DNA螺旋與拓撲異構酶相互作用的新發現
一個荷蘭人領導的國際性研究組在分子水平上破解了自然釋放DNA中積累起來的扭曲張力的機制。來自Delft理工大學、Ecole Normale Superieure和Sloan-Kettering研究所的研究人員將他們的發現公布在3月31日的《自然》雜志上,并成為這一期雜志的封面。 IB型拓撲異構酶能夠釋放DNA鏈中積累的扭力。研究過程中,研究人員能夠在分子水平上跟蹤一個單個的拓撲異構酶分子一段時間內在單個DNA分子上的活動。拓撲異構酶能夠夾著DNA、切開兩個DNA鏈中的一個并使DNA在與粘性末端重新結合在一起前變得舒展。在靈敏的檢測儀器的幫助下,研究人員能夠測量不同參數,如在酶空腔中的旋轉的DNA的摩擦力。這項研究對DNA和這種酶之間的相互作用有了新的了解。 DNA的兩個單鏈紐在一起并形成雙螺旋結構,而雙鏈的堿基對序列儲存著遺傳信息。在細胞分裂過程中,遺傳物質被復制并且負責復制的酶必須能夠將這些堿基序列轉錄。但是要實現這個......閱讀全文
DNA螺旋與拓撲異構酶相互作用的新發現
一個荷蘭人領導的國際性研究組在分子水平上破解了自然釋放DNA中積累起來的扭曲張力的機制。來自Delft理工大學、Ecole Normale Superieure和Sloan-Kettering研究所的研究人員將他們的發現公布在3月31日的《自然》雜志上,并成為這一期雜志的封面。 IB型拓撲異構
DNA拓撲異構酶(DNA-topoisomerase)的相關介紹
為催化DNA拓撲學異構體相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為了分析體外反應機制,用環狀DNA為底物。在閉環狀雙鏈DNA的拓撲學轉變中,要暫時的將DNA的一個鏈或兩個鏈切斷,根據異構體化的方式而分為二個型。切斷一個鏈而改變拓撲結構的稱為Ⅰ型拓撲異構酶(top -oisomera
DNA拓撲異構酶的相關介紹
DNA拓撲異構酶能催化的反應很多,這里只能作簡單敘述。DNA拓撲異構酶I對單鏈DNA的親和力要比雙鏈高得多,這正是它識別負超螺旋DNA的分子基礎,因為負超螺旋DNA常常會有一定程度的單鏈區。負超螺旋越高,DNA拓撲異構酶I作用越快。現已知道,生物體內負超螺旋穩定在5%左右,低了不行,高了也不行。
DNA拓撲異構酶的功能介紹
中文名DNA拓撲異構酶外文名DNA topoisomerase性????質生物類????別酶功????能實現DNA超螺旋的轉型定義DNA拓撲異構酶為催化DNA拓撲學異構體相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為了分析體外反應機制,用環狀DNA為底物。
DNA拓撲異構酶的基本信息
DNA拓撲異構酶為催化DNA拓撲學異構體相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為了分析體外反應機制,用環狀DNA為底物。
Ⅰ型DNA拓撲異構酶的功能介紹
中文名稱Ⅰ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅠ定 義編號:EC 5.99.1.2。在雙鏈結構中使其中一條鏈暫時斷裂,斷裂時不依賴于ATP,負責使超螺旋松弛的酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
Ⅱ型DNA拓撲異構酶的功能介紹
中文名稱Ⅱ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅡ定 義編號:EC 5.99.1.3。使雙鏈結構的兩條鏈均暫時斷裂,斷裂時依賴于ATP,是將松弛、閉環DNA轉變為超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
DNA拓撲異構酶的基本信息介紹
在閉環狀雙鏈DNA的拓撲學轉變中,要暫時的將DNA的一個鏈或兩個鏈切斷,根據異構體化的方式而分為二個型。切斷一個鏈而改變拓撲結構的稱為Ⅰ型拓撲異構酶(top -oisomeraseⅠ),通過切斷二個鏈來進行的稱為Ⅱ型拓撲異構酶(topoisomeraseⅡ)。屬于Ⅰ型的拓撲異構酶,有大腸桿菌的ω
