李曉江博士：探討用CRISPR／Cas9實現大型動物基因組編輯
6月2日，來自中國科學院遺傳與發育生物學研究所的李曉江（Xiao-Jiang Li）研究員在《細胞研究》（Cell Research）雜志上發表了題為“Targeted genome editing in primate embryos”的文章。 在這篇文章中他概述了近期在靈長類動物胚胎中應用CRISPR/Cas9的一些研究結果，并著重探討了在構建出非人類靈長類動物人類疾病模型之前CRISPR/Cas9面臨的一些技術問題。 在CRISPR/Cas9系統中，特別設計的導向RNA(gRNA)以一種序列特異性方式將核酸酶Cas9引導到基因組DNA處，Cas9在精確的位點切割DNA雙鏈。隨后通過非同源末端連接（NHEJ)或是同源重組(HR)基因組DNA得到修復，由此可導入破壞開放閱讀框的突變，引起基因失活。由于CRISPR/Cas9使得可以在幾乎所有的位點切割基因組，現在這一系統已成為了在各種各樣的物種包括人類胚胎和非人類靈長類......閱讀全文
新基因網絡模型可快速確認基因功能
美國得州大學奧斯汀分校研究人員開發出一種強大的新基因網絡模型，可更加容易和快速地確認出控制線蟲壽命及其腫瘤發展的致病基因。研究人員期冀通過擴展此項技術，未來可鑒別出造成人類疾病與其他身體功能失調癥狀的相關基因。該研究成果發表在1月27日的英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）網絡版上
基因修飾和動物模型
科學通報，中國科學C輯:生命科學，這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的，我國學術期刊中的知名品牌，被國內外各主要檢索系統收錄，如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI，英國的SA，日本的《科技文獻
腦卒中多基因遺傳風險評分模型建立
魯向鋒教授（中）在指導學生進行科研工作。 中國醫學科學院阜外醫院供圖 我國居民的第一位死亡原因、患病人群日益年輕化、70%患者均有不同程度殘疾、二次復發率高達40%……腦卒中像一個“惡魔”貪婪地“吮吸”著人類的健康。 如何及時有效地篩查出腦卒中高危人群，已經成為全社會關心的話題。 “現有的
轉基因小鼠模型的建立(SOP)1
名稱：轉基因小鼠模型的建立(SOP)關鍵詞：轉基因小鼠目的：在動物體研究轉化基因原理：轉基因動物是指染色體基因組中整合有外源基因并能遺傳給后代的一類動物。整合到動物染色體基因組的外源基因稱為轉基因。轉基因技術則是指制備轉基因動物所需的一套技術，它涉及外源基因的構建、載體和受體的篩選、基因導人技術、供
轉基因小鼠模型的建立(SOP)5
4．顯微注射（1）導入DNA的制備：顯微注射首先涉及導入DNA的制備，顯微注射的轉入基因通常為去除載體序列的線狀DNA，轉基因所用載體是真核表達載體，即含有在哺乳動物細胞內表達的真核啟動子。所謂組織特異性的實現多是通過組織特異性啟動子來實現組織特異性表達的。制備轉基因小鼠，必須對待導入DNA進行分離
轉基因小鼠模型的建立(SOP)4
（6）? 為保暖包裹小鼠于紗布中或將其放置于熱墊內使其蘇醒，處于麻醉狀態下的小鼠應該嚴格監護直到其完全蘇醒。手術后小鼠飼養2周后確定手術是否成功。（7） 實驗性飼養：將1-2只母鼠與輸精管切除小鼠合籠飼養，次晨進行陰道栓檢查。有陰道栓的母鼠，用磷酸緩沖液處理后24小時，其輸卵管潮紅。卵細胞應該處于單
轉基因小鼠模型的建立(SOP)6
[洗卵管制作]1）? 點燃酒精燈，調節火焰到最佳。捏持玻璃毛細吸管或巴氏移液管在火焰上焰旋轉過火。2）? 當吸管開始變軟，快速撤離火焰，向外急劇扯拉使吸管變長，形成口徑大約200?l的吸管。注意制備過程中離開火焰的時間以及扯拉的力度，盡量保證制備吸管的一致性。3）? 為吸管評分，輕柔地折斷吸管，辨別
轉基因小鼠模型的建立(SOP)7
4）? 如果未見DNA溶液流，則輕輕摩擦持樣器鈍緣，漸漸的打開注射器針頭。針頭重新進入油內確定DNA溶液流的存在。5）? 移動持卵管回到受精卵下部。通過微分驅動水壓控制系統使持卵管內產生溫和的負壓，并使持卵管末端吸住受精卵。此操作必須確保受精卵基底部與凹玻片基底部輕輕接觸。注意不宜吸得過緊，否則會使
轉基因小鼠模型的建立(SOP)8
