科學家揭示肝內膽管癌多組學分子特征全景圖譜
近日，復旦大學（附屬中山醫院）肝癌研究所樊嘉院士團隊與中科院上海藥物所研究員周虎、中科院分子細胞科學卓越創新中心研究員高大明等團隊合作，全面解析了肝內膽管癌的分子特征全景，為肝內膽管癌的臨床診治提供了新思路和新策略。相關研究已在線發表于《癌細胞》。 肝內膽管癌惡性程度高，早期診斷難，手術切除率低，易轉移并累及周邊臟器，同時缺乏有效的靶向和免疫治療，預后極差，術后5年生存率僅20%～30%。因此，急需深入闡明肝內膽管癌的發病機制，繪制更精確的基因及分子圖譜，為鑒定新的診治靶點并實現個體化治療提供理論依據。 研究人員用262例在中山醫院肝外科手術中切除的樣本，綜合基因組、轉錄組、蛋白質組、磷酸化蛋白質組和微生物組等多組學、多維度數據，首次系統性繪制了肝內膽管癌的多維分子圖譜，為肝內膽管癌的發生發展機制、精準分子分型、預后判斷和個性化治療策略提供了新思路。 在該研究中，研究人員建立了以蛋白質組為核心肝內膽管癌患者的分子分型：......閱讀全文
科學家揭示肝內膽管癌多組學分子特征全景圖譜
近日，復旦大學（附屬中山醫院）肝癌研究所樊嘉院士團隊與中科院上海藥物所研究員周虎、中科院分子細胞科學卓越創新中心研究員高大明等團隊合作，全面解析了肝內膽管癌的分子特征全景，為肝內膽管癌的臨床診治提供了新思路和新策略。相關研究已在線發表于《癌細胞》。 肝內膽管癌惡性程度高，早期診斷難，手術切除率
Cancer－Cell：樊嘉/周虎繪制肝內膽管癌多組學分子特征全景
肝內膽管癌（iCCA）是第二常見的原發性肝惡性腫瘤，當前手術切除率低，同時缺乏有效的靶向/免疫治療方案。肝內膽管癌具有高度異質性的基因組突變和腫瘤微環境，可能介導其高侵襲性和不良預后。因此，迫切需要對iCCA進行“鳥瞰式”研究，繪制其精確的分子圖譜，為系統理解肝內膽管癌異質性及實現個體化治療提供
中國科學家揭示肝癌分子特征全景和個性化診治新策略
復旦大學（中山醫院）肝癌研究所樊嘉院士等團隊借助大規模的蛋白質基因組平臺，以高質量的蛋白質組學技術為基礎，充分結合基因組和轉錄組學研究，首次實現了對乙肝相關肝癌的多組學、多層次、多維度的系統性分析，為更深入地探索肝癌發生發展機制及指導肝癌的個體化精準診療帶來了新希望。相關研究成果10月3日在線發
“沉默腫瘤”首張全景分子圖譜繪成
??7日，記者從復旦大學附屬腫瘤醫院獲悉，該院院長虞先濬教授聯合北京大學腫瘤醫院、中國科學院上海藥物研究所、上海長海醫院等單位的研究團隊，歷時5年成功繪制全球首張無功能性胰腺神經內分泌瘤多組學全景圖譜，并根據圖譜突破性提出這種“沉默腫瘤”的分子分型框架、預后模型和靶向—免疫治療新策略，為臨床精準診療
中國科學家繪制全球最“毒”乳腺癌多組學圖譜
3月8日，國際婦女節。 當天凌晨，國際腫瘤學頂尖期刊《癌細胞》發表了中國科學家完成的一項重要研究成果。 由復旦大學附屬腫瘤醫院大外科主任兼乳腺外科主任、復旦大學腫瘤研究所所長邵志敏教授領銜的，包括復旦大學附屬腫瘤醫院精準腫瘤中心執行主任、上海科學院國家人類基因組南方研究中心黃薇研究員團隊、復
研究揭示甲狀腺乳頭狀癌復發相關多組學分子特征