Ⅰ型DNA拓撲異構酶的基本信息
中文名稱Ⅰ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅠ定 義編號:EC 5.99.1.2。在雙鏈結構中使其中一條鏈暫時斷裂,斷裂時不依賴于ATP,負責使超螺旋松弛的酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
Ⅱ型DNA拓撲異構酶的基本信息
中文名稱Ⅱ型DNA拓撲異構酶英文名稱DNA topoisomeraseⅡ定 義編號:EC 5.99.1.3。使雙鏈結構的兩條鏈均暫時斷裂,斷裂時依賴于ATP,是將松弛、閉環DNA轉變為超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),酶(二級學科)
Science:跳躍的DNA螺旋
研究人員證實DNA超螺旋是能夠遠距離“跳躍”的動態結構,這一現象有可能影響了基因調控。 科學家們對于長鏈DNA如何包裝到狹小空間中的理解變得更為復雜了一些。一項關于單分子DNA的新研究證實超螺旋可通過沿著一條DNA鏈“跳躍”來移動。研究結果發布在9月13日的《科學》(Science)雜志上
DNA拓撲異構酶催化反應的相關介紹
很多,其反應本質是先切斷DNA的磷酸二脂鍵,改變DNA的鏈環數之后再連接之,兼具DNA內切酶和DNA連接酶的功能.然而它們并不能連接事先已經存在的斷裂DNA,也就是說,其斷裂反應與連接反應是相互耦聯的。拓撲異構酶(包括Ⅰ型和II型)都可以用符號轉化模型進行解釋 除了DNA拓撲異構酶可以產生異構
可以DNA結合的酶拓撲異構酶和解旋酶
拓撲異構酶和解旋酶: 拓撲異構酶是具有活性核酸酶和連接酶的酶。這些酶能夠改變DNA的拓撲特性。它們中的一些通過切割DNA螺旋并允許其旋轉,降低其超螺旋程度,然后通過連接酶將兩端連接。另一方面,其它拓撲異構酶能夠在連接斷裂的DNA鏈之前,切斷螺旋,并允許第二個螺旋通過斷裂部位。拓撲異構酶是許多涉及DN
DNA解超螺旋的定義
中文名稱DNA解超螺旋英文名稱DNA untwisting定 義生物體內通常處于負超螺旋狀態的DNA分子在復制或轉錄過程中負超螺旋解除的過程。是在解超螺旋酶,即拓撲異構酶Ⅰ催化下進行的。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
DNA雙螺旋結構的特征
(1) DNA由兩條反向平行的多聚脫氧核苷酸鏈形成右手螺旋:一條鏈的5’-3方向是自上而下,而另一條鏈的3’-5’方向是自下而上,稱為反向平行,它們圍繞著同一個螺旋軸旋轉而形成右手螺旋。(2)由脫氧核糖和磷酸基團構成的親水性骨架位于雙螺旋結構的外側,而疏水的堿基位于內側。。(3)位于DNA雙鏈內側的
正超螺旋DNA的定義
中文名稱正超螺旋DNA英文名稱positively supercoiled DNA定 義具有正超螺旋結構的環狀DNA分子。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
DNA超螺旋的結構特點
由于雙螺旋DNA的彎曲,正超螺旋或負超螺旋而造成的DNA分子的進一步扭曲所形成的DNA的三級結構。有兩種:當DNA分子沿軸扭轉的方向與通常雙螺旋的方向相反時,造成雙螺旋的欠旋而形成負超螺旋;方向相同時則形成正超螺旋。生物體內一般以負超螺旋結構存在。
負超螺旋DNA的定義
中文名稱負超螺旋DNA英文名稱negatively supercoiled DNA定 義具有負超螺旋結構的環狀或雙鏈DNA。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
抗癌藥物對ⅡDNA拓撲異構酶作用的實驗
實驗方法原理DNA拓撲異構酶在DNA形成環狀和超螺旋結構中起重要作用。另一方面在DNA超螺旋結構的松懈、DNA單、雙鏈的斷裂以至再連接的過程均有賴于該酶的參與,從而使DNA的復制或重組成為可能,關于抗癌藥如烴化劑和非烴化劑,其中許多是以DNA拓撲異構酶為靶點使之形成可斷裂的DNA蛋白復合物從而引起D
