先進院發現GPCR藥物全新結合模式
日前，中國科學院深圳先進技術研究院醫藥所計算機輔助藥物設計中心袁曙光課題組帶領團隊與上海科技大學合作，通過計算藥學與生物化學相結合的方法，發現G蛋白偶聯受體蛋白（GPCR）全新藥物分子結合模式與激活機制。相關工作近期發表在ACS Central Science上。 G蛋白偶聯受體（G Protein-Coupled Receptors，GPCRs）是一大類膜蛋白受體的統稱。這類受體的共同點是其立體結構中都有7個跨膜α螺旋，且其肽鏈的C端和連接第5和第6個跨膜螺旋的胞內環上都有G蛋白（鳥苷酸結合蛋白）的結合位點。研究顯示G蛋白偶聯受體只見于真核生物之中，而且參與了很多細胞信號轉導過程。在這些過程中，G蛋白偶聯受體能結合細胞周圍環境中的化學物質并激活細胞內的一系列信號通路，最終引起細胞狀態的改變。 GPCR參與著人類體內包括細胞分化、神經信號傳遞、代謝等多種生理功能，同時也與癌癥、抑郁癥、疼痛、艾滋病、糖尿病等重大疾病密切相......閱讀全文
先進院發現GPCR藥物全新結合模式
日前，中國科學院深圳先進技術研究院醫藥所計算機輔助藥物設計中心袁曙光課題組帶領團隊與上海科技大學合作，通過計算藥學與生物化學相結合的方法，發現G蛋白偶聯受體蛋白（GPCR）全新藥物分子結合模式與激活機制。相關工作近期發表在ACS Central Science上。 G蛋白偶聯受體（G Prot
先進院發現GPCR藥物全新結合模式
日前，中國科學院深圳先進技術研究院醫藥所計算機輔助藥物設計中心袁曙光課題組帶領團隊與上海科技大學合作，通過計算藥學與生物化學相結合的方法，發現G蛋白偶聯受體蛋白（GPCR）全新藥物分子結合模式與激活機制。相關工作近期發表在ACS Central Science上。 GPCR參與著人類體內包括細
上海藥物所發現B類GPCR與Arrestin全新作用模式
G蛋白偶聯受體（G protein-coupled receptor，GPCR）在細胞信號轉導過程中發揮關鍵作用，是最大的藥物靶標蛋白質家族。GPCR被細胞外的信號分子激活后，與細胞內的效應蛋白（G蛋白、阻遏蛋白等）結合，激活多種下游信號通路，從而介導并調控人體各種生命活動。G蛋白（G prot
Attenuation－of－GPCR－Signaling
The G-protein coupled receptor (GPCR) family transduces extracellular signals across the plasma membrane, activating cellular responses through a vari
arrestins－in－GPCR－Desensitization
Role of ?-arrestins in the desensitization, sequestration and intracellular trafficking of GPCRs. Homologous desensitization of GPCRs (1) results from
HPLC結合復合模式色譜柱檢測極性有機酸
近年來，有機酸的使用在制藥和食品領域越來越普遍， 在制藥領域，常用的有機酸主要有乙酸、三氟乙酸 、甲酸等，常被作為有機合成的原料，而三氟乙酸（TFA）隨著大量使用和排放，在水體中廣泛存在，植物會隨土壤和水濃度增加而富集TFA，且由于其持久性和缺乏揮發性，難以從植物組織中消除。三氟乙酸對水生生物有
上海藥物所發現GPCR與GPCR激酶相互作用新機制
GPCR（G蛋白偶聯受體）已經成為當前最成功的藥物靶標之一，迄今已有40%左右的上市藥物以GPCR為靶點，因此，在藥物發現領域，對GPCR結構及其如何與下游信號通路相互作用的認識與理解越深入，則越有希望開發出更加高效低毒的藥物。自GPCR與下游G蛋白和阻遏蛋白復合物晶體結構被成功解析以來，GPC
創新種養結合新模式，開啟高質量肉牛發展密碼
為促進肉牛業高質量發展，四川省雅安市政府揭榜掛帥項目肉牛產業組成員因地制宜，提出了雅安種養結合新模式飼喂肉牛，并在滎經縣牛鳴谷養牛基地率先示范應用。近日，肉牛產業揭榜掛帥項目主持人、四川農業大學動物科技學院教授賴松家一行來到滎經縣開展肉牛技術培訓和技術服務。專家團隊到牛鳴谷養牛示范基地進行指導種養結
《GigaScience》—實現文章與數據結合的創新學術發表模式