（1）? RNA的分離：根據實驗者的需要從轉基因小鼠組織或細胞中提取總RNA或mRNA。分離總RNA比較簡單，且適合做基因做基因轉錄分析。實驗操作參見第一章的第四節。（2）? Northern 印跡分析：該技術用于定性檢測轉基因動物組織或細胞中轉基因轉錄的相對水平。其實驗操作參見第一章的第九節。（3
轉基因小鼠模型的建立(SOP)7
10）? 移卵操作完成后，撤回移卵管，去除器械，按原本位置將各器官重置于腹腔內。10）縫合切口，用小夾夾持皮膚。常用自動小夾代替縫線，這樣可以避免小鼠啃嘶縫線，切口裂開。11）若進行雙側手術，則于另一側子宮角重復上述操作。12）手術完成后，安置小鼠于清潔的籠中。麻醉狀態下，小型哺乳動物無法有效維持機
轉基因小鼠模型的建立(SOP)3
（2）受體母鼠的準備輸卵管轉移的受體鼠應該為4-6周齡大小，體重在20-25克左右，嚴禁用低體重以及超重母鼠，若體重較低，其體能不足以維持妊娠，可能導致受精卵的重新吸收；若體重較重，麻醉劑被吸收入脂肪組織，降低麻醉效果，可能使手術困難，而且脂肪組織的存在意味著靜脈的存在，所以手術時切掉脂肪組織可能導
轉基因小鼠模型的建立(SOP)2
[不足之處]（1）外源基因隨機整合；（2）個別原核不清晰，需進行特殊處理；（3）需大型精密儀器，費用昂貴；（4）操作周期相對較長。（二）實驗器材的準備1．輸精管切除術用器材：彎式有齒鑷、直式有齒鑷、顯微鑷、手術剪、自動小夾涂藥器、自動小夾、帶彎針4/0絲線及持針器、直徑為10cm塑料 Petri氏培
基因編輯CRISPR找到自閉癥獼猴模型
自閉癥是一種嚴重的神經發育性疾病，目前中國自閉癥患者已超1000萬，且患病率呈現上升趨勢。自閉癥的發生機制目前仍不清楚。針對自閉癥的新藥研發和高度模擬人類自閉癥癥狀的實驗動物模型成為自閉癥研究領域的瓶頸。 DOI: 10.1038/s41586-019-1278-0 近日，中國科學院深圳先進
如何選擇基因敲除動物模型制備技術？
動物模型是現代生命科學研究的重要工具，特別是基因工程小鼠和大鼠，在基因功能研究、人類生理病理機制研究及新藥研發中起著不可替代的作用。近幾年來，制 備動物模型的基因修飾技術層出不窮，這不僅包括傳統ES打靶、TALEN、CRISPR/Cas9，?還有TetraOne基因敲除新技術。如此繁 多的技
PNAS：小鼠模型需慎用，基因表達差異大
PNAS：小鼠模型需慎用，基因表達差異大 小鼠被廣泛用于模擬人類代謝、疾病和藥物應答，是醫學研究中的一個基本工具。然而斯坦福大學的研究團隊指出，人類和小鼠的基因表達存在著驚人的差異，不論是蛋白編碼基因還是非編碼基因。這項研究發表在十一月十七日的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 Mic
最新RNAi技術可媲美轉基因小鼠模型
基因編輯技術一直都是生命科學的熱門研究領域，近來編輯領域出現了可與轉基因小鼠技術相媲美的新RNAi干擾技術，該技術由洛克菲勒大學的研究人員研制出，在全基因組水平上首次對小鼠進行RNAi篩查研究，并在數月內發現了導致表皮腫瘤生長的基因，研究成果發表在《自然》期刊上。 RNAi技術篩查致病基因
設計基因編輯工具的AI大模型問世
記者27日從中國農業科學院獲悉，該院農業基因組研究所農業基因編輯技術研發與應用創新團隊構建了全球規模最大的實驗驗證數據集，并基于此開發出人工智能（AI）大模型AlphaCD。該模型不僅能高效預測超過2萬余種胞嘧啶脫氨酶的酶活特征，還能設計出新型高性能堿基編輯工具。相關成果日前發表于國際期刊《細胞
計算機模型解開塑料的“基因密碼”
人們的生活離不開塑料。但迄今為止，工業上還是先開發出一種塑料，然后才去發現它的用途，或試驗幾百種不同的“配置”看看哪種管用，既費時又費錢。據美國物理學家組織網9月30日（北京時間）報道，最近，英國利茲大學和杜倫大學解決了這一難題，他們開發出一種計算機模型，能在化學水平預測各種高分子成型時的形狀，
干貨－|－制造業數字化轉型基因模型
2022年10月28日，在上海電氣科技大會暨人才工作會議上，上海電氣集團全新發布題為《數制融合·智慧賦能》的上海電氣數字化轉型白皮書。多年來，上海電氣集團各業務單元在能源裝備、工業裝備、集成服務領域積累了大量數字化轉型實踐經驗。據了解，白皮書結合離散制造、裝備制造型企業的共性特點，梳理了上海電氣數字
基因工程豬模型揭示免疫細胞“致命對話”
