GenomeBiology：食物會影響DNA序列
牛津大學的研究人員在兩種寄生蟲中檢測到了食物組分造成的DNA序列差異。他們在Genome Biology雜志上發表文章指出，食物能夠影響生物的基因序列。 “生物從食物中獲取原料構建自己的DNA。我們認為，食物組分可能應該能夠改變生物的DNA。我們也許可以預測素食者熊貓與肉食者北極熊之間的基因差異，” 牛津大學的Dr Steven Kelly說。 為了測試這個理論，研究人員選擇兩種寄生蟲作為模式生物，一種真核生物寄生蟲（Kinetoplastida）和一種細菌寄生蟲（Mollicutes）。這些寄生蟲有共同的祖先，但它們感染不同的宿主，食物也大不相同。“我們發現，寄生蟲食物中不同水平的氮造成了它們的DNA改變。具體來說，與攝取高氮高蛋白食物的寄生蟲相比，攝取低氮高糖食物的寄生蟲DNA使用更少的氮，”Kelly表示。 這些結果揭示了過去人們不曾發現的細胞代謝與進化之間的關系。研究表明，生物對不同食物的適應會影響它們的DNA......閱讀全文
Genome－Biology：食物會影響DNA序列
牛津大學的研究人員在兩種寄生蟲中檢測到了食物組分造成的DNA序列差異。他們在Genome Biology雜志上發表文章指出，食物能夠影響生物的基因序列。 “生物從食物中獲取原料構建自己的DNA。我們認為，食物組分可能應該能夠改變生物的DNA。我們也許可以預測素食者熊貓與肉食者北極熊之間的基因差
吃什么就是什么？對，食物會影響你的DNA序列
牛津大學的研究人員在兩種寄生蟲中檢測到了食物組分造成的DNA序列差異。他們在Genome Biology雜志上發表文章指出，食物能夠影響生物的基因序列。 “生物從食物中獲取原料構建自己的DNA。我們認為，食物組分可能應該能夠改變生物的DNA。我們也許可以預測素食者熊貓與肉食者北極熊之間的基因差
Genome－Biology：新技術90分鐘完成全基因組序列分析
美國國家兒童醫院（Nationwide Children's Hospital）的研發人員最近在Genome Biology上發布了一個自主開發的分析軟件，表示這個軟件使尋找全基因組致病變異從幾周縮短到按幾十個小時。 第一個人類基因組測序完成耗時大約13年，耗費30億美元，而現在技術測序技術的
Genome－Biology：為CRISPR選擇最佳向導
細菌一直在與病毒或入侵核酸進行斗爭，為此它們演化出了多種防御機制，CRISPR-Cas9 適應性免疫系統就是其中之一。規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合，可以在引導RNA的指引下，靶標并切割入侵者的遺傳物質。 2012年研究者們利用這一特點，將CRISPR系統發展成了強大
Genome－Biology發文介紹RNA印記法
生物學家們逐漸意識到，RNA不只是DNA和蛋白之間的過渡產物，它對調節基因的表達有重要作用。深入研究RNA調控，能夠幫助科學家們進一步理解相關疾病。 賓夕法尼亞大學的科學家們開發了分析RNA調控的新方法，這一方法能夠有效獲得RNA與RNA結合蛋白(RBP)互作的所有位點。這一發表在Geno
Genome－Biology：大豆重要性狀遺傳網絡解析
不同復雜性狀間的耦合是分子設計育種的關鍵科學問題。作物的產量、品質等大都是多基因控制的復雜性狀，由于受到一因多效和遺傳連鎖累贅的影響，使某些性狀在不同材料和育種后代中協同變化，呈現耦合性相關。解析復雜性狀間耦合的遺傳調控網絡，明確關鍵調控單元，對分子設計育種具有重要意義。大豆原產中國，是人類和動
Genome－Biology：RNAseq需要多長的讀長？
隨著新一代測序（NGS）的讀長在不斷增長，研究人員也開始糾結：到底多長的讀長才合適？雙端測序是不是優于單端測序？近日，康奈爾大學維爾醫學院的研究人員在《Genome Biology》雜志上發表文章，認為對于差異表達分析而言，讀長并非越長越好。不過，雙端測序和長的讀長無疑能改善剪接的檢測。 最初
Genome－Biology發布菜豆基因組測序結果
菜豆（Phaseolus），是世界上最古老的作物之一。幾千年前，它與玉米和木薯一起，在美國被馴養，成為世界性的主要主食。根據聯合國糧食和農業組織（FAO）的研究顯示，普通菜豆是最重要的糧食豆類，占世界食用豆類食品的50%，在超過5億人的飲食中顯得尤為重要。這種作物種植在拉丁美洲、非洲、中東、中國
973首席科學家發表《Genome－Biology》文章
