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  • 基因組穩定性驅動的低氧適應研究中取得進展

    近期,中國科學院昆明動物研究所研究員趙博團隊等在Journal of Experimental & Clinical Cancer Research上發表了題為RETSAT associates with DDX39B to promote fork restarting and resistance to gemcitabine based chemotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma的研究論文,報道了RETSAT基因在基因組穩定性維持和低氧耐受中的功能和機制。 基因組穩定性的維持以氧作為必要條件,特別是在極端低氧(氧濃度低于1%)條件下,HIF信號通路顯著下調DNA損傷反應(DNA Damage Response,DDR)核心組分的表達,引起DNA復制和修復效率降低,造成DNA損傷累積和基因組不穩定,細胞被動地進入凋亡或衰老。然而,一些特例值得關注。例如,高原......閱讀全文

    基因組穩定性驅動的低氧適應研究中取得進展

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      紐約大學Langone醫學中心的研究人員近日在Cell上發表了一篇題為"Widespread Transcriptional Scanning in the Testis Modulates Gene Evolution Rates"的研究,揭示了廣泛的轉錄掃描如何調控睪丸中的基因表達和進化。 

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    揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排

      在剛剛過去不到一個月的時間,染色體外環狀DNA(eccDNA)重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊,這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖,吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增,極大地促進腫瘤

    北京基因組所等揭示OGlcNAc維持基因組穩定性的分子機制

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    如何使用-geNorm-軟件評估多內參基因組合的穩定性?

    使用 geNorm 軟件評估多內參基因組合的穩定性,一般按照以下步驟進行:準備數據:首先,您需要從實驗中獲得多個內參基因在不同樣本中的定量 PCR 數據,通常是以 Ct 值(循環閾值)的形式。數據輸入:打開 geNorm 軟件,將準備好的數據按照軟件要求的格式輸入。軟件分析:軟件會計算每個內參基因的

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    1.?神經母細胞瘤eccDNA整體統計研究人員聯合eccDNA-seq和RNA-seq(云序生物提供此服務)技術,與開創性的生物信息學算法相結合,首次在神經母細胞瘤(一種主要發生在兒童的致命腫瘤)中進行詳細的環狀DNA序列分析。本研究中分析了93名兒童的神經母細胞瘤組織樣本,結果顯示,每個組織樣本平

    大模型驅動的基因組環形可視化生成研究獲進展

    近日,中國科學院計算機網絡信息中心科研團隊研發出大模型驅動的基因組環形可視化智能生成框架AuraGenome。AuraGenome突破“人工-腳本-靜態”傳統范式,開創“自然語言-智能體-交互”新模式,能夠將基因組數據快速轉化為高質量、可交互的可視化結果,并支持全流程的可追溯與復用。在急性髓系白血病

    研究發現調控基因組穩定性的新的細胞質因子

    中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員王濤團隊在國家自然科學基金區域創新發展聯合基金的資助下,研究發現了參與脫氧核糖核酸損傷修復及維持基因組穩定性的一個新的定位在細胞質中的因子YIPF2。相關成果近日發表于《細胞與生物科學》(Cell & Bioscience)。YIPF2通過調控HR修復與脫氧核

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    有哪些其他軟件可以評估多內參基因組合的穩定性?

    以下是一些可以評估多內參基因組合穩定性的其他軟件:NormFinder:能夠同時考慮組內和組間變異,評估單個內參基因和多個內參基因組合的穩定性。BestKeeper:通過分析基因的標準差、變異系數和相關系數等參數來評估內參基因的穩定性。RefFinder:綜合了上述幾種軟件(如 geNorm、Nor

    華南植物園揭示錐屬物種基因組變異的驅動機制

    遺傳變異的形成與維持機制是進化生物學研究的重要議題。已有研究表明,不同物種間的基因組變異模式存在一定的相似性,并受到多種進化力量的影響。然而,關于不同進化機制對相似基因組變異景觀形成的貢獻以及不同機制間復雜的互作模式尚不清楚。此外,已有研究多是基于近期快速輻射產生的物種或者少量分化時間較長的物種對,

    科學家揭示人類基因組古病毒復活驅動衰老

      病毒與人類之間的協同進化關系源遠流長,二者之間的交鋒從未隨時間停止過。在這場曠日持久的戰爭中,一方面,病毒使人類飽受疾病困擾,甚至死亡,并在此過程中對人類基因組不斷地利用與改造;另一方面,人類的免疫系統會積極對抗病毒的入侵,使得整合到人類基因組中的病毒序列逐漸被宿主細胞的遺傳調控系統接管,協同進

    研究團隊在干細胞基因組穩定性調控機制研究中取得進展

      干細胞是機體發育和組織穩態維持的基礎,基因組穩定是干細胞干性維持和再生醫學應用的前提。研究干細胞如何維持基因組穩定,有助于推動干細胞的安全應用和理解相關發育疾病的致病機理。中國科學院昆明動物研究所研究員鄭萍團隊長期關注干細胞維持基因組穩定性的獨特機制。前期工作中,該研究團隊鑒定胚胎干細胞基因組穩

