Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
實驗材料 基因組 DNA試劑、試劑盒 限制性緩沖液儀器、耗材 瓊脂糖凝膠實驗步驟 1. 7~20 μg 基因組 DNA 稀釋到 500 μl 合適的限制性緩沖液中。4℃ 過夜。2. 每管加 10~20 單位限制性酶。孵育 4~6 小時。10 μl 消化液在小瓊脂糖凝膠上電泳檢測消化的程度。如果需要,就在消化液中補加酶。3. 用乙醇沉淀消化物:加 50 μl 3 mol/L NaOAc,混勻。然后加 1 ml 100 % 乙醇并混勻,在 -20℃ 至少放 30 分鐘;或在干冰中放 10 分鐘。離心 20 分鐘(在離心機中定好管子的方向,這樣你知道沉淀的位置)。去掉上清。4. 用 70% 乙醇洗一次:加 1 ml 70% 乙醇,離心 5 分鐘。去掉上清。離心 5 秒鐘使殘余液體流到管底。吸掉液體。在空氣中干燥 15 分鐘。同時著手進行步驟 5.5. 0.7% 用 TAE 作為緩沖液的瓊脂糖凝膠。凝膠中含溴化乙錠以避免在后面進行凝膠染......閱讀全文
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
Southern 印跡 放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強,當電泳后凝膠經過DNA變
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
實驗材料 基因組 DNA試劑、試劑盒 限制性緩沖液儀器、耗材 瓊脂糖凝膠實驗步驟 1. 7~20 μg 基因組 DNA 稀釋到 500 μl 合適的限制性緩沖液中。4℃ 過夜。2. 每管加 10~20 單位限制性酶。孵育 4~6 小時。10 μl 消化液在小瓊脂糖凝膠上電泳檢測消化的程度。如果需要,
Southern印跡及基因組DNA雜交技術實驗
放射性標記的探針與固定化核酸進行雜交試劑、試劑盒預雜交液SSCSDS儀器、耗材硝酸纖維素濾膜實驗步驟1. 準備適合即將進行的工作的雜交溶液。每平方厘米硝酸纖維素濾膜或尼龍膜大約需要 0.2 ml 預雜交液。預雜交液:用于檢測低豐度序列:或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard
outhern印跡及基因組DNA雜交技術實驗——Southern-印跡
實驗方法原理硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強,當電泳后凝膠經過DNA變性處理,覆以上述濾膜,再于其上方壓上多層干燥的吸水紙,借助它對深鹽溶液的上吸作用,凝膠上的單鏈DNA將轉移到濾膜上。轉移是原位的,即DNA片段的位置保持不變。轉移結束后,經過80℃烘烤的DNA,將原位地固定于膜上。實
DNA印跡(Southern-Blot)實驗
【實驗原理】DNA印跡是1975年由英國Southern創建的。其基本原理是:DNA分子經限制性核酸內切酶酶切后,由瓊脂糖凝膠電泳將所得 DNA片段按分子質量大小分離,然后將DNA片段變性,并使凝膠中的單鏈DNA片段轉移到尼龍膜、硝酸纖維素膜(NC)或其他固相支持物上,此法中DNA 片段
Southern印跡雜交
?實驗原理核酸分子雜交技術是分子生物學領域中zui常用的具體方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原則形成雙鏈,此雜交過程是高度特異的。由于核酸分子的高度特異性及檢測方法的靈敏性,綜合凝膠電泳和核酸內切限制酶分析的結果,便可繪制出DNA分子的限制圖譜。但為
基因組DNA-Southern雜交操作步驟
1)基因組DNA Southern印跡的制備 預備 1.用適當的限制性內切酶消化基因組DNA樣品(10μg)。 2.進行瓊脂糖凝膠電泳。一般用0.7~1.0%的瓊脂糖凝膠分離基因組DNA,它在1~15kb的范圍內有較好的分辨率,可選用TBE或TAE緩沖液。瓊脂糖凝膠電泳需在1V/cm的電
