謝曉亮JAMA暢談單分子生物學
當單分子遇上基因組學,它們會擦出什么樣的火花?著名華人學者謝曉亮(Sunney Xie)博士圍繞這個話題,在《美國醫學會雜志》(JAMA)上發表了文章。謝博士現任哈佛大學化學及化學生物學系教授,也任北京大學生物動態成像中心主任。 謝博士寫道,單分子成像和操作的進步導致了單分子生物學的出現。由于全世界多個實驗室的努力,單分子生物學已經改變了解決問題的方式,并產生了許多新的知識。 他舉了早期一個膽固醇氧化酶的例子。這種酶包含黃素基團,在氧化形式下發出熒光,而在還原形式下不發熒光。熒光的每個開/關循環對應于酶促循環,實現了酶促反應的實時觀察。在單分子基礎上,化學反應以隨機方式發生(即發生化學反應的等待時間是隨機的),而不是像大量分子那樣是確定性的。 謝博士認為,這種實時觀察單分子化學反應的能力非常重要,因為許多分子(如DNA)在活細胞中以單分子(染色體)存在,這意味著基因組中的變化是隨機的。因此,個體中每個生殖細胞都是不同的......閱讀全文
細胞內的分子聚集有利于基因表達
活細胞內部是個擁擠的場所,各種及其他大分子緊緊擠在一起。據物理學家組織網7月14日報道,最近,美國卡內基·梅隆大學一個研究小組利用人造細胞系統,對這些聚集在一起的分子進行了近似研究,發現這種緊密聚集有利于基因表達過程,尤其是在其他條件不理想的情況下。這一發現有助于合成生物學家將來開發出人造細胞,
核酸基因分子探針
從化學和生物學的意義上理解,探針是一種已知特異性的分子,它帶有合適的標記物供反應后檢測。探針和靶的相互反應如抗原-抗體、血凝素-碳水化合物、親合素-生物素、受體和配體,以及核酸與其互補核酸間的雜交等反應均屬此類。用核酸探針與待檢標本中核酸雜交,形成雜交體,再用呈色反應顯示。此方法用于疾病的診斷,稱為
細胞表面RNA分子由細胞核內的基因組編碼產生
人類細胞的外表面上有很多不同的蛋白質、脂質、糖蛋白。然而除了這些已知類型的分子,近日科學家們發現,人類細胞的外表面還穩定附著了一類過去鮮有人知的RNA分子。??????? 加州大學圣地亞哥分校(UCSD)鐘聲教授與其合作者張良方教授、陳真教授共同的研究團隊,利用專門開發的檢測和測序技術鑒定出,這類細
基因簇調控水稻免疫和細胞死亡的分子機制
該研究利用基于代謝物的全基因關聯分析在水稻9號染色體上鑒定到控制羥基肉桂酰腐胺代謝物合成的基因簇。該基因簇由一個鳥氨酸脫羧酶基因( OsODC )和兩個串聯的腐胺羥基肉桂酰轉移酶基因(OsPHT3 和OsPHT4 )組成。功能分析表明,基因簇中三個基因均正調控水稻抗病性,并且 OsPHT3
分子雜交——Northern基因檢測
實驗概要Northern雜交采用瓊脂糖凝膠電泳,將分子量大小不同的RNA分離開來,隨后將其原位轉移至固相支持物(如尼龍膜、硝酸纖維膜等)上,再用放射性(或非放射性)標記的DNA或RNA探針,依據其同源性進行雜交,最后進行放射自顯影(或化學顯影),以目標RNA所在位置表示其分子量的大小,而其顯影強度則
分子雜交——Southern基因檢測
實驗概要將待檢測的DNA樣品固定在固相載體上,與標記的核酸探針進行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號。通過Southern雜交可以判斷被檢測的DNA樣品中是否有與探針同源的片段以及該片段的長度。該項技術廣泛被應用在遺傳病檢測、DNA指紋分析和PCR產物判斷等研究中。但由于該技
Nat-Commun:揭秘轉錄因子“勘察”細胞基因組的分子機制
轉錄因子(TFs)是一種能調節基因表達的特殊蛋白,其能在完整的基因組中搜索并結合特殊區域來調節基因的表達;我們都知道,轉錄因子不僅能結合特殊的DNA序列,還能非特異性結合任何DNA鏈。這些非特異性的關聯就能夠明顯增加轉錄因子尋找特殊靶點的能力,然而目前研究人員并不清楚在掃描大量基因組、定位以及結
綜述:轉基因食物分子可在人體腸道積累并進入體細胞
