CellStemCell巧用單細胞測序解析生發過程深層次調控機制
單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具，然而，是不是所有的研究都適合用該方法？是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋？這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說，單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜，發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向，是否也能利用單細胞轉錄組測序方法來使研究更加深入和出色？ 本期小編通過對近期發表在《Cell Stem Cell》上的文獻的重點內容解析，來領略下生發機制研究中，單細胞轉錄組學的巧妙運用，如何為解釋內在的生發關鍵時期的調控通路提供了直接證據。 研究背景 哺乳動物毛發生命周期是由毛囊（HF）經歷了由生長期（anagen）,退化期（catagen）和休止期（telogen）為代表的三個重要精細調控階段。來自毛囊干細胞（HFSCs）的角質細胞接受到如Wnt或者Shh等通路的激活信號后，會在生長期促進細胞增殖；在休止期接受到如BMPs等抑制信......閱讀全文
Cell－Stem－Cell巧用單細胞測序解析生發過程深層次調控機制
單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具，然而，是不是所有的研究都適合用該方法？是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋？這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說，單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜，發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向，是否也能利用單細胞
巧用單細胞測序解析生發過程的深層次調控機制（二）
圖2 單細胞測序結果tSNE細胞分類結果為進行更加精細的分類，研究人員對由巨噬細胞marker表達的細胞進行了重新分類，共產生7個新的分類亞群。這些巨噬細胞簇顯示出相對均一的CD68表達，但相對于經典炎癥和抗炎標記物是異質的。其中，Cluster 3主要表達抗炎癥marker Mrc2(CD20
巧用單細胞測序解析生發過程的深層次調控機制（一）
單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具，然而，是不是所有的研究都適合用該方法？是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋？這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說，單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜，發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向，是否也能利用單細胞轉錄
Cell－Stem－Cell綜述：干細胞免疫調控
免疫系統是我們機體對抗入侵病原體的第一道防線，也是組織發展，內環境穩態和傷口修復不可或缺的一部分。近年來，科學家們已越來越認識到免疫系統中的細胞和體液成分也有助于損壞組織的再生，比如四肢、骨骼肌肉、心臟和中樞神經系統中出現的損傷，因此在這一方面進行了大量的研究。 7月Cell Stem Ce
Cell－Stem－Cell
|泛素連接酶HECTD1通過協調核糖體大小亞基的組裝來調控造血干細胞的再生能力 造血干細胞（Hematopoietic stem cell， HSC）具有自我更新和分化的功能。在正常生理狀態下，HSC處于休眠狀態，其蛋白合成速度受到嚴格地調控并維持在較低水平。當機體受到損傷時，HSC 能夠迅速
Cell－Stem－Cell：揭示細胞炎癥記憶機制
當組織經歷炎癥時，它的細胞會記得。在炎癥的高峰期，細胞將蛋白質固定在其遺傳物質上，并將它們在最后斗爭中所處的位置記下來。下次接觸時，炎癥記憶就會啟動。這些細胞利用以前的經驗來更有效地做出反應，即使是對它們以前從未遇到過的威脅也是如此。如果皮膚以前接觸過刺激物，如毒素或病原體，它就會更快地愈合傷口
Cell－Stem－Cell:－帕金森發病機制新見解
在帕金森等神經退行性疾病中，特定的神經元的死亡會導致患者出現運動問題和其他癥狀。長期以來，科學家們致力于發現這些神經元死亡的原因。 最近，來自洛克菲勒大學的研究人員發現，帕金森氏病中受影響的神經元實際上會處于“關閉”而非“完全死亡”的狀態。研究小組發現，這些不死的神經元釋放出的化學物質也會使他
