《NatureGenetics》解讀腫瘤利器，預測癌癥進化
倫敦瑪麗王后大學的研究人員開發了一款計算分析模型，可用于預測腫瘤進展。這項研究發表在《Nature Genetics》，目的是讓臨床醫生具備預測腫瘤生長軌跡的能力，從而先發制人地控制病程和選擇相應治療方案。 研究人員采用亞克隆選擇計算模型和適用于高通量測序數據的理論種群遺傳學來監測人類癌癥克隆動態，這種方法可以察覺腫瘤樣本的亞克隆結構，同時測量每個亞克隆的選擇性優勢和出現時間。 “知道腫瘤是否會以某種方式改變，據此設計有效治療，”倫敦瑪麗王后大學Barts癌癥研究所教授Trevor Graham說。“這項工作還處于起步階段，待其成熟后將變得非常強大。” 解讀腫瘤的“秘密日記” 隨著腫瘤生長，它們的遺傳密碼（突變）也在不斷改變。其中一些變化可能賦予癌細胞優勢，使其更適合在某環境下生存。遵循達爾文進化論原則，這樣的細胞受到青睞能夠保持復制，產生更多相同突變細胞。許多攜帶不同突變的細胞群都在如此生長和聚集，創造出具有高度遺......閱讀全文
腫瘤大數據須著力打通“孤島”
我國海量腫瘤臨床診治信息處于無序利用狀態，也限制了腫瘤診治經驗的積累、傳承與深度挖掘，直接影響了惡性腫瘤診治規范的制定和質量控制管理。 或許，在很多人的心目中癌癥就等同于死亡。 國家癌癥中心發布的最新數據顯示：我國平均每天超過1萬人、每分鐘就有7人被確診為癌癥。癌癥的發病與死亡人數逐年
多項血液腫瘤研究數據亮相ASH年會
近日，多項血液腫瘤管線最新數據在第65屆美國血液學協會（ASH）年會上公布。其中奧布替尼聯合方案治療初治套細胞淋巴瘤（MCL）患者研究入選口頭報告。 一項由天津醫科大學腫瘤醫院張會來教授作為第一作者和通訊作者的奧布替尼+來那度胺+利妥昔單抗聯合方案治療初治MCL患者的前瞻多中心II期研究（PO
赫捷院士：我國腫瘤大數據剛剛起步
“惡性腫瘤已成為嚴重危害我國人們健康的重大疾病。但我國卻尚未建立以醫院為基礎的癌癥監查網絡，缺乏全國腫瘤診療狀況的權威數據，這就會導致腫瘤防治、臨床研究、指南制定、政府決策等帶有一定盲目性。” 7月29日，在中國衛生信息學會健康醫療大數據腫瘤專業委員會暨慢病防治聯盟指導委員會成立大會上，中國科
腫瘤基因專家致力挖掘單細胞大數據潛能
近年來，隨著測序技術的迅猛發展，單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年，單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測，都是在大量細胞宏觀水平上，對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上，對其遺傳物質進行檢測，從
“腫瘤精準醫學大數據中心”在津成立
1月15日，全國首家“腫瘤精準醫學大數據中心”在天津落成。天津市腫瘤醫院院長、腫瘤精準醫學大數據中心主任王平教授介紹，該中心將以推進我國“精準醫學”建設為核心，打造腫瘤生物醫療大數據科研平臺，通過對海量腫瘤樣本數據的分析研究，發現與中國人密切相關的腫瘤早期診斷的標志物，為腫瘤的早期篩查、診斷和藥
－訪ASCO主席：腫瘤大數據如何引導癌癥療法創新？
在2015年美國臨床腫瘤學會（ASCO）年度會議來臨之際，ASCO主席Peter Yu教授在采訪中簡要介紹了今年會議計劃的主要主題之一——大數據，并概述了ASCO牽頭的大數據項目CancerLinQ?的未來。此外，他還為 ASCO與會者推薦了一些重要的會議主題，并對為什么恰好是腫瘤科醫生引領醫藥
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
殼五糖骨肉瘤細胞抗腫瘤研究數據
研究人員發現殼五糖可有效抑制骨肉瘤細胞的增殖、遷移、侵襲能力，其作用機制可能是通過調控PI3K/AKT信號轉導通路產生的，該研究有望改善骨肉瘤的臨床療效及預后，文章發表于國際骨科學雜志上。該研究使用不同質量濃度的殼寡糖單糖（聚合度為2-6）處理3種骨肉瘤細胞系（MNNG、MG63、U2OS），發現殼
新一代腫瘤基因測序，數據質量是基石
