麻栗坡兜蘭簡單重復序列表達調控關鍵基序獲揭示
華南農業大學教授王艇團隊、福建農林大學教授劉仲健團隊和中山大學教授蘇應娟團隊在國家自然科學基金、廣東省基礎與應用基礎研究基金等項目的資助下，基于統計基因組學分析揭示了麻栗坡兜蘭簡單重復序列的表達調控關鍵基序。相關成果近日發表于《先進科學》（Advanced Science）。簡單重復序列（SSR）在原核和真核生物的基因組廣泛存在，能驅動物種快速發生遺傳變異、基因表達進化和環境適應。位于基因內的SSR更是可被用作調節基因表達和生理代謝過程的“旋鈕”，進而引發表型改變。可是，對于這些具基因表達調控功能的SSR（eSSR），它們的基序組成、拷貝數以及在基因中的分布式樣對基因表達產生的效應，目前還所知較少。該研究對麻栗坡兜蘭轉錄組的SSR進行了系統的統計基因組學分析，證實eSSR基序類型與基因表達水平存在關聯，鑒定出9個表達調控基序（expMotif）和11個基序-轉錄區組合；發現基序類型-轉錄區組合是決定SSR所起表達調控作用的關鍵因......閱讀全文
利用植物表型組學挖掘基因組學的成果
到2050年，全球人口將達到97億，預計作物產量翻一番才能滿足全球人口的糧食需求。為了達到這一目標，作物產量需每年增長2.4%，但目前作物產量平均增長率僅為1.3%。作物生產性能的遺傳改良仍然是提高作物生產力的關鍵因素，但當前的改善速度無法滿足可持續性和糧食安全的需要。為了確保糧食安全、生態系統的可
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作，向醫生推廣藥物基因組學檢測；印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心，旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤，從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
整合基因組和組織學信息－基因組學公司聯手開拓新前沿
10x Genomics公司宣布收購位于瑞典斯德哥爾摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空間基因組學（spatial genomics）領域的領先公司。空間基因組學是一個新興領域，它不但讓研究人員可以獲得單細胞內的基因組數據
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
蛋白質組學不能被基因組和轉錄組取代
基因和蛋白并不存在嚴格的線性關系ORF并不預示一定存在相應的功能性基因mRNA水平并非與蛋白質的表達水平對應翻譯后修飾及同工蛋白質（isforms)等現象在基因水平無從表現
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
全面解讀藥物基因組學基因檢測技術
全面解讀藥物基因組學基因檢測技術FDA和CFDA分別于2010和2012年將CYP2C19基因檢測的重要性說明納入氯吡格雷的藥物說明書。在國內，阜外醫院已完成氯吡格雷用藥基因檢測超過20000例，居全國單中心檢測量之首。以下列出了藥物基因組學涉及的主要基因及對應的個體化用藥：（4）? 以下為上述三大
北京基因組所開發出比較群體基因組學新算法
隨著基因組測序技術的發展，物種和群體水平基因組數據呈指數增長。這些數據為在基因組水平鑒定和解析自然選擇機制提供了機遇。然而，目前的分析方法面臨著技術瓶頸和挑戰。其中，關鍵問題是如何高效準確地檢測作用于非編碼區的自然選擇效應。同時，能夠高效、高性能地分析多物種大樣本數據，成為方法學方面的迫切要求。
基因組學與蛋白質組學兩大巨頭建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日聯手推出OneOmics? 計劃，其目的是在云計算環境中結合新一代蛋白質組學（NGP）和新一代測序（NGS）的工具。作為此計劃的一部分，Illumina的應用商店BaseSpace將托管AB Sciex的SWATH? 蛋白質組學云工具，這使得BaseSp
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
－Science：宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來，對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
