DNA去甲基化酶ROS1負調控基因印記和種子休眠新機制
9月28日，國際學術期刊《美國國家科學院院刊》（PNAS）在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心黃朝鋒研究組和朱健康研究組合作完成的題為DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DOGL4 and seed dormancy in Arabidopsis thaliana 的研究論文。該研究發現了擬南芥DNA去甲基化酶ROS1負調控DOGL4基因的印記和種子休眠的新機制。 基因印記是指父母本來源等位基因之間發生顯著表達差異的一種表觀遺傳現象。在植物中，基因的印記表達主要出現在胚乳中。擬南芥中含有4個DNA去甲基化酶，其中DME特異在雌配子的中心細胞中表達，它通過去甲基化作用調控了胚乳的基因組印記。然而，其它更廣泛表達的去甲基化酶是否參與了基因組印記的調控仍未知。此研究發現另一個DNA去甲基化酶ROS......閱讀全文
DNA去甲基化酶催化作用介紹
DNA去甲基化由DNA去甲基化酶催化。DNA去甲基化是在DNA糖苷酶的作用下脫掉甲基化堿基的反應，等同于被損傷的DNA在糖苷酶及無堿基核酸酶酶切偶聯催化下的修復反應。5一甲基胞嘧啶糖基化酶是體內侯選去甲基化酶。此外，甲基化CpG結合蛋白如MBD2等也具有去甲基化酶的活性。
DNA甲基化酶的分類
基因組中DNA的甲基化模式是通過DNA甲基轉移酶實現的。DNA甲基化酶分為2類，即維持DNA甲基化轉移酶（Dnmtl或維持甲基化酶）和從頭甲基化酶。根據序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化轉移酶又分為4類：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl類酶參與C
DNA去甲基化酶TET3調控I型干擾素表達新機制
7月14日，國際學術期刊《細胞-報告》（Cell Reports）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所王紅艷研究組的最新研究成果：TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
DNA去甲基化酶ROS1負調控基因印記和種子休眠新機制
9月28日，國際學術期刊《美國國家科學院院刊》（PNAS）在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心黃朝鋒研究組和朱健康研究組合作完成的題為DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting
鄭輝課題組揭示阿片類藥物與DNA去甲基化酶相互作用機制
3月17日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院/廣州再生醫學與健康廣東省實驗室鄭輝課題組在國際學術期刊Cell Reports 在線發表了題為Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d
阿片類藥物與DNA去甲基化酶相互作用新機制被發現了
3月17日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院/廣州再生醫學與健康廣東省實驗室鄭輝課題組在國際學術期刊Cell Reports 在線發表了題為Morphine and Naloxone Facilitate Neural Stem Cells Proliferation via a TET1-d
DNA去甲基化酶ROS1負調控基因印記和種子休眠新機制
國際學術期刊《美國國家科學院院刊》（PNAS）在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心黃朝鋒研究組和朱健康研究組合作完成的題為DNA demethylase ROS1 negatively regulates the imprinting of DO
DNA純化去雜質實驗
這周我們來討論一項常用的技術，即使常用但仍引起部分人核酸分離焦慮癥。那就是基因組DNA的純化去雜質。場景是這樣的：你有一份采自南太平洋中部一個偏僻小島上首次發現的古老蘭花品種根際土壤樣品。你使用了非PowerSoil Kit法提取其中的微生物DNA。最終DNA含有太多雜質，無法PCR擴增。因此需要去
DNA甲基化酶的基本信息
大多數限制性內切酶常常伴隨有1~2種修飾酶，即DNA甲基化酶，它能保護細胞自身的DNA不被限制性內切酶破壞。限制修飾系統（R-M系統）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使細菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤發生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重組實驗中，常用的甲基化酶屬于Ⅱ型，它與相應的
DNA甲基化酶的基本信息
大多數限制性內切酶常常伴隨有1~2種修飾酶，即DNA甲基化酶，它能保護細胞自身的DNA不被限制性內切酶破壞。限制修飾系統（R-M系統）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使細菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤發生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重組實驗中，常用的甲基化酶屬于Ⅱ型，它與相應的
DNA甲基化酶的主要類型介紹
基因組中DNA的甲基化模式是通過DNA甲基轉移酶實現的。DNA甲基化酶分為2類，即維持DNA甲基化轉移酶（Dnmtl或維持甲基化酶）和從頭甲基化酶。根據序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化轉移酶又分為4類：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl類酶參與C
DNA甲基化酶的作用和種類
DNA甲基化酶分為2類，即維持DNA甲基化轉移酶（Dnmtl或維持甲基化酶）和從頭甲基化酶。根據序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化轉移酶又分為4類：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl類酶參與CG序列甲基化的維持。CMTs類酶僅發現在植物中，主要特征
DNA甲基化酶的主要類型介紹
DNA甲基化酶分為2類，即維持DNA甲基化轉移酶（Dnmtl或維持甲基化酶）和從頭甲基化酶。根據序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化轉移酶又分為4類：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl類酶參與CG序列甲基化的維持。CMTs類酶僅發現在植物中，主要特征
中國農大JBC解析RNA去甲基化酶晶體結構