近日，中國科學院大連化學物理研究所研究員樸海龍等與復旦大學附屬腫瘤醫院上海癌癥中心嵇慶海教授、史榮亮教授團隊合作，整合利用蛋白質基因組學和代謝組學技術，運用生物信息學及機器學習方法，從基因突變、轉錄表達、代謝物水平、蛋白質及磷酸化蛋白質表達情況多個尺度，對具有不同復發風險的甲狀腺乳頭狀癌樣本進行深入
科學家揭示不同腫瘤類型的免疫特征圖譜
腫瘤由于其組織來源、驅動突變和周圍組織特性的不同而表現出顯著的異質性。不同的腫瘤之間可能會享有共同的免疫原型，事實上，在特定腫瘤類型中已經鑒定到不同的免疫細胞亞群和免疫治療響應性之間強大的原型關系。然而，如何從不同的腫瘤中去找到主要的免疫原型仍不清晰。 近日，發表在《Cell》上的一項題為“D
水稻多器官單細胞多組學圖譜問世
記者楊舒從中國農業科學院生物技術研究所獲悉，該所作物耐逆性調控與改良創新團隊日前聯合國內外研究機構，構建了首個水稻的多器官單細胞多組學圖譜，系統解析了水稻不同細胞類型的功能及其對復雜性狀的調控作用，有力助力水稻設計育種。相關研究成果近日發表在國際學術期刊《自然》上。 單細胞組學是近年來生命科學
復旦邵志敏等發《自然.遺傳》：乳腺癌多組學全景圖譜－實現分型精準診療
中新網上海10月8日電 (記者 陳靜)在乳腺癌患者中，臨床上近七成初診患者和超過半數的復發轉移患者罹患的是腔面型乳腺癌。記者8日獲悉，中國的學者們歷時5年攻關，率先繪制“腔面型乳腺癌多組學全景圖譜”，并提出“復旦腔面四分型”基礎上的精準治療策略。這將改變以往腔面型乳腺癌治療“一把尺子衡量一群人”的治
我所揭示甲狀腺乳頭狀癌復發相關多組學分子特征
近日，我所本草物質科學研究室（2800組群）樸海龍研究員等與復旦大學附屬腫瘤醫院上海癌癥中心嵇慶海教授、史榮亮教授團隊合作，整合利用蛋白質基因組學和代謝組學技術，運用生物信息學及機器學習方法，從基因突變、轉錄表達、代謝物水平、蛋白質及磷酸化蛋白質表達情況多個尺度，對具有不同復發風險的甲狀腺乳頭狀癌樣
Nature－genetics揭示膽管癌的分子秘密
由來自新加坡國立癌癥中心、杜克-新加坡國立大學醫學研究生院等機構的科學家們組成的一個研究小組，在對膽管癌分子基礎的了解上取得了重大的突破性進展。研究人員采用先進的DNA測序技術繪制出了膽管癌中遭受破壞的人類基因完整目錄。該研究小組的研究發現有可能促成膽管癌新療法，并闡明癌癥研究中的一些最古老的問
復旦大學樊嘉、孫云帆等團隊揭秘轉移性肝癌：多組學研究揭示關鍵分子特征
一支來自中國的團隊采用多組學方法，分析了隨時間變化的轉移性肝細胞癌（HCC）腫瘤內部和跨越腫瘤的分子特征，發現了早期轉移性擴散的多樣性腫瘤克隆。復旦大學肝癌研究所的肝臟外科研究員孫云帆在一封電子郵件中解釋說：“傳統上將HCC轉移視為疾病的終點。然而，我們的數據顯示原發性HCC和轉移瘤之間存在高度的遺
時空組學技術助力生物學和醫學發展
一直以來，科學家們努力解讀由30億堿基對組成的生命“天書”。隨著細胞組學向時空組學的全面突破，人們可以在時間和空間的維度上，清晰地看到身體每個細胞的全景特征，為理解基因組“天書”以及生物學和醫學研究帶來新機遇。 8月22日，《細胞》刊發了華大生命科學研究院團隊的綜述文章。該文章系統闡述了時空組
時空組學技術助力生物學和醫學發展