這篇文章由遠東聯邦大學(FEFU)的科學家和一個國際毒理學家合作,繼續研究轉基因食品的潛在風險,以及外源DNA在消化過程中存活和滲透到消費者體內細胞的方式和機制。 轉基因食物進入體內后的命運,文章發表在《食品與化學毒理學》(Food and Chemical Toxicology)雜志,期刊影
分子標記基于圖譜克隆基因
圖位克隆(Map—bascd cloning))是近幾年隨著分子標記遺傳圖譜的相繼建立和基因分子定位而發展起來的一種新的基因克隆技術。利用分子標記輔助的圖位克隆無需事先知道基因的序列,也不必了解基因的表達產物,就可以直接克隆基因。圖位克隆是最為通用的基因識別途徑,至少在理論上適用于一切基因。基因
分子雜交——Southern基因檢測2
C.轉移按凝膠的大小剪裁NC膜或尼龍膜并剪去一角作為標記,水浸濕后,浸入轉移液中5min。剪一張比膜稍寬的長條Whatman 3mm濾紙作為鹽橋,再按凝膠的尺寸剪3-5張濾紙和大量的紙巾備用。按下圖所示進行轉移。( 轉移過程一般需要8-24hr,每隔數hr換掉已經濕掉的紙巾。轉移液用20×S
前列腺癌SPOP基因突變導致細胞耐藥的分子機制
編碼E3泛素連接酶SPOP的基因在原發性前列腺癌中經常高頻突變,但是SPOP突變如何導致前列腺癌的發病機制仍知之甚少。應激顆粒(stress granules)的組裝是細胞在應激狀態下生存的一種進化保守策略,在人類癌癥當中經常上調表達。 近日,復旦大學生命科學學院王陳繼、李瑤團隊,發表了題為“
《細胞》:分子馬達鑄造記憶
科學家找到了將經歷與認知聯系起來的分子機制 大腦如何形成一次記憶?通常,我們的經歷和相互作用會以某種方式在大腦中留下烙印,然而神經細胞究竟是如何改變它們的連接從而形成記憶,卻一直是個未解之謎。如今,科學家表示,他們找到了將經歷與認知聯系起來的分子機制,而這一切似乎全部要歸功于一臺微小的分子發動機。
巨噬細胞的分子機制
巨噬細胞(Macrophages)能夠吞沒、破壞受損傷組織,有助于啟動康復過程。雖然它們在損傷位點發揮關鍵作用,但一旦任務完成,就需要盡快撤離,結束炎癥反應,為再生過程開路。繼續存在的巨噬細胞不利于組織恢復。盡管研究人員對于啟動巨噬細胞的分子機制研究的比較透徹,但關于其退出損傷位點的過程還了解甚少。
生物細胞分子的功能
DNA 是負責遺傳的主要分子,由 A、C、T、G 四種不同的單元依任意的順序排列,例如一個有 10 個單元的 DNA 分子,會有 4 的 10 次方種不同的排列順序,各種生物的遺傳雖然均由 DNA 分子負責,由于排列順序的差異,以致造成相互間極大的不同;RNA 是負責傳遞遺傳訊息的分子,它將 D
巨噬細胞的分子機制
巨噬細胞(Macrophages)能夠吞沒、破壞受損傷組織,有助于啟動康復過程。雖然它們在損傷位點發揮關鍵作用,但一旦任務完成,就需要盡快撤離,結束炎癥反應,為再生過程開路。繼續存在的巨噬細胞不利于組織恢復。盡管研究人員對于啟動巨噬細胞的分子機制研究的比較透徹,但關于其退出損傷位點的過程還了解甚
阻止細胞成為癌細胞的分子機制
最近,研究人員已經確定了一個多少有些神秘的分子有著從不為人知的作用。它似乎可以通過激活結直腸細胞組織避免使其成為癌細胞。 這個分子被稱為NLRC3,它是在細胞內發現的“傳導蛋白”NOD樣受體(NLR)大家族的成員之一,它們在細胞內幫助控制免疫等功能。然而,直到現在,科學家們才意識到NLRC3
HIV通過“綁架”細胞表面分子入侵細胞
艾滋病病毒(HIV)是怎樣將遺傳物質注入細胞的?弄清這個問題對于艾滋病的防治十分重要。美國尤妮斯·肯尼迪·施賴弗國家兒童健康與人類發展研究所(NICHD)的研究人員在最新一期《細胞·宿主與微生物》雜志上發表論文稱,他們發現了HIV入侵細胞的關鍵環節:為順利突破細胞膜的阻攔,HIV會“綁架”細胞表
分子生態學詞匯標記基因
中文名稱:標記基因外文名稱:labelled gene專屬名詞:基因工程廣泛應用:分子生物學、細胞生物學選擇基因:選擇標記基因定義:標記基因,原本是基因工程的專屬名詞,但是它已經成為一種基本的實驗工具,廣泛應用于分子生物學、細胞生物學、發育生物學等方面的研究。標記基因是一種已知功能或已知序列的基因,
