《NatureGenetics》染色體外DNA會改變癌基因擴增水平
惡性膠質瘤（glioblastoma，GBM）是最常見且最具攻擊性的腦癌，標準治療反應很差，兩年生存率僅為15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章發現了GBM腫瘤耐藥的一個關鍵密碼。 為了靶向遏制GBM的攻擊性，杰克遜實驗室（Jackson Laboratory，JAX）教授Roel Verhaak和亨利-福特健康系統赫梅林腦腫瘤中心的助理教授Ana C. deCarvalho專門檢查了患者治療前后以及異種移植（PDX）小鼠模型腫瘤細胞進化過程中的基因組變化。 報告指出，腫瘤進展通常由位于染色體外的癌基因（oncogenes）驅動。 通過患者培養細胞和小鼠腫瘤細胞分析，研究人員發現細胞都保持著相同的基因組病變，這表明PDX小鼠是研究GBM的相對準確且有效的實驗模型。但是在少數情況下，主要的差別在于PDX小鼠和患者培養細胞的癌基因拷貝數。 這相當重要。因為癌基因增加或擴增會引發癌癥和幫助癌細胞生存下來......閱讀全文
科學家揭示腫瘤“作弊器”持續存在的關鍵機制
在癌細胞的生存競賽中，有一種特殊的“作弊器”——染色體外DNA（ecDNA）。它像是一個游離在細胞內的“外掛程序”，以環狀小圈的形式攜帶關鍵致癌基因，幫助癌細胞“開掛升級”。臨床數據顯示，ecDNA存在于30%至50%的惡性腫瘤中，它的存在顯著加劇了腫瘤侵襲性、治療耐藥性和患者死亡率。早在1965年
癌癥DNA環“密碼”被科學家破解
美國斯坦福大學醫學院團隊及其國際合作者在《自然》雜志上發表了三篇研究論文，徹底改變了科學界對小DNA環（ecDNA）在人類癌癥中所起作用的理解。這些研究詳細闡述了ecDNA在近15000例癌癥患者中的分布及對預后的影響，揭示了一種違反遺傳學基本規律的新型遺傳方式，并介紹了一種針對ecDNA的抗癌
腫瘤細胞中ecDNA新機制在斯坦福大學致癌基因研究應用2
（5）EcDNA hubs調控兩個癌基因位點的分子互作上述研究證明ecDNA hubs可能促進分子間增強子-啟動子相互作用。為了驗證這些相互作用，作者對人類胃癌細胞系中兩種類型的ecDNA進行了研究，一種ecDNA包含來自8號染色體的MYC擴增子，另一種包含來自10號染色體的FGFR2擴增子。用
腫瘤細胞中ecDNA新機制在斯坦福大學致癌基因研究應用1
文章導讀eccDNA是染色體外的一種特殊的環狀DNA，從它的出現至今已長達數年，但在起初的很長一段時間里并未得到人們的重視。隨著高通量技術的發展，eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作為染色體外的環狀DNA的研究也進一步深入。在國際學術
研究揭示尿路上皮癌進化的核心基因密碼
尿路上皮癌是惡性腫瘤，具有易復發、多灶性生長、高度遺傳異質性等特點。目前，驅動尿路上皮癌異質性演化的遺傳機理尚未闡明。 近日，中國科學院杭州醫學研究所科研團隊聯合中外團隊協同攻關，在尿路上皮癌研究領域取得進展。該研究發現名為ecDNA的物質如同腫瘤的“幕后黑手”一般，在尿路上皮癌的演變過程中發
研究揭示尿路上皮癌進化的核心基因密碼
尿路上皮癌是惡性腫瘤，具有易復發、多灶性生長、高度遺傳異質性等特點。目前，驅動尿路上皮癌異質性演化的遺傳機理尚未闡明。 近日，中國科學院杭州醫學研究所科研團隊聯合中外團隊協同攻關，在尿路上皮癌研究領域取得進展。該研究發現名為ecDNA的物質如同腫瘤的“幕后黑手”一般，掌握著這種腫瘤的核心基因密
研究揭示尿路上皮癌進化的核心基因密碼
尿路上皮癌是惡性腫瘤，具有易復發、多灶性生長、高度遺傳異質性等特點。目前，驅動尿路上皮癌異質性演化的遺傳機理尚未闡明。近日，中國科學院杭州醫學研究所科研團隊聯合中外團隊協同攻關，在尿路上皮癌研究領域取得進展。該研究發現名為ecDNA的物質如同腫瘤的“幕后黑手”一般，掌握著這種腫瘤的核心基因密碼，在尿
科學家首次證實促癌的ecDNA在細胞癌變之前就已經存在！
在細胞中，DNA緊密盤繞成染色體結構，儲存著正常細胞生長和存活所需的所有遺傳物質。然而，也存在一些微小的環狀DNA片段屬于“編制外人員”，它們游離在染色體之外，被稱為染色體外DNA（ecDNA）[1,2]。 作為編制外人員，ecDNA很是自由自在，想去哪就去哪。在細胞復制時，不同于“捆綁”在染
