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  • “垃圾DNA”不“垃圾”

    就像從電影中刪掉的片段一樣,生物基因中的一些序列最終也會被剪掉,細胞不會利用它們制造蛋白質。現在,兩項研究發現,這些被稱為內含子的片段有助于酵母在艱難時期存活。這項研究揭示了DNA的另一種可能的功能,科學家曾認為這種功能是無用的。 未參與該研究的美國加州舊金山州立大學進化分子生物學家Scott Roy說:“這些結果非常令人信服,也非常令人興奮。”這項研究開啟了了解“內含子作用的全新范式”。 加州大學洛杉磯分校酵母微生物學家Guillaume Chanfreau說,這也回答了一個長期存在的問題:為什么酵母保留了以前被認為是“垃圾DNA”的東西。 內含子普遍存在于植物和真菌中,也存在于人類和其他動物體內——在大約2萬個基因中,每個基因平均攜帶8個內含子。在最初將它們視為垃圾之后,研究人員最近開始確定內含子的某些功能。例如,一些基因中的內含子可能有助于控制細胞制造多少相應的蛋白質。 為了確定剝奪內含子的影響,加拿大謝布魯......閱讀全文

    人肌肉基因首次插入面包酵母DNA

    荷蘭研究人員成功將人類肌肉基因插入面包酵母的DNA中,這是科學家首次將如此重要的人類特征植入酵母細胞,得到的人源化酵母模型,可作為藥物篩選和癌癥研究工具。相關論文發表于《細胞報告》雜志。 代爾夫特理工大學研究團隊添加到酵母細胞中的特征由一組十個基因控制,人類沒有這些基因就無法生存。這組基因包含了

    酵母基因組DNA簡易高效提取方案

    1. 10ml菌液過夜培養至飽和(OD600值為2-3)?2. 離心沉降細胞(Sorvall中以2000rpm的速度),然后以冷的、等體積的無菌蒸餾水洗滌?3. 將細胞沉淀在200μl 裂解緩沖液中重懸浮,然后加入約300μl 玻璃珠和200μl的1:1苯酚:氯仿混和液?4. 漩渦搖勻1-2min?

    酵母基因組DNA的玻珠制備法

    實驗概要本實驗利用玻珠制備法制備了酵母基因組DNA。主要試劑無菌水,裂解緩沖液,5mol/L NaCl,苯酚,氯仿:已戊醇(24:1),乙醇,TE緩沖液,EDTA-Sark,蛋白酶K,5mol/L醋酸銨主要設備搖床,玻璃離心管,臺式離心機,玻珠,振蕩器,P-1000移液器,1.5ml離心管實驗步驟1

    酵母菌基因組DNA的提取實驗

    實驗材料 酵母菌試劑、試劑盒 SE緩沖液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K緩沖液 Tris儀器、耗材 高速冷凍離心機臺式離心機恒溫水浴低溫冰箱冷凍真空干燥器取液器電泳儀水平電泳槽紫外觀測儀實驗步驟 1. ?1.5 ml ?對數生長期細菌細胞。2. ?離心,12 000 rpm,1-2 min。3.

    酵母菌基因組DNA的提取實驗

    基本方案 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 酵母菌 試劑、試劑盒

    克隆化酵母DNA的操作實驗——基因置換技術

    實驗材料酵母實驗步驟一、整合性破壞1. ?將基因的內部片段亞克隆到YIP載體。2. ?在此內部片段中將質粒線性化。3. ?繼續整合性轉化步驟3(見基本方案1)。二、基因破壞一步法1. ?將合適的選擇性基因亞克隆到目的基因上,必要時,可在亞克隆的同時引入一個缺失。2. ?采用合適的限制性位點,從步驟1

    酵母DNA微量制備

    實驗概要本實驗介紹了分別從40ml和5ml酵母培養液中制備酵母DNA的操作流程。實驗步驟1. 酵母DNA微量制備(40ml)?? 1) 在125ml三角瓶中用40ml YPD培養液在30℃條件下培養細胞達最大生長量(過夜)。?? 2) 將上述培養物移入螺蓋離心管,用醫用離心機或Sorvall SS-

    方法三:酵母菌基因組DNA的提取

    方法三:酵母菌基因組DNA的提取一:儀器:同方法一二:試劑:SE緩沖液(1M山梨醇,0.1MEDTA pH7.5);溶菌酶(50mg/ml);20%PVP;蛋白酶K緩沖液(10mM Tris pH7.6??0.5% SDS 1mM EDTA);其余同前三:操作?1.5ml??對數生長期細菌細胞???

