《Nature》:癌基因“地震擴增”,驅動多種癌癥!
染色體外DNA(ecDNA)是一類特殊的從正常基因組上脫落下來的游離于染色體外的環狀DNA。早在1964年,人們就在神經母細胞瘤細胞中觀察到了ecDNA的存在 ,但由于技術受限,人們對于ecDNA在腫瘤發生發展中發揮的具體作用未能有更進一步認識。 2017年Paul Mischel團隊在《自然》上發表文章證明,ecDNA在近一半的人類腫瘤細胞中廣泛存在,且無著絲粒序列的ecDNA在有絲分裂過程中的不均等分配,大大加速了腫瘤異質性的形成。 兩年后,Paul Mischel團隊再次于《自然》雜志發表研究論文,證明ecDNA存在高度開放的染色質結構,并且ecDNA上的癌基因呈現出明顯更高的表達水平。至此,ecDNA引發人們的廣泛關注。 關于腫瘤細胞中ecDNA的起源目前有很多假說,如串聯復制模型、斷裂融合橋模型(BFB)、染色體碎裂模型(chromothripsis)等。然而,目前對ecDNA結構的綜合分析表明,ecDNA的......閱讀全文
《Nature》:癌基因“地震擴增”,驅動多種癌癥!
染色體外DNA(ecDNA)是一類特殊的從正常基因組上脫落下來的游離于染色體外的環狀DNA。早在1964年,人們就在神經母細胞瘤細胞中觀察到了ecDNA的存在 ,但由于技術受限,人們對于ecDNA在腫瘤發生發展中發揮的具體作用未能有更進一步認識。 2017年Paul Mischel團隊在《自然
轉座因子驅動癌基因在人類癌癥中廣泛表達
近日,華盛頓大學醫學院等科研人員在Nature Genetics上發表了題為“Transposable elements drive widespread expression of oncogenes in human cancers”的文章,發現轉座因子驅動癌基因在人類癌癥中的廣泛表達。
癌基因擴增概述
原癌基因還可因某種原因自身擴增而過度表達。在腫瘤細胞尤其是胚胎神經組織腫瘤細胞中有時見到的雙微體和染色體上的均染區就是原癌基因DNA片段擴增的表現例如,在腫瘤細胞中c-myc癌基因可擴增數百到數千倍。
Nature揭示多種癌癥通用免疫逃逸通道
弄清楚如何可以打敗在轉移性黑色素瘤患者中導致治療失敗的一種信號通路,應該可以幫助醫生擴大最近獲得批準的一類增強免疫力的藥物——檢查點抑制劑的療效,讓更多患者受益。 在5月11日的《自然》(Nature)雜志上,來自芝加哥大學的研究人員揭示出了這些腫瘤通過生成高水平的細胞內信使β -cateni
Nature子刊揭示新型癌癥驅動基因
研究人員發現了一種基因驅動了1%癌癥患者的腫瘤形成。這是首次證實CUX1基因與癌癥形成存在廣泛的聯系。 研究小組發現,當CUX1失活時激活了一種促進腫瘤生長的生物信號通路。當前有一些抑制這一信號通路的藥物正在臨床使用或進入研發階段,因此為攜帶這種致癌突變的患者提供了一種潛在的靶向新療法。
Nature:腫瘤抑制蛋白竟驅動惡性癌癥
近日,來自賓夕法尼亞大學等處的科學家通過研究發現,惡性腫瘤的生長及DNA序列未發生改變的基因活性的變化往往和突變的p53蛋白質直接相關,相關研究結果刊登于國際著名雜志Nature上,該研究或為開發應對難以治療的癌癥的新型策略提供幫助。 TP53是所有人類癌癥中頻繁突變的基因,其可以編碼一種名為
《Nature-Genetics》染色體外DNA會改變癌基因擴增水平
惡性膠質瘤(glioblastoma,GBM)是最常見且最具攻擊性的腦癌,標準治療反應很差,兩年生存率僅為15%。最近,《Nature Genetics》的一篇文章發現了GBM腫瘤耐藥的一個關鍵密碼。 為了靶向遏制GBM的攻擊性,杰克遜實驗室(Jackson Laboratory,JAX)教授
以全新視角分析古老癌基因-尋找克制多種癌癥的新療法
KRAS是癌癥發生過程中最常見的一種突變基因,同時也是被科學家們廣泛研究的一種基因,在PubMed上搜索KRAS關鍵詞可以得到9000多條搜索結果,大部分的研究都重點分析了該基因在突變狀態下的致癌角色,但一種基因轉變成為癌基因或許有多種方法。近日,一項刊登在國際雜志Nature Medicine上的
