新技術有望叩開疾病研究的“黑匣子”
8月28日，由華大生命科學研究院牽頭建設的基因組多維解析技術全國重點實驗室聯合多家機構，在《細胞》發布最新版本的時空組學技術Stereo-seq V2。該技術成功解決了困擾醫學界多年的福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本分析難題，首次實現了在同一張組織切片上，同時對人體細胞和入侵微生物的基因活動進行高分辨率“現場直播”。該技術如同一把萬能鑰匙，有望打開醫學界存檔臨床病理樣本的“黑匣子”，喚醒沉睡的醫學寶藏，推動生命科學研究從“看見細胞”到“看懂細胞與微生物戰場”的精準醫學時代。修復病理樣本信息FFPE（福爾馬林固定石蠟包埋）是一種經典的生物組織保存技術，可以理解為制作“組織標本琥珀”。在世界各地的醫院病理科，保存著海量的FFPE樣本，醫生從患者身上取下病理組織（如腫瘤活檢），先用福爾馬林溶液將其“定格”，再用石蠟包裹，使其能在室溫下長期保存。通過切片，科學家們可以從這些樣本中提取出DNA、RNA和蛋白質等組學信息進行疾病研究。然......閱讀全文
FFPE樣本核酸（DNA/RNA）制備
福爾馬林固定、石蠟包埋（FFPE）組織切片的存檔代表了珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料。隨著越來越多的研究人員轉向 FFPE 樣品的分子分析，開發特定的操作步驟，考慮這些樣品的獨特性質就變得越來越重要。QIAGEN 在 FFPE 樣本純化及下游檢測整個流程中都提供完善的解決方案。QIAamp
FFPE組織樣品的DNA和RNA純化
福爾馬林固定后石蠟包埋的組織簡稱為FFPE樣品。將組織在 4–10% 的福爾馬林中迅速固定。 固定時間限制在 14–24 小時 (越長的固定時間將越容易導致DNA的片段化，對下游實驗不利)。將固定組織徹底脫水 (徹底脫去福爾馬林殘余，因為其阻礙蛋白酶K的作用)。 純化DNA時，使用新鮮從石蠟塊上切下
如何用FFPE組織樣品進行高通量檢測？
福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE）的樣品代表了珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料，如何從這些樣品中挖掘出有效的信息呢？上海伯豪生物技術有限公司針對FFPE樣品的高通量分析，建立了整套的SOP 標準解決方案，幫助廣大科
如何用FFPE組織樣品進行高通量檢測？
福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE）的樣品代表了珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料，如何從這些樣品中挖掘出有效的信息呢？上海伯豪生物技術有限公司針對FFPE樣品的高通量分析，建立了整套的SOP 標準解決方案，幫助廣
羅氏為FFPE樣品推出兩款新工具
羅氏診斷應用科學部近日宣布推出兩款新產品：High Pure FFPET RNA Isolation Kit和RealTime ready cDNA Pre-Amp Master & Primer Pools，適用于福爾馬林固定和石蠟包埋的組織(FFPET)。 據估計，現有超過10億個
羅氏FFPE組織切片核酸純化試劑盒操作說明
High Pure FFPET DNA Isolation Kit基于離心柱法的抽提原理，免去DNA沉淀和有機試劑抽提的步驟，是快速核酸抽提的理想工具。整個抽提過程僅需3小時（含脫蠟過程）；獲得高DNA得率和質量；在qPCR，芯片分析和測序等下游應用中獲得強大信號。圖1：從FFPET樣本中獲得高得率
一步脫蠟法在FFPE樣本DNA提取中的應用
什么是FFPE福爾馬林固定石蠟包埋技術（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded, FFPE）是一種組織保存技術。這種技術為了維持細胞核蛋白結構，先用福爾馬林固定然后將組織用固體石蠟包埋，以供切片后作組織學診斷或研究使用。FFPE技術的應用福爾馬林由于可以與蛋白氨基發
Bruker與3M公司聯合利用MALDI成像技術分析FFPE組織
美國時間2013年6月4日，布魯克公司發布聲明，表示已簽署了一項獨家ZL許可協議，允許布魯克使用關于3M專項創新MALDI質譜成像技術。 該ZL許可包涵使用質譜分析技術檢測福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織中的蛋白質。這一技術能使研究人員更容易地學習福爾馬林固定，石蠟包埋(FF