分子遺傳學詞匯結構基因
中文名稱:結構基因外文名稱:Structural Genes定????義:編碼蛋白質或RNA 的基因結構基因是編碼蛋白質或RNA的基因。細菌的結構基因一般成簇排列,多個結構基因受單一啟動子共同控制,使整套基因或都表達或者都不表達。結構基因編碼大量功能各異的蛋白質,其中有組成細胞和組織器官基本成分的結
分子生態學詞匯標記基因
中文名稱:標記基因外文名稱:labelled gene專屬名詞:基因工程廣泛應用:分子生物學、細胞生物學選擇基因:選擇標記基因定義:標記基因,原本是基因工程的專屬名詞,但是它已經成為一種基本的實驗工具,廣泛應用于分子生物學、細胞生物學、發育生物學等方面的研究。標記基因是一種已知功能或已知序列的基因,
分子遺傳學詞匯超基因
中文名稱:超基因外文名稱:super gene定義:超基因指作用于一種性狀或 作用于系列相關性狀的幾個緊密連鎖的基 因。如人類主要組織相容性抗原復合體hla和 免疫球蛋白重鏈及輕鏈基因都屬于超基因。超 基因可能是由于基因擴增后又經過功能和結構上的輕微改變而產生的,但仍保留了原始基因 的結構及功能的完
分子遺傳學詞匯晚期基因
中文名稱:晚期基因英文名稱:late gene定 義:細胞受刺激或激活后晚期轉錄的基因。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
分子遺傳學詞匯同源基因
中文名稱:同源基因外文名稱:homologous gene類? ? ? 型:直系同源基因定? ? ? 義:同源基因是由一個共同祖先在不同物種中遺傳的基因。雖然同源基因在序列上是相似的,但相似的序列不一定是同源的
分子遺傳學詞匯調節基因
中文名稱:調節基因外文名稱:regulator gene定義:是調節蛋白質合成的基因。它能使結構基因在需要某種酶時就合成某種酶,不需要時,則停止合成,它對不同染色體上的結構基因有調節作用。控制另一些遠離基因的產物合成速率的基因,以及控制阻礙物的合成,后者能與操縱基因結合,從而抑制它所控制的下游結構基
分子遺傳學詞匯重復基因
重復基因指染色體上存在多數拷貝基因,重復基因往往是生命活動最基本,最重要的功能相關的基因。
分子遺傳學詞匯dna基因
中文名稱:dna基因英文名稱:dna gene定 義:與細菌DNA復制直接相關的基因。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
分子遺傳學詞匯基因家族
中文名稱:基因家族外文名稱:gene family定? ? ? 義:基因家族(gene family),是來源于同一個祖先,由一個基因通過基因重復而產生兩個或更多的拷貝而構成的一組基因,它們在結構和功能上具有明顯的相似性,編碼相似的蛋白質產物, 同一家族基因可以緊密排列在一起,形成一個基因簇,但多數
分子遺傳學詞匯標記基因
中文名稱:標記基因外文名稱:labelled gene定義:標記基因,原本是基因工程的專屬名詞,但是它已經成為一種基本的實驗工具,廣泛應用于分子生物學、細胞生物學、發育生物學等方面的研究。標記基因是一種已知功能或已知序列的基因,能夠起著特異性標記的作用。在基因工程意義上來說,它是重組DNA載體的重要
分子遺傳學詞匯基因拷貝
中文名稱:基因拷貝英文名稱:gene copy定 義:編碼一個基因的DNA序列在基因組內完整出現一次,稱為該基因的一個拷貝。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
分子遺傳學詞匯基因剪接
中文名稱:基因剪接外文名稱:Gene splicing別????名:重組DNA定? ? 義:基因剪接是通過一些酶學操作使一條DNA分子與另一條DNA分子相連。即在mRNA成熟期,切除基因的內含子,連接基因的外顯子的過程,稱為基因剪接。而天然基因的某些片段被合成的DNA鏈所取代或連成整體的過程稱為基因