Nature-|-癌癥非整倍體形成的主要驅動力
盡管非整倍體(此處定義為整個染色體或整個染色體臂DNA的失衡)存在于約90%的腫瘤中,并且是癌癥中首次提出的體細胞改變,但其普遍發生的原因及其在驅動癌癥中的作用仍不清楚。有研究表明,非整倍體的普遍發生可能反映了頻繁的染色體錯誤分離、重排或中心體畸變(機械偏倚),或與非整倍體相關的適合性優勢(選擇
-Nature:IDH2在生物體中驅動癌癥
兩項最近的研究表明,新陳代謝基因異檸檬酸脫氫酶2(IDH2)中的突變能夠導致白血病和肉瘤在生物體內的發育。IDH1或IDH2中的單等位基因點突變已經被認為與各種各樣的癌癥類型有關,這意味著這些突變可能是腫瘤發生的驅動因子,然而,IDH的研究一直受到缺乏體內模型的困擾。 IDH酶通常將異檸檬
Nature:哈佛大學開發出通用型癌癥疫苗,或治療多種癌癥
癌癥是全球主要的公共衛生問題,近年來,由于飲食、環境、人口的老齡化等因素,全球癌癥發病率不斷增長,癌癥作為主要死因的情況日益突出。根據國際癌癥研究機構(IARC)發布的2020年全球最新癌癥數據,中國已經成為了名副其實的癌癥大國。作為世界上的人口大國,中國的癌癥數據不容樂觀,不論是新發人數還是死亡人
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
2019年11月,頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界,一時之間,將人們的目光都吸引到這個科研界的新寵
Nature:全新抑癌基因網絡
來自美國冷泉港實驗室,加拿大麥吉爾大學等多處研究機構的研究人員發表了題為“A tumour suppressor network relying on the polyamineChypusine axis”的文章,報道了一種基于多胺hypusine軸(polyamineChypusine
Nature解釋癌癥為何會發生:一種抑癌基因決定細胞命運
生物通報道:為何乳腺癌會進一步發展,為何某些患者會對治療產生耐藥性?來自巴塞爾大學的一組研究人員近期針對乳腺組織的分子進程提出了新的見解,他們發現抑癌因子LATS在乳腺癌發展和治療過程中扮演了關鍵的角色。 這一研究成果公布在1月9日的Nature雜志上。 所有的乳腺癌都不是均質的,高達70%
“三駕馬車”驅動癌癥
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/477944.shtm 加拿大研究人員近日在《代謝物》發表的一項綜述研究認為,雖然癌癥是一種遺傳疾病,但遺傳因素只是謎題的一部分,人們還需要考慮環境和代謝因素。 阿爾伯塔大學生物科學系和計算機科學系
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
?1. eccDNA為什么火?它到底是何方神圣? 2019年11月,頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤
再登Nature-GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...2
3.與線性DNA相比,ecDNA擴增導致的ai基因轉錄水平更高環狀ecDNA擴增的轉錄結果發現,在所有擴增子類別中觀察到DNA CN和ai基因表達水平高度明顯相關(圖3a)。然而,DNA CN歸一化后,環狀擴增子上的ai基因表達明顯高于非環狀擴增子。轉錄活性中不依賴于CN的增加現象可能部分是因為
再登Nature-GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良預后相關文章導讀研究發現,許多擴增的原ai基因,并不只是位于染色體,而且還能變成游離的染色體外DNA(ecDNA),并出現大量拷貝,而且相當高比例的ecDNA是以環狀DNA分子的形式存在,即eccDNA(染色體外環狀DNA
Nature發現癌基因MYC的主調控因子
