可以區分長度僅
DNA測序儀pcr測序反應
pcr測序反應 (1) 取0.2ml的pcr管，用記號筆編號，將管插在顆粒冰中，按下表加試劑： 所加試劑 測定模板管 標準對照管 bigdye mix 1μl 1μl 待測的質粒dna 1μl － pgem-3zf (+) 雙鏈dna － 1μl 待測dna的正向引物 1μl －
DNA測序技術的測序原理
化學修飾法測序原理化學試劑處理末段DNA片段，造成堿基的特異性切割，產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物，經凝膠電泳分離。化學切割反應：包括堿基的修飾，修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。Sanger法測序的原理就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物
DNA測序的測序原理介紹
化學修飾法測序原理 化學試劑處理末段DNA片段，造成堿基的特異性切割，產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物，經凝膠電泳分離。化學切割反應：包括堿基的修飾，修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。 Sanger法測序的原理 就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定
DNA測序儀：454測序儀
454測序儀的出現極大促進了測序業務的開展，科研人員已經將測序技術作為解決科研工作中許多常見 問題的利器。這是因為454測序儀在以下幾個方面取得了質的突破：首先是解決了高通量測序問題；其次它簡 化了樣品準備步驟，將以往轉化大腸桿菌擴增質粒的繁瑣過程全部用簡單的體外PCR擴增法替代了；最后， 它縮小了
DNA測序的測序目的
確定重組DNA的方向與結構，對突變進行定位、鑒定和比較研究。
DNA測序——自動測序法
DNA測序可用于：（1）測定未知序列；（2）確定重組DNA的方向與結構；（3）對突變進行定位和鑒定比較研究。實驗方法原理ABI ?PRISM 310型基因分析儀(即DNA測序儀)，采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳，應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法)，因此通過單
PNAS:外顯子變異檢測——全基因組測序比全外顯子測序更強大
目前，全外顯子測序和全基因組測序技術在遺傳分析和發現導致疾病發生的潛在基因突變方面應用越來越廣泛，隨著測序技術的不斷迭代更新，越來越成熟，昂貴的價格會逐漸降低，那么在排除價格因素之后，全外顯子測序和全基因組測序在檢測外顯子突變方面究竟誰更加強大呢？來自美國的科學家對這一問題進行了相關研究，其研究
雙脫氧法DNA測序實驗——測序酶進行標記測序反應
在基本的雙晩氧測序反應中，寡核苷酸引物退火于單鏈DNA摸板，在4種脫氧核糖核酸三磷酸存在時，引物為DNA聚合酶所延伸。反應混合物中也含有4種雙脫氧核糖核苷三磷酸的其中一種，當它摻入到DNA的生長鏈時，可終止鏈的延伸。實驗材料DNA試劑、試劑盒寡核苷酸引物測序酶終止混合液測序酶緩沖液焦磷酸酶混合液儀器
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983