ScienceAdvance|?農科院揭示lncRNAs調控水稻農藝性狀變異機制
2019年12月18日,Science Advances雜志在線發表了來自中國農業科學院作物科學研究所楊慶文團隊、劉君團隊和華盛頓圣路易斯大學的Ken Olsen團隊完成了水稻(亞洲栽培稻)及其祖先種(普通野生稻)非編碼區lncRNA的注釋,結合多重組學方法研究了水稻lncRNA的進化歷史,從全基因組水平揭示了lncRNAs調控水稻重要農藝性狀變異的分子機制。 盡管高達90%的真核生物基因組能夠發生轉錄,但僅2%的轉錄本能夠編碼蛋白。闡明非編碼區變異對農藝性狀多樣性形成的作用機理具有重要意義,是揭示作物遺傳變異的基礎。研究結果表明,栽培稻中95%的lncRNA表達量下調,且下調的lncRNA在進化過程中具有與定向選擇一致的顯著分子特征,差異表達的lncRNAs靶基因富集于與碳固定能力和碳水化合物代謝相關的位點。部分lncRNAs表達量降低直接導致淀粉含量和粒重的增加,從而通過lncRNAs的全基因組注釋重塑了水稻轉錄組的表......閱讀全文
Science-Advance|?農科院揭示lncRNAs調控水稻農藝性狀變異機制
2019年12月18日,Science Advances雜志在線發表了來自中國農業科學院作物科學研究所楊慶文團隊、劉君團隊和華盛頓圣路易斯大學的Ken Olsen團隊完成了水稻(亞洲栽培稻)及其祖先種(普通野生稻)非編碼區lncRNA的注釋,結合多重組學方法研究了水稻lncRNA的進化歷史,從全
靈長類動物結構變異的機制
2013年度基因組生物學大會(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美國紐約冷泉港實驗室召開。這是基因組學領域最大的會議之一,吸引了多個著名研究所的大牛參加。會議主題包括高通量基因組學和遺傳學、復雜性狀的遺傳學、功能和癌癥基因組學、計算基因組學、進化基因組學以
張德強團隊深度解析林木次生生長遺傳調控機制
近日,北京林業大學教授張德強研究團隊依托林木分子設計育種高精尖創新中心與國家重點研發計劃課題,以毛白楊群體為模式,采用轉錄組測序、基因組重測序、SNP檢測等技術手段及關聯作圖策略,系統揭示了林木次生微管組織差異表達lncRNAs的全基因組分布模式與表達規律,發現lncRNA保守序列元件主要與“維
科學家揭開耳聾基因變異分子機制
小核糖核酸miR-96變異是主因 英國科學家最近發表在美國《國家科學院院刊》(PNAS)上的一份研究報告稱,小核糖核酸miR-96發生變異,可導致漸進性失聰。該分子機制的發現為改善聽力損失和失聰的治療手段奠定了基礎。 該研究由英國謝菲爾德大學和劍橋桑格研究院等幾所研究機構科學
農科院研究揭示水稻全基因組功能單倍型自然變異特征
近日,中國農業科學院作物科學研究所(以下簡稱作科所)水稻分子設計技術與應用創新團隊構建了一個全基因組基因功能單倍型(gcHap)數據集,全面揭示了亞洲栽培稻基因功能單倍型自然變異特征,提出亞洲栽培稻多起源(馴化)假說,并開發了適用于功能單倍型數據全基因組關聯分析和全基因組預測的軟件包“HAPS”
漢字首登Nature-農科院等完成亞洲栽培稻基因組變異研究
水稻是全世界最重要的糧食作物之一,對水稻全球品種進行基因組研究,對于挖掘有利等位基因和指導基于全基因組信息的分子育種具有重大的理論和實踐意義,是關系著國家乃至全球糧食安全的重大戰略問題。 2011年9月,全球3000份水稻核心種質資源基因組項目(3K Rice Project)正式啟動,該項目
Science、EMBO重要發現:編碼蛋白質的lncRNAs
不久之前,研究人員還認為RNA分為兩類:生成蛋白質的編碼RNAs和發揮結構作用的非編碼 RNAs。發現小分子RNAs開啟了全新的研究領域。然而現在研究人員兜了個圈又回到了原地,推測一些長鏈非編碼RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期發表在《EMBO Journal》雜志上的一項研究
Nature-Methods:針對LncRNAs的新型精準基因測序技術
現在有一種新的基因測序技術-“捕獲測序'(CaptureSeq),能使我們以更高的分辨率去探索人類基因組。它優于現有的基因測序技術,能精確捕捉測量許多具體的活性基因樣品(即使基因的表達時間僅按分鐘水平計算)。這個技術對癌癥研究具有革命性的影響。在實際應用中,可用于包括許血液腫瘤的診斷。這篇文章由
中國農科院植保所揭示水稻抗病新機制
近日,筆者從中國農業科學院植物保護研究所獲悉,該所王國梁研究團隊對泛素連接酶SPL11底物SPIN6蛋白在水稻抗病調控途徑中的作用機理研究取得新進展。相關研究結果于2015年2月6日在線發表在院選SCI頂尖核心期刊《科學公共圖書館病原(PLoSPatho?gens)》上。 泛素蛋白酶體途徑是真
-農科院深化機制體制改革-穩定經費并適度競爭
糧油加工創新團隊首席科學家王強(左三)研究員在指導實驗。中國農科院加工所提供 讓科研人員從到處跑課題,到待在實驗室里搞科研 走進北京中關村南大街12號,中國農業科學院的大院里,往日繁忙的景象沒有了:主樓前停放的一排排汽車不見了,來回穿梭的人也少多了。歲末年初,本該是科研人員最忙碌的時候,
多篇文章聚焦lncRNAs與人類健康的密切關聯!