Southern印跡雜交實驗原理和方法1
實驗原理核酸分子雜交技術是分子生物學領域中最常用的具體方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原則形成雙鏈,此雜交過程是高度特異的。由于核酸分子的高度特異性及檢測方法的靈敏性,綜合凝膠電泳和核酸內切限制酶分析的結果,便可繪制出DNA分子的限制圖譜。但為了進一
Southern印跡雜交實驗原理和方法3
真空轉移法的最大優點是迅速,可在轉膜的同時進行DNA變性與中和整個過程約需30~60分鐘。但在操作中應注意兩個問題,一是真空壓力不能太大,若壓力過大,凝膠被壓縮,轉移效率會降低;二是真空轉移液要密封嚴,防止漏氣影響壓力的產生。下表列出了不同的印跡方法。表10-2 不同印跡方法的比較表五、探針標記用于
Southern印跡雜交實驗原理和方法2
(一) 細管虹吸印跡法此法是利用濃鹽酸轉移緩沖液的推動作用將凝膠中的DNA轉移到固相支持物上,轉移方式見圖10-1:容器中的轉移緩沖液含有高濃度的NaCl和檸檬酸鈉,上層吸水紙的虹吸作用使緩沖液通過濾紙橋、濾紙、凝膠、硝酸纖維素膜或尼龍膜向上運動,同時帶動凝膠中的DNA片段垂直向上運動而滯留在膜上。
Southern-印跡實驗
實驗方法原理?本方案是專門為將瓊脂糖凝膠印跡至不帶電荷或帶正電荷的尼龍膜上而設計的,稍作修改后同樣可用于硝酸纖維素膜方法。實驗材料?DNA試劑、試劑盒?HClNaClTrisNaOHSSC溴化乙錠儀器、耗材?電泳儀紫外透射儀實驗步驟 一、向上毛細管轉移法的轉移疊層系統::圖一、向上毛細管轉移法的轉移
Southern-印跡實驗
印跡法 堿性緩沖液法 向下毛細管轉移法 電轉印法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本方案是專門為將瓊脂糖凝膠印跡至不帶電荷或帶正電荷的尼龍膜上而設
Southern印跡技術
實驗原理:Southern印跡是將DNA片斷從電泳凝膠上直接轉移至膜支持物(如硝酸纖維素膜、尼龍膜)上,使DNA片斷固定的技術。先將DNA經限制性內切酶消化成一系列片段,進行瓊脂糖凝膠電泳,各片段因分子量不同而彼此分開,然后經堿處理凝膠,使DNA的片段被變性、中和并通過毛細作用在高鹽緩沖液中在原位將
Southern-印跡實驗——印跡法
Southern印跡法是將DNA片段從電泳凝膠中轉移至膜支持物上,使DNA片段固定,因此該膜半永久性地重現出凝膠電泳的帶型。實驗方法原理本方案是專門為將瓊脂糖凝膠印跡至不帶電荷或帶正電荷的尼龍膜上而設計的,稍作修改后同樣可用于硝酸纖維素膜方法。實驗材料DNA試劑、試劑盒HClNaClTrisNaOH
痘苗DNA檢測實驗——Southern-雜交法
實驗方法原理以前,用 HindIII 限制性內切核酸酶消化鑒定痕苗病毒 DNA。大部分的外源基因插入重組病毒的 TK 基因中,TK 基因位于 HindIII 5.1 kb 的 J 片段上。這樣在重組病毒中,如果插入片段上沒有 HindIII 內切酶位點,則J片段就會增大。如果缺乏 HindIII 5
DNA印跡雜交分析實驗
實驗方法原理?本方案適合于用100~1 000 bp 長的放射性標記的DNA探針對Southern轉印、斑點及狹線印跡進行雜交分析。實驗材料?DNA試劑、試劑盒?SDSSSC儀器、耗材?水浴鍋培養箱實驗步驟 ? 用6×SSC潤濕帶有固定了的DNA的膜。2.? 將膜的DNA面朝上置于雜交管中,ATP溶
DNA印跡雜交分析實驗
放射標記法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本方案適合于用100~1 000 bp 長的放射性標記的DNA探針對Southern轉印、斑點及狹線印跡進行雜交分析。 ?