亨廷頓病（HD）又稱大舞蹈病或亨廷頓舞蹈癥，是一種由HTT基因CAG重復序列異常擴增引起的常染色體顯性遺傳性神經退行性疾病。該病的核心病理特征極為明確：紋狀體中的中型棘狀神經元發生選擇性死亡。然而，驅動這種選擇性神經元丟失的精確機制，尤其是神經免疫系統在其中扮演的角色，長期以來一直是領域內亟待破
AI新模型精準預測細胞內基因活動
哥倫比亞大學瓦格洛斯內外科醫學院團隊開發了一種創新的人工智能（AI）模型——通用表達轉換器（GET），該模型能夠精確預測人類細胞內的基因活動，為理解細胞內部工作機制提供了全新視角。這項突破性成果可幫助科學家以前所未有的方式，探索從癌癥到遺傳疾病等一系列健康問題，推動醫學研究向前邁進一大步。相關論文發
Cell:－CRISPR技術加快轉基因小鼠模型構建
Whitehead研究所的研究人員利用基因調控系統CRISPR/Cas，僅需一步操作就可將報告基因和條件性等位基因轉入小鼠基因組中。目前生成包含如此復雜工程等位基因的動物只需數周而非數年的時間，科學家可快速利用這些動物來構建疾病模型及研究基因功能。這一突破性的研究發表在《細胞》(Cell)雜志上
我國首個冠心病多基因風險評分模型建立
近日，中國科學院院士、國家心血管病中心教授顧東風和該中心教授魯向鋒團隊建立了我國首個冠心病多基因風險評分模型，并系統評價了其在冠心病精準預防中的應用價值。該評分可提升冠心病發病風險預測和臨床風險分層能力，有助于冠心病的早期預測預警和指導精準防治。研究成果于近日在線發表在《歐洲心臟病雜志》。 《
AI新模型精準預測細胞內基因活動
哥倫比亞大學瓦格洛斯內外科醫學院團隊開發了一種創新的人工智能（AI）模型——通用表達轉換器（GET），該模型能夠精確預測人類細胞內的基因活動，為理解細胞內部工作機制提供了全新視角。這項突破性成果可幫助科學家以前所未有的方式，探索從癌癥到遺傳疾病等一系列健康問題，推動醫學研究向前邁進一大步。相關論文發
基因人源化動物模型應用與構建
古代祖先神農嘗百草為治病救人，根本原因在于缺乏人類試藥的替身，只能以身試法。上一期我們介紹了一種“目前最接近人類臨床實際情況的腫瘤模型”——“PDX”人源化動物模型，今天我們繼續為大家介紹另一種十分重要的人源化動物模型——基因人源化模型。人源化動物模型（Humanized Animal Model
雙轉基因模型證明干細胞促進再生新理論
《JCI-Insight》雜志近期發表了他們的研究成果——注射后，干細胞通過協調內源性細胞導致愈合效果，并不直接負責軟骨再生。 間充質干細胞（所謂的結締組織祖細胞）在治療軟骨組織再生領域極具潛力，但是，干細胞療法如何促進受損結締組織愈合的機制尚不明確。生物醫學科學系的研究者為解決這一問題首先需
首個百億級可部署基因組基礎模型發布
10月23日，在第二十屆國際基因組學大會上，華大生命科學研究院與之江實驗室聯合發布了首個百億參數可部署的基因組通用基礎模型（Genos）。這一針對人類基因組深度優化的基因組基礎模型，可支持高達百萬堿基對的超長上下文分析，并實現單堿基分辨率的精準識別，有望為臨床疾病診斷、個人基因組解讀及前沿科學研究帶
港中大研發精準計算模型預測病毒基因演變
香港中文大學(港中大)2日公布，港中大醫學院研究團隊建立了一套精準計算模型“beth-1”，能準確預測病毒基因演變，有助在設計流感疫苗時選擇最具代表性的病毒株。港中大醫學院表示，流感病毒會持續出現基因進化演變，導致免疫逃脫，令已經感染過病毒或打過疫苗的人可能再次感染突變后的病毒，造成新的季節性流感高
相分離調控線粒體基因組空間秩序的模型
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員劉興國團隊聯合清華大學、南方科技大學、北京大學、香港中文大學等科研人員，研究發現線粒體基因組與其結合蛋白，利用生物分子最基礎的自發聚集的相分離性質，調控線粒體類核的組裝以及轉錄的復雜過程，構建了首個相分離調控線粒體基因組結構與功能的模型。相關研究10月28日在
顯微注射法建立轉基因小鼠模型的操作流程
實驗概要本實驗詳細介紹了顯微注射法建立轉基因小鼠模型的操作流程。實驗原理轉基因小鼠制備的基本原理是將改建后的目的基因(或基因組片段)用顯微注射法注入供體小鼠的受精卵(或著床前胚胎細胞)，然后將此受精卵(或著床前胚胎細胞)再植入受體動物的輸卵管(或子宮)中，使其發育成攜帶有外源基因的轉基因動物，通過分