長鏈非編碼RNA(lncRNAs)因其重要的調控功能而受到全球科學家們的廣泛關注,許多研究都表明,lncRNAs與多種人類疾病有千絲萬縷的關系,其或會通過調控基因的轉錄,或會調節蛋白的功能。本文中,小編就整理了多篇研究報告,共同解讀長鏈非編碼RNA與人類健康的密切關聯,分享給大家! 基因組擴增
《Cell》:lncRNAs開辟增強子生物學新時代
長鏈非編碼RNAs(long noncoding RNAs ,LncRNAs)是在真核生物中發現的一類長度大于200個核苷酸、沒有長閱讀框架、但往往具有mRNA結構特征的RNA。LncRNAs在基因組中存在普遍的轉錄現象,但較之編碼蛋白質的基因,往往表達水平比較低。LncRNAs自身的表達水
研究揭示桃紅肉與成熟期協同變異機制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517293.shtm近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所桃資源與育種創新團隊利用基因組學與分子生物學相結合技術,組裝了紅肉桃品種“天津水蜜”基因,發掘出紅肉桃關鍵基因和遺傳變異機制,并闡明了紅肉性狀和成熟期
研究揭示桃紅肉與成熟期協同變異機制
近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所桃資源與育種創新團隊利用基因組學與分子生物學相結合技術,組裝了紅肉桃品種“天津水蜜”基因,發掘出紅肉桃關鍵基因和遺傳變異機制,并闡明了紅肉性狀和成熟期協同變異的分子機制,為多樣化紅肉桃育種奠定了基礎。相關成果發表在《園藝研究》(Horticulture Rese
中國農科院作物所揭示成花素基因分子新機制
近日,由中國農業科學院作物科學研究所研究員毛龍領銜的創新團隊在麥類作物模式植物二穗短柄草開花調控的分子機制研究中取得新進展。該研究從成花素基因FT2的可變剪切角度揭示了一個新成花素基因轉錄后調控的分子機制。相關研究成果在線發表于《自然》系列刊物《自然通訊》上。 據介紹,小麥抽穗期和開花期的調控
中國農科院揭示藍耳病病毒免疫抑制機制
近日,中國農業科學院上海獸醫研究所馬志永研究員領銜的豬呼吸道傳染病創新團隊,揭示了高致病性豬繁殖與呼吸綜合征病毒(HP-PRRSV)抑制抗原遞呈作用新機制,為深入理解豬繁殖與呼吸綜合征病毒PRRSV的免疫抑制和免疫逃逸提供新認識。相關研究成果日前在線發表于《病毒學雜志》。 豬繁殖與呼吸綜合征
農科院專家揭示玉米抗倒伏性的新機制
?過表達ZmSPL12提高玉米抗倒伏性和單株產量 ? ? ? ? ? ? ?中國農科院供圖近日,中國農業科學院生物技術研究所玉米功能基因組創新團隊和華南農業大學合作,研究發現“類綠色革命”基因ZmSPL12通過調控D1基因轉錄增強玉米抗倒伏性的新機制,為玉米耐密株型改良提供了新的思路和基因源。相關研
農科院種質資源所解析綠豆基因組及馴化機制
種質資源所農作物種質資源收集保護和評價創新團隊在綠豆(Vigna radiata)基因組組裝及馴化機制研究上取得新進展。研究論文“Telomere-to-telomere, gap-free genome of mung bean (Vigna radiata) provides insights
陳潤生院士、趙春華教授Cell子刊解析長鏈非編碼RNA
來自中科院生物物理研究所、中國醫學科學院的研究人員證實,長鏈非編碼RNA ADINR通過在轉錄水平上激活C/EBPα調控了脂肪生成。這項研究發布在10月15日的《Stem Cell Reports》雜志上。 中科院生物物理研究所的陳潤生(Runsheng Chen)院士和中國醫學科學院的趙春華
Science采用改進CRISPR技術-發現近500個新的lncRNAs
長鏈非編碼RNA (lncRNAs)是一類長度大約為200個核苷酸,但不編碼任何蛋白的神秘分子,一直以來科學家們都想知道基因組中這類分子到底是起什么作用的。 12月15日Science雜志公布了一項最新研究發現:來自加州大學舊金山分校的研究人員識別出了499個新lncRNAs,這為理解這些小分
