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  • COLDPCR和HRM結合應用于癌癥基因低水平未知突變

    研究背景:癌癥中體細胞分子層面的突變,常常需要在大量野生型DNA中辨識低濃度的DNA突變。但是,突變檢測方法的選擇率和靈敏度常常限制了鑒定低濃度突變的可靠性。最近開發的COLD-PCR(低變性溫度下的復合擴增,李等人。2008)解決了低含量基因突變檢測的一些局限性,在PCR擴增過程中利用關鍵變性溫度豐富含有突變的擴增子,不論突變位于序列的什么地方。COLD-PCR的一個主要屬性是富集突變體以便于在PCR后的直接測序。然而堿基測序仍然是昂貴的選擇,從而通過高通量掃描序列預檢是有吸引力的辦法。高分辨率融解(HRM)是一種可用于預篩查測序之前未知突變的技術,但不能確定具體的檢測基因突變的身份。因此,為了富集、快速篩查和鑒定低濃度的未知突變,我們把HRM突變掃描和COLD-PCR相結合,隨后進行已知突變的直接測序鑒定。方法:一系列稀釋的HCC2157細胞系和SW480 (ATCC)細胞雄株基因組DNA準備用于評估方法的靈敏度。TP53基......閱讀全文

    COLDPCR和HRM結合應用于癌癥基因低水平未知突變

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      在這一期的《Cancer Prevention Research》雜志,一個德國團隊介紹了一種高度靈敏的方法,能夠檢測引發結腸癌的遺傳變異,從而有望實現無創的結腸癌篩查。   據文章的通訊作者,德國波茨坦大學的助理教授Bettina Scholtka博士介紹,攜帶遺傳變異的癌前細胞會釋

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      肺癌和結直腸癌近年來已成為大多數國家癌癥死亡的主要原因。由于個體遺傳基因存在差異性,不同類型的癌癥患者選擇適合的靶向治療藥物或能取得預期的療效,基因突變檢測為醫生提供了重要參考信息。中國國家食品藥品監督管理局日前批準由瑞士羅氏診斷研發的cobas EGFR/KRAS基因突變檢測技術用于臨床基因突

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    美國首例!CRISPR基因編輯技術應用于癌癥治療

      據美聯社報道,美國賓夕法尼亞大學腫瘤學教授通過CRISPR基因編輯工具對三名晚期癌癥的血細胞進行基因改造,醫生從患者血液中提取出免疫系統細胞,對其進行基因改造以幫助患者對抗癌癥。這是美國首次嘗試使用CRISPR基因編輯治療癌癥。Edward Stadtmauer博士  這三名患者已經年過六旬,其

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      近日,來自威斯達研究所的研究人員揭示了保護端粒(我們染色體末端結構)的部分蛋白復合物的結構,相關研究成果發表在 Nature Communications 上,該研究解釋了與這個蛋白復合物相關的一組基因突變如何促進一系列癌癥。  端粒是染色體末端的保護性結構,對人體基因組的復制和保護至關重要。端

    NCCN增加女性癌癥新基因突變檢測

    據醫脈通報道,第21屆美國國家綜合癌癥網絡(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)年會近日在好萊塢召開,會議增加了幾個針對乳腺癌和卵巢癌遺傳風險管理的新基因突變檢測。 最近的研究發現PALB2基因突變與乳腺癌侵襲性相關,而RAD51C、RAD

    數字PCR和HRM在腫瘤樣本中的應用

    摘要:Vogelstein和Kinzler(美國國家科學院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一種在微量細胞群中(如原發性腫瘤組織)鑒定突變的方法。通過稀釋樣品DNA到一個單個分子水平,它可以把PCR自然模擬指數轉化為數字信號。當PCR成功的擴增出這些單個

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    單核苷酸多態性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指單個核苷酸堿基的改變,包括置換、顛換、缺失和插入,導致的核酸序列的多態性。在不同個體的同一條染色體或同一位點的核苷酸序列中,絕大多數核苷酸序列一致而只有一個堿基不同的現象,這就是SNP。SNP在人類

    基因重組和基因突變區別

    1、基因突變是基因的從無到有,突變產生新基因。基因重組是原有基因的重新組合,產生的是新基因型。2、發生的時間:基因重組發生的時期是:減數分裂中四分體時期同源染色體的非姐妹染色單體之間的局部交換和減數diyi次分裂后期非同源染色體的而重新組合;基因突變發生的時間是在有絲分裂和減數分裂的間期。

    甲基化檢測——MSHRM技術

      HRM技術服務之甲基化檢測(MS-HRM技術)    DNA甲基化是發生在DNA堿基序列上的一種共價修飾。在哺乳動物中,DNA甲基化主要發生在5'-CpG-3'雙核苷酸序列的胞嘧啶上。在人類基因組中,大約有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物種和細胞類型而異。DNA甲基化狀

    454測序識別早期HIV耐藥性突變低水平突變對臨床結果重大

      回顧性研究分析表明即使最低水平的耐藥性突變也會導致早期治療失敗   2月17日《傳染病雜志》(Journal of Infectious Disease)在線公布的一項研究稱HIV病毒群體中少至1%的HIV耐藥性突變會對臨床結果產生顯著影響。這篇論文由羅氏旗下454生命科學公司與耶魯大學醫

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      謝菲爾德大學的研究人員已經發現了保持我們DNA損傷和修復的完美平衡的機制,這將有助于提高腫瘤化療的成功率并對抗衰老相關的神經衰退。圖片來源:CC0 Public Domain  我們的基因組每天面臨著數千次破壞的風險。但是細胞會產生一組蛋白質負責尋找、檢測并修復這些損傷,以維持基因組完整性,但是

    單一基因不僅和糖尿病有關,突變體還會誘發癌癥!

      最近,來自牛津大學和薩里大學的研究人員通過研究發現,單一基因的突變或許就能對人類機體的面部特征產生較大的影響,近年來科學家們進行了大量研究都發現單一基因在人類多種疾病的發生上扮演著關鍵角色,本文中,小編對相關研究進行了整理,分享給大家!  【1】Science:單一基因或可驅動前列腺分化  do

    《科學》:多數癌癥基因突變或因“壞運氣”

      美國約翰斯·霍普金斯大學研究人員曾在兩年前發表論文說,多數癌癥發病要怪“壞運氣”,遺傳和環境因素影響相對較小。這一結論在科學界引起巨大爭議。如今,該校研究人員經進一步分析再次報告說,多數癌癥發病確實是因為運氣不好。  干細胞分裂時  出現錯誤  這項于23日發表在美國《科學》雜志上的新研究稱,近

    -利用腫瘤細胞的基因突變制備癌癥疫苗

      個性化疫苗為治療多對基因突變引發的癌癥提供新的選擇。  在一個小型臨床試驗中,利用在腫瘤細胞中的突變蛋白所制備的疫苗成功地引發了機體對癌細胞的免疫應答反應。  該結果是目前致力于研發個性化癌癥治療所得出的最新成果,并公布于4月2日的科學(Science)雜志中。在此次試驗中,三位惡性黑色素瘤患者

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