    哺乳動物調控DNA復制起始以維持基因組穩定性的機理

      DNA是主要的遺傳物質,也是中心法則的源頭。DNA代謝包括DNA復制、轉錄及DNA修復等。其中,DNA復制保證了遺傳信息精確完整地傳遞,而轉錄則是細胞身份維持和功能調控的關鍵。DNA復制發生在整個染色質上,而轉錄則只發生在染色質上的轉錄區。如果這兩個關鍵的細胞過程碰撞,猶如獨木橋上獅虎相遇,會發

    “基因組學+腦科學”雙輪驅動,紅杉中國醫療加速器啟用

    11月17日,“紅杉中國智能醫療加速器”在上海張江正式宣布啟用。上海市人民政府副秘書長陳鳴波、浦東新區區長杭迎偉、上海市經濟和信息化委員會副主任張英、上海推進科技創新中心建設辦公室專職副主任侯勁、上海市浦東新區副區長吳強、紅杉中國創始及執行合伙人沈南鵬以及來自科研、產業、醫療機構的多位專家共同見證了

    微流控芯片驅動磁驅動泵

    采用磁激發的泵(magnetic-actuated pump) 即磁驅動泵(magnetically-driven pump ,MDP) 也是一種重要的微流體驅動控制技術—磁流控技術。磁流控技術與光驅動泵一樣,一般需要在被驅動流體中添加親磁性納米粒子介質,實現對流體的有效控制。磁流體驅動泵的優缺點優

    因美納推出5堿基解決方案以驅動多組學發現,開啟基因組與表觀基因組的同步洞察

      ?? 在美國人類遺傳學會(ASHG)年會上,因美納5堿基解決方案的早期試用客戶——倫敦健康科學中心研究所將展示該技術在加速罕見病病例解析方面的強大潛力。  ?? 因美納專有的5堿基化學技術與全新DRAGEN算法助力雙組學分析,為科研人員帶來驅動精準醫療突破的全新工具。  美國加利福尼亞州圣迭戈—

    遺傳發育所在細胞凋亡及基因組穩定性研究中取得新進展

      基因組穩定性對于真核生物的正常生長發育以及增殖是必不可少的前提條件。然而,在生存過程中,生物體基因組由于經常受到一些內在和外在因素的影響,造成各種形式的DNA損傷。為了保持基因組的穩定性,真核生物中已經形成了一種在進化上高度保守的機制,來修復應對各種DNA損傷。當DNA損傷嚴重到無法正確修復時,

    有哪些方法可以評估多內參基因組合的穩定性和適用性?

    以下是一些評估多內參基因組合穩定性和適用性的方法:利用統計學軟件: 如 geNorm、NormFinder 等軟件,這些軟件不僅可以評估單個內參基因的穩定性,還可以分析多個內參基因組合的穩定性。它們通過計算相關指標來確定最優的內參基因組合。比較不同組合在不同樣本中的變異系數(CV):計算多個內參基因

    OGlcNAc糖基化修飾維持基因組穩定性的分子機制揭示

      DNA總是受到內源或外源環境中多種損傷因子的攻擊。O-GlcNAc糖基化修飾調控Polη與復制叉解離的分子機制示意圖  DNA總是受到內源或外源環境中多種損傷因子的攻擊,例如DNA復制錯誤、細胞代謝產物、電離輻射、紫外線照射和化療試劑等,這些因素都會引起DNA損傷的產生。如果不能夠及時有效修復D

    動態穩定性和暫態穩定性區別

    1.電力系統穩定性 電力系統穩定性可分為靜態穩定、暫態穩定和動態穩定。 (1)電力系統靜態穩定是指電力系統受到小干擾后,不發生非周期性的失步,自動恢復到起始運行狀態的能力。 (2)電力系統暫態穩定指的是電力系統受到大干擾后,各發電機保持同步運行并過渡到新的或恢得到原來穩定運行狀態的能力,通常指第一或

    《分子細胞生物學報》出版“基因組不穩定性與癌癥”專刊

      《分子細胞生物學報》(JMCB)剛出版的2011年第一期,是由本刊副主編之一,美國新澤西癌癥研究所沈智淵教授所組織的綜述專刊,主題是“基因組不穩定性與癌癥”。由于基因組不穩定性和癌癥之間存在著復雜的關系,因此本專刊涵蓋了DNA復制、DNA損傷反應和修復幾個方面,并列舉了它們在

    KHDC3L維持早期胚胎基因組穩定性的功能和突變致病機制

      10月14日,PLOS Biology 以KHDC3L mutation causes recurrent pregnancy loss by inducing genomic instability of human early embryonic cells 為題,在線發表了中國科學院昆明動

    同濟大學Cell-Rep:一種因子能提高iPS細胞基因組穩定性

      來自同濟大學生命科學與技術學院的研究人員利用年輕和年老組小鼠的皮膚細胞誘導成iPS細胞系,發現年老組iPS細胞的基因組穩定性下降,NHEJ修復能力下降,但HR修復能力不變。研究表明對于提高年老組iPS細胞基因組穩定性,重編程起始時聯合運用OSKM和Sirt6將是一個有效可行的方法。這一研究將為利

    我國學者在造血干祖細胞基因組穩定性的機制研究方面取得進展

    圖 胚胎肝細胞通過分泌Fetuin-A蛋白維持造血干祖細胞基因組的穩定性  在國家自然科學基金項目(批準號:81920108005、U23A20417、81730007、31872842、91442106)等資助下,上海交通大學醫學院洪登禮教授研究團隊,在揭示胚胎發育組織維持干細胞基因組穩定性及其疾

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