一直以來，科學家們努力解讀由30億堿基對組成的生命“天書”。隨著細胞組學向時空組學的全面突破，人們可以在時間和空間的維度上，清晰地看到身體每個細胞的全景特征，為理解基因組“天書”以及生物學和醫學研究帶來新機遇。8月22日，《細胞》刊發了華大生命科學研究院團隊的綜述文章。該文章系統闡述了時空組學技術如
多組學手段揭示苦蕎“不怕冷”的奧秘
苦蕎 ? ? ? 董玉梅攝低溫脅迫是影響植物生化、分子、代謝調控的主要環境因素之一。長期在暴露于低溫而引導植物脅迫耐受性的提高，即耐寒性或冷馴化。闡明植物對低溫響應的分子機制對育種和基因發掘至關重要。有研究表明苦蕎可以通過增加花色苷和原花青素的積累增強其耐寒性。苦蕎的每個器官幾乎都含有蘆丁，包括種子
Cell:中國團隊發布首個肺腺癌分子全景圖譜助力精準醫學
肺癌是發病率和死亡率增長最快，對人群健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一。非小細胞肺癌約占所有肺癌的80%，其中肺腺癌（Lung Adenocarcinoma, LUAD）是非小細胞肺癌中最普遍的分型，大約占所有惡性肺腫瘤的一半。已有研究發現，LUAD中最常見的體細胞突變是TP53、KRAS、KEAP1
肝星狀細胞的生物學特征
正常情況下肝星狀細胞處于靜止狀態。當肝臟受到炎癥或機械刺激等損傷時，肝星狀細胞被激活，其表型由靜止型轉變 為激活型。肝星狀細胞位于肝竇周Disse 腔內，約占肝臟所有細胞的13%。在規HE染色的肝組織切片中，不能顯示星狀細胞，但可用免疫組織化學將其定位，并可將其分離進行體外細胞培養。正常情況下肝
Cell重磅！揭秘肝癌多維蛋白組學最新成果
2019年10月3日，國際頂尖期刊《cell》(SCI影響因子 36.216)在線發表了復旦大學附屬中山醫院樊嘉院士團隊、中科院藥物所周虎研究員團隊、中科院生化與細胞所高大明研究員團隊、美國“登月計劃”臨床蛋白質組腫瘤分析協作組(Clinical Proteomic Tumor Analysis
杭州華大與南科大新突破：3D“生命劇本”解碼果蠅發育全程
動物發育是基因與細胞在時空維度上精密協作的復雜過程。以果蠅為例，其發育的過程，大體需要經過卵、幼蟲、蛹和成蟲4個階段。如果說這個成長過程，是一場精密編排的“生命舞臺劇”，那么每個細胞何時何地“登場”、如何變成特定的細胞類型，便都是由基因“劇本”調控的。但一直以來，科學家很難完全讀懂發育時空動態背后的
科學家開發出新型空間多組學技術
5月25日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院彭廣敦課題組在《自然-方法》（Nature methods）上，發表了題為Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou
Cell：科學家繪制出神經元細胞表面所有蛋白全景圖譜
近日，一項刊登在國際雜志Cell上的研究報告中，來自霍華德-休斯醫學研究所等機構的科學家們通過研究開發了一種新方法來重點研究特殊細胞表面覆蓋的蛋白質，相關研究結果或能幫助闡明機體發育過程中腦細胞如何形成精細化的網絡。這就好比是撒了一張小網，如今研究者就能利用這種新技術將果蠅大腦中神經元表面的所有
科學家合作構建再生生物學多組學數據庫