Cell解析蛋白質翻譯調控機制
一個細胞的內部運作涉及到不計其數的單個分子，它們參與到重復循環的相互作用之中來維持生命。蛋白質形成就是這種生命活動的基礎。 賓夕法尼亞大學的Joshua B. Plotkin教授說，由于蛋白質是細胞功能的基礎構件，科學家們一直以來對于細胞生成蛋白質的機制都極其地感興趣。 “蛋白質
《Cell－Stem－Cell》發現食管癌新機制
化生（Metaplasia ）被定義為一種完全分化的細胞類型被另一種細胞類型取代。有幾個典型的化生例子，其中最常見的是巴氏食管。巴氏食管的特點是慢性胃酸反流時食管下部的角化細胞被柱狀細胞取代。這個化生被認為是癌前病變，增加了大約50倍的風險食管腺癌。然而，參與食道化生發展的機制仍部分未知。 在
Cell：單細胞測序深度解析三陰乳腺癌
美國MD安德森癌癥中心聯合瑞典卡羅林斯卡學院的研究人員利用單細胞測序對三陰乳腺癌展開分析，表明耐藥性是來源于現有的帶有基因突變的克隆。這些結果于周四發表在《Cell》雜志上，將對這種癌癥的診斷、預后和治療具有臨床意義。 三陰乳腺癌是指雌激素受體、孕激素受體和原癌基因Her-2均為陰性的乳腺癌。
Cell－Stem－Cell－|－連續取得進展！
下丘腦含有驚人的異質性神經元，可調節內分泌，自主神經和行為功能。然而，其分子發育軌跡和神經元多樣性的起源仍不清楚。2021年4月21日，中國科學院遺傳與發育生物學研究所吳青峰團隊在Cell Stem 在線發表題為“Cascade diversification directs generati
中科院Cell－Res解析Hippo信號調控機制
來自中科院上海生命科學研究院的研究人員發現了轉錄因子Scalloped(Sd)的一個新型結合蛋白，證實它通過對抗Scalloped-Yorkie活性調控了Hippo信號，這一研究發現發表在9月3日的《細胞研究》(Cell Research)雜志上。 上海生命科學研究院的張雷(Lei Z
杰出女科學家再發Cell解析調控機制
來自美國麻省大學醫學院，英國牛津大學等處的研究人員發現DEAD-box家族蛋白中兩個成員：UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使過程中扮演了重要角色，并指出了一種新型核周轉錄沉默機制。相關成果公布在Cell雜志上。 文章的通訊作者分別是麻省大學醫學院生物信息學和整合生物學部的翁志萍
Cell－Stem－Cell：揭示造血干細胞休眠新機制
溶酶體是所有細胞中的有膜細胞器。溶酶體曾經被認為只是干細胞的“垃圾桶”，回收廢棄物，調節細胞再生，并在所有細胞類型中發揮同樣的功能。 在一項新的研究中，來自加拿大瑪嘉烈公主癌癥中心和多倫多大學的研究人員對休眠的造血干細胞如何被激活有了更廣泛的了解，這可能為開發針對一些癌癥的治療方法鋪平道路。他
stem－cell－culture－protocol
實驗概要stem cell culture protocol主要試劑cell culture supplies and reagentssEnvironment: cell culture requires a sterile environment, so it needs a separat
Cell－Stem－Cell揭示新癌癥干細胞
日前，Lawson健康研究所的研究人員在結腸中鑒定到了與癌癥生長有關的新干細胞群體。這項研究發表在Cell Stem Cell雜志上，將給結腸癌研究和治療帶來顯著改變。 結腸癌（colon cancer）是一種常見的消化系統惡性腫瘤，發病率占胃腸道惡性腫瘤的第三位。隨著飲食習慣的改變和人口老齡
Cell－stem－cell：純化人類細胞新技術
多能干細胞研究之所以流行是因為在生物醫學研究中，多能干細胞能夠分化為任意細胞類型。但一些代表性的分化方法會導致異質性細胞群體的出現，這時候就需要將目的細胞進行純化分離。 目前對這類細胞進行分離主要根據細胞表面的特征性受體不同，利用抗體進行分離篩選。但在一些情況下，這種分離方法的純化水平很低，并
Cell－Stem－Cell發表重編程重要成果
再生醫學旨在通過細胞移植替換人體內受損的細胞、組織和器官，是一個發展迅速的新興領域。胚胎干細胞（ESC）能夠形成胎兒體內所有類型的細胞、組織和器官，被視為細胞治療的寶貴資源。然而ESC在實際應用中遭遇了兩大瓶頸，免疫排斥和倫理問題。 細胞重編程可以繞過人類胚胎干細胞的倫理爭議，近年來受到了廣泛
Cell－Stem－Cell：皮膚是突變的戰場？
正常皮膚含有混雜的突變細胞，但很少有最終形成癌癥的，科學家現在發現了原因。劍橋大學桑格研究所和MRC癌癥研究所的研究員通過基因工程小鼠，發現皮膚組織中的突變細胞會相互競爭，只有適者才能生存。 9月27日發表在Cell Stem Cell雜志上的研究結果顯示，人類正常皮膚對癌癥的抵抗力比之前想象