腫瘤細胞的一個明確特點是其復雜的異質性，存在個體不同細胞間，不同個體間，另根據現有的研究基礎，已經發現腫瘤基因層面變異頻率普遍較低，各種因素告訴我們，在復雜的背景中確定腫瘤突變，首先測序堿基的準確率必須過關。原始數據的堿基識別準確性越高，使用的信息分析方法越合理標準，對測序深度的要求就會越低。在
人工智能與數據挖掘驅動的腫瘤新藥研發
人工智能作為一種旨在模擬、延伸和擴展人的智能的科學，人工智能正在以前所未有的廣度和越來越快的速度改變著世界的面貌。而在普瑞基準創始人季序我和梁晗看來，人工智能可以幫助我們更好地回答那些醫學中最為本質的問題，對于新藥研發、臨床診療和醫學基礎研究，都有著不可估量的價值。 道路 在癌癥診治的過程中，
中國完成首個人類腫瘤放療增敏數據庫
近日中科院合肥物質科學研究院技術生物與農業工程研究所研究員趙國平課題組、吳李君課題組與安徽大學夏俊峰教授合作，在前期工作基礎上開發建立了人類腫瘤放療增敏數據庫dbCRSR。該成果是國際上首個關于人類腫瘤放療相關基因的多組學整合數據庫。研究成果發表在《數據庫：生物數據庫與管理》。圖片來源于網絡
日本科學家因數據問題撤銷《腫瘤學》論文
據Retraction Watch網站消息，由于論文數據存在問題，日本大分大學（Oita University）Noriyuki Takai博士撤銷了他發表在《腫瘤學》（Oncology）上的一篇論文。 該論文主要研究卵巢癌中組蛋白的信號通路。《腫瘤學》發布通告稱，論文作者發現一些數據和原始
日本科學家因數據問題撤銷《腫瘤學》論文
據Retraction Watch網站消息，由于論文數據存在問題，日本大分大學（Oita University）Noriyuki Takai博士撤銷了他發表在《腫瘤學》（Oncology）上的一篇論文。 該論文主要研究卵巢癌中組蛋白的信號通路。《腫瘤學》發布通告稱，論文作者發現一些數據和原始
臨床測序重磅成果！300多種腫瘤，突變數據集問世
腫瘤分子分析是精準腫瘤醫學的基本組成部分，它能夠識別基因以及通路中所發生的變化，這是個性化醫療的關鍵。不同組織復發性突變的存在，加上分子靶向治療組合的擴大，這就需要靈活且綜合性的方法來分析全癌譜中與臨床相關的基因。 5月8日，Nature Medicine雜志在線發表了一篇“大作”，科學家們采
統計數據顯示：腫瘤成為國人最為關注的疾病
240億！這是2017年今日頭條健康類資訊總閱讀量。其中，“腫瘤”以36億次的超高關注度位列2017國人關注的疾病之首。 11月29日，在今日頭條與《健康報》社聯合主辦、中國健康知識傳播激勵計劃戰略合作支持的“2017算數健康大會”上，今日頭條副總編輯徐一龍表示，健康類資訊已成為移動互聯網3
首個國產PD1免疫治療兒童腫瘤臨床數據出爐
中山大學腫瘤防治中心張翼鷟教授團隊在 Signal Transduction and Targeted Therapy 期刊發表了題為：Safety and clinical efficacy of sintilimab (anti-PD-1) in pediatric patients wit
超十萬腫瘤患者數據證明：TMB預測免疫治療療效靠譜
隨著免疫檢查點抑制劑在我國的獲批上市，免疫治療大大改變了傳統的腫瘤治療策略。但是目前差不多只有20%-40%的腫瘤患者可以從免疫治療中獲益。要想篩選出最佳獲益人群，就要做到知己知彼，通過標志物了解腫瘤和自身免疫系統的狀態。近日，一項評估了45項臨床研究、103078例腫瘤患者數據的研究為TMB與
二代測序在腫瘤治療研究項目中的應用及數據
GenomeWeb芝加哥訊 – 本周美國臨床腫瘤學會年度會議中展示的研究項目包括了來自于部分研究項目的大量數據，這些研究項目均使用了二代測序技術來指導對腫瘤患者的治療方法。?研究結果表明，正如之前科學界已報道的那樣，NGS panel及更廣泛的測序方法可以在很多情況下的少部分（有時是多數）患者中鑒別
大型高質量mIF數據集——AstroPath，有助于識別腫瘤免疫療法
針對免疫系統的癌癥免疫療法目前已經在多種癌癥的治療中取得了令人興奮的成績，美國食品和藥物管理局（FDA）在超過17種實體瘤中批準了抗PD-1/PD-L1的藥物的使用，然而僅有30%的癌癥患者對免疫療法起反應，因此發現有效的生物標志物從而指導患者的臨床用藥是非常迫切的需求。免疫組化（IHC）評估的
300多種腫瘤－晚期癌癥患者測序突變數據庫發表的啟示