《Nature－Genetics》染色體外DNA會改變癌基因擴增水平
惡性膠質瘤（glioblastoma，GBM）是最常見且最具攻擊性的腦癌，標準治療反應很差，兩年生存率僅為15%。最近，《Nature Genetics》的一篇文章發現了GBM腫瘤耐藥的一個關鍵密碼。 為了靶向遏制GBM的攻擊性，杰克遜實驗室（Jackson Laboratory，JAX）教授
《Nature》：癌基因“地震擴增”，驅動多種癌癥！
染色體外DNA（ecDNA）是一類特殊的從正常基因組上脫落下來的游離于染色體外的環狀DNA。早在1964年，人們就在神經母細胞瘤細胞中觀察到了ecDNA的存在 ，但由于技術受限，人們對于ecDNA在腫瘤發生發展中發揮的具體作用未能有更進一步認識。 2017年Paul Mischel團隊在《自然
科學家首次解析腫瘤染色體外DNA的環狀結構與功能
早期研究認為腫瘤中大量擴增的原癌基因存在于染色體上。2017年，來自美國加州大學圣迭戈分校的Paul Mischel教授團隊在Nature雜志上指出，它們是以染色體外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的結構和功能一直缺乏直接的證據。 201
染色體外DNA——導至癌癥惡變的罪魁
北京時間11月21日，發表在《Nature》上的一篇新研究發現，在人類腫瘤細胞中發現大量如“甜甜圈”般的環狀染色體外DNA(EcDNA)，改變了與癌癥相關基因的表達方式，從而促進了癌細胞的侵襲性，并在腫瘤快速進化和抵御威脅的能力（如化療、放療和其他治療）中發揮了關鍵作用。該研究由美國加州大學圣地亞哥
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良預后相關文章導讀研究發現，許多擴增的原ai基因，并不只是位于染色體，而且還能變成游離的染色體外DNA（ecDNA），并出現大量拷貝，而且相當高比例的ecDNA是以環狀DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色體外環狀DNA
研究提出單細胞多組學新方法實現胰腺癌循環腫瘤細胞多維度解析
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員林達等報道了新開發的單細胞多組學技術——Uni-C。該方法可在一個細胞中同時解析基因組大尺度結構變異（如SV、CNV、ecDNA）、小尺度突變（SNP/INDEL）及染色質三維構象，實現高分辨率、多維度的聯合分析。胰腺癌異質性強、進展迅速，臨床面臨早篩困
Nature子刊：鄭大王立東揭示中國北方賁門癌與飲食相關性
河南、河北和山西三省交界的南太行山地區，特別是河南林州（原林縣）是中國也是世界上食管癌和賁門癌發病率和死亡率最高的地區。 1959年，河南省政府組建以河南醫學院牽頭的，以沈瓊教授、劉桂亭教授、裘宋良教授等為代表的食管癌防治醫療隊深入林縣開展多學科綜合防治研究。從此揭開了鄭州大學醫科三代人、六十
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...2
3.與線性DNA相比，ecDNA擴增導致的ai基因轉錄水平更高環狀ecDNA擴增的轉錄結果發現，在所有擴增子類別中觀察到DNA CN和ai基因表達水平高度明顯相關(圖3a)。然而，DNA CN歸一化后，環狀擴增子上的ai基因表達明顯高于非環狀擴增子。轉錄活性中不依賴于CN的增加現象可能部分是因為
新方法實現胰腺癌循環腫瘤細胞多維度解析
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員林達團隊與上海市第一人民醫院實驗動物中心主任楊玉琴團隊開發出單細胞多組學技術-Uniform Chromosome Conformation Capture（Uni-C）。該方法可在一個細胞中同時解析基因組大尺度結構變異（如SV、CNV、ecDNA）、小
癌基因的關鍵——染色體外環狀DNA（eccDNA）
實驗方法：環狀DNA-seq,?RNA-seq（云序生物提供以上服務）1.?ecDNA是環狀結構為了了解ecDNA的結構，作者通過環狀DNA-seq（云序生物提供以上服務）方法研究了三種人類癌細胞系和來自于TCGA的臨床腫瘤樣品。通過這種方法檢測到了GBM39細胞中的圓形擴增子游離于染色體之外，并且