Cell－Stem－Cell：叩開干細胞的家門
人類造血干細胞（HSC）可以通過造血過程生成成熟的血細胞，包括免疫系統的細胞。多年以來，科學家們一直在嘗試解析調控造血干細胞功能和分化的具體機制。但這項工作并不簡單，因為HSC只存在于骨髓的特殊區域（niche），體外培養很難重現這樣的環境。 要對人類造血干細胞進行深入分析，就需要一個能夠移植
Cell揭示節律活動調控機制
賓夕法尼亞大學Perelman醫學院神經科學教授Amita Sehgal博士，在《細胞》(Cell)雜志上的一篇論文中描述了控制果蠅日常節律性作息行為的一個大腦回路。新研究還發現，人類大腦蛋白CRF的果蠅版本是這一回路中的一個重要協調分子。 果蠅中的CRF叫做DH44為休息/活動周期循
Cell揭示重要發育調控機制
魯汶大學VIB研究所的Bassem Hassan研究小組發現了從前未知的一種機制，這一機制在物種間高度保守，通過精確地時間控制對大腦發育至關重要的一個蛋白質家族：proneural蛋白的活性調控了神經發生。這一機制——一種簡單的可逆的化學修飾對于生成充足數量的神經元、它們的分化及中樞神經系統的發
Cell解析細胞垃圾清除機制
包括阿爾茨海默氏癥、亨廷頓氏病和衰老在內的幾種人類神經退行性疾病，都與細胞中異常及聚集蛋白質的累積有關聯。細胞通過將它們清掃到稱作為溶酶體（lysosome）的細胞垃圾回收站中，來清除這類細胞“垃圾”。 現在，來自馬克斯普朗克生物化學研究所的科學家們發現了一個新的輔助蛋白家族，證實這些蛋白質能
單細胞測序技術(single－cell－sequencing)－綜述（一）
單細胞生物學最近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領域中，最前沿的則是單細胞測序技術。傳統測序方法一次處理成千上萬個細胞，得到的變異水平也是成千上萬個細胞的平均后水平。但是，就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣，沒有兩個細胞是完全相同的。所以，單細胞測序對于研究單個細胞就顯得至關重要。單細胞測序可以
單細胞測序技術(single－cell－sequencing)－綜述（二）
DroNC-seq10月，Broad研究所張鋒教授團隊在Nature Methods上發表題為“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章，提出了一個新的測
Stem－Cell－Rep：神經管發育缺陷機制探秘
4月20日，Cell子刊《Stem Cell Reports》在線發表了同濟大學生命科學與技術學院康九紅課題組和同濟大學醫學院章小清課題組合作的題為“Dysregulation of the SIRT1/OCT6 axis contributes to environmental stress-
《Cell》重磅！全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制
2月7日，加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序，結合后續的功能機制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制！該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci
Cell》重磅！全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制！
2月7日，加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序，結合后續的功能機制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制！該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci
Cell揭示免疫調控新機制
免疫系統時常保持著警惕，以保護機體抵御來自外部的威脅——其中包括我們吃喝下的東西。當消化食物通過腸道時會呈現出一種小心的平衡狀態。免疫細胞必須保持警覺以防御沙門氏菌一類的有害病原體，同時也必須適當控制它們的活性，因為過度反應可導致過分的炎癥和永久性的組織損傷。 由洛克菲勒大學粘液免疫學實驗室主
Cell揭示miRNA調控新機制
來自波士頓大學兒童醫院及哈佛醫學院的研究人員發現，微處理器上游的一個生物合成步驟控制了miR-17～92表達。這一重要的研究發現發布在8月6日的《細胞》（Cell）雜志上。 MicroRNAs (miRNAs)是一個調控RNA大家族，其主要通過與靶mRNA 3′端非翻譯區(3′ UTR)互補配