southern印跡雜交的方法步驟
以哺乳動物基因組DNA為例,介紹Southern印跡雜交的基本步驟。一、 待測核酸樣品的制備(一)制備待測DNA基因組DNA是從動物組織(或)細胞制備。1.采用適當的化學試劑裂解細胞,或者用組織勻漿器研磨破碎組織中的細胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白質和RNA;3.用有機試劑(酚/氯仿)抽提
Southern雜交技術
?SOUTHERN BLOT1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a r
southern印跡雜交的基本概念
Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原則特異性地雜交形成雙鏈。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段轉移至尼龍膜或其他固相支持物上,經干
Southern雜交實驗1
[實驗原理] Southern 雜交是分子生物學的經典實驗方法。其基本原理是將待檢測的DNA樣品固定在固相載體上,與標記的核酸探針進行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號。通過Southern雜交可以判斷被檢測的DNA樣品中是否有與探針同源的片段以及該片段的長度。
Southern雜交實驗2
③轉移按凝膠的大小剪裁NC膜或尼龍膜并剪去一角作為標記,水浸濕后,浸入轉移液中5min。剪一張比膜稍寬的長條Whatman 3mm濾紙作為鹽橋,再按凝膠的尺寸剪3-5張濾紙和大量的紙巾備用。按下圖所示進行轉移。(轉移過程一般需要8-24hr,每隔數hr換掉已經濕掉的紙巾。轉移液用20×SSC。注
Southern-雜交技術2
三:操作(一)轉膜1電泳2切膠 在紫外下,切取凝膠有條帶部分3脫嘌啉0.25NHCL浸泡凝膠10分鐘,蒸餾水洗膠(大于15kb的DNA片段轉移時做此步驟)4變性,變性液(0.5MNaOH、1.5MNaCL)浸泡凝膠2次,每次15分鐘,蒸餾水洗膠5中和,中和液(0.5Mtris-HCL,pH7.0、3
Southern-雜交技術1
Southern技術是指以Southern名字命名的DNA轉移雜交技術。它可用于基因組特定DNA序列的定位,可以測定相關片段的同源性、可以從c庫、基因組文庫中篩選完整基因等。用一種或多種限制性內切酶對基因組DNA加以切割,通過瓊脂糖凝膠電泳分離酶切片段,隨后,使DNA在原位變性,并從凝膠轉移至固相膜
DNA印跡雜交分析實驗——放射標記法
雜交分析的原理是特定序列的單鏈DNA分子(即通常標記的“探計”)可與另一個固定了的具有互補序列(“靶”序列)的DNA分子或RNA分子形成堿基配對,雜交分子的穩定性取決于發生堿基配對的程度,這一技術可檢測復雜基因組中的單拷貝基因。實驗方法原理本方案適合于用100~1 000 bp 長的放射性標記的DN
YAC克隆的分析實驗——制備YAC-DNA進行Southern印跡分析
實驗材料酵母菌試劑、試劑盒AHCSCESCEMTris·ClEDTATE乙酸甲RNase A異丙醇NaCl儀器、耗材培養箱離心管轉子實驗步驟1. ?接種一個紅色的含YAC克隆的酵母菌落于盛有20 ml AHC培養基的250 ml 三角燒瓶中,在旋轉搖床上30℃ 250 r/min 振蕩培養24 h。
Southern雜交的基本概念
Southern印跡雜交是進行基因組DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的兩條核酸單鏈在一定的條件下,可按堿基互補的原則特異性地雜交形成雙鏈。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經限制性內切酶消化的DNA片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNA片段轉移至尼龍膜或其他固相支持物上,
分子雜交技術Southern雜交的相關介紹
Southern雜交可用來檢測經限制性內切酶切割后的DNA片段中是否存在與探針同源的序列,它包括下列步驟: (1) 酶切DNA, 凝膠電泳分離各酶切片段,然后使DNA原位變性。 (2) 將DNA片段轉移到固體支持物(硝酸纖維素濾膜或尼龍膜)上。 (3)預雜交濾膜,掩蓋濾膜上非特異性位點。
分子雜交技術Southern雜交的操作步驟
(1) 約50μl體積中酶切10pg-10μg的DNA, 然后在瓊脂糖凝膠中電泳12-24小時(包括DNA分子量標準物)。 (2) 500ml水中加入25μl 10mg/ml溴化乙錠,將凝膠放置其中染色30分鐘, 然后照相。 (3) 依次用下列溶液處理凝膠,并輕微搖動: 500ml 0.2m
Southern-印跡實驗——電轉印法
實驗方法原理因為聚丙烯酰胺凝膠的扎徑太小,DNA不能在其橫截面上有效地擴散,毛細管轉移法不適用DNA從聚丙烯酰胺凝膠的轉移。因此,聚丙烯酰胺凝晈必須在低離子強度的緩沖液中用電轉移法進行印跡。實驗材料DNA試劑、試劑盒TBE儀器、耗材Scotch-Brite墊Whatman濾紙實驗步驟1. ?在非變性