來自西南大學蠶學與系統生物學研究所的研究人員利用家蠶全基因組芯片分析家蠶多種組織基因表達特征，這一研究成果公布在國際生物學權威期刊《Genome Biology》網絡版上。 領導這一研究的是夏慶友教授，現任教育部“長江學者”特聘教授，“973”項目首席科學家 原文檢索：Genome Biolog
Genome－Biol：DNA破裂或會重新調節癌癥基因的控制機制
理解介導癌癥基因組中廣泛DNA損傷的機制一直以來都是癌癥研究人員非常感興趣的研究領域，近日，一項刊登在國際雜志Genome Biology上的研究報告中，來自貝勒醫學院等機構的科學家們通過研究發現，基因組結構的變異或許能作為人類癌癥中DNA甲基化改變（基因控制的一種形式）的一種特殊機制。 文章
《Genome－Biology》：上海交大參與發表強迫癥研究成果
報道： 在2014年3月份的《基因組生物學》(Genome Biology)發表的一項研究中，美國哈佛-麻省理工博德研究所(The Broad Institute of MIT and Harvard)、麻省理工學院、上海交通大學、明尼蘇達大學和康奈爾大學等研究結構的研究人員，采用全基因
蘇州大學Genome－Biology：聚焦基因組中的新基因
來自蘇州大學、芝加哥大學的研究人員在新研究中，調查了人類和小鼠基因組中新基因驅動基因間相互作用（GGI）網絡的速度及模式。這項研究發布在近期的《基因組生物學》（Genome Biology）雜志上。 蘇州大學的沈百榮（Bairong Shen）教授及芝加哥大學遺傳與進化系終身教授龍漫遠(Man
Genome－Biology：普通小麥精細表觀組圖譜繪制成功
7月15日，Genome Biology期刊在線發表中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所張一婧研究組與南京農業大學張文利研究組等合作完成的研究論文。該工作生成并繪制普通小麥精細的表觀組圖譜，以此為基礎針對性開發整合計算流程對全基因組順式調控元件進行了系統的挖掘與鑒定，并初步探索
這樣加工食物，會破壞食物DNA，被吸收后會增加癌癥風險
民以食為天，飲食直接影響著人類的健康。良好合理的健康飲食習慣是保健的一個重要方面，可使身體健康地生長、發育。不良的飲食習慣則會導致人體正常的生理功能紊亂而感染疾病。食物的烹飪方法與健康息息相關。我們知道，吃燒烤和油炸食品會增加多種健康問題的風險。選擇合適的烹飪方法可以最大程度地保留食物的營養成分和口
《Genome－Research》：根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型，與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性，破壞宿主細胞膜和粘附的能力，粘附到人體組織的能力，是許多細菌病原體的主要毒力因子，包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌，自從上世紀40
驚人發現：食物會影響我們的基因？
科學家們最近發現，我們的大多數基因都會受到食物的影響。這項引人注目的研究發表在Nature旗下新期刊Nature Microbiology上。 細胞行為是由基因活性決定的，而基因活性受到表觀遺傳學開關的調控。此前有研究表明，基因調控還存在另一個層面，那就是代謝網絡。代謝是維持細胞的生化反應，主
Genome－Biol：突破！科學家提出“人如其食”的遺傳證據
日前，一項刊登在國際雜志Genome Biology上的研究報告中，來自牛津大學的研究人員通過研究發現，有機體的飲食方式能夠影響機體基因的DNA序列；文章中研究者通過對兩種寄生蟲進行研究發現，其機體中DNA序列的差異或許歸因于食物的組成成分。 研究者Steven Kelly表示，有機體會利用從
Genome－Biology：胰腺癌肝轉移的分子特征研究新進展
近日，中國科學院上海營養與健康研究所研究員李虹、李亦學研究組，與上海交通大學附屬仁濟醫院主任醫師孫勇偉、研究員薛婧、主任醫師王理偉及研究員張志剛團隊合作的研究成果，以Integrated genomic and transcriptomic analysis reveals unique cha
水生所舉辦Water－Biology－and－Security期刊影響力發布會
“水生所主辦的《Water Biology and Security》（簡稱WBS）獲得首個影響因子5.1！”6月22日， “Water Biology and Security期刊影響力發布會”在中國科學院水生生物研究所舉行。發布會由水生所黨委書記、研究員解綬啟主持。WBS主編桂建芳院士、副主編繆