2014年3月10日，在百年老牌雜志《生物化學雜志》（Journal of Biological Chemistry）發表的一項最新研究中，中國農業大學、清華大學和多倫多大學的研究人員，報道了RNA去甲基化酶Alkbh5催化核心的5個高分辨率晶體結構。該研究的通訊作者為中國農業大學的陳忠周教
上生科院揭示DNA去甲基化酶TET3調控I型干擾素表達新機制
7月14日，國際學術期刊《細胞-報告》（Cell Reports）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所王紅艷研究組的最新研究成果：TET3 inhibits type I IFN production independent of DNA demethylation。
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名稱Ⅱ型DNA甲基化酶英文名稱type Ⅱ DNA methylase定 義編號：EC 2.1.1.37。三類甲基化酶之一，包括內切酶和甲基化酶兩種成分，作用在識別位點(回文結構)內或其附近，反應不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的雙功能酶，在距不對稱的識別序列較遠處使DNA甲基化，又能
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名稱Ⅱ型DNA甲基化酶英文名稱type Ⅱ DNA methylase定 義編號：EC 2.1.1.37。三類甲基化酶之一，包括內切酶和甲基化酶兩種成分，作用在識別位點(回文結構)內或其附近，反應不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的雙功能酶，在距不對稱的識別序列較遠處使DNA甲基化，又能
DNA甲基化酶的類型和作用介紹
基因組中DNA的甲基化模式是通過DNA甲基轉移酶實現的。DNA甲基化酶分為2類，即維持DNA甲基化轉移酶（Dnmtl或維持甲基化酶）和從頭甲基化酶。根據序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化轉移酶又分為4類：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl類酶參與C
DNA的去甲基化過程
DNA的去甲基化由基因內部的片段及與其結合的因子所調控。有兩種假說可以解釋DNA去甲基化的分子機制。一種假說與DNA半保留復制聯系在一起，為被動去甲基化。如果甲基化的DNA經半保留復制后不被甲基化，其DNA則處于半甲基化狀態，半甲基化的DNA如再次發生DNA半保留復制，而DNA甲基化活性仍被抑制，則
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用
表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成，還有文章探究過其在急性白血病中的作用，但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在Molecular
Oncogene：組蛋白去甲基化酶如何影響癌癥相關的糖酵解
糖酵解途徑（glycolysis）是腫瘤細胞中重要的能量來源途徑，然而，目前對于這條代謝相關途徑的調控方式的了解，還十分有限。來自廈門大學生命科學學院，南京大學等處的研究人員發現JMJD1A作為一個組蛋白去甲基化酶，它能夠影響膀胱腫瘤細胞糖代謝途徑關鍵酶的啟動子上組蛋白甲基化修飾水平，從而影響酶
科學家揭示去甲基化酶在腫瘤中的致病機理
11月21日，腫瘤學研究領域的國際權威雜志《癌癥研究》在線發表了武漢大學李楓教授團隊和中國科學院北京基因組所呂雪梅研究員最新合作研究成果。該研究以“KDM4B通過激活LINE-1促進DNA損傷”為題，解析了組蛋白去甲基化酶（KDM4B）在腫瘤中所扮演的新角色，從全新角度揭示了KDM4B在腫瘤細
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用
文章導讀 表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成，還有文章探究過其在急性白血病中的作用，但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在M
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用（三）
總結本文作者通過RNA-seq,?m6A-seq,?MeRIP-qPCR,?ChIP,?CoIP,雙熒光素酶實驗等方法，研究發現去甲基化酶ALKBH5缺失會加重胰腺ai的發生和不良臨床病理表現特征。ALKBH5的過度表達可降低了體外腫 瘤的增殖、遷移和侵襲活性，改善了體內腫 瘤生長，而ALK
去甲基化酶Rph1底物特異性識別和催化機制
研究揭示釀酒酵母組蛋白去甲基化酶Rph1底物特異性識別和催化機制 11月10日，Biochemical Journal在線發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所丁建平組關于釀酒酵母組蛋白去甲基化酶Rph1底物特異性識別和催化機制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一類含有
我科學家發現新組蛋白去甲基化酶及其調控機理
陳德桂研究組發現新組蛋白去甲基化酶及其調控機理 繼4個月前生化與細胞所陳德桂研究組與景乃禾研究組合作發表一個新的組蛋白去甲基化酶KIAA1718(KDM7A)的發現及其在胚胎干細胞神經分化過程中的功能，及兩周前陳德桂研究組與基因敲除與轉基因小鼠平臺合作發表另一個新的組蛋白去
研究揭示擬南芥組蛋白去甲基化酶JMJ13的結構功能
3月21日，《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心杜嘉木研究組、中科院遺傳與發育生物學研究所曹曉風研究組和河北師范大學孫大業研究組合作完成的題為The Arabidopsis H3
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用（一）
文章導讀表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成，還有文章探究過其在急性白血病中的作用，但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在M
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用（二）
4.ALKBH5抑 制胰腺ai細胞生長和轉移將過表達ALKBH5的ai細胞移植到裸鼠體內，發現過表達ALKBH5的ai細胞生成的腫 瘤體積明顯小于對照組，并且細胞生長的指示分子Ki-67的表達也明顯降低。染色顯示過表達ALKBH5的組織中侵襲和轉移的指示分子MMP-2和MMP-9表達降低，敲
質粒DNA的去磷酸化實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 去除 5' 端的磷酸基可防止質粒 DNA 的自身連接和環化。在體外連接反應中，DNA 連接酶可在鄰近的兩個分子間形成磷酸二酯鍵。但只有當一個分子的 5' 端帶有磷酸基另一分子的 3' 端帶有羥基時，這一反