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  • “鸚鵡學舌”基因被解碼亦有望解釋癌細胞

    據外媒報道,有科學家稱,他們組合了一條更完整的基因鏈條,這個基因鏈條可以控制鸚鵡模仿主人和其他聲音的能力。 研究者用一種新技術分解了鸚鵡的基因組中的某個區域,進行了單分子測序,并用來自較早的DNA解碼設備的數據對其進行了糾錯。研究者還解碼了來自玉米和細菌的難以測序的基因物質,以此來證明他們新的排序方法。 單分子測序“在去年獲得了大量宣傳”,因為它產生了測序長讀取,“使組裝基因組中的復雜部分變得更容易,”研究參與者之一,Duke大學的神經生物學家Erich Jarvis說。 Jarvis對那些控制鸚鵡模仿能力的序列很感興趣,因為它們能幫助神經科學家了解控制人類語言發展的那些基因區域。 Jarvis首先嘗試用第二代測序技術把基因區域拼湊在一起,這種測序技術可以一次性讀取100到400個堿基對,然后用幾天的時間把它們組合成一個基因組序列草圖。在進行測序的時候,科學家發現讀取的長度不足以組裝某些基因的調控......閱讀全文

    單分子測序輕松升級參考基因組

      現代基因組學的最大需求之一,就是得到人類和模式生物的高質量完成基因組。目前,人們利用二代測序技術對越來越多的物種(從原核生物到真核生物)進行了基因組測序,取得了許多重要的研究成果。   不過大部分物種的基因組還中存在有大量的缺口gap,就目前的數據來說,各種已測序物種的基因組中缺口gap所占的

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀

    在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(脫氧核糖核酸)分子進行測序,而目前市場上的主流測序

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(脫氧核糖核酸)分子

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    Cell:單分子測序揭示驚人的基因組重排

      科學家們發現,生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力,它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。  Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程,“這是大自然早期一種的復雜化嘗試,”文章的資深作者,Prince

    單分子測序改善微生物基因組組裝

      美國國家生物防衛分析和反制中心的研究人員近日在《Genome Biology》上發表文章,介紹了SMRT技術在微生物基因組組裝上的應用。他們認為,單分子測序數據能降低測序費用,并帶來更多完整的基因組,改善微生物基因組數據庫的質量。   隨著測序費用的不斷下降,測序項目的數量也在不斷上升。G

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    第三代基因組測序儀問世-實現單分子速讀

      據《自然》雜志網站2月8日報道,在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。  研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(

    簡述單分子測序技術—第三代測序技術的基因組測序應用

      由于具有讀長長的特點,SMRT測序平臺在基因組測序中能降低測序后的Contig數量,明顯減少后續的基因組拼接和注釋的工作量,節省大量的時間[25]。Christophern等[26]僅僅用0.5*的Pacbio RS系統長度的數據與38*的二代測序(NGS)的測序數據,對馬達加斯加的一種指猴基因

    第三代基因組測序儀問世-實現了單分子速讀

    ?據《自然》雜志網站2月8日報道,在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。???? 研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(脫氧核

    測序牛人發布蛋白單分子測序技術

      人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。   現在,美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事,在納米孔DNA測序技術的基礎上,開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用

    全新測序技術利弊比較之單分子測序

      在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。   Harmsen教授在這場疫情

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

      在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail,致力于開發一種不超過1000美元的血液檢測,用于多類型癌癥的早期篩查。這種腫瘤DNA測序的主要目的是在無癥狀的個體中診斷各種各樣的癌癥,從而實現提前預防或治療。  隨著技術的不斷進步,

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

      如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話,那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組,進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術,在臨床診療上發揮更大的作用。  在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail

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    Pacific-Biosciences-單分子實時測序

    Pacific Biosciences單分子實時測序 Pacific Biosciences單分子實時(SMRT)測序使用特殊的環接頭,通過鏈置換擴增(SDA)或多置換擴增(MDA)從dsDNA片段中生成ssDNA,其基于滾動環擴增(RCA)。然后通過DNA聚合酶加入具有熒光磷酸基團(而不是熒光含氮

    帶您了解單分子測序技術

      單分子測序技術,也被稱為納米測序技術,是通過納米孔只允許一條鏈進入的方式,根據堿基的熒光或者電流阻斷來識別堿基序列的一種新型測序技術。這種技術包括PacBio技術和Nanopore技術兩種主要方法。  PacBio技術主要是利用熒光標記不同的堿基與待測序列、DNA聚合酶一起放入納米孔底部。當DN