    酵母DNA的小量制備

    實驗方法原理 通過消化細胞壁,然后用 SDS 裂解隨之產生的原生質體就可以制備酵母 DNA。用這種方法可重復性地制備若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性內切核酸酶切割,也可用作 PCR 的模板。實驗材料 酶解酶 100T酵母細胞試劑、試劑盒 異丙醇醋酸鉀SDS醋酸鈉山梨糖醇緩沖液T

    酵母DNA的快速分離

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 根據該方案制備的酵母 DNA 可以用作 PCR 反應的模板。在 E. coli 和 Saccharomyces cerevisiae 中均能復制的穿梭質粒也可以從酵母中提取,并且可以用于轉化 E. coli。

    酵母DNA的快速分離

    實驗方法原理 根據該方案制備的酵母 DNA 可以用作 PCR 反應的模板。在 E. coli 和 Saccharomyces cerevisiae 中均能復制的穿梭質粒也可以從酵母中提取,并且可以用于轉化 E. coli。實驗材料 酵母細胞試劑、試劑盒 乙醇酚氯仿醋酸鈉STES 緩沖液TE儀器、耗材

    酵母菌DNA制備

    實驗材料?酵母試劑、試劑盒?YPD破菌緩沖液酚氯仿異戊醇LB儀器、耗材?玻璃珠試管搖床培養箱離心機實驗步驟 1.? 注盛于一個13 mm×100 mm 無菌玻璃試管中的2 ml 培養基接種含有帶目的基因的質粒的酵母單菌落,在轉動或搖動培養箱中30℃過夜培養到靜止期。2.? 將1.5 ml 的過夜培養

    酵母DNA的小量制備

    實驗方法原理通過消化細胞壁,然后用 SDS 裂解隨之產生的原生質體就可以制備酵母 DNA。用這種方法可重復性地制備若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性內切核酸酶切割,也可用作 PCR 的模板。實驗材料酶解酶 100T酵母細胞試劑、試劑盒異丙醇醋酸鉀SDS醋酸鈉山梨糖醇緩沖液TE酵母

    酵母DNA的小量制備

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過消化細胞壁,然后用 SDS 裂解隨之產生的原生質體就可以制備酵母 DNA。用這種方法可重復性地制備若干毫克的酵母 DNA。得到的酵母 DNA 可被限制性內切核酸酶切割,也可用作 PCR 的模板。

    快速制備酵母DNA法

    實驗概要本實驗制備了酵母轉化質粒,快速從轉化酵母菌中分離了用于Southern分析的基因組DNA。主要試劑2% Triton X-100,1%SDS,100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-HCl(pH8),1mmol/L Na2EDTA,苯酚:氯仿:已戊醇(25:24:1),YP

    酵母DNA的快速分離

    根據該方案制備的酵母 DNA 可以用作 PCR 反應的模板。在 E. coli 和 Saccharomyces cerevisiae 中均能復制的穿梭質粒也可以從酵母中提取,并且可以用于轉化 E. coli。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理根據該方案制備的酵母 DNA 可

    PNAS破解新物種進化的難題

      經過將近5000億次的嘗試,美國德克薩斯大學(UT)奧斯汀分校的研究人員,見證了一個罕見的事件,也許解決了一個進化的難題:內含子——位于基因中的非編碼DNA序列,在基因組中是如何增加的。研究結果發表在《PNAS》雜志上,解決了關于新物種進化的基本問題,并可以增進我們對于“基因表達以及癌

    “垃圾DNA”不“垃圾”

       就像從電影中刪掉的片段一樣,生物基因中的一些序列最終也會被剪掉,細胞不會利用它們制造蛋白質。現在,兩項研究發現,這些被稱為內含子的片段有助于酵母在艱難時期存活。這項研究揭示了DNA的另一種可能的功能,科學家曾認為這種功能是無用的。  未參與該研究的美國加州舊金山州立大學進化分子生物學家Scot

    內含子的重要功能:幫助酵母應對壓力下的生存

      內含子(intron)的存在,是真核細胞蛋白質編碼基因與原核細胞最大的區別。在真核細胞基因表達的過程中,需要經過RNA剪接反應將其去除。一般來說,內含子的長度遠比編碼蛋白的外顯子序列長,并且執行剪接反應的酶——剪接體高度復雜,由170多個相關蛋白組成。剪接反應需要高度精準,移碼錯位一個堿基都會導

