用RNAseq快速繪制大腦圖
在過去的十年中，DNA和RNA測序技術已迅猛發展并且更加便宜，現在它們被運用到各種新的領域中。最近在《Neuron》發表的一項新研究中，研究人員使用RNA測序技術，在單個神經元水平上繪制小鼠的大腦圖。這種新技術被稱為Multiplexed Analysis of Projections by Sequencing (MAPseq)，可能比目前的方案更快和更容易。延伸閱讀：華人學者構建新的大腦圖譜；《科學》：迄今為止最詳細的大腦連接圖 。 這項研究的第一作者、冷泉港實驗室Anthony Zador教授的研究生Justus Kebschull說：“有了MAPseq，我們試圖查明單個神經元最終到達哪里。”Zador的團隊積極開發MAPseq，因為缺乏高通量方法來跟蹤單個神經元。 在這項新的研究中，研究人員向一個選定的腦區，注射了一種含有大量RNA分子的失活病毒。每個RNA分子都有其獨特的“條碼”序列，每一個都在一個神經元中結束......閱讀全文
用RNAseq快速繪制大腦圖
在過去的十年中，DNA和RNA測序技術已迅猛發展并且更加便宜，現在它們被運用到各種新的領域中。最近在《Neuron》發表的一項新研究中，研究人員使用RNA測序技術，在單個神經元水平上繪制小鼠的大腦圖。這種新技術被稱為Multiplexed Analysis of Projections by S
雙RNA測序技術
在發表于《自然》（Nature）雜志上的一篇研究論文中， 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現，采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術，可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制，以及在研究中獲得的重要發現
RNA測序描繪人類視網膜的完整基因圖
來自馬薩諸薩州和哈佛醫學院的調查者們發表了人類視網膜的基因表達圖。Drs. Michael Farkas和他的研究員們報告了視網膜上基因表達的完整的目錄。 視網膜是眼睛后的神經組織。主要的功能是接受光的信號，并把光的信號轉化為神經信號并傳送給腦，從而形成我們的視覺。如果把眼睛比作照相機
焦磷酸測序(Pyrosequencing)技術(多圖)
焦磷酸測序（Pyrosequencing）技術是新一代DNA序列分析技術，該技術無須進行電泳，DNA片段也無須熒光標記，操作極為簡便。Pyrosequencing技術是由4種酶催化的同一反應體系中的酶級聯化學發光反應，在每一輪測序反應中，只加入一種dNTP,若該dNTP與模板配對，聚合酶就可以將其摻
Nature－Methods發布新RNA測序技術
Santa Cruz公司和Rochester大學的研究人員開發了一種新的RNA測序技術。他們通過這一技術發現了許多此前未被檢測到的調控性小RNA。這一成果發表在八月三日的Nature Methods雜志上。 這個新技術可以在細胞中靈敏檢測到帶有化學修飾（甲基化）的小RNA。“tRNA是生物體內
Nature發布突破性雙RNA測序技術
由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現，采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術，可以揭示出兩者轉錄譜的改變。 在發表于《自然》（Nature）雜志上的研究論文中，這一研究小組描繪了他們的技術，為什么這一技術對于更多地了解細菌感染機制非常有用，以及在研究中獲
DNA芯片技術和RNA測序有啥不同？
?日本推理小說家東野圭吾的作品《白金數據》中描述了這樣一個未來世界：日本政府秘密建立名為“白金數據”的數據庫。該庫搜集了全國人民的DNA數據，通過對犯罪分子留在現場的毛發、體液等證物進行比對，警方可以高效、快速、準確鎖定真兇。借助“白金數據”的幫助，一個檢舉率100%、冤案率0%的理想法制社會構建完
更便宜、更全面的單細胞RNA測序技術