    -Pacbio單分子實時測序技術于藥用植物基因組研究應用

      藥源短缺成為限制臨床治療和新藥研發的最大瓶頸,因此,開發新的藥物來源途徑是迫切需要解決的問題。利用現代生物技術和次生代謝工程手段是未來生產藥物最有潛力的發展方向。我國藥用植物有1 萬多種,大多數藥用植物遺傳背景不清楚,基因組信息缺乏,遺傳信息和功能基因的研究亦極為薄弱。例如人參屬(Panax)

    PacBio單分子測序最新科研動態

      DNA基因測序技術從上世紀70年代起,歷經三代技術后,目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域,并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計,2012年全球基因測序市場的產值已超過百億,按最近幾年增長

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    《科學》:新型單分子DNA測序儀研制成功

    新發現朝1000美元/人的宏偉基因組測序計劃邁近了堅實一步 美國Helicos BioSciences公司研究人員近日稱,他們開發出了一種新型的測序設備——單分子DNA測序儀(single-molecule DNA sequencers)。該儀器能夠“閱讀”單分子DNA的單個堿基。相關研究文章發表

    -微滴單分子測序儀:設備成本僅1萬美金

      今年年初,以劍橋大學為依托的Base4公司宣布他們成功利用微滴中包裹的核苷酸熒光級聯反應技術清楚的分辨出每個堿基的類型。  每一個核苷酸包裹在一個微滴中,每個微滴按照順序放在每個小的微孔中,大大的增加微孔的數量,即可進行大規模測序。去年該公司和日立公司進行合作,通過固態的納米系統直接讀取堿基產生

    臺灣科學家首創單分子基因測序技術-更少耗時更低成本

      近日,中國臺灣地區的國立交通大學的科學家首創單分子基因測序技術,可加速基因組測序,有助于疫苗和藥物研發,相關成果發表在國際期刊《自然-納米技術》(Nature Nanotechnology)雜志上。   基因是決定生物遺傳特征的基本單位。研究人員指出,DNA由4種核酸堿基(G、A

    科學家繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜

      體細胞突變是腫瘤發生的標志,可用于癌癥的無創診斷。美國約翰·霍普金斯大學醫學院繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜,用于癌癥無創檢測。該研究成果于近日發表在《Nature Genetics》雜志上,題為:Single-molecule genome-wide mutation profile

    單分子測序推動復雜動植物的研究

      Pacific Biosciences公司近日風光無限,發布了新系統,帶動股價大漲。同時,它的單分子實時(SMRT)測序技術也助力了多個植物和動物基因組的研究。這些成果近期發表在多個期刊上,展現了SMRT測序的獨特魅力。  最新一期的《Nature》雜志發表了Oropetium thomaeum

    單分子測序公司Nabsys被曝已關門

      據美國媒體GoLocalProv報道,單分子DNA測序公司Nabsys已關門,它位于普羅維登斯的工廠已關閉。據其他媒體透露,Nabsys的電話無人接聽,發給公司各個官員的電子郵件也無人回復。  Nabsys的平臺使用固態納米檢測儀來分析單個DNA分子,揭示長距離內DNA序列的位置和身份,適合基因

    Nature子刊:蛋白單分子測序技術問世

    最近,美國學者在納米孔DNA測序技術的基礎上,開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用來在臨床上測序蛋白質和檢測新生物指標,還有望給醫療領域帶來徹底的改變,在單分子水平上精確監控患者對治療的應答情況??????? 人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋

    南方科技大學發布我國首個單分子測序儀樣機

      在10月27日南方科技大學舉行的“基因組測序技術進展國際研討會”上,深圳市瀚海基因生物科技有限公司發布了其自主研發的單分子基因測序儀“GenoCare”原理樣機。據瀚海基因創始人兼CEO、南方科技大學副教授賀建奎介紹,這是亞洲首個具有自主知識產權、中國第一臺制成樣機的第三代測序儀。  與已應用于

    科學家完成柑橘基因組測序

      美國佛羅里達大學研究人員帶領的一個國際研究小組日前完成了對甜橙和克萊門氏小柑橘(為柑橘與酸柑雜交的品種)樹的基因測序工作,并公布了相關基因圖譜,這在柑橘屬果樹中尚屬首次。   研究人員稱,該基因圖譜的公布將有助于科學家找到新方法來對抗包括柑橘黃龍病(又稱黃枯病、青果病,對柑橘危

    基因組測序儀簡介

      基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。  技術指標  個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。  主要功能  樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。

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