研究人員基于FFPE樣本構建甲基化圖譜預測癌癥原發部位
9月14日，《自然-通訊》（Nature Communications）在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心石建濤組完成的最新合作研究成果（DNA methylation profiling to determine the primary sites of metastatic can
華大科技DNA建庫起始量低至200ng
華大基因旗下全資子公司――華大科技服務有限公司(簡稱“華大科技”)，18日在福爾馬林固定石蠟包埋組織樣本測序技術上再獲新突破，成功推出FFPE全基因組外顯子測序(WES)技術。 目前，科研人員已成功實現外顯子測序DNA建庫起始量低至200ng，測序質量與正常樣本相近，這將有助于更好地解讀F
靶向序列捕獲和新一代測序前對石蠟包埋組織及...（一）
靶向序列捕獲和新一代測序前對石蠟包埋組織及新鮮冷凍組織進行DNA質控靶向序列捕獲和新一代測序前對福爾馬林固定石蠟包埋組織及新鮮冷凍組織進行 DNA 質量控制?作者Melissa Huang Liu安捷倫科技有限公司美國加利福尼亞州拉霍亞Maria Celeste Ramirez安捷倫科技有限公司美國
靶向序列捕獲和新一代測序前對石蠟包埋組織及...（二）
捕獲前擴增四個 DNA 樣品按照樣品前處理工作流程（圖 1）進行進一步處理。對捕獲前擴增樣品進行五次 PCR 循環，然后采用 DNA 1000 試劑盒在 2100 生物分析儀上進行分析（圖 3）。?圖3. 使用 Agilent 2100 生物分析儀及安捷倫 DNA 1000 試劑盒分析所得的捕獲前擴
樣本抽提中RNA降解的解決方法
從臨床樣本出發進行芯片、測序等高通量生物學研究是最常用的思路，但樣本采集過程受制于病理特征、病例數量等因素，耗時費力。無數期盼等來了期待中的臨床樣本，做個RNA抽提還常常…… 降解樣本的RNA完整度低，長鏈RNA變成了短鏈，在常規的擴增過程中會發生探針檢測的目的片段的丟失，導致芯片結果的不
樣本抽提中RNA降解的解決方法
從臨床樣本出發進行芯片、測序等高通量生物學研究是最常用的思路，但樣本采集過程受制于病理特征、病例數量等因素，耗時費力。無數期盼等來了期待中的臨床樣本，做個RNA抽提還常常……降解樣本的RNA完整度低，長鏈RNA變成了短鏈，在常規的擴增過程中會發生探針檢測的目的片段的丟失，導致芯片結果的不準確。遇到R
生物標志物研究與早期藥物研發基因表達分析功...（四）
FFPET 樣本特異性RealTime ready qPCR檢測潛在生物標志物假設檢驗我們使用的第一套臨床樣本來自于各種用于人類研究的福爾馬林固定、石蠟包埋（FFPE）組織。腫瘤來源的 FFPE? 組織是臨床試驗或生物標志物研究中，治療復合物研發最具有相關性的樣本材料。使用 High Pure
JCAD通過抑制LATS2激酶活性促進非酒精性脂肪肝向肝癌的...
JCAD通過抑制LATS2激酶活性促進非酒精性脂肪肝向肝癌的發展非酒精性脂肪肝（NAFLD）是一種由于代謝紊亂引起的肝炎，也是肝癌（NASH-HCC）發生的重要來源之一。但是，對于NAFFLD如何向NASH-HCC發展的分子機制還不了解。來自復旦大學醫學院的研究人員，通過石蠟包埋樣本的檢測與后續功能
新技術有望叩開疾病研究的“黑匣子”
8月28日，由華大生命科學研究院牽頭建設的基因組多維解析技術全國重點實驗室聯合多家機構，在《細胞》發布最新版本的時空組學技術Stereo-seq V2。該技術成功解決了困擾醫學界多年的福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本分析難題，首次實現了在同一張組織切片上，同時對人體細胞和入侵微生物的基因活動進行
新方法分析臨床樣本中的組蛋白翻譯后修飾
歐洲腫瘤研究所（EIO）等機構的研究人員開發出一種基于質譜的流程，可分析FFPE臨床樣本中的組蛋白翻譯后修飾。他們于上周在《Molecular & Cellular Proteomics》上詳細介紹了這種技術。 利用這種技術，研究人員分析了一系列乳腺癌樣本，發現Luminal A型乳腺癌和三陰
采用－RNA－ScreenTape－分析法進行－DV200－評估（二）
結果與討論重現性對三個 FFPE RNA 樣品進行五次獨立重復測定，以對采用 RNA 和高靈敏度 RNA ScreenTape 分析法獲得的 DV200 重現性進行驗證。兩種方法均表現出較高的重現性，CV 小于 5%（圖 3）。濃度依賴性采用 RNA 和高靈敏度 RNA ScreenTape 分析法
