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  • 科研論文|Sikun2000全基因組測序性能卓越

    上海交通大學聯合思昆生物在國際期刊Scientific Reports發表了題為“Comparative assessment of the Sikun 2000 sequencing platform for whole genome sequencing”的研究成果。研究成果表明Sikun 2000 是一款具有競爭力的國產全基因組測序(WGS)平臺。其在數據質量、平均測序深度和SNP檢測性能方面與Illumina測序平臺相當,同時在測序成本和有效數據利用率上展現出明顯優勢。文章解讀1、研究策略樣本:人類基因組HG001、HG002、HG003、HG004、HG005。測序平臺:Sikun 2000、NovaSeq 6000、NovaSeq X。數據分析:下機數據提取相同610M PE150 reads。生信分析:BWA比對+GATK HaplotypeCaller變異檢測。2、基礎數據分析Sikun 2000測序平臺的Q20......閱讀全文

    全新體驗!思昆生物發布Sikun-RapidGS480-基因測序儀

    2025年2月20日,在IND2025第五屆感染疾病診斷技術及檢測自動化建設論壇上,思昆生物正式發布新一代桌面式小通量測序儀Sikun RapidGS480(以下簡稱“GS480)和AISPre 3200 全自動基因測序文庫制備系統(以下簡稱“AISPre 3200 文庫制備儀”)。思昆生物總經理蔡

    科研論文|Sikun-2000全基因組測序性能卓越

    上海交通大學聯合思昆生物在國際期刊Scientific Reports發表了題為“Comparative assessment of the Sikun 2000 sequencing platform for whole genome sequencing”的研究成果。研究成果表明Sikun 20

    行業首次!思昆生物三款測序儀同日拿下醫療器械注冊證,開啟精準檢測新紀元

      當醫療檢測領域還在為 “效率與成本如何平衡”“多場景需求如何適配” 難題尋找答案時,鄭州思昆生物工程有限公司傳來重磅喜訊 —— 旗下 Sikun 2000、Sikun 1000、Sikun 500 三款測序儀,同日斬獲 國械注準 20253222466 醫療器械注冊證!這是行業內首次實現三款測序

    世界第一個茶樹基因組測序計劃在昆啟動

    2月3日,記者從中國科學院昆明植物研究所獲悉,在中國科學院昆明植物研究所3名中科院院士吳征鎰、周俊、孫漢董的大力推動下,一個在世界生物學界和推動普洱茶產業發展上均具有重大意義和經濟價值的科研創新項目——世界上第一個茶樹基因組測序計劃已在昆明正式啟動。此舉,將為云南省利用高科技實現對普洱茶的全新研究和

    人類基因組測序先驅欲進軍生物醫療測序領域

    J. Craig Venter(中)希望通過利用基因組學實現對抗衰老的目標   美國人類基因組測序先驅J. Craig Venter將和其新創立的公司Human Longevity Inc.(HLI)進軍生物醫療測序領域。HLI是“基因組學和細胞的診斷與治療公司”,計劃于今年夏季啟動,終極目標

    人類基因組測序先驅欲進軍生物醫療測序領域

    J. Craig Venter(中)希望通過利用基因組學實現對抗衰老的目標。   美國人類基因組測序先驅J. Craig Venter將和其新創立的公司Human Longevity Inc.(HLI)進軍生物醫療測序領域。HLI是“基因組學和細胞的診斷與治療公司”,計劃于今年夏季啟動,終極目

    基因組測序

    如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的

    單分子測序改善微生物基因組組裝

      美國國家生物防衛分析和反制中心的研究人員近日在《Genome Biology》上發表文章,介紹了SMRT技術在微生物基因組組裝上的應用。他們認為,單分子測序數據能降低測序費用,并帶來更多完整的基因組,改善微生物基因組數據庫的質量。   隨著測序費用的不斷下降,測序項目的數量也在不斷上升。G

    基因組測序揭示多細胞生物進化之謎

      最近,研究人員通過對各種綠藻進行基因組測序,已經接近于解開了“引起多細胞生物的遺傳變化”的謎團。  從單細胞生物到多細胞生物的過渡,是地球上生命進化的關鍵進步;在不同的系統發育譜系中,這種改變已經獨立地發生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因,對單細胞祖先成為多細胞來說是必要的”,是一個有趣的

    全基因組重測序的生物信息分析內容

    1.數據量產出總堿基數量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads統計,測序深度分析。2.一致性序列組裝與參考基因組序列(Reference genome sequence)的比對分析,利用貝葉斯統計模型檢測出每個堿基位點的最大可能性基因型,并組裝出該個體