Genome－Biology：聯合鑒定肺癌篩查與臨床預后生物標志物
肺癌是最常見的癌癥類型，并且表現出復雜的發病機理和高度異質性，遺傳因素是導致肺癌發生的風險之一，但目前其機制尚不清楚，研究發現13q12.12中的SNP rs753955（A> G）與中國人群中的肺癌發生風險高度相關。 2019年5月24日，南京醫科大學孫玉潔、沈洪斌，昆明醫科大學宋鑫等人在Ge
Genome－Biology：上海交大解析阿司匹林的抗結直腸癌機制
癌癥化學預防指利用天然或合成的化學物質來阻止、逆轉、減緩癌癥的發生發展過程。雖然阿司匹林的化學預防效果已經被廣泛研究，但人們還不完全清楚細胞組分在其中起到的作用，比如長非編碼RNA（lncRNA）。lncRNA是長達兩百個核苷酸以上的轉錄本，絕大多數位于細胞核內。 上海交大醫學院的研究團隊發現
DNA微序列技術
·?????????Protocols for Making Drosophila Arrays?(Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,?
DNA序列測定技術
DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam－Gilbert DNA化學降解法測序策略 目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的
DNA－序列分析技術
試劑、試劑盒 瓊脂糖TE 水飽和酚無水乙醇70％乙醇TEMED測序酶溴化乙錠儀器、耗材 電泳儀離心管離心機冰浴箱恒溫板DNA 測序儀
DNA－序列分析技術
DNA序列分析技術可用于：（1）分析物種的遺傳多樣性；（2）鑒定新的物種；（3）用于比較基因組學。實驗方法原理本節描述運用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自動DNA 測序儀進行雙鏈DNA 測序的方法。熱循環測序反應使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe
DNA序列測定技術
DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam－Gilbert DNA化學降解法測序策略目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的若干
DNA－序列分析技術
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本節描述運用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自動DNA 測序儀進行雙鏈DNA 測序的方法。熱循環測序反應使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator
Nat－Commun：父母會影響兒童對食物的選擇
當兒童在決定吃什么的時候，他們會推測母親會希望他們吃什么這一點。根據一篇發表在《自然-通訊》上的論文，研究人員指出了兒童在做食物相關的選擇時大腦中會激活的特定區域。 雖然已經有研究表明兒童期的食物選擇可以建立起終身的與健康相關的行為模式，但是兒童的決策行為包括食物選擇背后的神經機制仍不太清楚。
Cell子刊驚人發現：飲食會通過腸道菌影響表觀基因組
UW-Madison研究團隊十一月二十三日在Molecular Cell雜志上發表文章指出，飲食會影響腸道菌釋放的代謝物。這些代謝物作用于宿主近端結腸、肝臟和脂肪組織的組蛋白，通過表觀遺傳學途徑改變這些組織的基因轉錄。 研究人員首先對無菌小鼠和腸道菌活躍的小鼠進行比較。他們發現，腸道菌群能改變
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定3
2．利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下，末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端，如果作為底物的核苷酸經過修飾（如ddNTP），則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段，亦存在DNA的兩側均被標記問題，可通過上述同