基礎知識：福爾馬林固定石蠟包埋組織DNA提取
本篇文章是關于一個我們很少被問問題的題目，因為太簡單，方法很常規結果也很少出錯。我想說的是：福爾馬林固定石蠟包埋組織的DNA提取。什么是FFPE組織？FFPE指的是為維持細胞核蛋白結構，先用福爾馬林固定然后固體石蠟包埋，以便使用超薄切片機切成5-10微米厚的薄片的組織樣品（通常是疑似腫瘤組織）。福爾
JCAD通過抑制LATS2激酶活性促進非酒精性脂肪肝向肝癌發展
非酒精性脂肪肝（NAFLD）是一種由于代謝紊亂引起的肝炎，也是肝癌（NASH-HCC）發生的重要來源之一。但是，對于NAFFLD如何向NASH-HCC發展的分子機制還不了解。來自復旦大學醫學院的研究人員，通過石蠟包埋樣本的檢測與后續功能驗證，找到了一個肥胖相關基因，KIAA1462（JCAD），
采用－RNA－ScreenTape－分析法進行－DV200－評估
Eva Graf 安捷倫科技有限公司 Waldbronn, Germany 摘要 RNA 測序文庫制備工作流程的成功與否在很大程度上取決于 RNA 起始材料的質量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法獲得的 RNA 完整值當量 (RINe) 是一種評
Nature子刊：解決腫瘤異質性的革命性技術
精準醫療是指與患者分子生物病理學特征相匹配的個體化診斷和治療策略，被認為是繼經驗醫學、循證醫學之后的第三次醫學革命。作為一種極為復雜的致命疾病，腫瘤是精準醫療最重要的領域之一。 腫瘤的精準醫療需要我們準確認識患者腫瘤的分子圖譜。雖然人們已經擁有了強大的遺傳學分析技術（比如二代測序NGS），但腫
采用－RNA－ScreenTape－分析法進行－DV200－評估（一）
摘要RNA 測序文庫制備工作流程的成功與否在很大程度上取決于 RNA 起始材料的質量。采用 Agilent RNA ScreenTape 分析法獲得的 RNA 完整值當量 (RINe) 是一種評估標準 RNA 測序的樣品完整性的可靠且可重現的指標。由于 RNA 降解以及樣品體積有限，從福爾馬
Agilent－miRNA芯片在各類樣本中的應用（一）
1.新鮮組織樣本新鮮組織一般包括以人類疾病診斷及治療為目的，經患者或健康人同意后，從患者的機體中切取的未經特殊化學試劑處理的病變組織或相鄰健康組織，或者健康人的相同部位的對照組織。這些人類疾病相關的新鮮組織樣本的整理、保存、研究對于提高疾病的診斷質量、促進臨床工作、探討及研究疾病的發病機制具有重要的
數字PCR技術精確檢測癌癥基因組擴增
來自斯坦福大學以及Bio-Rad的研究人員證實，數字PCR系統能夠精確測定長期存放的癌組織樣本中的癌癥基因組擴增。該研究成果發表在《Translational Medicine》雜志上。 某些拷貝數變異(如基因組擴增)可能導致特定癌基因的過表達，推動癌癥發展。靶定擴增的癌基因有望實現癌
賽默飛世爾再推癌癥檢測產品
賽默飛世爾科技公司近日宣布，適用于癌癥研究的靶向檢測產品線又增添四款新產品，包括Oncomine Immune Response Research Assay，它能夠拷問腫瘤微環境，并鑒定免疫治療臨床試驗中的預測性標志物。這一系列產品適用于Ion Torrent NGS平臺，與FFPE樣品兼容。
TaqMan探針基因表達分析全面升級
TaqMan探針對于大家來說不是什么新名詞了，然而你知道嗎，對于部分降解的RNA，如福爾馬林固定、石蠟包埋（FFPE）樣品中的RNA，TaqMan引物探針的設計有更多的講究，你知道這是為什么嗎？FFPE樣本在固定時導致核酸相互交聯且片段化，RNA片段的大小在50-300 nt，大部分片段在100 n
Illumina發布癌癥研究的新產品
?????? Illumina繼年初推出NextSeq 500和HiSeq X Ten測序系統之后，日前再次推出新產品，能從與癌癥相關的血液和組織中發現基因組變異。這些新產品將充分利用該公司的新一代測序和芯片掃描系統，為基礎和臨床癌癥研究帶來完整的解決方案。 分析FFPE組織中的RNA
Naica自動化微滴芯片數字PCR系統在HPV檢測的應用
人類DNA中HPV16和HPV18的靈敏度和特異性檢測?全世界有超過5％的癌癥是因人乳頭瘤病毒（HPV）導致的，它主要通過性傳播的方式感染[1]。十多種HPV亞型由于其在細胞轉化中的作用以及宮頸癌和口咽癌發病率的增加而被認為是高風險的。在這些亞型中，HPV16和HPV18是最普遍的，在大約70％的宮