2012年7月12日，華大基因和生物醫學中心(BioMed Central)宣布其共同創辦的生物學期刊《GigaScience》首刊正式發行。該期刊采用標準全文文獻、數據庫信息以及信息分析工具相結合的嶄新模式，來發表大規模的生物學研究成果，為廣大科研工作者提供免費公開的有效數據以及生物學發現
最新合作研究闡述泛素鏈結合的協同效應模式
近日，美國PLoS ONE雜志發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所胡紅雨課題組的研究論文。該論文闡述了III型脊髓小腦共濟失調癥相關蛋白ataxin-3（AT3）中的串聯泛素結合模體（ubiquitin-interaction motif，UIM）的構象變化和UIM與泛素鏈結
Nature長文：GPCR藥物大盤點
G蛋白偶聯受體（G protein-coupled receptors，GPCRs）家族是人類中最龐大的膜蛋白家族，也是很多藥物的重要靶點。這個家族中有800多個成員，其中包括400個左右嗅覺受體。據統計，靶向GPCR的藥物銷量占全球市場的27%。GPCRs一直是藥物研發的重要靶點之一，因為它們
PNAS：GPCR孤兒受體找到“親人”
人類基因組中存在一些被稱為“孤兒受體”(orphan receptors)的蛋白，從它們與其他蛋白的序列相似性來看，這些蛋白應該能結合并應答激素或化學物質，但人們至今還未發現其生理性配體。 Emory大學的研究人員為大腦中的一對GPCR孤兒受體找到了配體，這一發現有望幫助人們治療相關的
陳可冀院士：提倡多元模式－推進中西醫結合
本期話題：SCI首次收錄中醫學類期刊?中國中西醫結合學會和中國中醫科學院主辦的《中國結合醫學雜志》（Chinese Journal of Integrative Medicine）日前被列為美國《科學引文索引（擴展庫）》（SCI-E）來源期刊，成為國內第一份被SCI收錄的中醫學類期刊。創刊于1995
Science重要成果：室溫解碼GPCR結構
科學家利用目前最強力的X射線激光器，在最接近天然的條件下，獲得了一種重要G蛋白偶聯受體(GPCR)的3D結構。這一突破發表在最近一期的Science雜志上。 GPCR是一個蛋白大家族，對人類健康有關鍵性作用，約40%的現代藥物都靶標這類蛋白。與GPCR有關的疾病包括，高血壓、哮喘、精神分裂
首次破解糖尿病關鍵GPCR結構
GPCRs是一類與G蛋白有信號連接的受體家族，調控著細胞對激素，神經遞質的大部分應答，以及視覺，嗅覺，味覺等。目前藥物市場上至少有一半的小分子藥物是GPCR的激活劑或者拮抗劑，2012年諾貝爾化學獎就頒給了“G蛋白偶聯受體”結構研究。 近期來自斯克里普斯研究所(TSRI)，中國科學院等處的
科學家系統評估AlphaFold3在藥物開發中的預測能力
中國科學院上海藥物研究所研究員徐華強團隊，在前期評估AlphaFold3蛋白相互作用預測精度的基礎上，進一步聚焦其新近開源的小分子配體預測功能，系統評估了AlphaFold3在G蛋白偶聯受體（GPCR）-小分子配體復合物結構預測中的表現，并深入揭示了其在藥物設計應用中的局限性。相關研究7月9日發表于
新成果－GCGR促進糖尿病新藥開發
中科院上海藥物研究所吳蓓麗課題組和趙強課題組在B型G蛋白偶聯受體（GPCR）結構與功能研究領域又獲重要突破，首次測定了胰高血糖素受體（GCGR）全長蛋白與多肽配體復合物的三維結構，揭示了該受體對細胞信號分子的特異性識別及其活化調控機制。該成果1月4日發表于《自然》雜志。 GPCR是人體內最大的
繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（三）
必要時，可先將cartoo隱藏起來，等調整好label后，再顯示出來），讓視圖更清晰。經過上述一系列操作，得到下圖：2.6. 生成圖片上面的圖已經可以發表文章了，但為了更好看，還需要進行一步：光線追蹤（Ray tracing）。繼續使用命令：至此，我們拿到3張圖片：focus.png、label.p
繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（一）
前言本期，我將帶大家使用PyMOL軟件（搭配Photoshop、MS Powerpoint）繪制D715-2441與PB2cap的結合模式圖。我們先來看一張成品圖：?研究背景根據上期的分析結果，我們獲得以下相互作用：1、化合物D715-2441的芳環夾在氨基酸殘基H357和F404之間并形成π-π堆
繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（二）