表型組學技術：精準挖掘玉米抗旱基因
隨著測序技術普及和待測材料的規模化，傳統的干旱表型性狀獲取手段已經不能滿足植物抗逆基因組學研究的需求，嚴重阻礙玉米抗旱資源的挖掘。 近年來，以智能化、高通量、動態無損測量為主要特征的表型組學技術迅猛發展，使得多時空多尺度表型檢測成為可能，可實現作物全生育期表型動態精準鑒定。 近日，《基因組生
作物基因組學研究進展
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
北京基因組所生命組學數據資源建設獲進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表。該研究成
蛋白質組學之逆襲，深度注釋基因組
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完
華大基因攜手愛丁堡大學，共促基因組學研究
2012年7月24日，深圳華大基因研究院與英國愛丁堡大學簽署合作協議，宣布雙方將在基因組領域展開廣泛的科研合作，通過匯聚中英兩國研究專長，加速基因組學在人類健康和農業及其他相關領域的創新和發展。 在簽署的合作備忘錄中，雙方將著眼于對人類和其他生物的科學認識，通過共同努力，對遺傳信息進行深入
《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成
最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
基因組學做不了的事－蛋白質組學更精準打擊癌癥
近日，國際人類蛋白質組組織公布了2020年度權威獎勵獲獎名單，中國科學院院士、軍事科學院軍事醫學研究院研究員賀福初榮獲蛋白質組學杰出成就獎。 賀福初院士率先提出人類蛋白質組計劃的科學目標與技術路線，倡導并領銜了人類第一個關于組織、器官的蛋白質組計劃，揭示了人體首個器官（肝臟）蛋白質組。2014年
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（三）
人類尚未充分認識復雜的癌癥基因組是如何轉化為導致復發和死亡的驅動生物學的，將蛋白質組學與基因組學結合在一起能夠讓我們獲得對癌癥的新認識，同時提供一種有價值的資源以便科學界能夠用來提出關于這些疾病的新假設，以及治療它的手段。蛋白質基因組學終有一天會被證明是一種強大的臨床工具，使得人類能夠橫跨癌癥基因組
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（二）
針對一些乳腺癌亞型和攜帶常見突變如PIK3CA和TP53突變的腫瘤，分析結果揭示出了一些新的蛋白質標記物和信號通路。另外將一些基因中的拷貝數改變與蛋白質水平聯系一起，從而鑒別出了10個新的候選調控因子。其中兩個候選基因SKP1和 CETN3可能與癌基因EGFR有關聯。EGFR是一種特別具有侵
蛋白質組學之逆襲：深度注釋基因組（一）
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完成了對多種物
藥物基因組學發展和應用【一】
影響患者對藥物反應的因素有很多，包括患者本身的內在因素如年齡、性別、種族/民族、遺傳、疾病狀態和器官功能，還有其它生理變化，包括懷孕、哺乳以及外源性因素如吸煙和飲食。基因變異可導致疾病表現和藥物反應的多樣性這一觀念目前已得到廣泛認可，并經許多的研究證實。對于一些遺傳因素影響研究比較明確的藥物，在治療
國際基因組學大會在長春落幕
10月24日，2011國際基因組學大會在長春落幕。中科院院士賀林、美國國立衛生研究院癌癥研究所資深研究員Charles Vinson等國內外知名專家學者，圍繞“基因組學時代的機遇與挑戰”主題，從基因組科學、基因組技術、基因組信息學與計算生物學、基因組轉化與應用等方面進行了交流，并就全球基因
基因組學出手－尋找番茄舊時味
近日，《科學》雜志以封面報道形式介紹了中美科學家關于番茄風味改良的化學和遺傳學路線圖研究成果，同期刊發了兩國科學家合作的論文。與此同時，《自然》雜志也就此在線發表了亮點報道。 小小番茄之所以獲得如此高的關注度，源于這種果實既是一種非常受消費者歡迎的蔬菜，又是植物生物學家的最愛之一，堪稱植物遺
基因組學推進腫瘤研究未來發展
——訪億明達腫瘤業務營銷副總裁約翰·萊特 基因組學正在改變腫瘤研究，其最終目標是推進癌癥的診斷、治療、監控及最終的篩查方式。 癌癥通常按照形態進行分類，這指的是病理學家在顯微鏡下看到的內容。“如今，癌癥分類依據已經開始從形態特征轉變為更有效的治療方式，其中的主要轉變在很大程度上歸功于基因組研