基因組所肥胖調控機制合作研究獲重要進展
肥胖相關基因FTO主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤 近日，中國科學院北京基因組研究所“百人計劃”研究員楊運桂與美國芝加哥大學何川教授合作，發現了肥胖相關基因FTO(Fat mass and obesity-associated protein）主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤（m6A）。文章N6-Methyladenosine in Nuclear RNA is the Main Substrate of the Obesity-Associated FTO Protein于10月16日在線發表在Nature Chemical Biology雜志上。該研究為揭示FTO調控肥胖發生機制提供了重要線索。基因組所楊運桂研究組博士研究生趙旭參與了本課題研究工作，并為本論文的共同第一作者。 目前，肥胖已成為世界五大流行性疾病之一，嚴重危害著人口健康。全球約有16億成年人面臨著超重，4億人患有肥胖癥。在中國成......閱讀全文
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術，如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等，已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化，它是在擴增片段長度多態性技術的基
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定，但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來，科學家們開發出多種新方法，試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說，全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組，但它還是面臨技
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日，吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象，改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史，同時也使以DN
全基因組測序解讀重要甲基化機制
DNA看起來只是AGTC四種堿基的簡單排列，可一旦它與組蛋白包裝形成染色質，情況就復雜得多了。組蛋白主要有四種，分別是H2A、H2B、H3和H4。這些組蛋白要么令DNA盤繞起來保持沉默，要么將DNA解開允許基因表達。組蛋白上的化學修飾(如甲基化)，能夠影響它對基因的控制。 H3K4me3是
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”，5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》（Nature Biotechnology）上發表，這是中國科學家
全基因組甲基化定量檢測技術ＬＵＭＡ
LUMA介紹 基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件，有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此，我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化，稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methyl
全基因組甲基化定量檢測技術ＬＵＭＡ
LUMA介紹基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件，有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此，我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化，稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methylat
基因組直接測序法檢測甲基化的介紹
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
基因組直接測序法檢測DNA的甲基化
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應
揭示全基因組DNA甲基化、半甲基化與遺傳突變的新方法
5月31日，中國科學院北京生命科學研究院研究員孫中生團隊與北京大學腫瘤醫院合作，在Briefings in Bioinformatics上，發表了題為A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl
人類基因組DNA甲基化數據分析
近期來自電子科技大學，清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發，闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法，并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法，以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。 DNA甲基化是表觀
北京基因組所發表RNA甲基化新發現
在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA最后流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以在不改變DNA序列的基礎上調控基因的表達，并由此決定細胞的分化和發育情況。實際上，mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine（m
進行全基因組甲基化檢測需要多少錢
建庫是5000塊錢一個庫，測序就是1500每G，看您要測多少G的數據量，信息分析大概要5000塊錢左右吧。。。
北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中，發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合，促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月，中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組，與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究，發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
Nature－Genetics：單細胞全基因組DNA甲基化組新發現
北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心，北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法，首次在單細胞分辨
中國科學家首次發現線蟲基因組存在DNA甲基化現象
中國科學家最新研究成果首次證實在旋毛蟲基因組中發現了甲基轉移酶并證實了ＤＮＡ甲基化的存在，改寫了長期以來認為線蟲中沒有該種表觀遺傳修飾的歷史。同時也使以ＤＮＡ甲基化序列做靶標進行抗寄生蟲藥物研發成為可能，為抗旋毛形線蟲病的藥物開發提供了全新思路。 吉林大學人獸共患病研究所和華大基因研究院合作完成的
北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫
DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用，不同物種所采用的機制亦各不相同。因而，整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析，可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異，并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。
Cell：染色體水平油松基因組組裝和甲基化研究取得進展
近期，北京林業大學生物科學與技術學院聯合安諾優達在國際知名期刊Cell（IF：41.582）在線發表了題為“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者對油松進行了
甲基化的甲基化的功能
甲基化是蛋白質和核酸的一種重要的修飾，調節基因的表達和關閉，與癌癥、衰老、老年癡呆等許多疾病密切相關，是表觀遺傳學的重要研究內容之一。 最常見的甲基化修飾有DNA甲基化和組蛋白甲基化。DNA甲基化能關閉某些基因的活性，去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、D
北京基因組所等首次精準解析結核分枝桿菌復合群甲基化
結核病是全球最常見的傳染病之一，據WTO“2015年全球結核病年報”報告，2014年全球新增感染人數960萬，死亡150萬，新增耐多藥結核（MDR）病例48萬（其中我國新增結核感染病例93萬，居全球第三位），其目前仍是全球第二大傳染病。結核分枝桿菌復合群（Mycobacterium tuberc
北京基因組所等發現RNA甲基化調控基因出核新機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂研究組和鄭州大學第一附屬醫院生殖與遺傳專科醫院孫瑩璞研究組、中國科學院生態環境研究中心汪海林研究組合作研究，揭示了m5C（5-甲基胞嘧啶）修飾在mRNA的分布圖譜規律及其對調控mRNA出核作用新機制。該研究成果以5-
北京基因組所RNA－m6A甲基化調控mRNA剪切研究獲進展
6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最為豐富的甲基化修飾形式之一，發生于保守序列RRACH（R=G ,A； H=A,C or U）中，富集在mRNA的外顯子編碼區及3’-非編碼區。類似于DNA甲基化修飾，RNA的m6A甲基化修飾也是可逆的，由
吉大和華大基因聯合發現線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日，吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》（Genome Biology）上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象，改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史，同時也使以DNA甲基化
全基因組甲基化測序技術可用于肺結節良惡性無創診斷
近期，中國科學院合肥物質科學研究院健康與醫學技術研究所研究員聶金福、副研究員洪波生物信息學研究團隊、研究員王宏志課題組和安徽醫科大學二附院趙大海團隊合作，在腫瘤早篩領域取得進展，開發出基于血液cfDNA甲基化的肺結節良惡性無創診斷模型。相關研究成果在線發表在Cancer Science上。
北京基因組所揭示半甲基化在基因表達調控中的作用
DNA甲基化是最早發現的表觀遺傳標記之一，在真核細胞基因表達調控中發揮重要作用。隨著DNA甲基化檢測技術的進步，研究發現DNA甲基化具有完全甲基化和半甲基化兩種狀態，以及可以穩定遺傳的半甲基化修飾。關于DNA半甲基化是否具有獨特的生物學功能仍有爭議，因而需要對DNA半甲基化進行研究。此外，傳統的
dna甲基化與rna甲基化的區別
DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點：都有包含甲基化修飾；不同點：修飾對象不同，一個是對DNA修飾，一個是對蛋白：組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解，與前兩者差異較大。
基因組所等在RNA甲基化表觀遺傳新機制研究中獲重要進展
11月21日，中國科學院北京基因組研究所重大疾病基因組與個體化醫療實驗室 “百人計劃”研究員楊運桂研究組，與美國芝加哥大學何川教授實驗室和奧斯陸大學Arne Klungland教授合作完成的“RNA甲基化表觀遺傳新機制研究項目”取得重要進展，相關學術論文在《細胞》子刊《分子細胞》
多囊卵巢綜合征病人基因組DNA甲基化免疫沉淀反應分析
多囊卵巢綜合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一種復雜的、病因不明的疾病，最新研究結果表明，胰島素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的發生過程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS發生過程中的分子機制，運用基