設置關鍵殘基對象：關鍵殘基包括：A鏈的K339、H357、E361、K376和F404。由于該蛋白只有一條鏈，在使用命令選擇殘基時，可以不用指定鏈名。按照下圖順序，將關鍵殘基設置為res對象。2.3. 顯示所需，隱藏多余在PyMOL中輸入以下命令：然后，進行鼠標操作：2.4. 繪制相互作用力前面說過
發現GPCR磷酸化編碼機制，創新性的提出“笛子模型”理論
中國科學院生物物理研究所研究員王江云課題組、山東大學基礎醫學院教授于曉團隊與孫金鵬團隊，與北京大學教授金長文團隊合作，在Nature Communications上在線發表了研究論文Structural studies of phosphorylation-dependent interacti
研究揭示G蛋白選擇調控機制
中國科學院上海藥物研究所吳蓓麗、趙強研究團隊與中國科學院生物物理研究所孫飛、澳大利亞莫納什大學Denise Wootten研究團隊合作，在G蛋白偶聯受體（GPCR）結構與功能研究領域取得突破性進展：解析了人源胰高血糖素受體（GCGR）分別與激活型G蛋白（Gs）和抑制型G蛋白（Gi）結合的復合物三
Roles－of－arrestindependent－Recruitment－of－Src－Kinases－in－GPCR－Signaling
The binding of ?-arrestins to agonist-occupied GPCRs coincides with the recruitment of Src family tyrosine kinases, including c-Src, Hck and c-Fgr (Sr
《自然》挑戰傳統觀點－揭示GPCR新特征
2012年諾貝爾化學獎頒給了兩位美國科學家：羅伯特·萊夫科維茨(Robert J. Lefkowitz)和布萊恩·科比爾卡(Brian K. Kobilka)，他們因“G蛋白偶聯受體”研究領域的杰出貢獻而獲獎。 這一久負盛名的受體家族是最著名的藥物靶標分子，調控著細胞對激素，神經遞質的
華裔青年Cell追隨諾獎腳步－解析GPCR
來自Salk生物研究所，Scripps研究院等處的研究人員發表了題為“Genetically Encoded Chemical Probes in Cells Reveal the Binding Path of Urocortin-I to CRF Class B GPCR”的文章，破
生物物理所等在大麻素受體的結構生物學研究中獲重成果
中國科學院生物物理研究所劉志杰課題組與合作者成功解析了人源大麻素受體CB1（human Cannabinoid Receptor 1, CB1）與激動劑——四氫大麻酚（THC）類似物復合物的三維精細結構，揭示了大麻素受體在激動劑調控下的結構特征和激活機制。北京時間7月6日凌晨，該項成果以Crys
生物物理所等在大麻素受體結構生物學研究中獲重要成果
中國科學院生物物理研究所劉志杰課題組與合作者成功解析了人源大麻素受體CB1（human Cannabinoid Receptor 1, CB1）與激動劑——四氫大麻酚（THC）類似物復合物的三維精細結構，揭示了大麻素受體在激動劑調控下的結構特征和激活機制。北京時間7月6日凌晨，該項成果以Crys
研究揭示人胰高血糖素受體的G蛋白特異性識別機制
G蛋白偶聯受體（GPCR）在細胞信號轉導中起重要作用，并作為多種疾病的重要治療靶標。與細胞外激動劑結合后，GPCR通過招募不同的G蛋白（Gs、Gi和Gq等）刺激各種信號通路以介導多種生理功能。GPCR和特定G蛋白之間的選擇性偶聯對于這類受體的生物學作用至關重要。 但是，確定單個GPCR如何識別
胰高血糖素受體晶體結構揭示B型GPCR信號轉導機制
近日，中國科學院上海藥物研究所在B型G蛋白偶聯受體（G protein-coupled receptor, GPCR）結構與功能研究方面取得又一項重要進展：首次測定了胰高血糖素受體（Glucagon receptor, GCGR）全長蛋白與多肽配體復合物的三維結構，揭示了該受體對細胞信號分子的特
研究發現胰高血糖素受體結構揭示G蛋白選擇調控機制
近日，中國科學院上海藥物研究所吳蓓麗研究組、趙強研究組與中國科學院生物物理研究所孫飛研究組和澳大利亞莫納什大學Denise Wootten研究組合作，在G蛋白偶聯受體（G protein-coupled receptor，GPCR）結構與功能研究領域取得又一突破性進展：解析了人源胰高血糖素受體（