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（三）
小編在這兒也給大家整理了eccDNA表達譜的研究思路，如下圖。?（2）生物標志物eccDNA優于線性DNA的生物穩定性以及獨特的分子結構特征，為迅速發展的無創活檢道路增添了新的方向，如果有較多的臨床樣本，它非常適合做生物標志物的研究。下面這篇文章是eccDNA在液體活檢方面探索的先驅文章，小編帶大家
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（二）
(3)?形成特征早期的研究發現eccDNA是基因擴增的產物，是基因組不穩定性的一種表現形式。腫瘤基因擴增往往以兩種方式，一種是在染色體上進行基因的擴增，另一種則是形成eccDNA。目前關于腫瘤中eccDNA的形成機制還沒有定論。早期的研究認為短重復序列是介導eccDNA形成的因素，主要通過基因重組機
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
?1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界，一時之間，將人們的目光都吸引到這個科研界的新寵
腫瘤研究，從認識腫瘤細胞開始
最近一段時間我們一直圍繞著腫瘤動物模型的構建，為大家介紹了腫瘤研究中各種實用動物模型的建立方法，相信大家應該收獲頗多。動物水平的研究為我們提供了更接近臨床的數據分析，與此同時，腫瘤細胞的實驗研究也同樣重要，它是腫瘤研究的初級階段，可以更加快捷地提供在體外水平的研究結果。本期我們就開啟腫瘤細胞學新
腫瘤標志物高是否就有腫瘤？
?? 腫瘤標志物是指在腫瘤發生和增殖的過程中，由腫瘤細胞合成、釋放或者是機體對腫瘤細胞反應而產生的一類物質。當機體發生腫瘤時，血液、細胞、組織或體液中的某些腫瘤標記物就可能會相應的升高。通過腫瘤標志物的檢查可以在腫瘤普查中早期發現腫瘤病人，幫助觀察抗腫瘤治療療效以及判斷預后。??? ???
研究成功抑制腫瘤血管、阻止腫瘤生長
美國國立衛生研究院(National Institutes of Health)和其他機構的科學家設計了一種新策略，以阻止腫瘤生長所需的新血管。曾經被認為是極有希望的癌癥治療手段--阻斷刺激新的血管生長(血管生成)的分子已被證明無效，因為腫瘤細胞的反應會產生更多的刺激分子。新的策略包括使關鍵的酶
腎盂腫瘤和輸尿管腫瘤的基本介紹
腎盂腫瘤和輸尿管腫瘤，約占所有尿路上皮腫瘤的10%左右。本病多數為移行細胞癌，少數為鱗癌和腺癌，后二者約占腎盂癌的15%左右，它們的惡性程度遠較移行細胞癌為高。臨床所見移行細胞癌可在任何被覆有移行上皮的尿路部位先后或同時出現，因此，在診斷及處理上應視為一個整體，不能孤立地對待某一局部的移行細胞癌
關于腎盂腫瘤和輸尿管腫瘤的檢查介紹
1、腎盂腫瘤和輸尿管腫瘤的檢查— 排泄性泌尿系造影 可見充盈缺損，應與尿酸結石、基質石鑒別，有時缺損可因血塊所致，腎實質腫瘤和囊腫均可能見腎盂腎盞充盈缺損，有時需配合B超和CT方可確診。 排泄性泌尿系造影不良時應配合逆行性造影或其他檢查。 2、腎盂腫瘤和輸尿管腫瘤的檢查—?逆行性泌尿系造影
Nature：靶向腫瘤微環境，用antimiR治療腫瘤
近日，著名國際期刊Nature發表了耶魯大學研究人員的一項最新研究成果，他們建立了一個能夠將antimiR靶向輸送到酸性腫瘤微環境的藥物輸送平臺，通過抑制miR-155表達，抑制淋巴癌發展。這一研究成果對靶向藥物輸送系統研究以及通過antimiR治療癌癥具有重要意義。 MicroRNA是是一類
腫瘤患者營養治療會不會促進腫瘤生長？
營養不良是惡性腫瘤患者常見的并發癥之一。有數據表明，在我國，胃癌、腸癌和胰腺癌中，營養不良的發生率可高達70%至80%。約有22%的病人直接死于營養不良。營養不良不僅影響腫瘤治療的臨床決策，還會影響患者的臨床結局。圖片來源于網絡 營養治療會不會促進腫瘤生長？ 腫瘤細胞是一種生長迅速的細胞，需
循環腫瘤細胞檢測有助早期發現腫瘤轉移
本報訊 1896年，澳大利亞學者Ashworth在一例轉移性腫瘤患者血液中首次觀察到從實體腫瘤中脫離并進入血液循環的腫瘤細胞，并率先提出了循環腫瘤細胞(CTC)的概念。近年來世界各國研究人員圍繞CTC在乳腺癌、結直腸癌等腫瘤中的應用價值開展了多項探索研究。美國喬治敦大學醫院教授Minetta