水生所揭示細菌RNA代謝調控新機制
近日,中國科學院水生生物研究所張承才團隊關于細菌中RNA代謝調控機制的研究取得了進展。相關研究成果以《藍藻中RNase E受一個保守蛋白調控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in cyanobacteria)為題,在線發表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。該團隊在藍藻RNA代謝領域有深厚積累,曾發現藍藻中存在RNA降解體并揭示了其關鍵組分。 細菌遍布于地球的每個角落,幾乎無處不在。同時,細菌具有很強的環境適應能力。有研究發現,這些微小生物的生存適應力與其細胞中RNA的高效代謝能力相關。 細胞中的RNA分子種類繁多,不僅編碼蛋白質,而且直接參與調控多種生命過程。在細菌中,有多種蛋白參與RNA代謝。其中,內切核酸酶RNase E是最為關鍵的一個。RNase E的切割作用是許多RN......閱讀全文
PNAS:小分子RNA引發肥胖代謝問題
科學家發現了機體生物事件鏈中的一種關鍵分子,這些事件會導致脂肪肝疾病,2型糖尿病和其他與肥胖有關的代謝異常疾病。通過阻擋這種分子,研究人員就能夠扭轉肥胖小鼠中其引發一些病理發展。這項研究結果刊登在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。MIR-34A是一種小分子RNA,在肥胖小鼠和患有脂肪肝的患者
新發現!細菌RNA代謝調控新機制
近日,中國科學院水生生物研究所張承才團隊關于細菌中RNA代謝調控機制的研究取得了進展。相關研究成果以《藍藻中RNase E受一個保守蛋白調控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in
水生所揭示細菌RNA代謝調控新機制
近日,中國科學院水生生物研究所張承才團隊關于細菌中RNA代謝調控機制的研究取得了進展。相關研究成果以《藍藻中RNase E受一個保守蛋白調控》(A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in
中國科學院動物所團隊綜述環形RNA藥物設計
環形 RNA(circular RNA,circRNA)是一類廣泛存在于真核細胞中的內源性非編碼 RNA 分子,在生物體發育過程中發揮著重要作用。其獨特的環狀結構使其免受外切酶降解,因此比線性 RNA 更加穩定。自 2010 年代初以來,circRNA 在 RNA 適配體、 guide RNA 等領
中國科學院:通過調控細胞分裂素代謝培育富鋅水稻
人體不僅需要碳水化合物、脂類、蛋白質等三大營養素,還需要鐵、鋅、硒、碘等16種礦物元素,以及維生素A、維生素E、葉酸等13種維生素。目前的研究表明,如果必需的微量營養素長期攝入不足,人體就會出現免疫力下降、智力低下、發育不全、勞動能力喪失等各種健康問題。2005年,世界衛生組織將這一現象稱為“隱
中國科學院生物物理研究所綜述RNA互作技術研究進展
近日,中國科學院生物物理研究所研究員薛愿超等在《分子細胞》期刊在線發表了綜述論文,論述RNA互作技術新進展及未來發展趨勢。人類基因組經過廣泛轉錄產生了海量的非編碼RNA分子,它們通過與其他RNA分子相互作用廣泛參與對轉錄、剪接和翻譯等遺傳信息傳遞過程的精準調控。因此,全面解析RNA-RNA相互作用是
prmt1依賴的RNA代謝調節和DNA損傷反應維持胰腺導管腺癌
預計到2030年,胰腺癌將成為第二大腫瘤。胰腺癌發病率不斷上升,總體5年生存率較低,且治療選擇有限。胰腺導管腺癌(PDAC)占胰腺癌病例的80%以上。PRMT1是PDAC人源腫瘤異體移植(PDX)模型中的一個新弱點,且具有環境特異性依賴。PRMT1是主要的I型酶,負責85%以上的ADMA,它調節
四川大學最新綜述:非編碼RNA與代謝的研究進展
生物通報道:非編碼RNA是指不編碼蛋白質的調節性RNA分子. 近年來的研究發現,非編碼RNA,尤其是微小RNA和長非編碼RNA,可以在基因轉錄、 RNA成熟和蛋白質翻譯等水平調控基因表達,參與發育、分化和新陳代謝等幾乎所有重要的生理生命過程,在人類疾病中發揮重要作用.腫瘤和糖尿病等代謝性疾病是人
中國科學院生物物理研究所發現古菌C/D-RNA識別底物新規則
11月30日,中國科學院生物物理研究所葉克窮課題組在《中國科學:生命科學(英文版)》(Science China Life Sciences)上,在線發表了題為Complicated target recognition by archaeal box C/D guide RNAs的研究論文,揭
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由
RNA提取時RNA降解原因
1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存
RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育
研究揭示腸道菌小RNA通過調控唾液酸代謝促進定植的新機制
1月11日,中國科學院上海免疫與感染研究所研究員晁彥杰團隊在《美國國家科學院院刊》(PNAS)上,發表了題為An RNase III-processed sRNA coordinates sialic acid metabolism of Salmonella enterica during gut
鐵代謝是如何代謝的?