隨著細胞重編程、基因編輯、合成生物學、高通量測序等技術的快速發展，再生生物學進入前所未有的蓬勃發展時期，助力解決組織替代、功能修復、衰老干預、疾病治療等一系列生命醫學領域的重要科學難題。面對科學數據的爆炸式增長，亟需建立以再生生物學為核心的開放數據庫，以存儲世界范圍內的組學研究數據為基礎，推動再
Cancer－Biol－Med：清華團隊運用多組學+AI，揭秘胃癌演進，開啟個性化治療新時代
胃癌，作為全球第五大常見癌癥，仍是對抗病魔前線的重大挑戰，奪走了無數生命。炎癥引發的腫瘤生長是胃癌演進的關鍵步驟，深入了解這一過程背后的生物機制，對于揭開胃癌之謎至關重要。 近日，一篇發表在國際雜志Cancer Biology & Medicine上題為“Deciphering gastric
分子遺傳學詞匯基因內抑制
中文名稱:基因內抑制英文名稱:intragenic suppression定 義:同一基因內部在不同部位的第二次突變而使其恢復野生型表型。應用學科:遺傳學（一級學科），分子遺傳學（二級學科）
分子遺傳學詞匯基因內重組
中文名稱：基因內重組英文名稱：intragenic recombination定 義：同一順反子內不同突變位點間的重組。應用學科：遺傳學（一級學科），分子遺傳學（二級學科）
高清肝臟時空圖譜出爐！揭示肝再生機制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521203.shtm在過度熬夜、吸煙喝酒、高糖高鹽飲食等不良習慣日漸常態化的現代生活中，肝臟疾病也呈現出日益嚴峻的態勢。作為人體的“化工廠”，肝臟除了解毒功能外，還具備代謝、合成、消化、免疫等多種功能。肝
全球肝內膽管癌死亡率升高－肝外膽管癌死亡率趨于平穩
肝內膽管癌（ICC）和肝外膽管癌（ECC）由于其診斷和鑒別相對困難，目前所能得到明確的研究結果較少。在過去的幾十年里，這兩種腫瘤的死亡率趨勢不盡一致。 近期意大利米蘭大學生物醫學與臨床科學系的Paola Bertuccio教授聯合多位意大利及美國學者對全球32個國家1995-2016年登記的I
我科學家首次詳盡揭示肝癌免疫圖譜
對研發抗癌新藥意義重大 近日，我國科學家對取自多個肝癌患者的5000余個T細胞逐個進行了基因測序，從而勾勒出每個細胞的基因表達圖譜，這是世界上首次對癌癥患者體內的T細胞在單細胞層面上進行如此大規模的詳盡分析，為未來發現肝癌及其他癌癥的免疫療法奠定了基礎。 這項由北京大學生命科學學院BIOPI
中國科學院自動化研究所揭示人類小腦功能層級背后的時空分子譜
人類小腦體積僅為大腦總體積的10％，卻包含整個神經系統超過50％的神經元。小腦不僅協調運動，而且影響著人類的思考和情感。在探索小腦功能多樣性的過程中，特別是剖析小腦如何參與和影響認知功能和情緒處理，研究發現了一個關鍵的軸線——感覺運動-聯絡（SA）軸。這一軸線有助于解釋小腦功能層級的復雜性。然而
Nature－Cancer：研究揭示高危前列腺癌代謝干預機制及診斷標志物
近日，中國科學院上海藥物研究所譚敏佳課題組、中科中山藥物創新研究院徐駿宇課題組，聯合中國科學院營養與健康研究所秦駿課題組、上海交通大學附屬仁濟醫院薛蔚和董柏君團隊、上海交通大學生命科學技術學院李婧課題組，在《自然-癌癥》（Nature Cancer）上發表了題為Integrative prote