雜交豬單倍型分辨率三維基因組特征成功解析
我國是世界第一養豬大國，2023年出欄生豬7.27億頭，占全球總量54.89%。生豬在國計民生、糧食安全和社會穩定中具有重要地位和作用。篩選并鑒定影響豬重要經濟性狀的關鍵基因組變異，挖掘育種靶點，創新性運用到實際育種中，能有效加速優質高產豬新品種（系）的培育進程。因此，系統鑒定豬基因組中的調控元件并分析其參與的三維基因組遠程互作，探究非編碼序列變異對基因轉錄調控的影響，對于挖掘和明確具有重要育種價值的分子靶點具有重要意義。已有研究表明二倍體生物的同源染色體在基因轉錄、表觀修飾、染色質可及性、染色質復制時間等方面存在差異。但目前三維基因組研究往往分析二倍體基因組的平均染色質空間構象特征，對同源染色體間的結構和調控功能差異缺乏有效解析。近日，Genome Research雜志發表了四川農業大學動物科技學院/豬禽種業全國重點實驗室主導完成的題為《雜交豬單倍型分辨率的三維基因組特征》的論文。該研究通過構建我國地方豬種——藏豬和歐洲豬種—......閱讀全文
雜交豬單倍型分辨率三維基因組特征成功解析
我國是世界第一養豬大國，2023年出欄生豬7.27億頭，占全球總量54.89%。生豬在國計民生、糧食安全和社會穩定中具有重要地位和作用。篩選并鑒定影響豬重要經濟性狀的關鍵基因組變異，挖掘育種靶點，創新性運用到實際育種中，能有效加速優質高產豬新品種（系）的培育進程。因此，系統鑒定豬基因組中的調控元件并
基因組的三維結構
摘要： 闡明染色質復雜結構的技術有染色質構象捕獲(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技術4C、5C，這些提供了長距離的染色質相互作用，但不能擴展到整個染色質相互反應組。在2009年末，兩種新方法的迸發，有望繪出全基因組范圍的相互作用圖譜。
比較基因組雜交芯片介紹
比較基因組雜交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比較基因組雜交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者陣列比較基因組雜交技術（array comparative gen
比較基因組雜交方法介紹
比較基因組雜交是將消減雜交、熒光原位雜交相結合，用于檢測DNA序列的拷貝數變異并將其定位在染色體上的方法。CGH?只能檢測不平衡的染色體改變。結構染色體變異，例如：平衡的相互易位或倒位不能被檢測出來，因為拷貝數沒有變化。CGH最初設計是用來檢測單一副本缺失的，所以它的的區帶長度至少5～10Mbarr
比較基因組雜交芯片介紹
比較基因組雜交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比較基因組雜交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者陣列比較基因組雜交技術（array comparative g
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
基因組研究顯示：豬與人“如此相似”
通過迄今為止規模最大的豬基因組研究，科學家發現豬擁有很強的適應能力，容易被食物誘惑和馴化，這些特征都與人類非常相似。而且，豬具有與人類相同的與很多人類疾病有關的基因和蛋白質變異。這一成果近日刊登在了《自然》雜志上。 在奧威爾的經典小說《動物莊園》中，豬和人類幾乎一模一樣。根據上述研究，《動
基因組原位雜交的概念
中文名稱基因組原位雜交英文名稱genomic in situ hybridization;GISH定 義用核酸探針進行原位雜交，確定與探針互補的DNA序列在基因組上的位置。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
基因組DNA－Southern雜交操作步驟
1）基因組DNA Southern印跡的制備 預備 1．用適當的限制性內切酶消化基因組DNA樣品（10μg）。 2．進行瓊脂糖凝膠電泳。一般用0.7～1.0％的瓊脂糖凝膠分離基因組DNA，它在1～15kb的范圍內有較好的分辨率，可選用TBE或TAE緩沖液。瓊脂糖凝膠電泳需在1V/cm的電
三維基因組（HiC）技術解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq
三維基因組（HiC）技術解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S
三維基因組（HiC）技術解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象，利用高通量測序技術，結合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系，獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-Seq
Nature重大成果：豬基因組全面解析
豬(pig)及其表親野豬(wild boar)與人類具有許多共同之處。它們遍及世界各地。它們的適應能力強，具有入侵性，常常毀壞自己的棲息地。它們易受食物引誘，容易馴化，但當條件允許時它們會恢復野生生活方式。 現在一項新的基因組分析揭示了豬和人類之間一些新的、意想不到的、潛在有利的相似之
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
Southern 印跡 放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強，當電泳后凝膠經過DNA變