(一)鐵的來源1.來自食物,正常人每天從食物中吸收的鐵量1.0~1.5mg、孕婦2~4mg.2.內源性鐵主要來自衰老和破壞的紅細胞,每天制造紅細胞所需鐵20~25mg.(二)鐵的吸收動物食品鐵吸收率高(可達20%),植物食品鐵吸收率低(1%~7%)。食物中鐵以三價鐵為主,必須在酸性環境中或有還原劑如
膽紅素的代謝:肝內代謝
肝內代謝:肝臟對膽紅素有攝取、轉化、排泄的功能。1)攝取:膽紅素隨血運輸到肝后,在膜上與白蛋白解離,并被肝細胞攝取。肝細胞內有Y蛋白和Z蛋白的兩種色素受體蛋白。Y蛋白是肝細胞主要的膽紅素轉運蛋白,Z蛋白對長鏈脂肪酸具有很強的親和力。Y、Z蛋白與進入胞質的膽紅素結合,并將它運至內質網。2)轉化:肝細胞
RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)
一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后
反義技術——RNA干擾(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNA分離與分析實驗_分離RNA
實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
膽紅素代謝中的肝內代謝
肝內代謝:肝臟對膽紅素有攝取、轉化、排泄的功能。 1)攝取: 膽紅素隨血運輸到肝后,在膜上與白蛋白解離,并被肝細胞攝取。 肝細胞內有Y蛋白和Z蛋白的兩種色素受體蛋白。Y蛋白是肝細胞主要的膽紅素轉運蛋白,Z蛋白對長鏈脂肪酸具有很強的親和力。Y、Z蛋白與進入胞質的膽紅素結合,并將它運至內質網。
膽紅素代謝中的肝內代謝
肝內代謝:肝臟對膽紅素有攝取、轉化、排泄的功能。1)攝取:膽紅素隨血運輸到肝后,在膜上與白蛋白解離,并被肝細胞攝取。肝細胞內有Y蛋白和Z蛋白的兩種色素受體蛋白。Y蛋白是肝細胞主要的膽紅素轉運蛋白,Z蛋白對長鏈脂肪酸具有很強的親和力。Y、Z蛋白與進入胞質的膽紅素結合,并將它運至內質網。2)轉化:肝細胞
α酮酸代謝的代謝過程
氨基酸脫氨后生成的 α-酮酸可進一步代謝。主要有以下三方面:1.經氨基化生成非必需氨基酸實驗證明人體不能合成賴、異亮、苯丙、亮、色、纈、蘇、蛋等8種氨基酸相對應的α-酮酸,因而這些氨基酸不能在體內合成,必須從食物攝取,稱為營養必需氨基酸。其它十二種氨基酸則稱為營養非必需氨基酸,所謂非必需氨基酸并不是
肝臟的代謝:蛋白質代謝
蛋白質代謝:(1)合成自身結構蛋白并合成多種血漿蛋白質,其中合成量最多的是白蛋白。(2)肝臟合成的許多凝血因子和纖維蛋白原等,在血液凝固功能上起重要作用。(3)有豐富的氨基酸代謝酶,轉化和分解氨基酸。(4)經鳥氨酸循環合成尿素(尿素是血中非蛋白含氮物質主要成分)。
RNA降解
新鮮細胞:如果試劑沒有問題,且外源性污染也可以排除,那么降解幾乎都來自裂解液的用量不足。如? 果將裂解液直接加入培養皿中裂解細胞,一定要使裂解液能覆蓋住細胞。 2. 新鮮組織:某些富含內源核酸酶的樣品(如肝臟,胸腺等),即使使用電動勻漿器勻漿也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮條件下將組織
RNA電泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and ?TransferUsing glyoxal
RNA提取
RNA提取(主要內容如下)Tips for Handing RNA?Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum??Basic Procedures for Handing
Quantitating-RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA標記
RNA labeling?(Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes??32P-pCp 3' End-labeling