抗癌藥物對ⅡDNA拓撲異構酶作用的實驗
實驗方法原理 DNA拓撲異構酶在DNA形成環狀和超螺旋結構中起重要作用。另一方面在DNA超螺旋結構的松懈、DNA單、雙鏈的斷裂以至再連接的過程均有賴于該酶的參與,從而使DNA的復制或重組成為可能,關于抗癌藥如烴化劑和非烴化劑,其中許多是以DNA拓撲異構酶為靶點使之形成可斷裂的DNA蛋白復合物從而引起
武漢病毒所:鄧增欽團隊非洲豬瘟病毒藥物靶點研究新進展
近日,中國科學院武漢病毒研究所抗病毒研究中心鄧增欽團隊在非洲豬瘟病毒拓撲異構酶的結構解析和催化機制研究中取得進展。相關研究成果以Cryo-EM structures of African swine fever virus topoisomerase為題,發表在mBio上。 DNA復制、重組和
拓撲異構酶的用途
DNA的結構轉換和解析 Ⅱ型拓撲異構酶 Ⅱ型拓撲異構酶巧妙地執行了打開DNA雙螺旋的過程。它將DNA的一個雙螺旋結構切開,并讓另一個螺旋從缺口處穿過,在此之后一個雙螺旋便被打開。這里顯示的圖片是由兩個蛋白構建的:這個編號為1bgw的蛋白具有拓撲異構酶的下半部分結構,另外一個編號為1eil的蛋
基因克隆常見方法
、T4連接酶介導的DNA克隆傳統的分子克隆,通常需要使用相同的限制性內切酶酶切載體和目的片段,使得載體和片段產生相同的粘性或平末端,使用T4 DNA連接酶對其進行連接,轉化,挑取陽性克隆,得到重組質粒為了更方便的對DNA進行克隆,后續又將克隆的載體進行了簡化,出現了T載體,這樣就可以不用酶切,直接將
拓撲異構酶的分類
可分為兩類一類叫拓撲異構酶I,一類叫拓撲異構酶II。拓撲異構酶I催化DNA鏈的斷裂和重新連接,每次只作用于一條鏈,即催化瞬時的單鏈的斷裂和連接,它們不需要能量輔因子如ATP或NAD。E.coliDNA拓撲異構酶I又稱ω蛋白,大白鼠肝DNA拓撲異構酶I又稱切刻-封閉酶(nicking-closin
拓撲異構酶的用途介紹
DNA的結構轉換和解析 Ⅱ型拓撲異構酶巧妙地執行了打開DNA雙螺旋的過程。它將DNA的一個雙螺旋結構切開,并讓另一個螺旋從缺口處穿過,在此之后一個雙螺旋便被打開。由兩個蛋白構建的:這個編號為1bgw的蛋白具有拓撲異構酶的下半部分結構,另外一個編號為1eil的蛋白來自于一個旋轉酶的結構域,它與拓
概述拓撲異構酶的分類
可分為兩類一類叫拓撲異構酶I,一類叫拓撲異構酶II。拓撲異構酶I催化DNA鏈的斷裂和重新連接,每次只作用于一條鏈,即催化瞬時的單鏈的斷裂和連接,它們不需要能量輔因子如ATP或NAD。E.coliDNA拓撲異構酶I又稱ω蛋白,大白鼠肝DNA拓撲異構酶I又稱切刻-封閉酶(nicking-closin
拓樸異構酶的分類與作用方式
拓撲異構酶I,屬于第一型拓樸異構酶。(PDB1a36) 拓樸異構酶II,屬于第二型拓撲異構酶。拓樸異構酶可依據其作用方式,而分為兩種類型:第一型拓樸異構酶(Type I topoisomerase):可將一條DNA雙股螺旋完全包覆,并以破壞磷酸雙酯鍵的方式切斷其中一股DNA,使其產生一個小缺口,此時
簡述拓撲異構酶的作用
是使超級螺旋松弛。所謂超級螺旋是DNA中張力積聚的形式。拓撲異構酶抑制成分是重要抗腫瘤藥物,被認為通過穩定拓撲異構酶與DNA之間所形成的一種共價復合物來發揮作用,后者又為DNA復制機制設置了一障礙。科學家對以拓撲異構酶為作用目標的藥物的藥效起源仍不是很了解。由于該藥物的作用而造成的正向DNA超級
解析DNA拓撲異構酶核心結構揭示DNA穿鏈新機制
生物物理所解析DNA拓撲異構酶核心結構揭示DNA穿鏈新機制成果入選Faculty of 1000 BiologyGyrase B’三維結構(左)及結構域運動(右) 近日,中科院生物物理研究所王大成課題組與畢利軍課題組合作在Nucleic Acids Research雜志上發表的題為
關于DNA螺旋酶的基本介紹
至今在大腸桿菌中發現的1 )'VA螺 旋酶就有數種,分別稱為螺旋酶I、ii、和mp蛋自等,都與 大腸桿菌DNA交制有關。作用是催化雙螺旋DNA的解旋 和解鏈,在這解旋的過程中需水解ATP提供能巳(切開個l1. T對約需5目·mol,一切開一個C.一‘_;對約需21劉· mnl’)。在復制