5月8日，Nature Medicine雜志發表一篇重量級文章，紀念斯隆-凱特琳癌癥研究中心(MSKCC) 的科學家采用MSK-IMPACT方法，開展了一個大規模、前瞻性的臨床測序研究。他們對上萬名晚期癌癥患者，接近300多種腫瘤進行了基因測序，同時收集了這些腫瘤病人的臨床注釋、病理等方面的信息
腫瘤免疫火得飛起，更新后的TIMER－2.0數據庫真心好用！
腫瘤微環境中免疫細胞的組成和豐度是影響腫瘤進展和免疫治療效果的重要因素。由于直接測量方法的局限性，計算算法通常用于從腫瘤轉錄組圖譜推斷免疫細胞組成。這些估計的腫瘤免疫浸潤人群與腫瘤的基因組和轉錄組學變化相關，提供了對腫瘤免疫相互作用的見解。今天我們就一起來看這個腫瘤免疫分析的又一神器——TIME
貝瑞和康建成全球最大婦科腫瘤基因組數據庫
基因組大數據的重大意義開始凸顯，貝瑞和康與阿里云合作開展的“神州基因組數據云”項目取得的階段性成果，便已經收效顯著。 9月23日，在第十九屆全國臨床腫瘤學大會暨CSCO學術年會上，北京貝瑞和康生物技術股份有限公司（以下簡稱“貝瑞和康”）公布了在生物信息分析領域和大數據建設方面做出的重要成果。
中科院物質院完成首個人類腫瘤放療增敏數據庫
記者從中科院合肥物質科學研究院了解到，技術生物與農業工程研究所研究員趙國平課題組、吳李君課題組與安徽大學夏俊峰教授合作，在前期工作基礎上開發建立了人類腫瘤放療增敏數據庫dbCRSR。該成果是國際上首個關于人類腫瘤放療相關基因的多組學整合數據庫。研究成果發表在《數據庫：生物數據庫與管理》。 放射治
乳腺癌是保還是切腫瘤專家用真實世界數據將告訴你答案
乳腺癌作為中國女性健康的第一殺手，他不僅發病率高，而且依然以每年3%的速度在遞增，對于乳腺癌的治療，也是各有各的說法，有的人認為乳腺癌應該選擇切除手術進行根治，這也是目前來說治愈率比較高的一種方式，而有的人認為早期乳腺癌可以選擇保留乳腺，做到精準治療，對于這樣的爭議專家也在不斷地在尋找新的治療方
數據無界：共創開放數據空間
8月28日，2024中國國際大數據產業博覽會——數據空間國際交流活動在貴陽舉辦，活動以“數據無界：共創開放數據空間”為主題。海內外多位專家學者和企業代表分別做了主題發言和經驗分享，涵蓋能源、汽車、金融、跨境、城市治理等多個領域。會上，國家數據局局長劉烈宏表示，國家數據局正在研究推動數據空間試點，以數
首屆科學數據大會探討“科研大數據與數據科學”
2月24日，首屆科學數據大會在中國科學院大學國際會議中心舉行。包括中科院院士郭華東、陳潤生，中國工程院院士汪懋華在內的400多名專家、青年科研人員參會。 中科院副院長、國際科技數據委員會(CODATA)中國全國委員會主席丁仲禮向會議發來賀信。他在賀信中表示，科研大數據和數據科學的作用越來越
腫瘤研究，從認識腫瘤細胞開始
最近一段時間我們一直圍繞著腫瘤動物模型的構建，為大家介紹了腫瘤研究中各種實用動物模型的建立方法，相信大家應該收獲頗多。動物水平的研究為我們提供了更接近臨床的數據分析，與此同時，腫瘤細胞的實驗研究也同樣重要，它是腫瘤研究的初級階段，可以更加快捷地提供在體外水平的研究結果。本期我們就開啟腫瘤細胞學新
定性數據和定量數據的區別
1、定義不同定量分析是依據統計數據，建立數學模型，并用數學模型計算出分析對象的各項指標及其數值的一種方法。定性分析則是主要憑分析者的直覺、經驗，憑分析對象過去和現在的延續狀況及最新的信息資料，對分析對象的性質、特點、發展變化規律作出判斷的一種方法。2、所依賴的哲學體系不同作為定性數據，其對象是客觀的
定性數據和定量數據的區別
1、定義不同定量分析是依據統計數據，建立數學模型，并用數學模型計算出分析對象的各項指標及其數值的一種方法。定性分析則是主要憑分析者的直覺、經驗，憑分析對象過去和現在的延續狀況及最新的信息資料，對分析對象的性質、特點、發展變化規律作出判斷的一種方法。2、所依賴的哲學體系不同作為定性數據，其對象是客觀的
定性數據和定量數據的區別
1、定義不同定量分析是依據統計數據，建立數學模型，并用數學模型計算出分析對象的各項指標及其數值的一種方法。定性分析則是主要憑分析者的直覺、經驗，憑分析對象過去和現在的延續狀況及最新的信息資料，對分析對象的性質、特點、發展變化規律作出判斷的一種方法。2、所依賴的哲學體系不同作為定性數據，其對象是客觀的