康奈爾大學生物醫學工程學院助理教授Iwijn De Vlaminck課題組開發了一款更健全的、低成本的方法解決了這個問題，不僅推動了單細胞基因組學發展，而且為感染和免疫生物學研究提供了一條新途徑。這篇題為“Simultaneous Multiplexed Amplicon Sequencing
淺談單細胞RNA測序的技術與分析難點
如今，單細胞生物學是一個熱門話題。而在這一領域中，最前沿的則是單細胞RNA測序（scRNA-seq）。傳統“批量的”RNA測序方法（RNA-seq）可以一次處理成千上萬個細胞，并得到變異的平均水平。但是沒有兩個細胞是完全相同的，而scRNA-seq則可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化，甚至可以揭示全新
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...1
一次RNA甲基化測序的多項成果-云序RNA甲基化測序技術大公開文章導讀RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程，目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...2
（二）云序客戶m6A RNA甲基化修飾表達譜，一次測序兩篇文章疾病：胃癌樣品：胃癌組織vs癌旁組織（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修飾對其修飾基因在胃癌中的異常表達及預后的潛在影響發表雜志：Frontiers in Genetics影響因子：3.258
核糖核酸（RNA）測序
RNA在細胞中的穩定性較差，在實驗中也更容易受到核酸酶的攻擊。因為RNA是由DNA轉錄產生的，所以信息已經存在于細胞的DNA中。然而，有時也需要對RNA分子進行測序。雖然DNA測序給出了生物體的遺傳圖譜，但RNA測序卻反映了細胞中活躍表達的序列。為了給RNA測序，通常的方法是首先對從樣品中提取的
環狀－RNA－測序案例分析
案例：以結腸癌，卵巢癌，特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是構成生物體 RNA 網絡的一部分，而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
基于單細胞RNA測序繪制人類大腦高分辨率免疫細胞圖譜
近日，在德國弗賴堡大學醫學中心科學家的指導下，一個聯合研究團隊利用單細胞RNA測序技術繪制了首個人類大腦高分辨率免疫細胞圖譜！有史以來第一次證明大腦中的小膠質細胞（即吞噬細胞）具有相同的核心特征，并會根據大腦功能需求進行適應性表達，揭示了小膠質細胞的時間和空間異質性。2月14日，相關研究成果發表
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
吳立剛研究組研發微量小RNA深度測序技術
中科院上海生科院生物化學與細胞生物學研究所國家蛋白質科學中心（上海）吳立剛研究組與上海市計劃生育研究所施惠娟研究組合作，優化建立了適用于微量樣本的小RNA深度測序文庫構建方法，并系統解析了小鼠早期胚胎發育過程中小RNA的動態變化及其生物學功能。相關研究成果日前在線發表于《科學進展》。 目前小
《Nature－Methods》更便宜、更全面的單細胞RNA測序技術
微流控技術革新促進了單細胞RNA測序發展，它為單細胞基因組學提供了一種低成本、高通量的方法。然而，這種方法捕獲完整RNA轉錄信息的能力有限。（圖片來源：Cornell） 康奈爾大學生物醫學工程學院助理教授Iwijn De Vlaminck課題組開發了一款更健全的、低成本的方法解決了這個問題，不
曹博團隊聯合MIT開創RNA絕對定量測序新技術
RNA高通量測序技術（RNA-seq）是研究基因表達與調控領域的重要技術手段。然而目前RNA測序技術只能實現相對定量，以及無法檢測含表觀遺傳修飾或復雜高級結構的RNA分子，阻礙了RNA組學研究的進一步發展。 2021年4月15日，Nature Biotechnology 在線發表了曲阜師范大學
“RNA測序”通用模板新突破