根據來自明尼蘇達大學共濟會癌癥中心的一項新研究中,一個導致了20%的癌癥的關鍵致癌基因MYC,其盔甲上或許有一個弱點。MYC與非編碼RNA PVT1之間的伙伴關系,有可能是了解MYC推動癌細胞機制的關鍵。這項研究發表在最新一期的《自然》(Nature)雜志上。 論文的主要作者、明尼蘇達大學醫學
Nature里程碑成果:解析21種癌癥基因組
針對21種癌癥類型開展大規模分析,一項里程碑式的研究揭示癌癥突變的世界遠比以前認為的要大得多。通過分析數以千計的患者腫瘤基因組,由Broad研究所領導的一個研究小組發現了許多的新癌癥基因,將與這些癌癥相關聯的已知基因目錄擴增了25%。此外,這項研究表明還有許多重要的癌基因有待發現。這項研究工作為
Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤
癌基因的關鍵——染色體外環狀DNA(eccDNA)
實驗方法:環狀DNA-seq,?RNA-seq(云序生物提供以上服務)1.?ecDNA是環狀結構為了了解ecDNA的結構,作者通過環狀DNA-seq(云序生物提供以上服務)方法研究了三種人類癌細胞系和來自于TCGA的臨床腫瘤樣品。通過這種方法檢測到了GBM39細胞中的圓形擴增子游離于染色體之外,并且
研究發現低氧驅動癌癥生長
《分子細胞生物學期刊》(Journal of Molecular Cell Biology)2012年第3期“復雜疾病的系統生物學研究”專輯中發表了一篇美國佐治亞大學生物化學與分子生物學系徐鷹教授題為“Hypoxia and miscoupling between reduced ene
Nature頭條文章:削減癌基因名單
某些被人們稱之為“可疑基因”( fishy genes)的DNA錯誤,看起來似乎與腫瘤相關,然而當研究人員對癌癥基因組數據進行梳理時卻又無法對它們進行解釋。例如,為何某些與嗅覺相關的基因突變,又會與肺癌存在關聯? 來自美國哈佛-麻省理工Broad研究所的研究人員,通過對癌基因組數據進行
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生(三)
小編在這兒也給大家整理了eccDNA表達譜的研究思路,如下圖。?(2)生物標志物eccDNA優于線性DNA的生物穩定性以及獨特的分子結構特征,為迅速發展的無創活檢道路增添了新的方向,如果有較多的臨床樣本,它非常適合做生物標志物的研究。下面這篇文章是eccDNA在液體活檢方面探索的先驅文章,小編帶大家
Nature癌癥綜述:復制應激與癌癥
基因組的穩定性直接關聯到細胞是否發生癌變,而在這其中,DNA復制是最容易發生變化的過程,也是最容易致癌的過程。任何導致DNA損傷高水平發生的條件也都會引發復制應激(replication stress),這是基因組不穩定的來源之一,也是癌變前細胞和癌變細胞的一大標志。 來自西班牙塞維利亞大學的
《Cell》提出癌癥形成新理論
100多年來,研究人員一直無法解釋癌細胞中染色體數目異常(這一現象被稱作為非整倍體)的原因。許多人認為,非整倍體只是癌癥的一種隨機副產物。 現在,哈佛醫學院的一個研究小組想出了一種方法來了解腫瘤中的非整倍體模式,以及預測在受累染色體中哪些基因有可能是癌癥抑制基因或是促癌基因。他們提出非整倍
大數據:助力判定癌癥驅動基因!
目前已知超過100個新的癌癥驅動基因,幫助解釋了怎樣的腫瘤驅動會造成:相同的癌癥基因導致不同的病患! 在一項由Sanford Burnham Prebys醫學發現研究所(SBP)引導下的協作研究中,研究人員結合兩個公開的“組學”數據庫創建一個新的目錄“癌癥驅動者”。當癌癥驅動基因的改變造成癌癥
首張癌癥驅動突變圖譜繪成
新突變圖譜揭示關鍵癌癥基因的微小變化如何顯著改變腫瘤生長模式。圖片來源:美國《每日科學》網站癌癥驅動突變是指某些基因突變能直接推動正常細胞向癌細胞轉化。一個國際科研團隊繪制出全球首張完整的癌癥驅動突變圖譜,揭示了癌癥關鍵基因中數百種突變如何影響腫瘤生長。當與真實患者數據比對時,這張圖譜能準確預測癌癥