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交試劑、試劑盒預雜交液SSCSDS儀器、耗材硝酸纖維素濾膜實驗步驟1. 準備適合即將進行的工作的雜交溶液。每平方厘米硝酸纖維素濾膜或尼龍膜大約需要 0.2 ml 預雜交液。預雜交液：用于檢測低豐度序列：或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard
細胞遺傳學——比較基因組雜交(CGH)
·?????????Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
實驗材料 基因組 DNA試劑、試劑盒 限制性緩沖液儀器、耗材 瓊脂糖凝膠實驗步驟 1. 7~20 μg 基因組 DNA 稀釋到 500 μl 合適的限制性緩沖液中。4℃ 過夜。2. 每管加 10~20 單位限制性酶。孵育 4~6 小時。10 μl 消化液在小瓊脂糖凝膠上電泳檢測消化的程度。如果需要，
黑龍江雜交民豬飼養管理地方標準通過專家審定
2019年5月10日，黑龍江省市場監督管理局組織有關專家對東北農業大學、蘭西縣種豬場及黑龍江省畜牧總站所主持的《基于民豬為母本的二元及三元雜交商品豬飼養管理技術規范》黑龍江省地方標準進行了審定。 該標準對基于民豬為母本的二元及三元雜交商品豬的名詞概念、豬場建設、種豬的來源、飼料與飲水、飼養管理
哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。
哺乳動物基因組三維結構首次確定
英國醫學研究理事會網站日前報道稱，英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構，顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。 很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉，但事實上，染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。
高精度亞洲豬參考基因組圖譜繪制成功
近日，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所動物基因工程與種質創新科技創新團隊聯合北京相關生物企業等單位成功繪制了梅山豬高質量基因組圖譜。該圖譜是迄今為止精度最高的亞洲豬基因組圖譜，為我國地方豬種質資源保護和開發利用奠定了基礎。相關成果發表于《分子生態資源（Molecular Ecology Reso
雜交稻基因組學研究獲進展
中科院上海生科院植物生理生態研究所韓斌院士課題組聯合中國水稻所楊仕華等團隊，在雜交稻基因組學及雜種優勢遺傳機制研究中獲重要進展，2月5日，相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹，雜交水稻育種技術的成功是我國近幾十年來取得的一項重要科技成就。伴隨著汕優63、兩優培九等一大批高產雜交稻品種
雜交稻基因組學研究獲進展
中科院上海生科院植物生理生態研究所韓斌院士課題組聯合中國水稻所楊仕華等團隊，在雜交稻基因組學及雜種優勢遺傳機制研究中獲重要進展，2月5日，相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹，雜交水稻育種技術的成功是我國近幾十年來取得的一項重要科技成就。伴隨著汕優63、兩優培九等一大批高產雜交稻品種
湖南地方豬60K單核苷酸多態性芯片開發成功
11月30日，中國工程院院士、湖南農業大學教授印遇龍主持的湖南省創新型省份建設專項“優質湘豬全基因組育種技術研發及新品種（配套系）培育”項目中期檢查會在長沙召開。該項目旨在針對目前我國地方豬品種遺傳基礎和基因資源研究不足問題，系統挖掘地方豬優異特色性狀功能基因，開發和優化以基因組選擇和雜種優勢預測為
Genome－Biology：構建豬體細胞染色質三維結構圖譜
豬不僅是重要的經濟家畜，在生物醫學領域也有重要應用。生豬的育種中廣泛應用了輔助生殖技術，包括體外受精技術、孤雌和孤雄生殖技術等。但與體外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率級低。這一存活率差異產生的機制目前還不清楚。深入理解這一機制不僅有助于增加商業化豬育種的產仔數，也將有利于生物醫學研究中轉基
研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
研究發展出新型三維基因組成像系統
4月7日，《細胞研究》發表了中國科學院生物物理研究所劉光慧課題組和徐濤課題組，以及中科院動物研究所曲靜課題組合作的題為Visualization of Aging-Associated Chromatin Alterations with an Engineered TALE System的研究
Cell：基因組三維結構存在細胞異質性
美國國家癌癥研究所、哈佛大學、馬薩諸塞大學和麻省理工學院聯合開展的一項研究發現，不同細胞和不同等位基因之間的基因組組織結構存在很大差異。這項研究成果于本周發表在《Cell》雜志上。 研究人員利用高通量的染色質構象捕獲（Hi-C）和高通量的熒光原位雜交（hiFISH）光學圖譜繪制來分析人包皮成纖
首個家雞泛三維基因組圖譜構建成功
雞是如何從野生原雞演化為如今的高產肉雞或蛋雞的？其背后的基因“開關”在哪里？近日，華南農業大學動物科學學院家禽遺傳育種研究團隊聯合國內多家單位，成功構建了首個高分辨率家雞泛三維基因組圖譜。相關成果發表于《先進科學》（Advanced Science）。“該研究成果就像是一張高精度的‘立體導航圖’，將
Cell－Res封面文章：新型三維基因組成像系統
來自中科院生物物理研究所，中科院動物研究所等處的研究人員發展了一種新型三維基因組活細胞成像工具TTALE，并利用該系統實現了對端粒縮短和著絲粒構象變化等衰老伴隨的染色質結構改變的精準成像。此外，該研究發現了核仁區核糖體DNA拷貝數減少可以作為人類衰老的新型分子標志物。上述成果為在遺傳和表觀遺傳水