通過檢測血液或尿液中少量的RNA來診斷或治療疾病是一個新興領域。隨著技術的進步，研究人員可以對RNA片段進行測序，但不同的人使用不同的方法來測序RNA，有時會得到不同的結果，這是影響成功的一個重大障礙，使得此領域很難取得進展。近來，密歇根大學Tewari教授的實驗室領導了美國和荷蘭的9個實驗室組
測序常見問題及其分析（圖）
1、PCR 產物測序時出現重疊峰問題圖1【模板中有堿基缺失，往往是單一位點（1-1）或兩個位點（1-2）堿基缺失導致測序結果移碼】圖1-1解決方法：將PCR產物克隆到質粒（如T載體）中挑單克隆測序，或將PCR產物進行PAGE純化（至少瓊脂糖充分電泳后切膠純化）后再進行測序。問題圖2（PCR產物不純，
大腦RNA編輯位點“辭典”發布
美國西奈山伊坎醫學院研究人員對大腦中的數千個位點進行了編目，在這些位點中，RNA在整個人類生命周期中被修飾，這個過程被稱為腺苷到肌苷（A-to-I）編輯，其為理解大腦發育的細胞和分子機制以及它們如何影響健康和疾病提供了重要的新途徑。在《細胞報告》上發表的論文中，研究團隊描述了大腦中RNA編輯的速率如
Nature公布新興測序技術繪制的人類組織RNA多樣性
由紐約基因組中心和布羅德研究所的科學家完成了一項對人類組織中RNA多樣性的研究，最近發表在Nature雜志上。當遺傳密碼轉錄成RNA時，一個基因通常會產生幾種不同形式的RNA分子，或具有不同功能的轉錄本。雖然這一現象幾十年來一直為人所知，但人類轉錄本的目錄仍然不完整。“我們配備了最新的測序技術，能夠
單核RNA測序的芯片現已上市
高通量的單核RNA測序方法——DroNc-Seq才剛剛在《Nature Methods》上發表。一轉眼，相應的芯片已經上市。Dolomite Bio公司針對DroNc-Seq推出一款新的芯片，可實現高通量的單核RNA-Seq分析。 DroNc-Seq方法在Broad研究所的張鋒（Feng
Science發表超深度線粒體RNA測序
蒙特利爾大學的一項新研究顯示，線粒體遺傳物質在個體內和個體間具有顯著的多樣性，而線粒體RNA上的修飾影響著我們每個人的身體健康。 線粒體基因組中的突變與多種疾病和生物學過程有關，然而此前人們還不了解線粒體轉錄組中的序列多樣性。這項研究通過超深度線粒體RNA測序，首次為人們展示了線粒體RNA
RNASeq和線粒體測序介紹
如今NGS已能夠快速經濟地閱讀數億個reads，所及之處遠超越基因組學（如RNA測序使轉錄組學發生革命性變化）。盡管NGS取得了諸多進步，但依然存在一些重大的挑戰。日前，牛津大學舉辦的“NGS七周年大會”聚焦了NGS面臨的挑戰，此次會議闡述了NGS領域最令人生畏的障礙，同時也闡述了跨越這些障礙的技術
RNA測序，真的有那么準確嗎？
RNA測序是遺傳學家工具箱中的一種常用工具。利用RNA測序，研究人員能夠定量地檢測各種生物體的基因表達，從而更好地了解細胞中正在發生的事情以及特定基因的功能。由于在藥物發現、疾病診斷和基因鑒定中具有潛在作用，RNA測序的應用似乎無極限。RNA測序的準確性早在2014年，《Nature Biotech
單個循環腫瘤細胞RNA測序結果
由麻省總醫院，哈佛大學主持的一項最新研究發現了前列腺癌細胞對一種常見的癌癥治療方法產生抗性的原因，研究人員完成了前列腺癌單個循環腫瘤細胞的RNA測序，其中找到了非經典Wnt信號所起的關鍵作用。 這一研究成果公布在9月18日的Science雜志上。 Androgendeprivationthe
RNA測序發現雜交蟬遺傳證據
? 據英國《通訊·生物學》雜志近日發表的一項動物學研究，日本科學家通過RNA測序，出乎意料地發現了13年蟬與近親17年蟬雜交的遺傳證據，而這兩種蟬至少221年才相遇一次。研究顯示，雜交蟬在極其漫長時間里都維持了各自不同的生命周期，目前科學家無法就這種平行趨異演化給出遺傳學解釋。長期以來，周期蟬的生命
DNA測序的測序技術
高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（Next-generation sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等，主要有以