抗原變異基因家族相互排斥性表達的分子機制
2月6日,國際學術期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)在線發表了中國科學院上海巴斯德研究所江陸斌課題組題為DNA helicase RecQ1 regulates mutually exclusive expression of virulence genes in Plasmodium fa
中國農科院狂犬病病毒感染機制研究取得進展
近日,中國農業科學院哈爾濱獸醫研究所重要人獸共患病與烈性外來病研究團隊在狂犬病病毒(rabies virus,RABV)致病機制研究方面取得重要進展,發現代謝型谷氨酸受體2(mGluR2)為RABV入侵神經細胞的全新受體,相關研究在病原學權威期刊《公共科學圖書館—病原體》(PLOS Pathog
中國農科院植保所揭示雙生病毒致病新機制
近日,中國農業科學院植物保護研究所周雪平團隊在國際知名期刊PLoS Pathogens上發表論文,揭示了雙生病毒致病新機制。該研究第一作者為博士生梅玉振,通訊作者為周雪平。 雙生病毒是在世界范圍內普遍發生的一類植物DNA病毒,在番茄、煙草、棉花、玉米、小麥、豆類、木薯等經濟和糧食作物上造成毀滅
中國農科院狂犬病病毒感染機制研究取得進展
近日,中國農業科學院哈爾濱獸醫研究所重要人獸共患病與烈性外來病研究團隊在狂犬病病毒(rabies virus,RABV)致病機制研究方面取得重要進展,發現代謝型谷氨酸受體2(mGluR2)為RABV入侵神經細胞的全新受體,相關研究在病原學權威期刊《公共科學圖書館—病原體》(PLOS Pathog
上千種lncRNAs-可能被定義為新的腫瘤標記物
密西根大學綜合癌癥中心的研究者們最近對人類基因組中沒有被詳細研究過的長鏈非編碼RNA (lncRNAs)進行了全面分析。他們發現lncRNAs可能在癌癥中扮演很重要的角色,深入研究lncRNAs將會找到有利于癌癥診斷,預后和治療的新標記物。 LncRNAs在基因組研究領域很長一段時間以來都沒有
植物所發現植物果實大小自然變異遺傳調控新機制
茄科(Solanaceae)酸漿屬(Physalis)的一些物種的果實藥食同源,其生殖器官(包括花部器官、漿果和種子)的大小協同變化,可分為大、中和小3個組。這一器官大小自然變異現象的分子遺傳調控基礎尚不清楚。 中國科學院植物研究所賀超英研究組最近研究發現,Physalis Organ Siz
酸漿屬果實進化發育基因組變異機制研究獲進展
近日,中科院植物研究所研究員賀超英團隊與合作者在酸漿屬果實進化發育基因組變異機制上取得新進展,他們提出了“中國燈籠”這一形態創新起源的原創性模型,即“雄性育性遺傳腐蝕-恢復”模型。相關研究成果發表于《園藝研究》。茄科酸漿屬宿存花萼在受精后隨漿果發育迅速膨大,形成“中國燈籠”或膨大花萼綜合征(ICS)
新機制或影響新冠病毒變異株傳染性
自新冠疫情流行以來,已經有幾個更具傳染性的新冠病毒變種出現。美國國立衛生研究院的科學家發現,阿爾法和德爾塔變異株的突變克服了被稱為GALNT1的酶的活性抑制效應,這可能會增強病毒進入細胞的能力,提高病毒的傳播能力。相關研究論文在線發表于5日的美國《國家科學院院刊》上。 新冠病毒利用其外表面的刺
河南省農科院揭示黃色燈光防治蛾類害蟲分子機制
日前,河南省農科院植保所武予清團隊利用第二代高通量測序技術,分析了利用夜間黃色光照改變夜蛾類害蟲——黏蟲成蟲的相關基因組表達,揭示了利用燈光防治害蟲的分子機理。相關成果已在《科學報告》發表。 黏蟲具有敏感的視覺系統,因此光照條件改變可能會影響其行為活動,進而影響其繁殖和種群數量等。近20年來,
中國農科院研究揭示油菜生長能力和抗逆性同步提升機制
近日,中國農業科學院油料作物研究所油料作物營養與栽培團隊研究揭示了氮驅動的葉片解剖結構變化促進油菜生長能力和抗逆性同步提升的機制,相關研究成果發表在《實驗植物學雜志(Journal of Experimental Botany)》上。據科研人員介紹,油菜生長能力和抗逆性分別受葉片光合速率和葉片單位面