    酵母菌基因組DNA的提取實驗——基本方案

    實驗材料酵母菌試劑、試劑盒SE緩沖液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K緩沖液Tris儀器、耗材高速冷凍離心機臺式離心機恒溫水浴低溫冰箱冷凍真空干燥器取液器電泳儀水平電泳槽紫外觀測儀實驗步驟1. ?1.5 ml ?對數生長期細菌細胞。2. ?離心,12 000 rpm,1-2 min。3. ?沉淀。4

    關于第一類內含子的發現和初步研究介紹

      1975年,人們以啤酒酵母菌mt-DNA某些突變為標記進W+XW-雜交,發現W+傳遞到了代的比例為95%而W-幾乎為零,現象上好似發生了單方賂基因轉變(unidirectionalgeneconversion)。從W-到W+,由于W+中有內含子ScLDU.1,而W-則無,故人們認為上述現象與該內

    兩篇Nature發現內含子的新作用:幫助細胞應對壓力

      一直以來,科學家們對許多真核蛋白編碼基因中散布的沒有明顯生物學功能的非編碼DNA片段到底起什么作用感到困惑。這些被稱為內含子的序列通常在轉錄和翻譯的時候,從它們的原始序列剪接出來并在蛋白質產生之前迅速被破壞。  1月16日Nature雜志上發表的兩項最新研究意外發現了內含子的新作用(至少在酵母中

    CDK12通過抑制內含子多聚腺苷酸化調節DNA修復基因

      11月28日,麻省理工學院科研人員在Nature雜志上發表了題為“CDK12 regulates DNA repair genes by suppressing intronic polyadenylation”的文章,報道了CDK12的功能及其在腫瘤檢測和治療中的應用前景。  減弱同源重組(h

    酵母菌DNA制備實驗2

    實驗材料酵母試劑、試劑盒TERNA酶乙酸銨無水乙醇儀器、耗材離心機培養箱玻璃培養管實驗步驟1. ?在18 mm×150 mm 無菌玻璃培養管或17 mm×100 mm 無菌聚丙烯酰胺管中用10 ml YPD培養基過夜培養酵母菌至靜止期。2. ?培養物室溫下在臺式離心機上1 200 g 離心5 min

    克隆化酵母DNA的操作實驗

    實驗材料?酵母實驗步驟 ? 將待研究的基因亞克隆到YIP質粒。2.? 用限制性內切酶在克隆化基因內部切開,使質粒線性化。3.? 用1~10 μg DNA加上擔體DNA轉化適合的菌株,通過質粒上帶的標記進行選擇,在選擇培養基上純化幾個轉化子,制備DNA,應用Southern 雜交確證整合是否發生在所期

    酵母菌DNA制備實驗1

    實驗材料酵母試劑、試劑盒YPD破菌緩沖液酚氯仿異戊醇LB儀器、耗材玻璃珠試管搖床培養箱離心機實驗步驟1. ?注盛于一個13 mm×100 mm 無菌玻璃試管中的2 ml 培養基接種含有帶目的基因的質粒的酵母單菌落,在轉動或搖動培養箱中30℃過夜培養到靜止期。?2. ?將1.5 ml 的過夜培養物轉移

    將DNA導入酵母細胞實驗

    乙酸鋰轉化 電穿孔轉化 單鏈高分子質量載體DNA的制備 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料

    將DNA導入酵母細胞實驗

    實驗方法原理 實驗材料 待轉化的酵母菌株試劑、試劑盒 YPD培養基YPAD培養基:添加30 mg L腺嘌呤半硫酸的YPD培養基高純無菌水l0×TE緩沖液pH 7.5無菌10×乙酸鋰儲液:1 mol L乙酸鋰pH 7.5 (用稀乙酸調pH)過濾除菌DNA :高分子質量單鏈載體DNA和待轉化DN

    關于基因內含子的基本信息介紹

      基因內含子是阻斷基因線性表達的序列。DNA上的內含子會被轉錄到前體RNA中,但RNA上的基因內含子會在RNA離開細胞核進行轉譯前被剪除。在成熟mRNA被保留下來的基因部分被稱為外顯子。基因內含子有時也叫內顯子,與外顯子相對。真核生物的基因含有外顯子和基因內含子,是前者區別原核生物的特征之一。  

    Nature驚人發現:RNA,修復損傷的模板

      能夠準確地修復自發的錯誤、氧化或誘變劑導致的DNA損傷對于細胞生存至關重要。這種修復通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列來實現。但科學家們現在證實,在一種常見芽殖酵母細胞內RNA可充當模板用來修復破壞性最大的DNA損傷——DNA雙鏈斷裂。  盡管較早的研究表明了將RNA寡核苷酸導入到細胞中可

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