    《PLoS生物學》:老鼠全基因組測序圖公布

      最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上,美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。   在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后,研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠

    全球微生物模式基因組測序計劃獲進展

      近日,《核酸研究》(Nucleic AcidsResearch)在線發表了國家微生物科學數據中心(中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心)關于全球模式微生物基因組數據庫gcType的論文。gcType是由我國牽頭的全球模式微生物基因組測序計劃的重要成果。  模式菌株(t

    攻克基因組測序難題-探究茶樹生物學奧秘

      我國現存最早的中醫醫藥典籍《本草經》記載:“神農嘗百草,日遇七十二毒,得荼(茶)而解之。”這說明了茶的神奇功效。茶樹起源于我國的云南、四川等地,在從中國向世界各地數千年漫長傳播歷程里,與全球多元文化邂逅交融,發展形成了今天地球上復雜而美妙的茶文化。茶之所以廣受歡迎,除了有迷人的香氣和令人愉悅的滋

    中美倡議啟動“地球生物基因組計劃”-對所有真核生物測序

      在美國斯密森尼生物多樣性基因組學項目組與中國華大基因公司近日聯合主辦的生物基因組學會議(BioGenomics2017)閉幕論壇上,加州大學戴維斯分校基因組學家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學家張國捷等組成的科研團隊聯合倡議,全球科學家合作開啟另一項與人類基因組計劃(HGP)類似的項目——地球生

    《基因組生物學》:一種超級細菌的基因組測序完成

    最近,英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作,研究結果顯示,這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論

    解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序

      “桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、   有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983

    微生物宏基因組測序可以解釋地球氮循環?

      微生物(細菌和古細等)是全球生物地球化學循環的重要驅動者。闡明微生物生物地理分布及其驅動過程對于預測環境變化將如何影響生物地球化學循環非常重要。以往微生物生物地理學的研究常常聚焦在物種的層面。然而,越來越多的研究表明,由于微生物群落固有的功能冗余性,微生物群落的功能變化通常與其物種組成變化是解耦

    PNAS:甜瓜基因組測序

      甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。   聯合國糧農組織2009年

    基因組測序儀簡介

      基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。  技術指標  個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。  主要功能  樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。

    認識泛基因組測序

    什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

    關于全基因組測序的測序指標介紹

      一、全基因組測序的測序指標— 深度  測序深度(Sequencing depth)是指測序得到的堿基總量(bp)與基因組大小的比值,它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系,測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體,如果采用的是雙末端或Ma

    營收44.71億元,安圖生物2024年財報公布

      近日,安圖生物發布2024年年度報告。報告顯示,公司全年實現營收44.71億元,同比微增0.62%;歸屬于上市公司股東的凈利潤為11.94億元,同比小幅下滑1.89%,;公司擬向全體股東每股派發現金紅利1.26元(含稅),合計派發現金紅利7.20億元,占合并報表中歸屬于上市公司股東凈利潤的60.

    成都生物所完成脫落酸高產菌株全基因組測序

      3月8日,從中科院成都生物研究所科技處獲悉,在上海人類基因組研究中心的協作下,該所完成了脫落酸高產菌株灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea) TBC-A的全基因組測序及分析工作。   B. cinereaTBC-A是成都生物所經過多年改良篩選及系統研發的、具有自主知識產權

    中國完成海帶等7種海洋生物全基因組測序

      中國科學家10月30日在青島首次披露了海帶、櫛孔扇貝和南美白對蝦全基因組測序的部分成果,至此中國已完成7種大型海洋生物的全基因組測序,為改良這些海洋生物品質、提高產量奠定了科學基礎。   中國的海洋生物基因組學研究雖然起步較晚,但現在一些研究成果已達到國際前沿水準。目前,人類完成全基因組測序的

    454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目

      一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代,其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1,科學家通過454全基因組測序,掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因,包括抗病能力、牛奶產量,這些性狀已通過北美的當

    我國完成小麥A基因組測序

    本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和

    我國完成小麥A基因組測序

    ?? 5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入和

    盤點最新基因組測序成果

      the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者:  種屬:非洲腔棘魚(Latimeria chalumnae)  基因組:~2.86 billion bp  人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕,直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年

    基因組測序的具體過程

    講起來很復雜哈,簡單來說,就是邊合成邊測序,把所要測序的序列通過各種手段來建庫,然后加上5‘和3’都加上接頭,放在一個小玻璃片一樣的芯片上,上面一般是8個lane,把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合(之前的建庫時加的接頭與之反向互補),然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇,然

    簡化基因組測序好做嗎

    簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。這些技

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